Protein

View in Explore
Genbank accession
QLF86075.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,74
Protein sequence
MANFNKSFNFRGGFQVDETTFIVRGEKVGIGSSVPDTLLDVNGTITAKGLAIDSSADVIIESANVGFLSATTIHVGVASISAGIITSATPTGIVTYYGDARFLQGLPTSQWIDTDVGLGYTSIYAAGNVGVDTTDPRYAFQVGGVPFPTIDGPPLPAQDGVGIENGNVYASGIVSTRGEFIGLGSNITAIDGSNITVGAIGSMAYGPLIVTEEVIADRFTGIASTAISVTPDATLEFDTATANEFNAVNRFVSTTGKLQIGDDSTSSAVGDIDVFKTGSNSSVYSLSNQVSKLFVGAQRQSGQARQFGGLRHGLVGSDPLTQINDLDLVNYDIGNLNFYLHSGSGGPGITTGAFRWIYGQTGFSLAELSKEGVFSLKGNGVSGSIVLEVAGISSFSDAVYINGDLNVPAGNNVDIGADITVSGNFDFSGSTITFPDQVTMEELIISDTLTVGNPLSDFVTITSTQISNGNSIIGNGTINSTSIQGDTINGTSVNATELQYTTSLVGPQFSINSLGDLQASSITSASASLSSIISTDITTGSLSVTSSLSVINANVTTITSDTVNSTNINGTTLDISGTSTLNDISSNSIDTPLANITAVNTNSIAPLSSSSISIPGDIDGAGNGTITDFSELNSSLVNCTTLRVDQIEIAPGLFSSTSVRLTFISDSVPDGAYVDLTLTPLPSN
Physico‐chemical
properties
protein length:684 AA
molecular weight: 70164,49400 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,06725
hydropathy:0,16184

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-CAM7
[NCBI] 		1883368 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QLF86075.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT586120 [NCBI]
CDS location
range 26312 -> 28366
strand +
CDS
ATGGCTAATTTTAATAAGTCCTTCAATTTTAGAGGTGGATTCCAGGTCGATGAAACAACTTTCATCGTCCGTGGAGAGAAGGTGGGCATTGGTTCCAGTGTCCCCGATACTCTCCTAGATGTAAATGGAACCATCACAGCTAAAGGACTGGCTATTGATTCTAGTGCTGATGTTATTATAGAGAGTGCGAATGTAGGTTTCTTAAGTGCTACAACTATTCACGTTGGTGTTGCTTCTATTAGTGCTGGTATTATTACATCAGCAACTCCAACTGGAATCGTCACATACTATGGCGATGCAAGATTTTTACAAGGACTACCAACTTCGCAGTGGATTGATACTGATGTTGGGTTAGGCTACACAAGTATCTACGCAGCTGGTAATGTTGGTGTAGATACAACAGATCCCCGTTATGCCTTCCAGGTTGGTGGTGTTCCTTTCCCCACCATAGATGGACCACCACTACCCGCACAGGATGGCGTAGGTATTGAGAATGGTAATGTATATGCTTCTGGTATTGTATCTACCCGTGGTGAGTTTATTGGTTTAGGTAGTAATATCACTGCTATTGATGGTAGTAATATTACTGTTGGTGCTATTGGTTCTATGGCTTATGGTCCTCTAATTGTAACAGAGGAAGTCATTGCTGATAGGTTCACTGGTATTGCTTCTACAGCTATTAGTGTAACTCCTGATGCTACACTAGAGTTTGATACTGCAACAGCTAATGAGTTTAACGCAGTAAATAGATTCGTATCTACCACAGGTAAGCTACAGATAGGTGATGACTCAACATCTTCCGCTGTAGGTGATATTGATGTATTTAAGACTGGTTCTAATTCATCAGTATATTCACTATCAAATCAAGTATCCAAGCTATTTGTAGGGGCACAAAGACAATCTGGTCAGGCTAGGCAGTTCGGTGGACTACGACACGGATTAGTTGGTAGCGACCCACTCACTCAAATTAATGACCTTGACCTAGTAAACTATGATATTGGTAATCTAAACTTTTATCTACACTCTGGTAGTGGTGGTCCAGGTATTACTACTGGTGCTTTCCGCTGGATATATGGTCAGACTGGCTTCTCTCTAGCAGAACTATCCAAAGAAGGTGTATTTTCACTGAAAGGTAATGGTGTTTCTGGTTCTATTGTATTGGAAGTTGCTGGTATCTCTAGTTTTTCTGACGCAGTATATATTAACGGAGACTTAAACGTTCCCGCAGGGAATAATGTTGATATTGGTGCTGATATAACTGTTAGTGGTAATTTTGACTTTAGTGGTAGTACTATAACCTTCCCAGATCAAGTTACAATGGAAGAATTGATAATAAGTGATACTCTCACAGTTGGTAATCCATTATCAGATTTTGTAACTATTACATCAACGCAAATATCTAATGGAAATAGTATTATTGGTAATGGCACTATCAACTCTACTTCAATTCAGGGTGATACAATTAATGGTACATCTGTAAATGCAACAGAATTACAATATACCACATCTTTAGTTGGTCCTCAATTCTCAATAAATTCTCTGGGTGATCTACAGGCATCTTCAATAACATCTGCATCTGCATCATTATCATCAATTATATCCACAGATATTACTACTGGCAGTCTTTCTGTTACTAGCTCTTTATCTGTAATTAATGCAAATGTAACTACAATTACTTCGGATACGGTTAATTCTACTAATATTAATGGAACAACATTGGATATTTCGGGAACCAGTACATTAAATGATATATCTTCCAATTCTATAGATACCCCTTTAGCAAATATAACTGCGGTTAATACTAATAGTATTGCTCCACTTAGTTCATCATCTATCTCTATACCTGGAGATATTGATGGCGCTGGAAATGGAACTATCACAGATTTTAGTGAATTGAATTCTAGTTTAGTTAATTGTACAACACTTAGAGTTGATCAAATTGAGATCGCTCCAGGATTGTTTAGTTCAACTAGCGTTAGATTGACCTTCATTAGTGATTCAGTTCCCGACGGTGCTTATGTTGATCTTACATTGACCCCACTTCCATCTAACTGA

Tertiary structure

PDB ID
4186c11c5ad2137514022c18cb405abe80373066a594fc9387844bd93bc80c22
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4872
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Signatures of coevolution in a cyanophage population Abebe,J. 1984-06 — GenBank