Protein

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Genbank accession
WPK34459.1 [GenBank]
Protein name
side tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,76
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQNGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHTNKAPIFTDLSSTTSTSEYHPLIKQRYKNGTFSAGTLVSEGSFKIHYIDETGDSKYWTFNRNGSFIVDNGNIEVRAGNISASGNINSASGVVSAPRVNTKNINLSSKTFIPNNDAGYDIVSLPTWIYNPPADGSDRDTNGLNYMRKMRASNTSSIFHEIVDCRKDKPQEISWWTGVGPSSFQWSFDTTGRIAAGKSISVGLPDNGVNGRYPLESAISIGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDFMANGISSATILNNGINSTKKLMVGYSRDSGTTWDFPNNNQAMFTARTDIDGNNNGDGQTHIGYSSNSKMYHYFRGTGRMAIGMAEGLIVEPGILDIKTSSNTLSLRADGTVASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLVFKAASGIDGTKQIMWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNASGDRTRETVFEVADGQGYYFYSQRVAPTGSETVGPVVTQINGQLNARGSIITDGSLRVNGLSTLSGQVTMDNGLVLSGGGSITGQVKIGNTADAFRIYNAEYGAIFRRSEASLYIIPTPKDAGESGGISNLRPLTIELNTGTVKMSHDVHLGDSGSGTGLLQVSNSLKTIKMICPVTINERNAALTLDSPSSSSANYLQGSKAGTRSWYVGLGGSGNDLSLYSQSYGHGLVISDNFVSITKPFKVGNAQLGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPNGYAIMEGQTFDKSAYPKLAVAYPSGVIPDMRGQTIKGKPSGRAVLSAEADGVKSHSHSASASSTDLGTKTTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSSTTGNHNHTVSGNTSSAGAHQHARSGPQIQGGVPASIFYDGYNSAGPNGNAKITGSVSGATASSNMAKTSSDGAHTHSWSGTTSATGNHAHTVGIGAHTHSVGIGAHTHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1048 AA
molecular weight: 110353,55660 Da
isoelectric point:8,72671
aromaticity:0,07920
hydropathy:-0,36574

