Protein

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Genbank accession
AET72584.1 [GenBank]
Protein name
outer membrane protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGEIGIELDTTRLKIGDGVTAWNTLRYERPLESTTNTSNTLVQRDVDGNFSAGTITATLIGQSSTASRLASTRQVQITGDVTGTDNFDGSDNINLQSQLSIVDTLAHYDGTNTSLGTYTQVEVDAKGRIKRGFNPTSIADYGLDGSVEGSSAQPYDTDLQAIAQLNTTGLVARTSPGNAIARTINGTASQIVVNNGGGLTGNPVVDLAVTTVVAGDYNTESLTSVDALGSSNEPFGTETVNAAKFTVDDRGRLQSATNVPIATATEGSKYAAYAAGTTYVRYDIIEDSSKVYQAITGIAAGGGAPTHTDATDAGGWRYLGAATVEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAVGVDNTQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATSGYRGFNYLNYIKVNDVSGNLLVGANNTGDGGAGELDVNVRSYFSDADITLDGALNQTLDKTGDGNLTFQLTQNTATNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTVQISASEADGKVHVEDARFQDNYIATANATLNLDPGDDRAATGTVRVWGNLQIDGTTTTVNSTTVTVDDPIITLGGDTAPATDDNLDRGIEFRYYDTEARLGFYGWDTNYTDLGGHGGGYRFLHAATNTTEVFSGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTTNTTGDLVIAGGAGITQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNIVLQGASKTLQLNNGSGTTKIEFQSTTGNGSLAGILDVTGNLNVNTDKFNVIAASGNTSIAGTLGVTSIATFSNNIDANGDVAIAGNIHSESTNDITVLKNSGTGIWEIQSNDYGSLKVDGGAYVAGSALIDGTLHVNGAIEVKDSATETESRLNWLQVRYRGRFGDSYQATPSYASHNTTTIRAHGGAGIERSLHVGGTGTGEGLFVGKRYSGDTQKFSVLGASGNTTIEGTLTVNDNVNFNGTLDQDGDFAVRNGTTDKFFVAATSGDTNIEGTLTVDGHTELNSTLNVDNNVTLGAQLTVTGTTEFNNTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSVRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDAVQINDTLGVSDVVTFTRNTQQSITGNSISLDGAVRMSGGLGVSKNLAVGENLVVYGDFNIIGDTVVNGTTTYNAKIDITNTAEADSLGDSNVAFQVDGGGIIRKKLWAGGDFTVYDDANSRNAFFVDVSTGDATLHNDLTVGGNLTINGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPTTNDGKDRGVEFRYYDSTAKVGFFGLDRSSLEYVFLNDATNSSEVLSGTDGQLRAGSLNLTGSGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGAALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASTATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNATTADALKTARNITVAGVVSGDAEFNGSGDITITTSYVDADITALAAMAGTGLVARTAANTYAQRSVTATASSGITITNADGVSGDITLNVASTSTNASNNLVLRDASGDFAANEITADLVGGVTGDVVGNVTGNVTGQTSDISNHDTGDLTEGSNLYYTDARADARIAAADTDALSEGSTNLYYTDARADARIAAADTGDLTEGSNLYYTNARADARIVAAGLDGGTLTGDVTGDVTGNVDGNVSGEVTLEGAAPASATATGTAGDIRYDADYIYICVATDTWKRAAISTWS
Physico‐chemical
properties
protein length:1720 AA
molecular weight: 177258,80450 Da
isoelectric point:4,18934
aromaticity:0,05930
hydropathy:-0,19942

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.10.10.30
1–44
G3DSA:2.10.10.30
SSF69349
4–242
SSF69349
IPR041352
5–43
IPR041352
AET72584.1
1 1720
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-CAM8
[NCBI] 		754038 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AET72584.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JF974299 [NCBI]
CDS location
range 88333 -> 93495
