Protein

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Genbank accession
AAV35917.1 [GenBank]
Protein name
orf97
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MSNFSIPQSMNPVRYQASLGGNIKSTNIDNVHEQFQIELGIVKKVFYRKGTLLFSIINRGSSVSVVGNDTSSATASAPIPVETFGRNSDGKVFGGYRPVKVGSKIAVGYVNGERSAPIVLGVYPDNDESYEIVSPVSFETGEDSDKSVEDIALGSKEITASQNIIYQSGKGDILKTFNGKSLLYINANGSNYMDDINYAYDQIADTRDGNMNPVTPRETRAQSWLLVHEDNPENEETNGHRTRFYVNKNGEFQMVMFSPNNDSDNNLVVFTASKDDGFKLRKQFDTDDLDGSEQYVQFSIGSGNSAVLQSVDKDNASEISMLPNGLQLTTPNNGAMTFNGRSLETVFGSISSAVDAAKDAGDKANNAASAGAIAQSAASDAASQALAASQAGEDAKSAAVSAQAAGEDAKAQAKDTRDRIIYYSSISNEKDVAIPGKYIIVNTDTYIKNGTIKTAHIGDGAITNAKIANLAVGTAQLEDAAITRAKIGNLAVGTAQIEDAAITDAKVGNLSANHLNAGTIDFSVISGIHINASEIDVGKIVADQIFVNGLGDISKNLGTVTSGNINGTNVNDDIDDLNDPNSMSVIEKQTRASQFNGLTSQYNVILSRAKDANISTTDLTTAYNNLKDFMTNPLADTSNSSSIDRASYNKLIFYYNSALSDVQMELRNSYNNDISNMQSSVSVASQAASSAAIVASQATTTGDNASYAAAQALATANQAQTAGDSATRVANNASQAASGAVIAGSTASVNADKAVSVANQAKSAGDNATRVANNASQAASGAILAGSTATVIANKASTVANEAKSAGDNATSVANNATSVANSAKSTADSTYAYANSEIAVQSTAITKAQSTADNAFSQAQAVGSQASAEIAVQSNATAKAQSTADNAFSKATTAIDNGKVTSQAVTDLKDGSKLTIAELENGLATKVANSDYASYKEQTASQIGQLVTNGAFSAYQTQTADLIASKVATKDFSAYQATTAKAIESKVESSDFNTYKTQTADLIDDKVSNSAYASDKTQTASEIADRVSNSAFSTYQTQTASQIASKVDNGDFSTYKTQTADLIASKVANKDFSAYQATTAKEISSKVESSDFNTYKTQTADMISSKVESSDFQTLQTQVNNSTVGTNLLTNLSSNWTKSWGGSSVGTPPTFSDTNARIRTIQTVSVSSNSPYTISIGDDLFKFSWVELDSNGNSTYQAPWITSANYTFTTTSTTTQLYIGVAYKNDTALDTSNLPKIKLEKGSLATDWSLNPEDQATQSQITQLSGEIDLRVTKGDLVDQINMQAGKTLISSSGQLILSGNSVVLDSVDPVIMKSANIGNMAVGTAQIANGAITNAQIGSLAVDTANIKDAAISSAKIANLAVGTAQIGDGAITNAKIGKLAVGTAQIANGAITDAQIGSLAVGTAQIKDEAVNSAKIAKLAVGTAQIGDGAITNAKIGNLAVGTAQIANAAITDAQVGNVSANKLTAGIIDFNTITGKNINASNITTGTLSTDRLNVGTLSALSANLGNVTAGSLKGVNIIANSFSTPNGSFTTDASGNVVASNLTIRGVTNLVYNASLSGGSGSYIPGWGISNNGYYAPSMLFDGVPSIGWNNSTGAGVWNIFAQTKLHPLNGATGIPFSASVWFLECGSDTNLKYQVTLAFFDSNSNRINGGFVGNTWNGISSSQRWRYVTLDNVVIPSNATYVGLQFWSYNGKGNAYFSSPMLTQSSHSTGYQPDTGNVVSAGEIDGSVINGSTINGTTLNAGSISTNANNTAKFYPFTAGSDGVLHSYHVDDYFANYARMYSGKIVISDRNMVTTDGNKYGSETAVIGGASISLSSGYTVGKDTDFSKPLVADGDGTTQLILSGVTGIALNGSNQSVTFKGTSSTGTNGISMDSYGNVHGEGTSTWWRVLDSAGNQVANFGTAPGNNTTFPKPIFTDEVGGLNGNLLIHNKDGQSQMLFWHDSDGIGINAPTIYNRTYGSGSTVTITSHGVLGRITSATKYKLNIGHYSDTVKADRLFSLDPAFWHDKFAVEKIAERKGEGDTPKDGALTLNYHYGLIAEDLVKAGLEEFVIKNDDGGVEGIAYDRLWTVLIPKIRDLSNNQINDRMTISRLEKEIEKLKQEVSSR
Physico‐chemical
properties
protein length:2112 AA
molecular weight: 221063,35630 Da
isoelectric point:4,90818
aromaticity:0,06866
hydropathy:-0,25251

Domains

Domains [InterPro]
IPR030392
1983–2102
IPR030392
Coil
2088–2108
Coil
AAV35917.1
1 2112
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage LP65
[NCBI] 		2892344 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAV35917.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AY682195 [NCBI]
CDS location
range 73231 -> 79569
strand -
CDS
ATGAGTAACTTTAGTATTCCACAATCAATGAATCCAGTTAGATACCAAGCTTCACTTGGTGGTAACATTAAATCAACGAATATAGACAATGTTCATGAACAATTTCAAATAGAACTAGGTATTGTTAAAAAGGTATTCTATAGAAAAGGCACATTATTATTTAGCATTATAAACAGGGGAAGCTCTGTAAGTGTTGTAGGTAATGATACAAGTAGTGCTACTGCTAGCGCCCCTATCCCAGTTGAGACCTTTGGCAGAAATTCAGATGGTAAAGTGTTTGGTGGTTATCGGCCAGTTAAGGTGGGCTCAAAGATTGCTGTTGGATATGTTAATGGGGAACGATCAGCACCTATTGTTCTTGGTGTGTACCCAGACAATGATGAAAGCTACGAAATTGTCAGCCCAGTATCATTTGAAACTGGAGAAGATAGTGATAAATCTGTTGAAGATATTGCATTAGGTAGCAAAGAGATAACAGCTAGTCAGAACATCATCTATCAGTCTGGTAAGGGCGACATACTAAAGACTTTTAACGGTAAGTCTTTGCTTTATATAAACGCTAATGGCTCTAACTATATGGACGACATTAACTATGCTTATGACCAGATAGCAGACACCCGTGACGGTAACATGAATCCTGTAACACCACGAGAAACTAGAGCTCAGTCTTGGCTACTAGTTCATGAAGACAACCCTGAAAACGAAGAGACTAATGGTCACAGGACTAGGTTCTACGTTAATAAAAACGGTGAGTTTCAAATGGTCATGTTTTCACCTAATAACGATAGTGACAACAATTTAGTTGTTTTTACAGCAAGTAAGGACGACGGATTTAAATTAAGAAAACAATTTGATACTGACGATTTAGATGGTTCAGAACAGTATGTGCAGTTTAGTATTGGCTCAGGTAACTCAGCTGTTCTGCAATCAGTAGACAAGGACAATGCTAGCGAAATAAGTATGCTTCCTAATGGCCTTCAATTGACTACTCCTAATAATGGTGCAATGACATTTAATGGCCGTTCACTCGAAACCGTGTTTGGATCAATTTCTAGTGCTGTTGACGCTGCTAAGGATGCTGGGGATAAAGCAAACAATGCAGCTAGTGCGGGTGCAATAGCCCAGTCAGCTGCTAGCGATGCAGCAAGTCAAGCACTAGCAGCAAGTCAGGCAGGGGAAGATGCTAAGAGTGCTGCTGTTAGCGCACAAGCCGCTGGAGAAGACGCTAAAGCTCAGGCTAAAGATACCCGAGATAGAATAATCTATTATTCTTCAATTTCAAACGAAAAAGACGTTGCTATCCCCGGTAAATATATTATAGTTAACACTGACACCTATATTAAAAATGGTACAATTAAAACTGCACATATAGGTGATGGTGCAATCACTAATGCTAAAATAGCTAACCTAGCTGTTGGGACGGCTCAACTAGAAGACGCCGCTATCACCCGTGCTAAGATTGGTAATCTTGCCGTAGGTACTGCTCAAATTGAAGATGCCGCTATCACAGATGCTAAAGTAGGTAACCTTAGTGCTAACCATTTAAATGCAGGTACTATAGACTTTAGTGTCATTAGTGGTATTCATATTAATGCTAGCGAAATAGACGTTGGTAAAATCGTTGCTGACCAGATATTCGTTAATGGCTTAGGAGATATATCTAAAAATTTAGGGACAGTTACCAGTGGTAATATAAATGGTACTAATGTAAATGACGATATTGATGATTTAAATGACCCAAACTCAATGAGTGTTATTGAGAAACAAACACGGGCTTCACAATTTAACGGGTTAACTAGCCAGTATAATGTAATCTTAAGTCGAGCTAAAGATGCCAATATTAGTACGACTGATTTAACAACAGCCTATAACAACCTCAAGGATTTTATGACCAACCCTTTGGCAGACACTAGTAATAGTAGTAGTATTGACCGGGCATCCTATAACAAGCTTATATTCTATTACAATTCAGCTTTAAGCGATGTACAGATGGAATTAAGAAACAGTTATAACAATGATATTAGCAATATGCAGTCTAGTGTATCGGTAGCTAGCCAAGCCGCTTCTAGTGCCGCTATAGTGGCTTCACAGGCAACTACAACTGGTGATAATGCTAGCTATGCCGCGGCACAGGCCCTTGCAACTGCTAACCAAGCTCAGACTGCTGGTGATAGTGCAACTCGTGTTGCTAATAATGCTAGTCAGGCCGCTTCTGGTGCCGTAATAGCTGGTAGTACAGCATCAGTAAATGCAGACAAAGCAGTTTCTGTTGCTAACCAAGCTAAAAGTGCTGGTGATAATGCAACTCGTGTTGCTAATAATGCTAGCCAAGCCGCTTCTGGCGCCATTTTAGCCGGTAGCACAGCAACAGTCATTGCCAACAAAGCAAGTACAGTTGCTAACGAAGCTAAAAGTGCTGGTGATAATGCCACAAGTGTTGCTAATAATGCCACTAGTGTCGCTAATAGTGCTAAGTCGACTGCTGATAGCACCTACGCTTATGCTAACTCTGAAATAGCAGTACAGTCTACAGCTATTACTAAAGCTCAAAGTACGGCTGATAATGCCTTTAGCCAAGCTCAAGCAGTTGGTAGTCAGGCTAGTGCTGAAATAGCCGTACAGTCTAACGCTACTGCCAAAGCTCAAAGTACAGCTGATAATGCCTTTAGCAAAGCGACTACAGCAATAGATAATGGTAAAGTAACTAGTCAAGCAGTAACAGACCTAAAAGATGGTTCCAAGTTAACGATTGCTGAACTAGAAAATGGACTAGCTACAAAGGTTGCTAACTCAGACTATGCTAGTTACAAAGAACAAACTGCTAGTCAGATAGGACAACTAGTTACTAATGGTGCTTTCTCGGCATACCAAACACAGACAGCTGACTTGATAGCAAGTAAGGTAGCTACTAAGGACTTTTCGGCCTACCAAGCTACAACCGCTAAAGCAATTGAAAGTAAAGTTGAGTCTAGCGATTTTAACACGTACAAAACACAAACTGCTGACTTGATTGATGACAAAGTCTCTAACTCAGCTTATGCGTCTGACAAGACACAAACTGCTAGTGAAATAGCAGATAGAGTAAGTAATAGTGCCTTCTCAACTTATCAAACACAGACTGCTAGTCAGATCGCTAGCAAGGTTGACAATGGTGATTTTTCAACTTACAAAACACAGACAGCTGACTTGATTGCTAGCAAAGTAGCTAATAAGGACTTTTCAGCATACCAAGCGACAACTGCTAAAGAAATATCCAGTAAGGTTGAGTCCAGTGATTTTAATACGTACAAAACACAGACAGCTGATATGATTTCTAGCAAGGTTGAATCTAGTGACTTTCAAACATTGCAAACTCAAGTTAATAATAGTACGGTTGGCACTAACTTGCTAACTAATCTTTCTTCTAATTGGACTAAAAGCTGGGGTGGTTCTTCCGTAGGTACTCCCCCTACATTTAGTGATACTAATGCTAGAATTAGAACTATTCAAACTGTTTCTGTAAGCTCTAATTCTCCTTACACAATCTCTATCGGTGATGATTTATTCAAATTTAGTTGGGTGGAGTTAGATTCTAATGGGAATTCAACCTATCAGGCGCCATGGATAACTTCTGCAAACTATACATTCACAACAACAAGCACGACAACTCAACTGTATATAGGTGTCGCATATAAAAATGATACTGCACTAGATACAAGTAATTTGCCTAAAATTAAGCTTGAAAAAGGTAGTCTAGCAACTGATTGGTCTCTTAATCCAGAAGACCAAGCTACGCAGTCTCAAATCACACAGTTAAGCGGTGAGATAGACCTTAGAGTTACTAAGGGTGACCTAGTCGACCAGATTAATATGCAAGCCGGTAAAACCCTAATCTCATCCAGTGGTCAATTAATATTATCTGGTAATAGTGTTGTTCTTGATAGTGTTGACCCAGTTATTATGAAGAGTGCAAACATTGGTAATATGGCTGTAGGTACGGCACAGATAGCCAATGGTGCAATTACTAATGCTCAAATTGGTTCATTAGCTGTTGATACTGCCAATATTAAAGATGCCGCCATCAGTAGTGCTAAGATTGCTAACCTAGCTGTAGGCACAGCCCAAATAGGTGACGGTGCTATCACTAATGCCAAGATAGGTAAATTAGCTGTAGGTACGGCACAGATAGCCAATGGTGCTATCACCGATGCTCAGATAGGGTCATTAGCTGTAGGTACAGCACAGATTAAAGATGAAGCTGTTAATAGCGCTAAGATTGCTAAGCTAGCTGTAGGCACCGCACAAATAGGTGATGGGGCTATCACTAATGCTAAAATTGGGAACCTTGCTGTAGGTACAGCCCAAATAGCCAATGCAGCTATCACTGACGCCCAAGTTGGTAATGTTAGCGCCAATAAATTAACAGCTGGTATAATTGACTTTAATACAATTACTGGTAAAAATATTAACGCATCAAACATTACTACTGGAACACTTAGCACTGACCGATTAAATGTCGGCACACTATCGGCTTTAAGTGCCAATTTAGGTAACGTTACAGCCGGATCACTAAAAGGTGTCAATATTATCGCTAATTCATTTAGTACGCCTAATGGTTCGTTCACAACCGATGCAAGTGGTAATGTGGTTGCTAGCAATCTAACAATCAGAGGGGTTACGAACTTAGTTTATAACGCGTCATTATCTGGCGGTAGTGGCTCATATATTCCGGGCTGGGGTATAAGTAATAATGGGTATTATGCCCCAAGTATGCTTTTTGATGGTGTCCCCTCAATTGGGTGGAACAATTCTACTGGTGCTGGAGTTTGGAATATATTTGCACAAACTAAATTGCACCCCTTGAACGGAGCTACTGGTATACCATTTAGTGCTTCCGTATGGTTCTTAGAGTGTGGTAGTGATACGAACTTGAAATATCAAGTCACATTAGCATTTTTCGATTCAAATAGTAATCGTATCAACGGAGGGTTTGTTGGTAACACATGGAACGGTATTAGCTCAAGTCAGAGATGGCGCTATGTGACCCTTGATAACGTAGTTATACCAAGTAACGCCACATATGTTGGGTTACAATTCTGGTCATATAACGGGAAGGGTAATGCTTATTTTAGCTCACCTATGCTAACTCAATCGTCTCACTCAACTGGCTATCAACCAGATACAGGTAATGTTGTTAGTGCTGGTGAAATAGATGGATCAGTTATTAATGGTTCAACTATTAACGGGACAACGTTAAATGCTGGTAGTATTAGCACTAACGCTAACAATACAGCTAAATTCTATCCGTTTACAGCAGGCTCTGATGGAGTTCTACACTCATACCATGTAGACGACTATTTCGCTAACTATGCTAGGATGTACTCCGGTAAAATTGTTATATCAGATAGAAATATGGTAACTACTGATGGTAATAAGTATGGTAGTGAAACAGCGGTGATTGGGGGCGCTTCAATAAGCCTATCATCTGGTTACACTGTCGGTAAAGATACAGATTTTTCAAAGCCATTGGTTGCAGATGGGGATGGTACAACTCAGCTTATACTGTCAGGAGTAACTGGAATTGCTCTAAATGGCTCTAATCAATCCGTGACATTTAAGGGAACATCTAGTACTGGAACTAACGGAATAAGTATGGATAGTTATGGTAATGTTCATGGAGAAGGTACCTCTACTTGGTGGAGGGTTCTTGATTCTGCTGGTAACCAAGTAGCAAACTTCGGTACTGCCCCCGGTAATAACACTACGTTTCCTAAACCAATATTTACTGATGAGGTTGGTGGTCTAAACGGGAATCTTCTTATCCATAATAAAGACGGTCAAAGTCAGATGCTGTTCTGGCATGATAGCGACGGAATTGGTATTAACGCACCTACCATTTATAACAGAACTTATGGTAGTGGCTCTACCGTAACAATAACATCACATGGTGTTCTTGGAAGAATAACCTCAGCCACTAAGTATAAACTCAACATTGGTCACTACTCAGATACTGTAAAAGCTGACCGCCTATTCTCGCTAGACCCAGCATTCTGGCACGACAAATTTGCTGTTGAAAAAATAGCTGAAAGAAAGGGTGAGGGTGACACGCCTAAAGATGGCGCTCTTACACTAAACTATCATTATGGACTAATAGCCGAAGATTTAGTTAAAGCAGGACTTGAAGAATTTGTTATTAAGAACGACGACGGCGGAGTAGAGGGAATTGCTTATGATAGACTATGGACAGTTCTTATCCCAAAGATTAGGGACTTGTCAAATAATCAAATTAATGATAGAATGACTATAAGTAGGTTGGAAAAAGAAATAGAGAAATTAAAACAGGAGGTTTCATCTAGATGA

Tertiary structure

PDB ID
294ce3acd35a4c450689d76569c6a025c89da431396a9857c709c29609c4f99b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5577
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Lactobacillus plantarum Bacteriophage LP65: a New Member of the SPO1-Like Genus of the Family Myoviridae Chibani-Chennoufi,S., Dillmann,M.L., Marvin-Guy,L., Rami-Shojaei,S. and Br. 2004 15489418 GenBank