Protein

View in Explore
Genbank accession
QGT54278.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,72
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MALNRLENFLKSSRGKVLHVNPENLDSTDAISNDGSSPFTPFKTINRALMEASRYSYQIGLGNDRFNFCTILLYSGEHLVDNRPGAVISDNGIVRVRSGSTTIINQFDINTILDITNSNNKLYLLNSVHGGVIVPRGTSIIAQDLRKTVVRPLYVPDPISSDAVDENIERSAIFRITGASFFFGFSILDASPNGFCYKNYNTSKFTPNYSHHKLTAFEYADGVNPVKIRDAFINLDTTRTDLDQYYEKISLVYGVSSGRTITDVNYVGGVSVDIQPIIDEYRIVGPRGEVVGISSIISGDGVTPSKVITVTLDGPATGISVDTSIQVSDVNEIGYDGQYVVAAIPTTNQVQYITPNIPTDPNPPLFGATLNIISDTISSASPYVFNVSLRSVYGMCGLHADGSKVTGFKSVVVAQFTAVCLQKDDNAFVIYDEDSGNYVDSSVIPDLYKNTRSRYKPEFENYHIKVSNDSFAQLVSVFSIGYATQIVAESGGDYSITNSNSNFGAKTFISSGYKKDSFDQDDHGYIIGVIPPEEVNVDPVTVEFAQIDIGLTKSVSVGIGTTNRLYLYNKTDINSPPNVIMDGFTVGAKINDTINIELPTRASSKIVIPNTESSYAKSFNVQRQNNDFENAITGGVLTLTQSHTFEAGEKVRVLSENGHLPDGLDDRVYYIIESSIDNTLLNTQVKLATTFNNSINNISILPNRKGGVLSIVSRVHDKIANDPGHPIQWDSVNNNWYITVSETDNGIYSVIIPLSIDSTGRTFVIRTPDRRTEQNKLYKLIYSIPKNTATAARPPINGYIIQESNNSSLTNEELSRYFGSSSLTVDNEIRNPRFISDIRWVSGEIIVTTELPHKLNVGDFTEIVNVLPVGYNGTYQVLRTPSSRSFVYTSTNNPGIFSNDTRNRNIDLPYIKRKEIRDVFQIYKSEEVQKFIRDKQDGIYELTVIHNSVAPTVAPFTEFKFSQPLTNLYPRLDRDNLNIDPDPTVCFADSNLIGSVLVNNPENSVTKESFNKFNSDLVVGFGVTGIVSNQTGTSHTIYTSVDHGLAGITSVSVVSTGASYISGTYYGVGVGTTSGGISASFKVVVDGTQRVSSVSLMNGGSNYSVGNRISIISGIGTTTGFIPAVLNVTAIADSIDNSVSVSGFCEKYSNYNDAYRITEIKNSNQVIVSSASTIIGFSTSIVPIIGAGIINGKIIPIVSLTYNNVTGISTVTLGRSSGIKLNSKIRITGFNSDLYNQDVVVTKVNSLTQVEVKTGISTTTPLTSGSGIVIPLGISPIIGKNRNSYYYSGISTTTGSALNSNASDSTPLNIRNATVTGLNQGDFIEVNGEIMRIKSPITSNLVPVYRGVFGTERTTHPTNSLVKKVQIIPVELRRNSIIRASGHTFEYVGYGPGNYSTALPENQDREISTKERLLSQATKIGGGTIYYSGMDENGDFYSGNRKLSSSTGQEEVYDLPIPTVVGEYSTPNIAESDKLIVSSSITVNGGENNNAVSEFNGPIILNKKLTSYSPDGIETTSLFLQGDQEISRRHSISEDTPIIVGNYGDILYRATPNEGENIGWVYTTNNRWKTWGYVGDLGTLVYLYSGTESTSTLEGIVDSLKIVGDPNGFGIDVDIQIDPVVGFGTIVLRNPISIINFGTELSRNNPTFTNRSGGSRLVYYNNLNTTNVDYATGVSANSLWNSIPINDSSVNFKWFAGETEIASLNGVGNLTIAGTLNVSGGITGTITGNVTGNLTGTATSSITSANLTRSVVAGDGLAGGGSLNGQDVTLNIGTVVNGGIQVDGDSIQVDSTVVRTSGTQSISGAKTFNDGVSVTGNTSSTTFTGNGIAPIGGIIMWNGTFAEAATLQPGWAICDGRTVSGRTTPDLRNRFIIGSAGDSGGISVATITGGVTKTGGNKDSIVVSHSHTGSTTGAGGHIHDVSDPGHSHNATAAVTGAAFPSLASSGSLGLVVANTTISTTGSGTGISISAVGNHTHGLSIDATGGSGTDANLPPYYALAFIMRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:2005 AA
molecular weight: 214508,17380 Da
isoelectric point:5,24819