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGACGTGGTGGTGCTCAGGAGTGGGCAAACGCGAATCCAACTCTTGCACAAGGTGAGATCGGCATCGAACTCGATACAACTCGCCTCAAGATTGGTGATGGTGTTACTGCATGGAACACTCTGAGGTATGAGCGTCCTCTTGAATCTACGACAAATACTTCAAACACTCTTGTACAAAGAGATGTTGATGGTAATTTTTCTGCAGGTACAATCACAGCAACGTTGATTGGACAATCTTCTACTGCTAGTCGCCTTGCTTCTACAAGACAGGTTCAGATAACTGGTGATGTAACTGGTACAGATAACTTTGACGGTTCGGATAACATCAATCTGCAATCTCAACTCTCGATTGTTGATACTCTTGCTCATTATGATGGTACAAATACGTCTCTAGGAACATACACTCAAGTTGAGGTAGACGCAAAAGGTAGAATTAAGAGAGGTTTTAATCCAACATCAATTGCTGATTATGGTCTTGATGGAAGCGTCGAAGGATCTTCCGCACAACCTTATGATACCGATCTTCAGGCGATTGCTCAATTAAATACCACTGGTCTTGTTGCCAGAACTTCTCCTGGTAATGCCATTGCCAGAACAATCAATGGTACAGCATCTCAAATTGTTGTTAACAATGGTGGCGGTCTTACTGGTAATCCAGTTGTTGACTTGGCAGTTACAACTGTAGTTGCAGGTGACTATAACACTGAATCATTAACATCAGTTGATGCTCTTGGATCTAGCAACGAACCATTCGGTACAGAAACTGTAAACGCTGCAAAATTTACAGTTGACGATAGAGGTCGTTTACAAAGTGCTACAAATGTACCTATTGCTACTGCTACCGAGGGTAGTAAGTATGCGGCATATGCAGCAGGTACAACGTATGTTAGATATGATATTATTGAAGATAGTAGTAAAGTATATCAAGCAATCACAGGAATCGCTGCAGGTGGTGGTGCTCCAACTCATACTGATGCTACAGATGCTGGTGGATGGAGATATCTCGGTGCTGCAACAGTTGAACAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGATGCCAACGGTCATGTAACTATTGCTGCAGTTGGTGTTGATAATACACAACTACAGAATAATAGAGTTTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTGCAACCTCTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATATTAAAGTTAATGACGTTAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACGGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTACTTCTCTGACGCTGATATTACTCTTGACGGCGCTCTTAATCAGACACTGGATAAGACTGGGGATGGCAACTTAACGTTCCAGTTAACACAGAATACTGCTACAAATAGAAACTTTAACATTCTGACAACTAACGCTGGGTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTGTACAGATTAGTGCATCAGAAGCAGATGGTAAGGTACATGTAGAAGATGCAAGATTTCAAGATAACTATATTGCTACAGCAAACGCGACATTAAACCTCGATCCTGGTGATGATCGTGCTGCTACAGGAACAGTTAGAGTCTGGGGCAACCTTCAGATTGATGGCACTACCACCACTGTAAACTCAACAACTGTTACAGTTGATGATCCTATTATCACTCTTGGTGGTGATACTGCACCTGCAACCGATGACAATTTAGATCGTGGTATTGAGTTTAGATATTATGATACTGAAGCACGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTACACCGATTTGGGTGGTCATGGTGGTGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTACTGAAGTCTTTAGTGGCACTGATTCTGGTATCATTGCAGGTAACGTAAAACTTACAACTGGCACCAACTCAACTACTAATACAACTGGTGATCTAGTTATTGCTGGTGGTGCTGGTATCACACAAGATGTAAATATCGGTGGATTGCTAGATGTTGATGGTACTTTCCGTGCTAATAGTACTTCTCGCTTTGACGATAATATCGTTCTACAAGGTGCTTCTAAGACTTTACAACTGAATAATGGTAGTGGCACAACCAAGATTGAATTCCAATCTACAACTGGTAACGGATCTCTTGCTGGTATTCTGGATGTAACTGGAAACCTTAACGTTAATACTGATAAGTTTAATGTTATTGCTGCTTCAGGTAATACATCTATTGCTGGCACATTAGGTGTTACAAGTATCGCAACCTTCTCTAATAATATTGATGCTAACGGTGATGTTGCAATTGCAGGTAACATTCACTCCGAGAGCACCAATGATATCACAGTTCTTAAGAACTCAGGAACAGGTATTTGGGAGATTCAGTCTAATGACTATGGTTCGCTGAAAGTTGATGGTGGTGCATATGTTGCAGGATCTGCTCTGATTGATGGCACACTCCATGTTAACGGTGCTATTGAAGTTAAGGATAGTGCGACAGAGACTGAATCTAGACTTAACTGGTTGCAAGTAAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGATTCTTATCAGGCAACTCCTTCTTATGCATCTCACAATACCACAACTATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGATCTCTACATGTTGGTGGCACAGGAACTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACTCTGGAGATACTCAGAAGTTTTCTGTTCTTGGTGCATCTGGCAATACAACAATTGAAGGCACACTAACTGTTAATGATAATGTAAACTTCAATGGCACTCTTGATCAAGACGGTGACTTTGCTGTCAGAAACGGCACAACGGATAAATTCTTTGTTGCTGCTACCTCAGGCGATACAAATATTGAAGGCACACTGACTGTTGATGGTCACACTGAGTTAAATTCAACTCTTAATGTTGATAACAATGTCACACTTGGTGCTCAGTTAACAGTTACTGGTACAACTGAGTTTAATAATACTGTTGATGTTGATGCCAACTTCGCTGTTAGAAGTGGTAGCACTGATAAGATGACCGTTGCCTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACTATCAATGATTCACTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTCTTCTCTGTCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGACAATGGCAACACAAACATCATTGGCACACTGACTGTTGGTGATGCGGTTCAGATCAATGATACCTTAGGCGTCTCCGATGTTGTAACCTTTACTAGAAACACACAACAATCTATCACTGGCAACTCCATCAGTCTGGATGGTGCCGTAAGAATGTCTGGTGGTCTTGGTGTTTCTAAGAACCTGGCAGTCGGTGAAAACTTAGTTGTTTATGGTGACTTTAATATCATTGGTGATACGGTAGTCAATGGTACTACCACTTATAATGCAAAAATTGATATTACAAATACTGCTGAAGCAGATTCTCTTGGTGATAGTAACGTTGCATTCCAAGTTGATGGTGGCGGTATTATCAGGAAGAAACTCTGGGCAGGAGGAGACTTCACTGTATATGATGATGCAAACTCCAGAAATGCATTCTTTGTCGATGTAAGCACTGGTGATGCAACTTTACACAATGACCTTACAGTTGGAGGAAACCTTACTATCAATGGAACGACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTTTGGGTGGTGACACAGCACCGACAACTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTATGACAGCACTGCGAAAGTGGGTTTCTTCGGACTCGACAGATCGTCGTTAGAATATGTCTTCCTTAATGATGCAACTAACTCATCAGAAGTTCTTTCTGGTACTGATGGACAACTTCGTGCTGGTAGTTTGAATCTTACTGGCAGTGGCACATCTCTTGATGTTGATGCAAATGCAAACATTGATGGCACCCTGACTGTAGATGGTCAGATTATCTCTCAAGTTTCTTCTGGTGCTGCTCTAGTCATTCCTAACACGACTAAGATTAACAACCTGAATGCTGACCTTCTGGACAGTATGACAACTGCTTCTACAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCTGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCAACAACTGCAGATGCACTTAAAACGGCAAGAAATATTACAGTTGCTGGTGTTGTTTCTGGAGATGCTGAGTTTAATGGTTCTGGTGATATTACGATCACTACATCATATGTTGACGCAGACATTACTGCACTCGCCGCTATGGCAGGCACTGGTCTAGTAGCAAGAACTGCTGCTAACACCTACGCACAACGCTCTGTGACCGCCACAGCGTCCTCTGGTATCACTATTACCAACGCAGATGGGGTATCTGGCGATATCACCCTTAACGTCGCTTCTACGAGCACTAACGCATCCAATAACCTTGTCCTTCGTGATGCATCTGGTGACTTTGCTGCAAACGAGATCACTGCTGATCTGGTTGGTGGTGTAACGGGTGACGTTGTTGGTAACGTAACTGGTAATGTTACAGGACAAACTTCTGACATCAGCAACCATGATACTGGTGATCTTACAGAGGGATCCAATCTTTACTATACAGACGCTAGGGCAGATGCAAGAATTGCTGCTGCTGACACTGATGCATTGAGTGAGGGTTCTACCAACCTTTACTACACCGATGCTCGCGCTGATGCACGTATCGCTGCTGCTGATACTGGAGATCTTACAGAGGGATCTAACCTCTATTATACGAATGCTCGTGCTGATGCAAGAATTGTTGCTGCTGGACTTGACGGTGGCACTCTTACTGGTGATGTCACAGGTGATGTCACAGGTAATGTTGATGGTAATGTTTCTGGTGAAGTTACATTAGAGGGTGCTGCACCCGCCAGTGCTACTGCAACTGGAACTGCAGGTGATATTCGTTACGATGCTGATTATATCTACATCTGTGTTGCTACTGACACCTGGAAGAGAGCAGCAATTTCTACCTGGAGTTAA

Tertiary structure

PDB ID
e2d7b43abd3d471e425d281f386850970fdb3f3cb5c88e759fdde08d60c75d68
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5783
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Synechococcus phage S-CAM8 0608SB47 Henn,M.R., Martiny,J., Weihe,C., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank