Protein
View in Explore- Genbank accession
- AUZ95334.1 [GenBank]
- Protein name
- high-affnity carbon uptake protein Hat/HatR
- RBP type
-
TSPTSP
- Protein sequence
-
MSIIIDNYKNVNIGFAYSMAKLSPNGRFIALSPNSGASITTQHIYDTVTETLLQISSPARVPTEAIAFSPNGNKLYVGCANNGTILVFEYTTSWAYVSSIVSSDNTATIHSIAVGADNIDIAWVEGLNVFKFYNTTTTTYYAGGGTLVATNTAVPFIYADTARKASDTNYFVFGRPTSGAGGTAYIIKQDSTYLLLQAQSNINISNVNMSGSGTVNYVSFNSSSSATAGIRYYNNDIMNSSAVLSISQNNVNGGSVVCQIDEATSLRYARVSPGLMSVGQIAGYNVIDPVNYTITSPFTISGDMQIFNKTVINYSNNNGTFLEYATIKNTDGNETITVNNDQASGLLNRYYAATNYVVSENGKKYLYTNINNTLQMGNVVNGVPINNNVGNPAGTTNNIIANNAAISPNGRHAFIVDATTLYHYTNSLNTALASRKFTYPVGSAGSRQMSVSPDSKLLAFPDGTSLKVYSISETGLTALTVPATNQVWATAWFSPTEFYGMTTSSVIFYRVSGSTVTQVGTMSVGTSLYSMAISNDRTKLAFTSFAAAGSPYFANINPSDFTQLGVIRRGNAPPGGFFSNNYYGSFSPDGNKFVLCGAISSATNNLIVYDTTEININTIYVLGNRSISYSFAYRPQWINNNIFKIAVNANTVSLHDFSVINGVLTEITNFNVTTDVNNSIGDNTWGTGISPDGKYIIRPVAAAKPDLIYLIAPDTDSFTDPLPFKSTITTSCTISSDSKYMMLPGPATNGNGTVDFYEKTSEGIPVPVQQFTGLPWVTALATSGTLGDYSPVSKMFAVPYGRTLLLFINNEDGTFTNISKYDLTANRLVARFSNDGSLLYVAGATSSTGVDIYDRVGNDYVYRTTIATTTGVTRIDFSPNGQYVLLSYNNAAPYLNVYSIAPDGTFDTLIASTPFNALSLGRWLTDTLLFVVVNNNGYGYYYVADFFADKGVIIPRNWNGTTLGGGMKQNISISNTGSKKLIVLGHATEIAFGSSTTTASLNNFTSLYAFKMVDTATNISGATVIPSITTEIISETDLALFGDVSINSITTTGEIEAPNAIYGDVLVPSPFSVDGFIGEDSSSAITTVTLSTAFIDLNGYNYELSYTPLPQPYAYGKTRFGSISTIGQLYIDNELYGDTLIPMFVVEGDMNLPPQFEGDVLINNIITEGDLYEEQFLSGETVIDSITSSGALSQGETIDIGILLPSFEISGEFLLEPEIYGDTLLPSFETDGLFTVPQNASGDVLIPSIVTEGRLSDGEDITGEVIIPSIETTGYVTSGENISGETLIPFIITSGELITDLAIDSDTIIGPISTSGILASGDFVTGDVNISNIITEIVGDVLNPGEITGDTLISNIITEGIMAQEGAITGDVVISNIITNGVLSRQIDVEGSIILNSIETEIVAELQLHLSGNVIINSFTTTGELKKIAGRRRFLNIV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1438 AA molecular weight: 153742,89770 Da isoelectric point: 4,34150 aromaticity: 0,10014 hydropathy: 0,07691
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Agrobacterium phage Atu_ph07 [NCBI] |
2024264 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AUZ95334.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MF403008
[NCBI]
CDS location
range 409869 -> 414185
strand -
strand -
CDS
