Protein

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Genbank accession
BBG28761.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,53
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSVRWRALRTDANWTTVSSGPYQLKSGESISVNTAAGNDITFTLPSSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLITAPVQSIVNFRGQQVRSVLMTHPKSQIVLIFSNRLWQMYVADYSREAAVVTPASLYQAQSNDFIVRRFTSASAINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTDISIGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPETKWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNNSTRARLGVIALATQAQANADLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQDTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEATAGKLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTTVRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADSNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVTANSVLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTVRVWGNQFSGELDTTRSTVFEVSDETSSHFYSQRNKAGNITFNINGTVTPINVNASGTLNANGVATFGNSVTATGEIISRSANAFRAINGNYGFIVRNDGSVTNFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140173,73620 Da
isoelectric point:5,54751
aromaticity:0,07215
hydropathy:-0,32839

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
980–1092
IPR048390 IPR048391
BBG28761.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage KIT03
[NCBI] 		2218499 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BBG28761.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AP018932 [NCBI]
CDS location
range 147788 -> 151657
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGACGGTCTGGACGCAGGTGGTGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCAGGAGCTTTTAATAGCGTACGATGGAGAGCGTTACGTACTGATGCAAACTGGACAACTGTTTCGTCAGGACCTTATCAATTAAAATCAGGCGAATCGATTTCAGTTAACACTGCAGCGGGTAATGACATTACATTTACTTTGCCATCTTCTCCAATTGATGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAGGTTTTAATTACAGCTCCGGTACAAAGCATTGTAAACTTTAGAGGTCAACAAGTACGCTCAGTACTAATGACTCATCCAAAATCACAGATAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGCAGAGAAGCGGCAGTTGTAACGCCAGCGAGTCTTTATCAAGCGCAATCAAACGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTTCAGCAATTAATATTAAACTTCCAAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTGGATAAATTAAATCCACTTTATCACACAATTGTTACCACATACGATGAAACGACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGTCGTACATCTATTGATGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACGACTAATTCTAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTCATGGTATTTGGCGCGAATAATGGAACAACCCAAACAATTGAACTTCAGCTTCCAACTGATATTTCTATCGGTGATACTGTTAAGATTTCCATGAATTATATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTTCCAAAACGTTCAGAATACCCACCTGAAACTAAATGGGTGACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAATGGCGAAACCAATTATGTTCCAGTTTTACAGCTTGCTTATATCGAAGATTCCGATGGAAAATATTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACCGTAGAAAGAGTAGACTCTTTAAATAATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAGGCTCAAGCTAATGCTGATCTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTGGCAATTACTCCAGAAACGTTAGCTAATCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATTGCAAGAATAGCAACAACTGCGCAAGTAAACCAGGATACCACATTCTCTTTTGCAGATGACCTTATCATCACTCCTAAAAAGTTGAATGAAAGAACAGCTACTGAAACTCGCAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAAGAAACTAATGCAGGAACCGATGATACTACAATCATTACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACCTTTGTATCTACTGCAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGCCGTGAATTAAATGGTACGAATGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCGCCAAAAGCTTTGGACCAGTATAAAGCTACGCCTACTCAACAGGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGTCAAAGTCAAGAAGGATGGGCAAATGCTGTTGTAACGCCAGAAACGTTACACAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGATTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACTAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACACTTCGTGTGGCTACACAAGTTGAAGCTACTGCTGGAAAATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCACAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACCTGGGCAGCTACTACTACAGTAAGAGGCTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTTGTCGGTAATGATACAGTCGGTTCTACCCAAGATTTAGAACTGTATGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCATACGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTACCGTTAAAAGCAAAAGCTGCTGATAGTAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCGCAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTACAGCAAATAGTGTACTAACGATTTCTAATACTGGAACAGCAACTCGATTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACAAACCCAGCCCAAACGATGACTGTTAGAGTGTGGGGAAATCAATTTAGTGGGGAATTAGATACAACACGTTCTACCGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACATCTAGTCATTTTTATTCTCAGCGCAATAAAGCCGGAAATATAACATTTAATATCAACGGTACAGTAACACCGATAAATGTTAATGCTTCAGGAACATTGAATGCAAATGGCGTAGCAACATTTGGTAATTCAGTCACTGCAACTGGTGAAATTATTTCTCGAAGCGCAAATGCTTTCCGTGCTATTAACGGAAATTATGGTTTCATTGTTCGCAATGATGGATCAGTAACGAATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAGACTGGTGGATTTAATGGATTACGTCCTTTGGCTATTAATAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATCGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTGACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAAGGTACTAAAACATCTGACTTATATACACGTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGATATTAACGATTCAGCTACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGTCTTCCATATTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACACTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACACCAGAAGCGCGTACCACTCGCTGGACACGCACATGGCAGAAAACCAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAATCCTCCTCAACCATCTGATATTGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGTAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
f09a336eb38013080b3c0252dec1fc1320fba02b8dc445fa8bd048a247b1bae3
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5527
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of bacteriophage KIT03, a T4virus infectious both E. coli O157:H7 and Salmonella Pham-Khanh,N.H., Nakayama,T., Truong,T.B.V., Miyanaga,K. and Kamei,K. 2019-07-24 — GenBank