Protein

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UniProt accession
A0ABZ0YZ95 [UniProt]
Protein name
SbcC-like subunit of palindrome specific endonuclease
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,57
Protein sequence
MDKKCSQLIIGQSIIHSFNPKPFKNMDTAIYALNNKELRAGEIAIAYYNDPTETRGIGAIVATGNILPGGNQIFKNTAYTDKLIKNVKELIESNSVDISVIEENVNNNIADIAVLKTQLKKLTSDINNNSSSIDDKLKEINELIDNMKKDVSNIIDNINKIVADASKSIVDTATSVSKDYLAADTSLKNYVDEENIKINQKIDNISSNFDTKVNEIYNKIDTNTSILENTINNNSSLIYNDISKLDDKVNSYNTSLNTSLAFNVSTLNSRIDDNKDYVDTRESLIRKYVDSKDEQINWNINDTSKHIHYRIDEEVHTLNDRITQEHIDMNRVIADNKTEAKRYADQMLTEAKSYTDEVEEYTKASIKQAELDSKKYTDDEISKLDKNLSETIHNTSLYAKECYDNVKKHLKLQNASLITYVNDEIRMCDERVTDRVNSVKTLVDSTKAQLNTSINKVYENALKYTNNTKNDILKHILINDIKVREDFAKADAVLDKKIDDTSKLLGDYVDNTSNAIVNNIKDTSKLIWDYIDNTSNDIVSYIDNTSNDIVSYIDNTSDAIVAYIDKQDNAQKDYTDAKKTEIINFVEDLSNNFKTYIDTRDNVTLSDAKIYTNGEIQKVNNTITTLDEKVEDYNRNTHELITNVSNGIINDYKTEIKNVIDDVSRNDTWLYNHIEKYNTDLSGKIDTNNQTVTKLLNDVSDGLYQKIEDTSDYLESVITALETKHNDEVKITNTSIMNYVNSYNSSTATAINALNTSINDYWKNITDTINTNLENVNTGVLGRINEIQKDLSTYIETADSTLKSLFENADDGLLGYINDQDTKLQNHIDDISTNIVNKFNTKCSELSNLIDTTKNKLNTSINSVHDTLFQKIENTSTEIVDALNTSISNINIKLGQDKSELIGKIDDISTKIVDALNVSINDINKLLKQKDVELDNKIDTTYTKIIGEMNASDGILNTRITNLETKHVNELNQKVGDLTTLITNTKTELSDQHTRDKNAIITKYDKLTSDNNTAINNVRKDFEAADEAIHTKYDKLCKDNKDELIRKIDDISTKIVNAFNTSIGNVYDELKQVDSNLDIKYKGITDDIITDFNTSIGKVYSELKQADSDLLRKINDASNLIPKAQDGAVTTYEALKYVWSDGNNASDKCVVGAGQTNVVVRDNKVQFVLGAWNNGTTRLRYTEIPETTTTNNGLLSIDSKQKYDNYANEIQTINQTITEVKQNLRTETQTRETEDHKLQTSIDTINNTTIPNLHTTITTEVDNKYDPQITTINGKITSESTKLQGNIDKLKTTLQTDYDTKLSELNTSINNKVYKVLDGRITNEISTVNTNYKAEDSRLQGEIDKINNTTIDKKVNDLKTTLEGKYDPEISTIKQTISDNQSDIINNKLPSLKTTIETDYNKKITDESNERKITDSSLKTDIDLLTGKVNTINNLIGTVDTDNNKNIIQMFKDVNQSITDIKQSIAQLDTRITSLEATGAPHPDIENRLNVLESKYNQITTMSSDITDIKAKLNNINVEHENLYSGVKAYNESLNYD
Physico‐chemical
properties
protein length:1537 AA
molecular weight: 173489,12470 Da
isoelectric point:4,81053
aromaticity:0,05400
hydropathy:-0,68419

