Protein

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Genbank accession
CAB4129148.1 [GenBank]
Protein name
Collagen triple helix repeat
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,55
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MTRANVNVRQILLKRGTTVRSLNYTGPAGEITIDTDLKTLRIHDGLTPGGFVISSNGGNTSALINSINANVTAANLQIVNLWSNAAVQSIGIITSNTQMKSYVDQQISHISLTPGPQGLQGIQGNTGPAGAQGVQGNIGPAGPQGIQGIQGVAGPTGPQGIQGNTGSQGPQGIQGIKGNRGDQGISVTLLGNVAAPENLPFTANAGEAYIVNTTGNLWFWNSTLSSWGDIGPIVGPRGDKGDTGEQGIQGNVGPQGIQGIQGNAGPTGEQGIQGIQGNVGPQGETGPTGAQGPQGVPGSSISGWSVDTFNGFVPNTDNLQDIGTVSNRVRHIYVGPGSISIGDSVLSESVSGKLVVPGLTRATALHADEVEDTSDQTYSFNSTPVIIDQYEYTVRSGLATPSNSYVAAEYIVDGLDGEGFIDGITVDVGGVWTQAIADDNKNNSMYAYIGSSIQEAFNPTHWINIPFRVRAKADDVEYEFSSGGSSDRIVNTDTGDGAYINEQGDIVLFNTDDSGQGVNRALRWDYGSANDGVDSFIRQDGQGLTIQSYADMAYQNGNDIILRTGDSSNEWKFKPTGGLEFPDGTVQTTAYTGQSGGSGGTALYMAINVDGNVMSSTDGVNWTDATDLGIGSLGTVAVGPEKIIYTRSDINGDAQDGETSGPGTGLYTASSPTATPTLIEGTDGDGTNTYFWNQIQYFAGTTYPWVAVGWLYNVSDLKQPILAYSINGVNWSYNMLDGGSFLSTNNFEFTDIAYGNGHYLISSRLDGSSTSSLWATTDLTVTLNGSNWVEVENDFKAVEYFGAQSGSIGYRWLAFTTTAGFYFTSNSDPTVVGDWDQWEPSVIADIIFQETGLTGQSVEEVTSGQVNGFWTFMTSSSNGHIVWWPNAPVGPFVSLPNPYTSTITDIIRNGSGDGLPTTIAFTGGSIPYGDGEKITISGVTSATENGSTTEQSYNGTYYIKNNNGSSELYTDQACTQPWDTSTYWPISNDTGTLTWSHGQYLDALGFANGHFYVGNDDEQLFKSEFDNSGNLTWTKVDDKNNSLAYWNDFAYYGEFSTSSSSSVTIAATAPTGVNGALWFNSNDGRLYLKYSGQWIDASPTEVNSNQVLLSAGGSVVLEGTGDNLAFGFPTLLDIVTDDEDPNALTIRNTNAGLNYGLELFVDNDGVAFISRGDGLGSDTDWLSVSPAGETTISTGGNGANEWKFGNDGTLTLPGPAVGTTSYSRIRTDIAFLNLDVQYNSLNDVYGGARVGTNGSAPFDIVTDFNGTQNTWRFGGELGNFTVPEGGNIIGGGMGRYATYDGTSSSDIVLSAGFNGQFLHFNGSNGNMTIRVPHTTDVLLQIGFIVTIVMDDFGGNIVYINNDYGTDTATINAVGFAPGTTGYWRIGAAGNVTGIYTLMKVDTDRWILSGPDVQVD
Physico‐chemical
properties
protein length:1415 AA
molecular weight: 149340,82670 Da
isoelectric point:4,09573
aromaticity:0,09965
hydropathy:-0,27258

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.10.10.30
9–56
G3DSA:2.10.10.30 IPR050149
IPR041352
13–46
IPR041352 IPR008160 IPR008160
G3DSA:1.20.5.320
271–324
G3DSA:1.20.5.320
CAB4129148.1
1 1415
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured Caudovirales phage
[NCBI] 		2100421 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4129148.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796233 [NCBI]
