Genbank accession
WVM05040.1 [GenBank]
Protein name
fibronectin type III protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MRKTIHGQKGGGGSPRVPVEQPDDLQSIAKAKLLIALGEGEFAGELTAQNIFLDGTPLEDTEGNANFSGVTWDFRPGTQAQTYIQGLPSAENEINVGSTISSKTPWVHTFTNSQLSAIRVRLKWPSLFKQEDNGDLVGNEVKYAIDLQTDGGSWKTVIDSAVKGKTTSGYERAHRIDLPESTTSWSLRVRKVSNDANSSKIGDTVVLQSYTEVIDAKFTYPHTALLYIEFDSKQFNGSIPQITCKPKGRIIRIPSNYNPIDRTYTGVWDGSFKWAWSNNPAWVFYDIVISDRFGLGQRINQQQIDKWELYRIAQYCDQLVPDGKGGDGTEPRYVCDVYVQDRNEAYNVLRDFAAIFRGMTYWGGGQIVTLADMPRDIDYSYTRANVIDGKFIYSSSSSKEKYSTALVSYSDPQNGYADAMEPVFEPDLVSRFGFNQLEVTAIGCTRQSEANRKGRWGILTNNKDRMVTFSVGLDGNIPQPGYIIAVADELLSGKVTGGRVSAIDGRNITLDRVASAVSGDRLILNLPSGQSQARTIQTVSGKVITVTTEYSETLETECVWVVESEELYAQQYRVVSVTENESNQFTITAIQHDPSKYEHVDSGALIDERPISVIPPNNQQAPKNIVIDSYSIVSQGVSIETMRAQWPQVENAISYEAQWRRNEGNWVNMPRSSINSIEVPNVYSGRYLVRVRAINASEISSGWGYSEEKTLTGKMGNPPKPVNFRASPLVFGIKLDWGFGENTSDTLKTEIQYSKTNDGEGLMLLSDVPYPSKTYEMAGLSAGVAFYFRARLVDKTGNQSEWTEFIRGESEFDVGTILPELDGHFMSSEAGQQLSERLDWNAETALLLSNADSQLSRSVLMKHGQSQAGIRELWQVRATDNEAWAQEVKEIYSAVGDNTSAIKETQTSITKLDEAFGQRFTEIRTEMDKAQADIVSNSTAISNTNKAFAENKTQVQAKFDKQEGMIQEKMQATFEQSGDGVVTHSINITIVHNNVKYNAAGQVISAQVKNGKLESFFGYNANNFAWYNPANGKMELFMYAKDGQLFIRDLFIEDGSITNAKIGNVIQSNNYLNGRPSWIINKNGFAEFQNIKARGEIDATSGRLKNVVIEESCEILGKLNVENLEGNIISIHRDNIYLREIWNDGNIHTIFKVKQRSQYCTIWVDGTITADETIPINAIHKVENRAVIAYRAPGFPIERAMFSVFMDGKEVDFNSHIYPLVTGNVAGFYAANDITITIPPGNSIVEIGIRIPHIPGESNGVLIRGRVFLLPHSDEVILIN
Physico‐chemical
properties
protein length:1280 AA
molecular weight: 142419,71070 Da
isoelectric point:5,20261
aromaticity:0,09375
hydropathy:-0,38734

Domains

Domains [InterPro]
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage vB_PvuS_Pm34
[NCBI]
3116923 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WVM05040.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP059946 [NCBI]
CDS location
range 493 -> 4335
strand -
CDS