Domains

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage phage Lak_Megaphage_RVC_AP3_GC26
[NCBI] 		3109225 Uroviricota > Caudoviricetes > Caudoviricetes code 15 clade >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WQJ51155.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR769219 [NCBI]
CDS location
range 96539 -> 101152
strand +
CDS
ATGGATAAGAAATGTTCTCAACTCATTATAGGTCAATCAATAATTCATAGTTTTAACCCTAAACCGTTTAAAAATATGGATACTGCTATTTATGCTCTTAATAATAAGGAATTAAGAGCAGGTGAAATTGCAATAGCATATTATAATGACCCTACTGAAACAAGAGGAATTGGAGCTATTGTAGCAACTGGTAATATTCTACCTGGAGGAAATCAAATATTCAAAAATACAGCATATACAGATAAACTTATAAAAAATGTTAAAGAATTAATCGAATCTAATTCAGTTGATATAAGTGTAATAGAAGAAAATGTAAATAATAATATTGCAGATATTGCTGTTTTAAAAACATAGTTAAAAAAATTAACATCAGACATAAATAACAATAGTTCGTCAATAGATGATAAGTTAAAAGAAATAAATGAACTTATCGATAATATGAAGAAGGATGTTTCAAATATTATTGATAATATTAATAAGATAGTTGCTGATGCTTCAAAATCTATTGTTGATACTGCAACTTCTGTTTCCAAAGATTATTTAGCGGCAGATACATCATTAAAAAACTATGTTGATGAAGAAAACATAAAAATTAATCAAAAAATTGATAATATTTCATCAAATTTTGATACAAAAGTTAATGAAATATACAATAAAATCGATACCAATACAAGTATACTTGAAAATACAATAAATAATAATTCATCATTAATTTATAATGATATTTCAAAGTTAGATGATAAAGTAAATTCTTATAATACAAGTTTAAATACATCTTTAGCATTTAATGTTTCTACACTTAATTCTCGTATTGATGATAATAAGGATTATGTTGATACACGTGAATCTCTAATAAGAAAGTATGTTGATTCTAAAGACGAACAAATAAACTGGAATATTAATGATACATCAAAACATATTCATTATCGTATTGATGAAGAAGTTCATACACTTAATGATAGAATAACATAGGAACATATTGATATGAATAGAGTTATTGCTGATAATAAAACAGAAGCAAAGCGCTATGCTGATCAAATGTTAACTGAAGCAAAATCATATACAGATGAAGTAGAAGAATATACTAAAGCTTCTATTAAACAAGCAGAACTTGATTCAAAGAAATATACAGATGATGAAATATCAAAGTTAGATAAGAATTTATCTGAAACTATTCATAATACAAGTTTATATGCAAAAGAATGTTATGATAATGTAAAAAAACATCTTAAATTACAAAATGCTTCATTAATTACATATGTAAATGATGAAATCAGAATGTGTGATGAGCGTGTTACTGATAGAGTAAATAGCGTTAAAACATTAGTAGATTCTACAAAAGCTCAGTTGAATACGTCTATTAATAAAGTATATGAAAATGCATTAAAATATACTAATAACACTAAAAATGATATATTAAAACATATATTAATTAATGACATTAAAGTACGGGAAGATTTTGCAAAAGCTGATGCAGTATTAGATAAAAAAATAGATGATACTTCTAAATTATTAGGCGATTATGTTGATAATACTTCAAATGCTATTGTTAACAATATCAAAGATACATCAAAGTTAATATGGGATTATATTGATAATACATCTAATGATATTGTTTCATATATTGATAATACATCTAATGATATTGTTTCATATATTGATAATACATCTGATGCTATTGTTGCATATATAGATAAACAGGATAATGCATAGAAAGATTATACAGATGCAAAGAAAACAGAAATAATTAATTTTGTTGAAGACCTTTCTAATAATTTTAAAACTTATATTGATACCAGAGATAATGTAACATTAAGTGATGCAAAGATTTATACTAATGGGGAAATTCAAAAAGTTAATAATACAATAACAACACTTGATGAAAAAGTAGAAGATTATAATAGAAATACACATGAATTGATTACAAATGTTTCAAACGGAATTATCAATGATTATAAAACAGAAATTAAAAATGTAATTGATGATGTTTCACGTAATGATACATGGTTATATAATCATATTGAGAAATATAATACAGATCTTTCTGGTAAAATTGATACTAATAATCAAACAGTAACAAAATTACTCAATGATGTTTCTGATGGTCTTTATCAAAAAATTGAGGATACTTCAGATTATTTGGAAAGCGTTATTACTGCATTAGAAACAAAACATAATGATGAAGTAAAGATAACAAATACTTCCATTATGAATTATGTTAATTCTTATAATTCAAGTACTGCTACTGCTATTAATGCTCTTAATACAAGTATTAATGATTATTGGAAAAATATAACAGATACAATTAATACTAATTTAGAAAATGTAAATACAGGTGTTTTAGGACGAATTAATGAAATATAGAAAGATTTATCTACATATATCGAAACGGCAGACAGTACATTAAAATCATTATTTGAAAATGCAGATGATGGTCTTCTTGGATATATAAATGATCAAGATACAAAACTTCAAAATCACATTGATGATATTTCTACAAATATTGTTAATAAGTTTAATACCAAATGTAGTGAATTAAGTAATTTAATTGATACAACAAAAAATAAATTAAATACATCAATTAACAGTGTACATGATACATTATTCTAGAAAATAGAAAATACATCTACTGAAATCGTTGATGCATTAAATACATCAATATCTAATATTAATATTAAATTAGGTTAGGATAAATCAGAATTAATAGGAAAAATTGATGATATTTCTACAAAGATTGTTGATGCGTTAAATGTTTCAATTAATGATATTAATAAGTTGCTTAAACAGAAAGATGTAGAATTAGATAACAAGATTGATACTACATACACCAAAATTATCGGAGAGATGAATGCATCTGATGGTATTTTAAATACACGTATAACTAATCTTGAAACAAAACATGTTAATGAATTAAATCAAAAAGTAGGAGATCTTACAACATTAATTACTAATACAAAAACAGAATTATCTGATCAACATACAAGAGATAAAAATGCTATTATTACAAAGTATGATAAATTAACATCTGATAATAATACAGCAATTAATAATGTTAGAAAAGATTTTGAAGCTGCAGATGAAGCAATTCATACAAAATATGATAAGTTATGTAAAGATAATAAAGATGAGTTAATAAGAAAAATTGATGATATTTCTACAAAGATTGTCAATGCATTTAATACTTCTATTGGTAATGTATATGATGAATTAAAGCAAGTAGATAGTAATTTAGATATTAAATATAAAGGAATTACAGATGATATTATTACAGATTTTAATACATCAATTGGTAAGGTATATAGCGAATTAAAACAAGCAGATAGTGATTTATTACGGAAAATTAATGATGCAAGTAATTTAATTCCAAAAGCATAGGATGGTGCTGTTACTACATATGAAGCGTTGAAATATGTATGGAGTGACGGTAATAATGCTTCTGATAAATGTGTTGTAGGCGCAGGTTAGACTAATGTTGTTGTAAGAGATAATAAAGTTCAATTTGTTTTAGGTGCATGGAATAATGGAACAACAAGACTTCGTTATACTGAAATTCCTGAAACTACTACAACAAATAATGGTCTTTTATCTATTGATTCTAAATAGAAATATGATAATTATGCAAATGAGATTCAAACTATTAATCAAACTATTACTGAAGTTAAATAGAATTTAAGAACTGAAACGCAGACACGTGAGACTGAAGATCATAAGTTACAAACTAGTATTGATACAATTAATAATACTACAATACCTAATTTACATACAACTATTACAACAGAAGTTGATAATAAATATGATCCACAAATTACGACAATTAACGGTAAGATAACAAGTGAATCTACTAAATTACAAGGTAATATAGATAAACTTAAAACAACATTACAAACTGATTATGACACTAAATTAAGTGAATTGAATACTTCTATTAATAATAAAGTATATAAAGTATTAGATGGTAGAATTACAAATGAAATAAGTACTGTAAATACAAATTATAAAGCAGAAGATTCTCGTTTACAAGGTGAAATAGATAAGATTAATAATACTACTATTGATAAAAAGGTTAATGACCTTAAAACGACATTAGAAGGTAAGTATGATCCAGAAATAAGTACAATCAAACAAACAATTTCCGATAATCAGTCTGATATTATTAATAATAAGTTACCAAGTTTAAAAACAACTATTGAAACAGATTATAATAAGAAAATAACTGATGAATCAAATGAACGAAAGATAACAGATTCATCATTAAAAACAGATATTGATTTATTAACAGGAAAGGTTAATACTATAAATAATCTTATCGGAACAGTAGATACAGATAATAACAAAAATATTATCTAGATGTTTAAAGATGTAAATCAATCTATTACTGATATTAAACAATCTATTGCTTAGTTAGATACTCGTATAACATCACTTGAAGCAACAGGTGCACCACATCCAGATATTGAAAATAGACTTAATGTTCTTGAATCTAAATATAATTAGATAACAACAATGTCTAGTGATATTACTGATATTAAAGCAAAACTTAATAATATCAATGTTGAACATGAAAATTTATATAGTGGCGTAAAAGCTTATAATGAATCATTAAACTATGATTAA

Tertiary structure

PDB ID
160023c5c1dc70373c3f6f638eda47a4e50cfd67ea31dd7032c9b83a7bf367c6
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4460
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50