Protein
View in Explore- Genbank accession
- XOD33701.1 [GenBank]
- Protein name
- tip attachment protein J
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MIKIIYKQDPLSEDKTIEHAETLGQWLTSKYDHMPEHVRIFHTTSNMDHAEISFANEVTPKNAYELKQLDFLPGTFIVIENPKGMDPITLAWIVVASIVMGVAVALLMPVPSITQTNQNNNQSSSANNELSNRENKTRVNGRIADIYGAAHDTPDLITVPYKVYENNVEVEHVVGCIGRGHYKINGAYDGETNIVDIAGASVEVFRPGVDIVSGEPYFSLGTEITTPPLTVQHQNSVNGQILRPADTQSLEGTNYLLFAYPNEILRASANNTDLTTKFVSNDRVEITNASFTFNGQTYDLNGTYSVLSVADDRMALSNPAAVNSNWLKLKELSNQQTTALSPKISSIGEKWIGPFILDNVERSRVLCNFVATNGLYTVSAGGNQAAVNVTIEVEVTPVNESGAAIGNPMLKQIILKGSAKSRQTVGATLDFVTFQGRCSVRARRLTPTPAVTTVVDEVKWQALYGAYPLQSTVYEHETVFRARTYATTGALSVKSRKINFDLQRMLPTFKNGAMTTELFPTSSFADALVSMALDDKIGRRTIDEIDLENIYRTYNDVVDYFGTPLAAEFCTTIDDTNLSFEELVTNLCDAVFCTAYRQNNKLKLYFERPTDNSVMLFNFRNIIPDSYKHDLTFGVMDDYDGLIYEYTDPTDDSRINIYLPDKGAKNPKEVKSVGVRNKWQAHFNAYRIWNKLRFQRKSITFDAAPESELLVLRDRIAVADYRNGIHQSGEVVQQEGLILTLSHDVDFIAGKSYVIYLQMGDGTVDLIPVTAGSAKNKVVLGRLPNGALKLSPDDFVNTIYTVVNDDTKGSLPYLVAKREPADQFSNTITAINYDERYYLNDKDFIDVPVDDSPIYIRYDQLDINLARLFQMQRGDLPTTGEISFVVEAGALVSSSSSYRPETRFVYKFDYKSSPAKREYIVPAATELPAIDTGEFPPDLVVNLTIKGAVVGRGGDGGLPHLAYGDWEKDSDFNFTKTRRDGFQGAPGLLNRHSKLNLIIDGGTLARGGSGGGATPSGIYTGLSYGVQGIPGGAGAPFGRVMTGQPITNDSQDWRWYLNGDFMVVKVTDAEASVPGKGYRTQNDRYGSPLSGDGGNWGQRGTKSTNDGTWNWQYHGTTEGQPGPGGPAIVGVAPLTTQLINGGKILQTL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1148 AA molecular weight: 126361,37060 Da isoelectric point: 5,22591 aromaticity: 0,09321 hydropathy: -0,29852
Domains
Domains [InterPro]
NF040662
360–838
360–838
1
1148
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XOD33701.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ568402.1
[NCBI]
CDS location
range 27831 -> 31277
strand -
strand -
CDS
ATGATTAAGATTATTTATAAACAAGACCCTTTATCCGAAGACAAAACAATTGAACACGCCGAAACTTTGGGTCAATGGCTTACTTCAAAATATGACCATATGCCTGAGCATGTCCGTATTTTTCATACCACAAGCAATATGGATCATGCAGAAATTTCATTTGCGAATGAAGTCACGCCGAAGAATGCATATGAATTAAAGCAGCTCGATTTCTTGCCAGGCACTTTCATTGTAATTGAGAATCCCAAGGGTATGGACCCCATAACTCTAGCTTGGATAGTGGTTGCCTCTATAGTTATGGGTGTGGCTGTTGCATTATTAATGCCAGTACCATCAATTACCCAAACCAACCAGAATAACAATCAATCCTCGTCTGCAAATAACGAATTATCAAACCGTGAAAATAAAACTCGCGTAAATGGTCGTATTGCTGATATTTATGGTGCCGCTCACGATACCCCTGATCTGATTACTGTGCCTTACAAGGTATATGAAAACAATGTCGAAGTAGAGCATGTTGTTGGTTGTATTGGTCGTGGTCACTATAAAATTAACGGTGCATATGACGGTGAAACCAACATTGTTGATATTGCCGGCGCATCGGTAGAAGTCTTTCGACCAGGTGTAGATATTGTTTCAGGTGAGCCATATTTTTCGCTTGGTACCGAAATTACCACGCCCCCACTAACGGTTCAGCATCAAAACTCGGTGAATGGCCAGATCTTGCGTCCGGCAGATACTCAAAGCTTGGAAGGTACCAACTATCTTCTTTTTGCATATCCAAATGAGATCTTGCGTGCATCTGCAAACAATACTGATTTAACCACTAAGTTTGTTAGTAATGACCGGGTAGAAATCACAAATGCTTCGTTTACTTTTAACGGCCAGACTTATGATTTAAACGGTACATATAGCGTTCTATCGGTAGCTGATGACCGTATGGCATTGTCTAATCCGGCTGCGGTAAACTCCAACTGGTTAAAGCTTAAAGAGTTAAGTAACCAACAAACAACAGCTTTATCACCAAAGATAAGTTCAATAGGTGAAAAGTGGATTGGTCCTTTCATTCTGGACAATGTTGAACGTAGCCGGGTGCTGTGTAATTTTGTGGCCACAAATGGACTTTATACCGTTTCAGCAGGTGGGAATCAGGCCGCTGTTAACGTCACGATTGAAGTTGAAGTAACGCCGGTTAATGAATCTGGTGCAGCTATTGGTAATCCAATGCTGAAGCAGATCATTTTGAAAGGCTCGGCAAAGTCACGTCAGACAGTTGGTGCAACGCTGGATTTTGTGACATTTCAGGGTCGCTGTAGTGTCCGTGCACGTCGTTTAACACCAACACCGGCGGTTACAACGGTAGTAGATGAAGTAAAGTGGCAGGCGCTTTATGGTGCTTATCCTTTGCAAAGCACAGTGTATGAACATGAAACGGTTTTTCGTGCGCGCACTTATGCAACCACTGGAGCTTTATCTGTTAAGTCCCGCAAGATCAATTTTGATCTTCAGCGGATGTTACCGACTTTTAAAAACGGCGCAATGACGACAGAGCTATTTCCAACATCAAGCTTTGCTGATGCATTGGTTTCAATGGCACTGGATGACAAGATAGGCCGCCGTACGATCGACGAAATAGATCTGGAAAATATCTATCGGACTTATAACGATGTAGTTGATTATTTTGGTACACCACTTGCGGCTGAGTTCTGTACTACGATTGATGATACAAACCTGTCTTTTGAAGAGCTGGTCACCAATCTTTGTGATGCTGTATTTTGTACCGCATATCGGCAAAACAATAAGCTCAAGCTTTACTTTGAACGTCCAACTGATAACTCGGTAATGCTGTTTAACTTCAGGAATATCATTCCGGATAGTTACAAGCATGACCTTACCTTTGGCGTGATGGATGACTACGATGGACTGATCTATGAATACACGGATCCGACCGACGATAGTCGTATCAATATCTACTTGCCGGACAAAGGAGCGAAGAACCCGAAAGAAGTGAAATCCGTTGGTGTGCGAAACAAGTGGCAAGCTCATTTTAATGCGTACCGGATCTGGAACAAGCTTCGGTTTCAACGTAAATCCATCACCTTTGATGCGGCGCCTGAGTCTGAATTGCTTGTGCTACGTGACCGTATTGCCGTAGCAGATTATCGCAATGGTATTCATCAAAGTGGGGAAGTGGTACAGCAAGAGGGTTTAATCCTCACCTTAAGCCATGATGTAGATTTCATTGCAGGCAAGAGCTATGTGATCTATCTGCAAATGGGGGATGGCACAGTGGACCTTATTCCTGTTACCGCTGGATCTGCCAAGAACAAGGTGGTTTTAGGCCGTTTACCGAACGGGGCCTTAAAGCTTAGTCCTGATGATTTTGTGAATACTATCTATACGGTGGTTAATGACGATACCAAAGGCTCATTGCCTTATCTGGTTGCAAAAAGAGAACCGGCTGACCAGTTCTCTAATACCATTACTGCAATTAATTACGATGAACGTTATTACCTCAATGACAAGGACTTTATTGATGTGCCAGTAGATGATTCACCGATTTACATTCGATATGACCAGCTAGATATAAATCTGGCACGTTTATTTCAAATGCAAAGAGGTGATTTACCAACGACTGGCGAAATCAGTTTTGTAGTTGAAGCTGGTGCGCTGGTTTCAAGCTCAAGTTCTTATCGACCGGAAACCAGATTTGTCTATAAATTCGACTATAAGTCTAGTCCTGCAAAACGAGAGTATATCGTTCCTGCTGCAACTGAATTACCAGCGATAGATACAGGGGAGTTCCCACCTGATCTGGTGGTAAATCTGACTATTAAAGGTGCTGTTGTTGGACGTGGTGGAGATGGCGGTTTGCCACATCTAGCTTACGGAGATTGGGAAAAAGATTCTGACTTCAATTTTACCAAAACCCGCCGTGATGGTTTTCAGGGAGCACCCGGTCTATTAAACCGGCACAGTAAACTAAACCTGATTATTGATGGTGGAACTCTGGCTCGAGGCGGCTCAGGTGGTGGAGCAACACCAAGCGGTATTTATACAGGATTATCGTATGGAGTTCAGGGTATTCCCGGTGGAGCTGGAGCACCTTTTGGTCGGGTTATGACCGGACAACCTATTACTAACGATTCACAAGACTGGCGTTGGTACTTAAATGGTGACTTTATGGTTGTCAAAGTAACCGATGCCGAAGCTTCGGTACCCGGTAAAGGTTACCGAACCCAAAATGATCGTTATGGATCTCCATTATCAGGTGATGGCGGAAATTGGGGCCAACGTGGTACCAAGTCTACTAATGATGGAACATGGAATTGGCAATACCATGGCACAACTGAAGGTCAGCCGGGGCCGGGTGGACCTGCAATTGTGGGAGTTGCACCACTGACAACTCAATTGATTAACGGAGGGAAAATCTTACAAACCCTTTAA
Tertiary structure
PDB ID
1e704b7d6fd027563d4b061019abbe809cf0c75ff1481669d47bbdb6cc5680c8
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50