ATGAGAAAAACAATTCACGGTCAAAAAGGGGGCGGTGGTAGTCCTCGTGTGCCTGTTGAGCAACCTGATGATTTGCAATCTATTGCTAAAGCAAAGTTACTCATTGCCTTGGGTGAGGGAGAATTTGCCGGAGAGTTAACGGCACAAAATATCTTTCTTGATGGTACGCCGTTAGAAGACACTGAAGGAAATGCAAATTTTAGTGGTGTTACGTGGGATTTTAGACCAGGCACGCAAGCACAGACTTATATTCAAGGATTACCTAGCGCTGAAAATGAGATCAATGTTGGTTCTACGATTTCGAGTAAAACACCGTGGGTTCACACATTTACCAATTCACAATTATCAGCTATTCGGGTTCGTCTAAAGTGGCCTTCATTATTCAAGCAAGAAGATAATGGGGATTTGGTGGGTAATGAAGTTAAATACGCCATTGATTTACAAACTGATGGTGGTAGTTGGAAAACCGTTATTGATAGTGCCGTAAAAGGAAAAACAACTTCAGGTTATGAGCGAGCTCATCGAATTGATTTACCTGAATCGACAACATCATGGTCACTACGTGTTAGAAAAGTCTCTAATGATGCTAATAGCAGTAAAATCGGTGATACGGTTGTTTTGCAAAGTTACACTGAAGTCATTGATGCTAAATTCACCTATCCTCATACAGCATTACTTTATATTGAATTCGACTCTAAACAATTCAACGGCTCTATTCCGCAAATAACGTGCAAACCGAAAGGGCGCATAATCCGAATACCCTCAAATTACAATCCTATTGATCGCACCTATACGGGCGTGTGGGATGGTTCCTTTAAATGGGCATGGAGCAATAATCCCGCATGGGTTTTCTACGATATTGTTATCTCCGATAGATTTGGTCTTGGACAACGAATAAATCAACAACAGATAGATAAATGGGAGTTATATCGTATAGCGCAGTATTGTGATCAATTAGTACCCGATGGAAAAGGTGGTGACGGCACAGAACCTCGTTATGTCTGTGATGTTTATGTGCAAGATAGAAATGAAGCGTATAACGTGTTACGTGACTTTGCGGCTATCTTTCGAGGAATGACCTATTGGGGTGGCGGTCAGATTGTGACATTAGCAGATATGCCTCGTGATATTGATTATAGCTATACCCGAGCCAATGTGATTGATGGAAAATTTATTTATTCAAGCAGTAGCAGTAAAGAAAAGTATTCTACGGCATTGGTTTCGTATTCAGATCCGCAAAATGGATATGCTGATGCAATGGAGCCAGTGTTTGAACCTGATTTAGTTTCTCGGTTTGGGTTTAATCAATTAGAAGTTACCGCGATTGGCTGTACTCGACAAAGTGAAGCAAACAGAAAAGGGCGCTGGGGAATACTGACAAACAATAAAGACAGAATGGTGACATTCTCTGTCGGGTTAGATGGGAACATTCCGCAACCTGGTTACATTATTGCTGTTGCTGATGAACTATTGTCAGGAAAAGTCACTGGTGGTCGAGTGAGTGCCATCGATGGCAGAAATATCACGTTAGATCGTGTTGCAAGTGCTGTGAGTGGTGATCGCTTAATTCTCAATCTTCCTTCAGGGCAATCGCAAGCAAGAACGATACAAACAGTATCAGGGAAGGTGATCACGGTTACAACGGAGTACAGTGAGACACTAGAGACAGAATGTGTTTGGGTTGTCGAGTCAGAAGAGCTGTATGCGCAACAATATCGCGTTGTTAGTGTTACAGAAAATGAGTCTAATCAATTTACTATTACAGCCATTCAGCATGATCCCAGTAAATATGAACATGTTGATTCTGGCGCATTGATTGATGAAAGGCCCATTAGTGTTATTCCTCCTAATAACCAGCAAGCCCCGAAAAATATTGTCATCGACTCTTACTCAATTGTAAGCCAAGGCGTTAGCATTGAAACGATGCGAGCACAGTGGCCACAAGTTGAAAATGCAATCTCTTATGAAGCGCAATGGCGTAGAAACGAAGGCAATTGGGTCAATATGCCTCGTAGCTCCATTAATTCTATTGAAGTTCCTAATGTTTATTCAGGTCGATATTTAGTTCGTGTTCGAGCCATTAATGCTTCTGAGATCTCAAGCGGATGGGGATATTCTGAAGAAAAAACGTTAACCGGAAAAATGGGTAATCCACCTAAACCAGTTAACTTTAGAGCGTCGCCATTAGTATTTGGCATTAAGTTAGATTGGGGGTTTGGTGAAAATACTAGTGATACGTTAAAAACTGAAATCCAGTACAGCAAAACGAATGACGGTGAAGGACTGATGCTGTTATCTGATGTTCCTTATCCATCTAAAACCTATGAAATGGCGGGTTTATCAGCTGGTGTAGCGTTTTATTTTAGGGCAAGGCTGGTGGATAAAACAGGTAATCAATCCGAGTGGACTGAGTTTATTCGGGGAGAATCTGAGTTTGATGTAGGTACGATATTGCCAGAGCTTGATGGACATTTCATGTCATCAGAAGCCGGCCAGCAACTTAGTGAACGCTTGGATTGGAATGCTGAGACAGCGCTTCTTCTTAGTAATGCTGATTCTCAACTATCACGTAGTGTGTTAATGAAACACGGTCAATCACAAGCGGGTATTCGCGAATTATGGCAAGTTCGTGCAACGGATAATGAAGCATGGGCGCAGGAAGTTAAAGAAATTTACTCCGCTGTTGGTGACAACACGTCTGCAATTAAAGAGACTCAAACTTCAATTACCAAGCTTGATGAGGCTTTTGGTCAGCGATTTACTGAAATTCGCACGGAAATGGATAAGGCTCAAGCAGATATTGTTTCAAACTCTACTGCCATCTCTAACACAAATAAGGCTTTTGCTGAAAACAAAACGCAAGTTCAAGCTAAGTTTGATAAACAAGAAGGCATGATTCAGGAGAAGATGCAAGCTACGTTTGAGCAGTCTGGCGACGGCGTTGTCACCCATTCCATTAATATCACGATTGTTCATAACAACGTGAAATACAATGCAGCAGGACAAGTAATTAGTGCTCAAGTTAAGAATGGAAAGCTCGAATCATTCTTTGGTTACAATGCGAATAACTTTGCTTGGTATAACCCTGCAAATGGCAAAATGGAATTATTCATGTATGCCAAAGATGGGCAATTGTTTATTCGAGATTTATTTATCGAAGATGGCTCGATTACAAATGCAAAAATAGGGAATGTTATTCAATCAAATAATTATTTAAATGGGAGACCGAGCTGGATAATTAATAAAAATGGGTTTGCTGAATTCCAGAATATAAAAGCGAGAGGGGAAATAGATGCAACTTCAGGTCGCTTAAAAAATGTTGTTATTGAAGAAAGTTGTGAAATTCTAGGAAAATTAAATGTTGAAAACTTAGAGGGGAATATAATCTCAATACATAGAGATAATATTTACCTAAGAGAGATTTGGAATGATGGGAATATTCACACTATATTCAAAGTTAAGCAACGAAGTCAATATTGTACGATATGGGTGGATGGAACAATAACGGCAGATGAAACAATTCCTATTAATGCAATTCATAAGGTGGAAAACCGCGCAGTCATTGCCTATCGAGCACCAGGATTCCCTATTGAAAGAGCTATGTTTTCTGTTTTTATGGACGGCAAGGAAGTTGATTTTAACTCTCATATATACCCACTTGTTACTGGCAATGTCGCTGGTTTTTATGCTGCAAACGATATAACAATCACAATTCCACCGGGTAACAGTATTGTGGAAATAGGTATTAGAATCCCACATATCCCTGGTGAATCTAATGGAGTATTAATTAGAGGTCGAGTGTTTTTACTACCACATAGTGATGAAGTTATTTTAATTAACTGA

Tertiary structure

PDB ID
0ab742354d98d3590178c447d2bb012926b9bbb23933e2af17dd7f573294c020
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7316
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50