Protein
View in Explore- Genbank accession
- WVM05040.1 [GenBank]
- Protein name
- fibronectin type III protein
- RBP type
-
TSPTFTF
- Protein sequence
-
MRKTIHGQKGGGGSPRVPVEQPDDLQSIAKAKLLIALGEGEFAGELTAQNIFLDGTPLEDTEGNANFSGVTWDFRPGTQAQTYIQGLPSAENEINVGSTISSKTPWVHTFTNSQLSAIRVRLKWPSLFKQEDNGDLVGNEVKYAIDLQTDGGSWKTVIDSAVKGKTTSGYERAHRIDLPESTTSWSLRVRKVSNDANSSKIGDTVVLQSYTEVIDAKFTYPHTALLYIEFDSKQFNGSIPQITCKPKGRIIRIPSNYNPIDRTYTGVWDGSFKWAWSNNPAWVFYDIVISDRFGLGQRINQQQIDKWELYRIAQYCDQLVPDGKGGDGTEPRYVCDVYVQDRNEAYNVLRDFAAIFRGMTYWGGGQIVTLADMPRDIDYSYTRANVIDGKFIYSSSSSKEKYSTALVSYSDPQNGYADAMEPVFEPDLVSRFGFNQLEVTAIGCTRQSEANRKGRWGILTNNKDRMVTFSVGLDGNIPQPGYIIAVADELLSGKVTGGRVSAIDGRNITLDRVASAVSGDRLILNLPSGQSQARTIQTVSGKVITVTTEYSETLETECVWVVESEELYAQQYRVVSVTENESNQFTITAIQHDPSKYEHVDSGALIDERPISVIPPNNQQAPKNIVIDSYSIVSQGVSIETMRAQWPQVENAISYEAQWRRNEGNWVNMPRSSINSIEVPNVYSGRYLVRVRAINASEISSGWGYSEEKTLTGKMGNPPKPVNFRASPLVFGIKLDWGFGENTSDTLKTEIQYSKTNDGEGLMLLSDVPYPSKTYEMAGLSAGVAFYFRARLVDKTGNQSEWTEFIRGESEFDVGTILPELDGHFMSSEAGQQLSERLDWNAETALLLSNADSQLSRSVLMKHGQSQAGIRELWQVRATDNEAWAQEVKEIYSAVGDNTSAIKETQTSITKLDEAFGQRFTEIRTEMDKAQADIVSNSTAISNTNKAFAENKTQVQAKFDKQEGMIQEKMQATFEQSGDGVVTHSINITIVHNNVKYNAAGQVISAQVKNGKLESFFGYNANNFAWYNPANGKMELFMYAKDGQLFIRDLFIEDGSITNAKIGNVIQSNNYLNGRPSWIINKNGFAEFQNIKARGEIDATSGRLKNVVIEESCEILGKLNVENLEGNIISIHRDNIYLREIWNDGNIHTIFKVKQRSQYCTIWVDGTITADETIPINAIHKVENRAVIAYRAPGFPIERAMFSVFMDGKEVDFNSHIYPLVTGNVAGFYAANDITITIPPGNSIVEIGIRIPHIPGESNGVLIRGRVFLLPHSDEVILIN
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1280 AA molecular weight: 142419,71070 Da isoelectric point: 5,20261 aromaticity: 0,09375 hydropathy: -0,38734
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Vibrio phage vB_PvuS_Pm34 [NCBI] |
3116923 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WVM05040.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP059946
[NCBI]
CDS location
range 493 -> 4335
strand -
strand -
CDS
