Protein

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Genbank accession
URY15276.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,57
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,89
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRAVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSVRWRALRTDANWTTVSSGPYQLKSGESISVDTAAGNDITFTLPSTPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLITAPVQSIVNFRGQQVRSVLMTHPKSQIVLIFSNRLWQMYVADYSREAVVVTPASLYQAQSNDFIVRRFTSASAINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTAQTIELQLPTDISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQDTTFSFADDIIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLIESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATQTETVAGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTLVRGFVKTSSGSITFVGNDTAGSTQDLELYEKNNYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSVLTISNTGTETHLIFEKGPQTGTNQAQTVTIRVWGNQFSGESDATRSTVFEVSDETSYHFYSQRDKDGNIAFSINGTVMPINVNALGSLNANGVATFGSSVTANGEFISKSSNAFRAINGDYGFFIRNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNAIMGNLTIRDFLRIGNVRIVPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140327,80430 Da
isoelectric point:5,19425
aromaticity:0,07525
hydropathy:-0,31009

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
978–1092
IPR048390 IPR048391
URY15276.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage ESh32
[NCBI] 		2950779 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
URY15276.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
ON528742.1 [NCBI]
CDS location
range 77527 -> 81396
strand -
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGTGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTGCCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATACGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCAGGAGCTTTTAATAGCGTACGCTGGAGAGCGTTACGTACTGATGCAAACTGGACAACTGTTTCATCAGGACCTTATCAATTAAAATCGGGTGAATCAATTTCAGTTGATACTGCAGCTGGTAATGACATTACATTTACTTTACCATCTACCCCAATTGACGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAATCAAGTTTTAATTACAGCTCCGGTACAAAGCATTGTAAATTTTAGAGGTCAGCAAGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAATCACAGATAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTCGCTGATTATAGTAGAGAAGCTGTAGTTGTAACGCCTGCGAGTCTCTATCAGGCGCAATCAAACGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTTCAGCAATTAATATTAAACTTCCAAGATTTGCCAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTGGATAAATTAAATCCTCTTTATCACACAATTGTTACTACATATGATGAAACAACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCTATTGATGGTTTCTTAATGTTTGATGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACGACTAATTCTAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTCATGGTATTTGGCGCGAATAACGGAACAGCTCAGACAATTGAACTTCAGCTTCCGACTGATATTTCTGTTGGTGATACTGTCAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACGGTTAAAATCAAAGCTGCAGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGCTCAGAATATCCGCCTGAAGCTGAATGGGTTACAGTCCAAGAATTAGTTTTTAATGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAGCTCGCTTATATTGAAGATTCTGATGGAAAATATTGGGTTGTACAGCAAAATGTTCCAACCGTAGAAAGAGTAGATTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAGGCTCAAGCTAACGTCGATTTAGAAAATTCTCCGCAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACGTTAGCTAACCGTACTGCTACTGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTTAACCAGGATACTACATTCTCTTTTGCTGATGATATTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACAGCTACTGAAACTCGCAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACACAGCAAGAAACTAATGCAGGAACCGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACCTTTGTATCTACTGCAGGTGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTAGATCAATATAAAGCTACTCCAACGCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGCGAAGTAATTGCTGGACAGAGTCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACACCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGATTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCGACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAATTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAGGTCGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCACAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACACAAACCGAAACTGTTGCTGGAACATCGGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATCGTGCAGAGTGAACCTACCTGGGCAGCTACTACCCTAGTAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCGTCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGCCGGTTCTACCCAAGATTTAGAACTGTATGAGAAAAATAACTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATCTGCCGTTAAAAGCAAAAGCGGTAGATAGTAATTTATTAGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACAGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTTCGGCAAATAGTGTACTAACTATTTCTAATACTGGAACAGAAACTCATCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCAAGCACAGACGGTGACTATTAGAGTGTGGGGTAATCAATTTAGTGGTGAATCAGATGCAACGCGTTCTACTGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACATCTTATCACTTTTATTCTCAACGCGATAAAGATGGTAATATAGCATTTAGCATTAATGGTACTGTAATGCCAATAAATGTGAATGCTTTAGGTTCTTTGAATGCGAACGGCGTTGCAACATTCGGTAGTTCAGTTACTGCTAATGGCGAATTTATCAGTAAATCGTCGAATGCTTTTAGAGCAATAAACGGTGATTATGGATTCTTTATTCGTAATGATGCTGCTAACACCTATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAGACTGGTGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTGACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGCACTAAAACATCTGATTTATATACCCGCGCACCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGATATTAACGATTCGGCCACTTATAATCAATTCCCTGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACCCCAGAAGCTCGTACCACTCGTTGGACACGCACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGACGGAGGTAACCCTCCTCAACCGTCTGATATTGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTATAATGGGTAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTGTTCCTGACCCAGTGAATAAAACGGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
401e328acb0f471a93b0fa45e2b93ac8138eaa0c66a5cbae3c97ffe1ef2cad6a
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5712
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Design of a bacteriophage cocktail active against Shigella species and testing of its therapeutic potential in Galleria mellonella Filippov,A.A., Su,W., Kevorkian,R.T., Sergueev,K.V., Srijan,A., He,Y., Lurchachaiwong,W., McGann,P.T., Ellison,D.W., Swierczewski,B.E. and Nikolich,M.P. — — GenBank