Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_010067662.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,76
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGQRPAASVLAEGELAINLKDKTIFTKDDSGSVIELGLKYGGTIDGSLTVNGNIIGNLTGNAATATKLKTARKINGISFDGSKDITLTPSDINVNSTTFIKNNGELPVDANLDEYGPVEEYLGVWSKATSTNAQPANKFPEENAVGVLEVFVAGQFAGTQRYTTRYGNVYIRSLTATWNGVNGPWSAWRNIQSGTRPLSTTIDLNDLGGAEHLGLWRNSSNSIATFDRNFPEEGSSAQGLLEVYEGGNYSRTQRYTTRFGVVYTRCLAAAWDASAPKWGPWQQVGNVTPATFYDGDLNDFKTPGLYNILGTDAVINCPTGEGLPAVIVGLLEVKQRASGGAIFQKFTTAGTGATTRDRIFERAYTGGVWGAWNEVYTSYSLPITLGMGGIKTQLAELDWQTFDFVPGSMFSVPLNKIKNMPANMDWGTIDGNLVMFSVGPSEHTSTGRTVQIWRGTVSQTNYRYFVVRVFGNSGNRTCTVRRVVLEDGSHTWTAKQDFNGAVNFNSTVNLNNTTTFKTEVKFRSLNAFRMYGGKFGTFLRNDGESLYILSTDEDDQDGNFNTNRPFRYELRTGDVTLGGASGANVLKLKRDSLTAFFGGDINIKGMMTFDAGRLGSRDYFKFNHWGDSNNARDNIIQLEDSKGAHFSTERTLATGAIKTKFFGEIESDGKLVIKRPGDSIVLSTTASNSLHIRGDIDGTGNWYIGKGGADNGLAFYSYATNAGVYITNAGDISLSPKGAEMAQVNNVRLYVHGERWTASQPGDWGSQWQVEAPIFVDHGYVGPDSYYPIIKGRSVITNQGFVTAVDLGIRRVPNNWGQAIIRVGSAEASPAAGHPNAVFEFHYDGTFYSPGNGNFNDVYIRSDGRLKINKKELENGALEKVCRLKVYTYDKVKSIKDRSVIKREVGIIAQDLEKELPEAVSKVEVDGSDVLTISNSAVNALLIKAIQEMSEEIKELKTPFFTKIARKISKYFKF
Physico‐chemical
properties
protein length:988 AA
molecular weight: 108176,84410 Da
isoelectric point:8,23637
aromaticity:0,10526
hydropathy:-0,34889