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
581–653
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
IPR048388
702–775
IPR048388 SSF88874 SSF88874
IPR037053
796–849
IPR037053
IPR011083
801–848
IPR011083
WPK34459.1
1 1048
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage AV112
[NCBI] 		3077257 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPK34459.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR352942.1 [NCBI]
CDS location
range 56411 -> 59557
strand +
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTAGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGCGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAAATGGAGATTATTTACAGAACGGTACATATAATCTCAATGGAAACCAGTTTGTTTATGCAGGAAAGTATATTGAATTCTTGCCAAAAACTGCTGGAAATGGCGCTTGGGCTAACCAACACACAAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTGAGTTCAACTACTTCAACTTCTGAATACCATCCTTTGATTAAGCAACGTTATAAAAACGGTACTTTTTCAGCAGGTACATTAGTAAGCGAAGGTAGTTTTAAAATTCACTATATCGATGAAACAGGTGATTCAAAATATTGGACTTTTAACCGTAACGGTAGTTTTATTGTAGATAACGGCAATATTGAAGTCCGCGCCGGTAATATTTCGGCTTCAGGTAATATTAACTCTGCTTCAGGGGTTGTGTCTGCGCCACGCGTCAACACAAAAAATATTAACTTGAGTTCTAAAACCTTTATCCCGAATAATGACGCGGGTTATGACATTGTTTCTTTACCTACTTGGATTTATAATCCACCAGCAGATGGTTCAGACCGTGATACAAACGGATTGAACTACATGCGTAAAATGCGTGCATCAAACACATCCAGCATTTTCCATGAAATTGTCGATTGCCGTAAAGACAAGCCGCAAGAAATTTCTTGGTGGACTGGTGTAGGGCCGTCATCTTTCCAATGGTCGTTTGATACCACTGGACGTATTGCTGCCGGTAAATCAATTTCTGTAGGTCTTCCTGATAATGGTGTGAATGGTCGTTATCCGCTTGAGTCTGCAATTTCTATTGGTATTGCAATTGGTGATAACGACACCGGTATTAAATGGGTCCGCGACGGTGTTATTGATTTCATGGCTAATGGTATTTCATCCGCTACCATTTTGAATAACGGTATTAACAGTACTAAGAAATTGATGGTCGGTTATAGCCGCGATTCTGGTACTACTTGGGATTTCCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACTGCTCGTACTGATATTGATGGTAATAATAACGGCGATGGACAGACTCATATCGGTTATAGCAGCAATTCTAAAATGTATCACTATTTCCGTGGCACGGGTCGTATGGCTATTGGCATGGCCGAAGGACTTATTGTTGAACCAGGAATTTTAGATATTAAAACTAGTTCAAATACATTAAGTTTGCGTGCTGATGGTACCGTCGCTTCTGTTCAAACATTAAAGCTTAATAATGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTCTAGTTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGACGGCACTAAGCAAATCATGTGGGAAGGCGGTACTCGAGCAGGTCAGAATAAGAGTTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGCATCCGGCGATCGTACTCGTGAAACAGTTTTTGAAGTAGCTGACGGGCAGGGATATTATTTTTATTCACAGCGTGTGGCTCCAACCGGTTCAGAAACTGTGGGACCTGTTGTAACACAAATTAATGGACAACTGAATGCAAGAGGGAGCATTATCACCGATGGAAGTCTTAGAGTTAATGGATTAAGTACATTATCCGGACAAGTTACTATGGATAACGGGCTTGTTTTATCCGGCGGTGGTTCTATTACCGGTCAAGTTAAAATCGGTAATACCGCAGATGCTTTCCGTATTTACAATGCTGAATATGGAGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGCATCTTTGTATATTATACCTACTCCTAAAGATGCCGGAGAATCAGGAGGTATAAGTAATCTTAGACCATTGACAATAGAACTGAACACTGGTACAGTTAAAATGTCACATGATGTTCATTTGGGAGATTCTGGATCCGGCACAGGATTATTACAAGTAAGTAATAGTCTTAAAACTATTAAAATGATATGTCCAGTAACTATTAATGAACGTAATGCAGCGCTTACTCTAGATTCTCCTTCATCTTCTTCTGCTAATTATTTGCAGGGTTCTAAAGCTGGAACTAGATCTTGGTATGTTGGTCTTGGTGGTTCTGGAAATGATTTATCACTTTATAGCCAATCGTATGGACATGGTCTTGTTATAAGTGATAATTTCGTGTCAATCACTAAACCCTTTAAAGTCGGAAATGCCCAACTAGGAACTGATGGTAATATCACCGGTGGTTCTGGTAATTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGACGGATATTGTCTCAAGTTATCCAATTGGTGCTCCAATTCCATGGCCAACGGATACTCCTCCTAATGGTTACGCTATTATGGAAGGTCAGACTTTTGATAAGTCTGCATATCCAAAGTTAGCTGTTGCATATCCTAGTGGTGTTATTCCAGATATGCGTGGGCAAACTATCAAGGGTAAACCAAGTGGTCGTGCTGTTTTGAGCGCAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCATCAAGCACAGATTTAGGTACTAAGACCACTTCTAGTTTTGATTACGGTAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACAAGTAGTACCACTGGCAACCATAACCATACAGTGAGTGGTAATACTAGTTCCGCTGGTGCTCACCAACACGCGCGTTCAGGCCCTCAGATACAAGGCGGCGTACCCGCTAGCATATTCTATGATGGATACAATAGTGCCGGTCCAAACGGCAACGCTAAAATCACTGGAAGCGTGAGCGGTGCTACTGCATCGTCGAATATGGCCAAAACTTCTTCAGACGGTGCCCACACCCATAGTTGGTCTGGTACTACTAGCGCCACAGGTAACCATGCGCATACGGTAGGTATTGGCGCTCATACCCATTCGGTAGGTATTGGTGCTCATACGCATACTGTTGCAATTGGTTCCCATGGACATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACAGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Tertiary structure

PDB ID
33b83049682ad952fd5c4a08b05f409cab602b4605af3a42620ce72c558e0b54
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5150
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
A collection of diverse bacteriophages for biocontrol of ESBL- and AmpC-beta-lactamase-producing E. coli Vitt,A.R., Sorensen,A.N., Bojer,M.S., Bortolaia,V., Sorensen,M.C.H. and Brondsted,L. 2023 — GenBank