ATGAGAAAAACAATTCACGGTCAAAAAGGGGGCGGTGGTAGTCCTCGTGTGCCTGTTGAGCAACCTGATGATTTGCAATCTATTGCTAAAGCAAAGTTACTCATTGCCTTGGGTGAGGGAGAATTTGCCGGAGAGTTAACGGCACAAAATATCTTTCTTGATGGTACGCCGTTAGAAGACACTGAAGGAAATGCAAATTTTAGTGGTGTTACGTGGGATTTTAGACCAGGCACGCAAGCACAGACTTATATTCAAGGATTACCTAGCGCTGAAAATGAGATCAATGTTGGTTCTACGATTTCGAGTAAAACACCGTGGGTTCACACATTTACCAATTCACAATTATCAGCTATTCGGGTTCGTCTAAAGTGGCCTTCATTATTCAAGCAAGAAGATAATGGGGATTTGGTGGGTAATGAAGTTAAATACGCCATTGATTTACAAACTGATGGTGGTAGTTGGAAAACCGTTATTGATAGTGCCGTAAAAGGAAAAACAACTTCAGGTTATGAGCGAGCTCATCGAATTGATTTACCTGAATCGACAACATCATGGTCACTACGTGTTAGAAAAGTCTCTAATGATGCTAATAGCAGTAAAATCGGTGATACGGTTGTTTTGCAAAGTTACACTGAAGTCATTGATGCTAAATTCACCTATCCTCATACAGCATTACTTTATATTGAATTCGACTCTAAACAATTCAACGGCTCTATTCCGCAAATAACGTGCAAACCGAAAGGGCGCATAATCCGAATACCCTCAAATTACAATCCTATTGATCGCACCTATACGGGCGTGTGGGATGGTTCCTTTAAATGGGCATGGAGCAATAATCCCGCATGGGTTTTCTACGATATTGTTATCTCCGATAGATTTGGTCTTGGACAACGAATAAATCAACAACAGATAGATAAATGGGAGTTATATCGTATAGCGCAGTATTGTGATCAATTAGTACCCGATGGAAAAGGTGGTGACGGCACAGAACCTCGTTATGTCTGTGATGTTTATGTGCAAGATAGAAATGAAGCGTATAACGTGTTACGTGACTTTGCGGCTATCTTTCGAGGAATGACCTATTGGGGTGGCGGTCAGATTGTGACATTAGCAGATATGCCTCGTGATATTGATTATAGCTATACCCGAGCCAATGTGATTGATGGAAAATTTATTTATTCAAGCAGTAGCAGTAAAGAAAAGTATTCTACGGCATTGGTTTCGTATTCAGATCCGCAAAATGGATATGCTGATGCAATGGAGCCAGTGTTTGAACCTGATTTAGTTTCTCGGTTTGGGTTTAATCAATTAGAAGTTACCGCGATTGGCTGTACTCGACAAAGTGAAGCAAACAGAAAAGGGCGCTGGGGAATACTGACAAACAATAAAGACAGAATGGTGACATTCTCTGTCGGGTTAGATGGGAACATTCCGCAACCTGGTTACATTATTGCTGTTGCTGATGAACTATTGTCAGGAAAAGTCACTGGTGGTCGAGTGAGTGCCATCGATGGCAGAAATATCACGTTAGATCGTGTTGCAAGTGCTGTGAGTGGTGATCGCTTAATTCTCAATCTTCCTTCAGGGCAATCGCAAGCAAGAACGATACAAACAGTATCAGGGAAGGTGATCACGGTTACAACGGAGTACAGTGAGACACTAGAGACAGAATGTGTTTGGGTTGTCGAGTCAGAAGAGCTGTATGCGCAACAATATCGCGTTGTTAGTGTTACAGAAAATGAGTCTAATCAATTTACTATTACAGCCATTCAGCATGATCCCAGTAAATATGAACATGTTGATTCTGGCGCATTGATTGATGAAAGGCCCATTAGTGTTATTCCTCCTAATAACCAGCAAGCCCCGAAAAATATTGTCATCGACTCTTACTCAATTGTAAGCCAAGGCGTTAGCATTGAAACGATGCGAGCACAGTGGCCACAAGTTGAAAATGCAATCTCTTATGAAGCGCAATGGCGTAGAAACGAAGGCAATTGGGTCAATATGCCTCGTAGCTCCATTAATTCTATTGAAGTTCCTAATGTTTATTCAGGTCGATATTTAGTTCGTGTTCGAGCCATTAATGCTTCTGAGATCTCAAGCGGATGGGGATATTCTGAAGAAAAAACGTTAACCGGAAAAATGGGTAATCCACCTAAACCAGTTAACTTTAGAGCGTCGCCATTAGTATTTGGCATTAAGTTAGATTGGGGGTTTGGTGAAAATACTAGTGATACGTTAAAAACTGAAATCCAGTACAGCAAAACGAATGACGGTGAAGGACTGATGCTGTTATCTGATGTTCCTTATCCATCTAAAACCTATGAAATGGCGGGTTTATCAGCTGGTGTAGCGTTTTATTTTAGGGCAAGGCTGGTGGATAAAACAGGTAATCAATCCGAGTGGACTGAGTTTATTCGGGGAGAATCTGAGTTTGATGTAGGTACGATATTGCCAGAGCTTGATGGACATTTCATGTCATCAGAAGCCGGCCAGCAACTTAGTGAACGCTTGGATTGGAATGCTGAGACAGCGCTTCTTCTTAGTAATGCTGATTCTCAACTATCACGTAGTGTGTTAATGAAACACGGTCAATCACAAGCGGGTATTCGCGAATTATGGCAAGTTCGTGCAACGGATAATGAAGCATGGGCGCAGGAAGTTAAAGAAATTTACTCCGCTGTTGGTGACAACACGTCTGCAATTAAAGAGACTCAAACTTCAATTACCAAGCTTGATGAGGCTTTTGGTCAGCGATTTACTGAAATTCGCACGGAAATGGATAAGGCTCAAGCAGATATTGTTTCAAACTCTACTGCCATCTCTAACACAAATAAGGCTTTTGCTGAAAACAAAACGCAAGTTCAAGCTAAGTTTGATAAACAAGAAGGCATGATTCAGGAGAAGATGCAAGCTACGTTTGAGCAGTCTGGCGACGGCGTTGTCACCCATTCCATTAATATCACGATTGTTCATAACAACGTGAAATACAATGCAGCAGGACAAGTAATTAGTGCTCAAGTTAAGAATGGAAAGCTCGAATCATTCTTTGGTTACAATGCGAATAACTTTGCTTGGTATAACCCTGCAAATGGCAAAATGGAATTATTCATGTATGCCAAAGATGGGCAATTGTTTATTCGAGATTTATTTATCGAAGATGGCTCGATTACAAATGCAAAAATAGGGAATGTTATTCAATCAAATAATTATTTAAATGGGAGACCGAGCTGGATAATTAATAAAAATGGGTTTGCTGAATTCCAGAATATAAAAGCGAGAGGGGAAATAGATGCAACTTCAGGTCGCTTAAAAAATGTTGTTATTGAAGAAAGTTGTGAAATTCTAGGAAAATTAAATGTTGAAAACTTAGAGGGGAATATAATCTCAATACATAGAGATAATATTTACCTAAGAGAGATTTGGAATGATGGGAATATTCACACTATATTCAAAGTTAAGCAACGAAGTCAATATTGTACGATATGGGTGGATGGAACAATAACGGCAGATGAAACAATTCCTATTAATGCAATTCATAAGGTGGAAAACCGCGCAGTCATTGCCTATCGAGCACCAGGATTCCCTATTGAAAGAGCTATGTTTTCTGTTTTTATGGACGGCAAGGAAGTTGATTTTAACTCTCATATATACCCACTTGTTACTGGCAATGTCGCTGGTTTTTATGCTGCAAACGATATAACAATCACAATTCCACCGGGTAACAGTATTGTGGAAATAGGTATTAGAATCCCACATATCCCTGGTGAATCTAATGGAGTATTAATTAGAGGTCGAGTGTTTTTACTACCACATAGTGATGAAGTTATTTTAATTAACTGA
Tertiary structure
PDB ID
0ab742354d98d3590178c447d2bb012926b9bbb23933e2af17dd7f573294c020
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50