Domains

Domains [InterPro]
cd19958
137–205
cd19958 cd19958 cd19958 IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR030392
876–974
IPR030392
YP_010067662.1
1 988
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_DalCa
[NCBI] 		2420240 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010067662.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_054908 [NCBI]
CDS location
range 152557 -> 155523
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGTAAAACTGCAGGTCAACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAAAACAATTTTCACAAAAGATGACTCAGGTAGTGTTATAGAATTAGGTTTAAAATATGGAGGAACAATTGATGGTTCTTTAACTGTTAATGGAAACATAATTGGAAATTTAACAGGTAACGCTGCAACTGCAACGAAATTAAAAACAGCACGAAAAATTAATGGTATATCCTTTGATGGGTCAAAAGATATCACGCTAACTCCATCTGACATAAATGTCAATAGCACAACGTTTATAAAAAATAACGGCGAATTACCTGTTGATGCTAATTTAGATGAGTATGGGCCTGTTGAAGAATATCTTGGAGTTTGGTCGAAAGCAACTTCAACCAACGCTCAACCAGCAAATAAATTTCCAGAAGAAAATGCTGTAGGTGTTCTAGAAGTATTTGTGGCCGGTCAATTTGCTGGTACTCAGAGATATACAACTAGATACGGAAATGTTTATATTCGTTCCTTGACTGCTACATGGAACGGAGTAAACGGTCCGTGGAGTGCGTGGCGAAATATTCAATCTGGTACTCGTCCACTGTCAACAACGATTGATCTTAATGATCTAGGAGGCGCTGAACACCTTGGTTTGTGGCGAAATAGTTCAAATTCCATTGCTACCTTTGACAGAAATTTCCCAGAAGAAGGATCGTCCGCTCAAGGACTTTTAGAAGTATATGAAGGTGGAAACTATTCTCGCACACAGAGATATACGACCAGATTTGGTGTTGTTTATACTCGTTGTCTTGCTGCTGCGTGGGATGCTTCTGCGCCTAAATGGGGACCTTGGCAACAAGTCGGTAATGTCACACCGGCGACTTTCTATGACGGAGATCTGAATGATTTTAAAACTCCTGGGTTATATAATATTTTAGGCACTGATGCCGTTATTAACTGTCCTACCGGTGAAGGTTTACCAGCCGTTATTGTTGGTTTGCTGGAAGTTAAACAGCGTGCTTCTGGTGGTGCTATTTTCCAAAAATTTACTACTGCCGGAACGGGTGCAACTACTCGCGATCGTATTTTTGAGCGTGCATATACTGGTGGTGTGTGGGGTGCATGGAACGAAGTATATACATCTTATTCCCTGCCAATTACTTTGGGTATGGGTGGTATTAAAACTCAATTAGCGGAGTTAGATTGGCAAACCTTTGATTTTGTCCCTGGTAGTATGTTTAGTGTTCCTTTGAACAAAATAAAGAATATGCCAGCAAATATGGATTGGGGCACGATTGATGGAAACCTGGTTATGTTTTCCGTTGGTCCTAGCGAACACACTAGCACAGGACGTACTGTTCAGATTTGGCGCGGCACCGTATCCCAGACAAACTACCGTTATTTTGTCGTTCGTGTGTTCGGTAATTCTGGAAATAGAACTTGCACAGTTCGTCGTGTTGTTCTTGAAGACGGATCACATACTTGGACTGCTAAACAAGATTTTAATGGCGCAGTTAACTTTAACTCTACTGTTAACCTTAATAACACTACCACATTTAAAACAGAAGTTAAATTTCGCTCATTGAATGCATTCCGTATGTATGGCGGAAAATTTGGTACATTTTTACGTAATGATGGAGAGAGTCTTTATATTCTTTCCACCGACGAAGATGATCAAGATGGAAACTTTAATACAAATAGACCTTTCCGTTATGAATTAAGAACTGGTGATGTTACTTTGGGTGGTGCTAGTGGTGCTAACGTTTTAAAATTAAAACGTGATTCTCTCACCGCATTTTTTGGCGGTGATATTAACATTAAAGGCATGATGACTTTTGACGCCGGACGTTTAGGATCACGAGATTATTTTAAATTTAACCATTGGGGTGATAGTAATAATGCGCGTGATAACATTATTCAGTTAGAAGACAGCAAAGGCGCTCATTTTTCCACTGAACGTACTTTAGCGACTGGTGCAATTAAGACTAAATTTTTTGGTGAAATTGAATCCGATGGTAAATTGGTTATTAAACGTCCGGGTGATTCTATTGTATTATCAACAACTGCTAGTAATTCTTTGCATATTCGCGGTGATATAGACGGGACTGGTAACTGGTATATTGGTAAAGGTGGTGCTGATAATGGATTAGCGTTCTATAGTTATGCTACTAATGCTGGTGTATACATTACAAACGCAGGAGATATCTCGCTAAGTCCAAAGGGTGCCGAAATGGCTCAGGTCAATAACGTTCGATTATATGTTCATGGTGAACGTTGGACCGCTAGTCAACCAGGTGATTGGGGCAGTCAGTGGCAAGTGGAAGCGCCAATATTCGTCGATCATGGTTATGTTGGACCAGATAGCTATTATCCAATTATTAAAGGAAGAAGTGTAATCACCAATCAAGGGTTTGTAACTGCCGTCGATCTTGGTATTCGTCGTGTCCCTAACAATTGGGGGCAAGCAATTATTCGTGTTGGATCTGCAGAGGCATCGCCAGCGGCTGGACACCCTAACGCGGTATTTGAATTTCATTACGACGGTACTTTCTATTCTCCTGGTAATGGTAACTTTAACGATGTGTATATTCGTTCCGATGGTCGTCTTAAGATTAATAAAAAAGAGCTAGAAAACGGAGCACTTGAAAAAGTATGCCGACTGAAAGTTTATACATACGATAAGGTTAAGTCTATTAAAGATCGTAGTGTTATTAAACGTGAAGTTGGTATTATTGCTCAGGATCTTGAAAAAGAATTACCGGAAGCTGTGTCTAAAGTTGAAGTTGATGGATCTGATGTTCTGACAATTTCTAACTCCGCTGTGAATGCTCTTTTAATTAAGGCTATCCAAGAAATGAGCGAAGAAATTAAAGAATTAAAAACGCCTTTCTTCACTAAAATTGCTCGCAAAATTAGTAAATATTTTAAATTCTAA

Tertiary structure

PDB ID
09fa0135919a52c9a81818ca99854b75fd4d96204308983e6a8fa8b78ca93bf1
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6363
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Phage interactions in dual species E. coli and Salmonella Enteritidis biofilms Milho,C., Silva,D., Alves,D., Oliveira,H., Sousa,C. and Sillankorva,S. 2019-12-03 — GenBank