aromaticity:0,07980
hydropathy:-0,13047

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:6.10.140.2190
1776–1817
G3DSA:6.10.140.2190 IPR037053
IPR040956
1789–1808
IPR040956 SSF88874
QGT54278.1
1 2005
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage B3
[NCBI] 		2674978 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QGT54278.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN695334.1 [NCBI]
CDS location
range 18006 -> 24023
strand +
CDS
ATGGCGTTAAACCGTTTAGAGAATTTTCTGAAGTCTTCTAGAGGAAAAGTTCTTCATGTAAATCCAGAAAATCTGGATTCAACTGATGCAATTTCAAATGATGGTTCCTCACCATTTACTCCGTTTAAGACCATCAACAGAGCCCTCATGGAGGCTTCAAGATATTCTTATCAAATTGGTTTAGGTAATGATAGATTTAATTTCTGCACCATTCTATTATACTCAGGTGAACATCTTGTAGATAATAGACCAGGTGCAGTAATAAGTGATAATGGAATAGTAAGAGTAAGAAGCGGTTCTACTACAATAATCAACCAGTTTGATATAAACACTATTCTTGATATCACAAATTCCAATAATAAATTATACCTCTTAAATTCTGTTCATGGTGGAGTGATAGTTCCAAGAGGAACATCTATTATTGCACAAGATTTAAGGAAAACAGTAGTTAGACCATTATATGTTCCAGATCCTATAAGTAGCGATGCTGTCGATGAAAACATAGAAAGATCCGCTATTTTTAGAATTACTGGGGCTTCTTTTTTCTTTGGTTTTAGTATTTTAGATGCAAGTCCAAATGGATTCTGTTATAAAAATTATAATACTTCTAAATTTACTCCAAATTATTCACACCACAAATTAACCGCATTTGAATATGCTGATGGGGTGAATCCAGTAAAAATAAGAGATGCTTTTATTAATCTAGATACTACTAGAACTGACCTAGATCAATATTACGAAAAGATTTCTCTGGTTTATGGTGTTAGTTCTGGTAGAACTATAACTGATGTAAATTATGTTGGTGGAGTATCTGTCGATATTCAACCAATTATTGATGAATATCGAATTGTTGGACCTAGAGGAGAAGTTGTAGGTATTTCAAGTATTATTTCTGGTGATGGTGTAACGCCATCAAAAGTAATCACCGTAACTCTAGATGGACCAGCAACTGGTATTTCAGTAGACACTTCTATTCAAGTTTCTGACGTTAATGAAATAGGATATGATGGACAATATGTTGTTGCCGCTATTCCAACAACTAATCAGGTTCAGTACATAACACCGAATATTCCAACTGATCCAAATCCACCATTATTTGGTGCTACGTTAAACATCATATCTGATACTATATCATCAGCGTCACCATATGTTTTTAACGTATCATTAAGATCCGTTTATGGCATGTGTGGCCTACATGCAGACGGTAGTAAAGTTACTGGATTTAAGAGTGTAGTTGTTGCACAATTTACTGCTGTTTGTTTACAGAAAGACGATAATGCATTTGTAATTTATGATGAAGATAGCGGTAATTATGTTGATTCATCAGTAATACCAGATCTCTATAAAAATACCAGATCAAGATATAAGCCAGAGTTCGAAAACTACCACATTAAGGTATCTAATGACTCTTTTGCACAGCTAGTTTCTGTTTTCTCTATTGGATATGCTACTCAAATTGTTGCGGAAAGCGGTGGTGATTATTCAATCACTAACTCAAACTCCAACTTTGGGGCAAAGACCTTCATTTCTTCTGGTTATAAAAAGGACTCATTTGATCAAGATGACCACGGATACATTATAGGTGTAATTCCACCCGAAGAAGTAAATGTAGATCCAGTTACAGTTGAATTCGCTCAGATTGATATTGGTCTGACTAAATCTGTTTCTGTGGGAATCGGCACCACAAATAGATTGTATTTGTATAATAAAACTGATATAAATTCTCCACCTAATGTAATTATGGATGGATTTACTGTTGGTGCTAAAATAAATGATACAATAAACATTGAACTACCAACAAGAGCATCATCTAAAATTGTTATACCGAATACTGAAAGTTCATATGCAAAATCTTTTAATGTTCAAAGACAAAATAACGATTTTGAAAATGCGATTACCGGTGGAGTTTTAACTCTAACACAATCACACACATTTGAGGCCGGTGAAAAAGTAAGGGTATTGTCTGAAAATGGACATCTACCAGACGGTCTTGATGATAGAGTTTATTATATTATAGAATCGAGTATCGATAATACTCTTTTAAATACTCAAGTAAAACTAGCCACCACATTTAATAACTCTATCAACAATATATCCATACTACCAAATAGGAAGGGTGGAGTTCTTTCAATTGTAAGTAGAGTACACGACAAGATAGCGAATGATCCAGGACACCCTATTCAGTGGGATTCGGTTAATAATAATTGGTATATTACTGTAAGTGAAACAGACAATGGAATATATTCTGTTATTATTCCCCTTAGTATTGATAGCACTGGAAGAACTTTCGTCATCAGGACCCCCGATAGAAGAACAGAGCAGAATAAATTATATAAATTAATTTATAGTATTCCAAAGAATACAGCAACCGCTGCAAGGCCGCCAATTAACGGATATATCATACAGGAAAGTAATAATAGTTCTCTTACTAATGAAGAACTTTCAAGATATTTTGGAAGCAGTAGCTTAACTGTAGACAATGAAATTAGAAATCCTAGATTTATTTCTGATATACGGTGGGTCAGTGGTGAGATTATAGTAACTACAGAATTGCCTCATAAGTTAAACGTAGGGGACTTTACCGAAATTGTAAATGTTCTCCCTGTTGGATATAATGGAACATATCAAGTATTAAGAACACCTAGTTCTAGAAGTTTCGTTTATACTTCAACAAATAATCCTGGTATCTTCTCAAACGATACCAGAAATAGAAATATTGATCTTCCATATATTAAAAGAAAAGAAATCCGGGATGTTTTTCAAATCTATAAATCTGAAGAAGTTCAGAAATTTATTAGAGATAAACAAGATGGTATATATGAATTAACAGTTATTCATAATTCTGTAGCACCGACAGTAGCGCCGTTTACTGAATTTAAGTTCTCACAACCATTAACAAATCTCTATCCAAGATTGGATAGAGATAATTTGAATATAGATCCAGATCCAACAGTTTGTTTTGCTGATTCTAATCTAATTGGTAGTGTATTAGTAAATAATCCAGAAAACTCAGTTACAAAAGAATCTTTTAATAAATTTAATTCTGATTTAGTGGTTGGTTTTGGTGTCACAGGTATAGTGTCCAATCAAACTGGTACTTCACATACGATTTATACTAGTGTTGATCATGGATTGGCTGGTATTACTAGTGTTTCTGTCGTTAGTACTGGAGCATCTTATATAAGTGGAACTTACTATGGGGTGGGTGTTGGTACTACTTCTGGTGGAATATCAGCGTCCTTTAAAGTTGTTGTTGACGGTACTCAAAGAGTTTCATCTGTCAGCCTCATGAATGGGGGCAGCAATTATTCAGTTGGAAACCGAATTTCTATTATATCAGGAATCGGAACTACTACTGGATTTATTCCTGCCGTTTTAAATGTAACTGCAATTGCCGATAGTATTGATAACTCAGTTTCCGTTTCTGGTTTCTGTGAAAAATATTCGAATTATAATGACGCATATAGAATAACCGAGATTAAAAATTCAAATCAAGTAATAGTTTCTTCAGCATCTACAATAATTGGGTTTTCGACTTCAATAGTTCCGATTATCGGTGCAGGCATAATTAATGGTAAAATTATACCAATAGTATCATTAACATATAACAATGTCACTGGTATTTCAACTGTTACTTTAGGTCGATCATCTGGTATAAAATTAAATTCTAAAATTAGAATTACTGGATTTAATTCCGACTTATATAATCAAGACGTTGTAGTAACTAAAGTAAACTCTCTGACACAAGTTGAAGTCAAAACTGGTATTTCTACTACAACACCACTAACTAGTGGTTCTGGTATTGTAATTCCATTGGGTATTTCACCTATTATTGGAAAAAATAGAAATAGTTATTACTACTCTGGAATTTCAACAACCACTGGATCCGCACTTAACTCTAATGCTTCTGATAGCACACCACTTAACATAAGAAATGCCACTGTAACTGGTTTAAATCAGGGTGATTTTATTGAAGTGAATGGTGAAATCATGAGAATTAAATCACCTATAACTTCAAATTTAGTTCCAGTTTATCGTGGAGTTTTTGGTACTGAAAGAACAACACACCCAACCAATTCTTTAGTTAAAAAAGTACAGATCATTCCAGTTGAATTAAGAAGAAATTCCATCATTAGGGCGTCTGGTCATACATTTGAATATGTTGGTTATGGTCCAGGTAATTATTCAACTGCGTTACCGGAAAATCAAGACCGAGAGATTTCAACCAAGGAAAGATTACTATCACAGGCTACTAAGATAGGTGGTGGAACAATCTATTATAGTGGAATGGATGAAAATGGTGACTTCTATTCTGGAAATAGGAAGTTGTCATCTTCCACTGGACAAGAGGAAGTTTATGATCTTCCAATTCCAACAGTTGTAGGCGAATATTCTACCCCGAATATTGCGGAATCTGATAAATTAATTGTTTCCAGTTCCATTACGGTTAATGGTGGTGAGAATAATAATGCGGTATCTGAATTCAATGGACCCATTATTTTAAATAAAAAATTAACATCATATTCACCGGACGGAATAGAAACCACCTCGTTGTTTTTACAAGGTGATCAAGAAATTTCAAGAAGACATTCTATTTCTGAAGATACTCCAATTATTGTAGGTAATTATGGTGATATTCTTTACCGTGCCACTCCAAATGAGGGTGAAAATATTGGATGGGTTTATACCACAAACAATAGATGGAAAACCTGGGGATACGTTGGCGATCTAGGAACATTAGTTTACTTATATTCTGGAACAGAATCGACATCCACTTTAGAAGGTATCGTTGATTCACTTAAAATTGTTGGTGATCCTAATGGATTCGGTATAGATGTTGATATTCAAATAGATCCAGTAGTTGGATTTGGTACAATTGTATTACGAAATCCAATTAGTATTATAAATTTTGGAACGGAGTTAAGTAGAAATAATCCGACTTTTACAAATAGAAGTGGCGGATCTCGATTAGTTTATTATAATAATTTAAATACAACTAATGTAGATTATGCCACTGGTGTAAGCGCCAACTCTCTATGGAATTCAATTCCAATTAATGATTCCTCAGTTAACTTTAAATGGTTTGCTGGTGAAACTGAAATTGCATCTTTAAATGGTGTTGGTAATCTTACCATAGCTGGAACACTTAACGTAAGTGGTGGAATTACTGGTACCATAACCGGTAATGTGACTGGTAATTTGACTGGCACTGCGACAAGTTCAATAACATCTGCAAACTTAACTCGATCAGTCGTTGCTGGTGATGGATTAGCTGGTGGCGGATCTTTAAATGGCCAGGATGTAACTTTAAATATAGGTACTGTGGTAAATGGTGGTATTCAAGTTGATGGTGATAGCATTCAAGTCGATTCCACTGTAGTAAGAACTTCTGGAACTCAGAGTATTTCTGGTGCCAAGACTTTTAATGATGGTGTTTCTGTTACTGGAAATACTAGTTCAACTACATTTACTGGTAATGGTATTGCCCCAATTGGTGGTATTATTATGTGGAATGGTACTTTTGCTGAAGCTGCCACATTACAGCCAGGTTGGGCAATATGTGATGGTAGGACAGTAAGTGGGAGAACTACTCCAGACTTAAGAAATAGATTCATTATTGGATCTGCCGGTGATTCCGGTGGAATATCTGTTGCCACAATAACCGGTGGAGTTACTAAAACTGGTGGTAATAAAGACTCAATTGTTGTTTCACACTCACATACAGGGTCTACTACTGGTGCTGGTGGTCACATTCACGATGTTTCAGATCCTGGTCACTCTCATAATGCGACTGCCGCAGTAACTGGTGCTGCGTTCCCATCACTTGCTTCTTCTGGTAGTTTGGGTCTTGTCGTGGCCAATACAACAATTAGTACCACTGGTTCTGGAACTGGAATTAGTATCTCTGCTGTTGGTAATCACACTCATGGATTATCGATTGATGCTACGGGCGGTTCAGGAACAGATGCTAATCTCCCACCATATTATGCACTTGCATTCATTATGAGAACTGCTTGA

Tertiary structure

PDB ID
b99459b407958524bcd968b243538d4352b2fbded0cf35c0161214f3a3e9e83b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7904
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequences for two Myoviridae strains infecting cyanobacteria in a subarctic lake Levesque,A.V., Thaler,M., Labrie,S.J., Marois,C., Vincent,A.T., Lapointe,A.-M. and Culley,A. 2020 32139574 GenBank