CDS location
range 227118 -> 231365
strand +
CDS
ATGACCAGGGCCAATGTAAACGTACGACAAATTTTATTAAAACGCGGCACAACTGTACGCAGTTTAAATTACACTGGTCCTGCCGGCGAAATAACAATAGACACAGACTTAAAAACTCTGCGTATCCACGATGGACTAACACCAGGCGGATTTGTAATTAGTTCAAACGGTGGTAATACATCGGCATTGATTAATTCAATTAATGCTAACGTAACAGCTGCTAATTTACAAATTGTAAATTTATGGTCTAATGCTGCTGTACAATCAATTGGTATTATCACATCAAATACCCAAATGAAGAGTTATGTGGATCAGCAGATATCACATATTAGTTTAACACCTGGCCCACAAGGCCTACAAGGTATCCAGGGTAATACTGGTCCTGCTGGCGCACAAGGCGTACAAGGTAATATTGGACCGGCTGGTCCGCAAGGCATACAAGGCATACAAGGTGTTGCTGGGCCAACTGGTCCACAAGGAATACAAGGAAATACCGGATCACAAGGCCCGCAAGGTATTCAAGGCATTAAGGGAAATCGTGGTGATCAAGGTATTAGCGTAACATTATTAGGTAACGTAGCAGCACCTGAAAATTTACCATTCACTGCCAATGCCGGTGAAGCATATATTGTAAACACCACTGGTAACTTATGGTTCTGGAACTCGACATTAAGTAGTTGGGGAGATATTGGTCCTATTGTAGGTCCACGTGGCGATAAAGGTGACACTGGTGAACAAGGTATACAAGGTAATGTTGGGCCGCAAGGCATACAAGGCATACAAGGTAATGCTGGACCAACTGGTGAACAAGGTATTCAAGGCATTCAGGGTAATGTTGGGCCGCAAGGCGAAACAGGACCAACAGGTGCACAAGGACCACAAGGAGTTCCTGGTTCAAGTATATCTGGATGGTCGGTTGACACATTTAATGGCTTTGTGCCAAACACAGATAACTTACAAGACATCGGTACAGTAAGTAACCGAGTACGACATATCTATGTTGGCCCAGGTTCTATCAGCATTGGCGATAGCGTACTATCAGAATCTGTCTCAGGTAAATTAGTTGTTCCTGGTCTAACTCGTGCTACAGCATTACACGCAGACGAAGTAGAAGATACAAGTGATCAAACGTATAGTTTTAATTCTACCCCAGTTATTATTGACCAATACGAATATACAGTTCGTAGCGGATTAGCGACTCCATCTAATTCTTACGTTGCTGCAGAATATATTGTGGATGGATTAGATGGCGAAGGATTTATTGACGGCATTACTGTTGATGTTGGCGGTGTTTGGACACAAGCTATTGCCGACGATAATAAAAATAACTCAATGTATGCTTACATTGGCTCTAGCATACAAGAAGCATTTAACCCTACACACTGGATTAATATCCCATTCCGTGTTCGTGCCAAAGCAGATGATGTTGAATATGAATTCTCAAGTGGTGGCAGTAGCGACAGAATTGTTAACACCGACACTGGCGACGGCGCTTACATTAACGAACAAGGCGACATTGTGTTGTTTAACACAGATGATTCGGGCCAAGGTGTTAATCGTGCTCTACGTTGGGACTATGGTTCTGCTAACGATGGTGTAGATAGCTTTATTCGTCAAGACGGGCAAGGGTTAACTATTCAATCGTATGCGGATATGGCATACCAAAATGGTAACGACATTATCCTAAGAACTGGAGACAGCTCTAATGAGTGGAAGTTTAAACCAACTGGCGGCTTAGAGTTCCCAGACGGTACTGTACAAACTACAGCCTACACTGGACAAAGTGGCGGCAGCGGTGGCACAGCATTGTATATGGCTATCAACGTTGATGGCAATGTTATGTCCAGCACAGACGGAGTCAACTGGACTGATGCTACTGACTTAGGCATAGGATCATTAGGTACAGTAGCCGTTGGTCCGGAAAAGATTATCTACACTCGCAGTGACATAAACGGTGATGCTCAAGATGGAGAAACAAGCGGCCCTGGCACAGGCTTATATACAGCCTCAAGCCCAACAGCAACTCCAACATTGATCGAAGGTACAGACGGAGACGGGACTAACACCTACTTCTGGAATCAAATACAGTACTTTGCGGGCACAACTTATCCGTGGGTAGCAGTCGGTTGGCTATATAATGTTTCCGATCTTAAGCAGCCTATCTTAGCCTATTCTATCAACGGTGTCAACTGGTCTTACAATATGTTGGACGGTGGTAGTTTCCTTTCAACTAACAACTTTGAGTTCACTGACATTGCCTACGGTAATGGCCATTATTTGATTAGTAGCAGACTAGACGGTAGTTCTACTAGCAGTCTATGGGCCACAACAGACTTGACAGTTACTCTAAACGGCTCTAACTGGGTCGAAGTTGAAAACGACTTTAAGGCAGTTGAGTACTTTGGTGCGCAGAGCGGCTCGATAGGGTATCGCTGGTTAGCATTTACTACAACTGCTGGCTTCTATTTTACTAGCAACAGTGATCCTACAGTGGTCGGTGATTGGGATCAATGGGAACCTAGTGTAATAGCAGATATCATCTTCCAAGAAACTGGACTAACAGGTCAATCAGTAGAAGAAGTAACATCTGGACAAGTTAACGGTTTCTGGACGTTTATGACCAGCAGTAGTAACGGACACATAGTATGGTGGCCAAATGCACCAGTAGGTCCGTTTGTATCACTGCCTAATCCTTATACCAGTACTATTACAGATATTATCCGTAATGGATCAGGAGATGGATTACCAACAACTATCGCCTTTACTGGCGGAAGTATTCCATACGGTGATGGTGAAAAGATTACTATTAGCGGTGTAACTAGTGCGACAGAAAATGGCAGTACTACTGAACAAAGTTACAACGGCACTTATTATATCAAGAACAACAATGGCTCATCTGAGTTATATACAGATCAAGCCTGTACACAGCCTTGGGATACCAGCACATACTGGCCAATTAGCAATGATACAGGTACGCTAACTTGGAGTCACGGTCAATACCTCGACGCACTGGGCTTTGCTAACGGACACTTCTATGTTGGTAACGATGATGAGCAACTGTTTAAGAGTGAGTTTGATAACAGCGGTAATTTAACTTGGACAAAAGTTGATGACAAGAACAATTCACTAGCATATTGGAATGACTTTGCCTACTACGGTGAGTTTAGCACATCGTCAAGCTCGTCAGTGACTATTGCCGCCACAGCACCAACAGGTGTTAATGGCGCACTATGGTTTAACAGCAATGACGGACGATTATATCTCAAGTATAGCGGACAATGGATTGACGCAAGCCCAACTGAAGTAAACAGTAATCAAGTATTGTTGTCAGCAGGTGGTAGTGTTGTACTCGAAGGTACAGGTGATAACCTAGCATTTGGATTCCCAACACTATTAGACATTGTTACCGATGATGAAGACCCAAACGCATTAACTATTAGAAACACAAATGCCGGCCTAAACTACGGATTAGAACTATTTGTTGACAATGACGGCGTTGCGTTTATTAGTCGCGGTGACGGCCTAGGTAGTGATACTGACTGGTTATCAGTAAGTCCTGCTGGCGAAACAACTATATCTACTGGTGGCAACGGTGCTAACGAATGGAAGTTTGGTAATGATGGTACCTTGACCTTACCTGGGCCTGCTGTAGGCACAACAAGTTATAGTAGAATAAGAACTGATATCGCATTCTTAAATCTTGATGTTCAGTACAATAGCTTAAATGATGTATACGGCGGTGCTAGAGTAGGAACAAATGGATCAGCTCCATTTGATATTGTTACTGATTTTAACGGAACACAGAATACTTGGCGATTTGGTGGGGAGTTAGGTAACTTTACCGTGCCAGAAGGTGGAAACATTATCGGCGGCGGTATGGGTAGATATGCTACCTATGATGGTACTAGCAGTAGTGACATCGTCTTATCCGCTGGATTTAACGGACAGTTCTTACACTTTAACGGTAGTAATGGCAATATGACAATCCGTGTGCCACATACTACTGACGTACTTCTCCAAATAGGATTTATTGTAACTATTGTTATGGACGACTTTGGCGGTAACATAGTATATATTAACAACGACTACGGAACTGACACAGCCACAATCAATGCTGTGGGATTTGCTCCTGGTACAACTGGTTATTGGAGGATAGGAGCCGCTGGTAATGTAACTGGCATCTACACCCTAATGAAAGTTGATACAGATCGTTGGATCCTAAGTGGCCCAGATGTACAGGTAGATTAA

Tertiary structure

PDB ID
cc0f03d6045aec8bff17950259fe87c1f28ed357a07d9f498920242038941e66
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4574
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50