ATGAGTATCATTATCGACAACTACAAAAATGTTAATATCGGTTTTGCTTATTCTATGGCAAAGCTTTCTCCAAATGGTCGTTTTATTGCCCTATCTCCTAACTCTGGAGCATCTATTACAACCCAACATATTTACGATACGGTGACGGAGACTCTATTACAAATTTCGAGCCCTGCACGTGTTCCTACTGAGGCAATTGCTTTTTCCCCAAATGGAAATAAATTGTATGTCGGGTGTGCAAATAATGGTACTATCCTAGTATTTGAATACACTACATCGTGGGCATATGTTTCAAGTATAGTTAGTTCCGATAATACCGCAACAATTCATTCTATCGCTGTTGGTGCAGATAACATCGATATCGCGTGGGTTGAAGGCTTAAACGTTTTTAAATTTTACAATACAACCACTACCACATATTATGCTGGAGGTGGAACGTTAGTTGCCACAAATACCGCTGTTCCATTTATATATGCAGATACCGCTCGAAAAGCGTCTGATACAAATTATTTTGTATTTGGTAGACCAACGTCAGGCGCTGGTGGAACTGCCTATATTATTAAACAAGATAGCACATATTTATTATTACAAGCTCAGTCAAATATTAACATATCTAACGTTAATATGTCTGGAAGCGGTACAGTTAATTACGTGTCATTTAACTCCTCAAGTTCTGCAACAGCCGGTATTAGATATTACAATAATGACATAATGAATTCTAGTGCTGTATTGTCAATTTCGCAAAATAACGTTAACGGTGGTTCAGTTGTTTGTCAAATTGATGAAGCAACCAGCCTACGATATGCTCGTGTTAGTCCCGGTTTAATGTCTGTTGGGCAAATAGCAGGTTACAACGTTATCGATCCTGTAAACTACACAATAACGTCTCCTTTTACTATTTCTGGAGACATGCAAATCTTCAATAAGACTGTTATAAATTATTCAAATAATAATGGCACATTTTTAGAATATGCCACCATAAAAAATACCGATGGTAATGAAACCATTACCGTAAATAATGATCAAGCAAGTGGTCTTCTCAATCGCTATTATGCTGCAACAAATTATGTTGTATCTGAAAATGGTAAAAAATACTTATATACCAACATCAATAACACTTTACAAATGGGTAATGTTGTCAACGGCGTTCCTATTAACAATAATGTCGGTAATCCGGCAGGGACAACAAATAATATCATCGCAAATAATGCGGCGATTAGTCCAAATGGTAGACACGCTTTTATAGTAGATGCAACAACATTATATCATTACACAAATTCGTTGAATACCGCTCTTGCATCTCGTAAATTCACATATCCTGTAGGGTCAGCAGGATCGAGACAGATGTCTGTATCACCCGATTCTAAATTATTAGCATTTCCAGATGGCACCTCTCTAAAGGTATATTCTATTTCGGAAACCGGCCTAACCGCACTTACTGTTCCGGCTACTAACCAAGTTTGGGCAACTGCGTGGTTTTCACCTACTGAATTTTATGGAATGACAACATCAAGTGTTATTTTCTATAGAGTCTCTGGTTCAACCGTGACGCAAGTTGGAACGATGTCAGTTGGTACAAGCTTATATTCAATGGCTATCAGTAACGATAGAACTAAACTCGCATTTACCTCGTTTGCGGCGGCAGGATCGCCTTATTTTGCAAATATAAATCCATCAGATTTTACTCAATTAGGTGTGATTAGACGTGGTAACGCACCTCCCGGTGGATTTTTCTCAAACAATTATTATGGTTCCTTTAGTCCTGATGGTAATAAGTTTGTATTATGTGGTGCTATTTCTTCTGCCACTAACAATCTCATTGTTTATGATACAACAGAGATTAATATCAATACAATTTATGTGTTGGGAAATAGATCAATATCATATAGTTTTGCATATAGACCTCAATGGATTAATAATAATATTTTCAAAATAGCGGTTAACGCTAATACTGTATCATTACACGATTTCAGTGTAATCAACGGCGTGTTGACTGAAATAACTAATTTTAACGTTACAACAGACGTTAATAATAGTATTGGCGATAATACGTGGGGTACTGGTATTTCCCCTGATGGTAAATATATTATTCGACCAGTAGCGGCGGCCAAACCTGATCTTATCTATCTCATTGCACCGGATACTGACTCTTTTACTGATCCGTTACCTTTTAAAAGTACAATAACAACATCTTGTACTATTTCATCAGATTCGAAGTATATGATGTTACCCGGTCCAGCTACTAATGGAAATGGTACTGTTGATTTTTATGAAAAAACATCCGAGGGTATCCCTGTGCCGGTACAACAGTTCACCGGTCTTCCGTGGGTTACCGCACTTGCAACTAGCGGTACGTTGGGTGATTATTCTCCTGTATCTAAAATGTTTGCGGTTCCGTATGGCCGAACGTTGTTACTATTCATAAACAACGAAGATGGTACTTTTACAAACATCTCAAAGTATGATCTTACCGCCAATCGTCTGGTTGCTCGTTTCTCAAATGACGGTTCATTGTTGTATGTTGCAGGTGCAACGTCATCTACAGGGGTTGATATTTATGATCGTGTAGGTAACGATTATGTATACCGTACCACTATAGCAACAACTACTGGTGTTACCAGAATAGATTTTTCACCAAATGGTCAATATGTTCTATTAAGTTATAATAATGCAGCACCATATTTGAATGTTTATAGTATTGCGCCGGATGGAACATTTGACACCCTCATCGCATCTACACCATTTAACGCGCTATCCCTCGGCAGATGGCTTACAGATACCTTACTATTTGTTGTCGTTAACAATAATGGATATGGATATTATTATGTAGCTGATTTTTTTGCTGATAAAGGTGTTATTATTCCACGAAACTGGAATGGAACTACTCTCGGCGGCGGGATGAAACAAAATATTAGTATTTCCAATACTGGTAGTAAGAAATTAATCGTCTTAGGCCACGCAACCGAAATAGCGTTTGGATCATCGACAACAACCGCCTCTCTTAATAATTTCACCTCATTGTATGCATTCAAAATGGTAGATACCGCAACCAATATATCAGGGGCTACGGTAATACCATCGATAACAACCGAAATTATAAGCGAAACAGACCTCGCTTTGTTTGGTGATGTATCAATAAATTCGATTACTACCACAGGTGAAATCGAGGCACCAAATGCGATTTATGGCGACGTTCTCGTACCATCACCGTTCTCGGTGGACGGGTTCATTGGCGAAGATAGTTCATCAGCAATCACAACCGTTACATTGTCGACGGCATTTATTGATTTAAATGGTTATAATTATGAATTATCATATACGCCATTACCACAACCGTATGCTTATGGTAAAACACGTTTTGGCTCCATATCCACTATAGGCCAATTATATATTGACAATGAGTTATATGGTGACACCCTTATCCCTATGTTTGTTGTTGAAGGCGACATGAATCTTCCTCCACAATTTGAGGGTGACGTATTAATTAATAACATAATTACAGAAGGCGATCTATACGAGGAACAGTTCTTAAGCGGAGAAACTGTTATAGATAGTATTACATCTAGCGGCGCATTATCACAAGGCGAAACTATCGATATAGGTATACTATTACCTTCGTTTGAAATTTCTGGAGAATTCTTGTTGGAACCGGAAATTTACGGTGACACATTATTACCGTCATTTGAAACTGATGGATTGTTTACCGTTCCTCAAAATGCATCCGGTGATGTATTGATACCGTCTATTGTAACTGAAGGTCGTTTGAGTGATGGTGAGGATATTACTGGCGAAGTAATAATTCCTTCAATCGAAACTACAGGATATGTAACCTCAGGAGAAAATATTTCTGGAGAAACATTAATACCATTCATAATTACAAGCGGTGAATTGATAACAGACCTCGCAATTGATAGTGATACTATCATTGGACCAATATCAACATCAGGTATATTGGCATCAGGAGACTTTGTAACCGGTGATGTCAACATTTCAAACATTATTACTGAAATTGTTGGAGACGTATTAAACCCCGGTGAAATAACAGGTGACACCCTAATTAGTAATATTATCACCGAGGGTATTATGGCGCAAGAGGGCGCTATAACAGGTGATGTTGTAATAAGTAATATCATTACGAATGGGGTTCTTTCACGTCAAATAGATGTTGAAGGATCGATTATTCTAAACAGTATCGAAACCGAAATTGTAGCTGAATTGCAGTTACATTTATCTGGAAATGTAATTATTAACAGTTTTACAACCACAGGTGAATTGAAGAAAATAGCAGGACGCAGACGTTTCTTGAATATAGTATAA
Tertiary structure
PDB ID
08bbe0b5cf15dcffac63b47f5795868bed21612005686472ca3a3b8a59e7e2d0
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50