Protein

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Genbank accession
YP_010355702.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSFHINSDKEKIRGVNPKLIGDNEATIRVGTGANEQEIMRLQKDPVSGLPRVGINRTGQRVNNIDIDQGGTGYNQVPIIEIDPPPTGGVQARASASIFNGRVTSVSVNEPGSGYTSVPGVAFIGGNGQGASATAFLDTVEFELDINGAIRTSTSIISDTARILNLDIENFITPDLNLRAPNLKTYMNGTGTPWASNVIVQKGQYRYAVSNVYQALNTGTTGILTPEHKDGVVTNGTVDFKHIGFRVSNPTDFDYLETGEAGAFPRSITPLLGDRSDKIATTEYVLNLATNDVGGRIYVSQQIGSDLNDGRSAVNPVRTIKKAAQEAWKTPGVKETLIVSGGNYVEDNPISLPPDCSVVGDNLRLVIIRPGNVGKHIFKFGDKNYVTGVTYRDKVDSNGDATGTWDFAMVFDDKQRIIIDNEVNGDFGVEFPVGHQVFGPDRFRISFQNNTGLALLQSGVQLLGLNTGARADSSGVSFNSTTGSNAFVAGTIDVTLTSGSFIEGDQYSYITSAAVGGALSQTISGTSGENTLRFTTDPSTDLPVSDVVFLDDTDNSSFTSGFYQVSVVNNGNAPTYWDVTFVPILGAIGWDSTLSDSTITVSSATPTTNTIDSTNLKSIRAEGEVVSYDEDIISTLPITRLDFSLQGDPSIATGGFQSDIYGDAEDIGGVVVYTSALVGRTNFHEFKEGQEIVLENLPTSGPDLSFLNGKQRIYKVLEDADGRCRRFVIPKKIPSLTTANFSPSEFAVVKSYSKSVTLSLLNSPNKFALATPTERRYQDACQLIRNNRDYIAEEVVGIINDQFKSDYYSVYNLDAVNNTFDIYLGPLDHANTYVSGGTVAFGGNSYAISDFVYDTLVTGVATITTTAAGISALSEDDTVQLADILISCTAGQKIYPSYSSPTNVNNGSNGDEQCKQDVIHFLNALVRDLEFGSNHNIIEAASKYIVNGKITYIEDEIIQNVRAIEYARELAIYAMCNWRIKNRTVSDPLYTTKYATSVRYTDPTIVNTTAGTPACDDVRSAIDTLAYLWADVITNDASGTYLDAAYLIAKNADLIADQALIDTEVAYPTLGLSNIRQRKCLRDIRLVIEGLVRDLVLGGNHGIVSAAESYFSGTVLSGIPEAQLDETRYAFQQVKDLAIAAMRNWSDGDVVPTTPTGSTYAPTTGILTVTFPNLAIIPSLQDRVAFAEGAITYSCAANGGGNDASPYRTDLNFGQSFALTNVSSSGGNTTITANVGVAGSNADVHTFVSALTGGTKIIYAPFATTSLIPKFEDWSILEDSANPSCAAIASAITTALTTFDSILEYASDPVNGAAPGSITQTFGTLYETNSLLTYPTSFINDFSNKRMAVRGVYDDYPIIEASPYTQNASVISFRGGGGAEIDGDKVKQPNCPFPGLEPDGTASFPNQGKSMVAAAFTIVSFGGTGYKVINDGYTQLVSVFVIFCQDGVLCETGGYASITNSATNFGTFALRGTGFRKDAYEFDAGVVNVVSQTPTGRTILTVGNIGREPLEHYIVKIDGYRNADPDKEFFIESVSGVTVGPPFTAILTIDDGIGNGLTLIRESDGATVSGLTALQQALTPSNAANAAIKLHRPSIVNSSSHTWEFAGSGTNYLALPENGGTKVEANEQVSENYGRVYVSGTDELGDFKVGTFARIENRTGNITFTGTVTISEVEFLKLKGGDVVVTGFDNSNTLGGANATDSKLPTQKAVKDYITNSLGPYINKPYSTNAVPRALVELTDSGKISLDQIPALRPFSIFTVVNEAERLSIEGALAGDIAIQDNSDVVDGSPQSFILNNDLSSLFLGFAVDPSLVFNIGEVFVGTPSTGRIQSTEYREGVLHKINITNGGSGYTVPPTVSITGGNPSAGAVPATATCTIANGEVVTVTITENAGFVGGFGYTTQPSIDIPAPPGAGTQATADGFIESRLYGNIVNAIKILDTDTFTDNDSPTNTINILRVVNTSSNIVSNWVSLSSEAVGVGSLTGPGVISTTLLGSEAANSFTFLRGDQRYAKTVQSLKGAETRYFARLFAQASLGSNSFIFQGLSGVLKGNTISDNVAGVVADTTVNGVTVVAGLTTVSFNNPIDANIPAGTVIEFGRGASPLVFDSTNTGGEFIDSVVIANPGTGFTDGQYFDVALDAPAGINGNDLRVNIIVGEDGRSGEVTTVTVTNAGNGFTQDFQITPNPSVIGSGSNLVLLAKVATTQKQFANISLDIQRVSDLTISQDLFGTIGVSRYKKSQFNIGTEGNGSVSIKMGPDSGLDADLLDGQQGSYYLNGAFFVDSSINPDKLASGTYGIDISGRSTNTLRVDTGISNPNANPSPSESIQGLTLQTLFNSSNGLLSAYPSVDTGNQNSAKHLVMTLRNGETGGDATYGGVRQLAFANDDRIYFRGSGDGVSNYNSWFEVWTSGNQGVSSGMDSDKLDNKEGVWYQDGWNIKENTIFETRLPTWRSSTKFRDKIEVASYGGTDTFYRIFVRQNLDTSAGGDFETTKTIDLYNVNKLSVGDFTITATDRNIDLNDSSNTYTMLTGRLSSGGNIEAAIYLGYAGDEREFEQYEIFDDNTVQYAELGNNSGTGYLRLGRYDGISATDPYVYFNSSQAQAVDNNGDPTYNSAIIATGGTATEGSGSIEIKVLNENELTVNSNIIWNAGNVAFNSSNVVSTASLKSAVMRDTSGNFTAGTITAGIIGAASLNVLKTGDTMTGGLTITGNNNLAIQGTGALNVGGNATLGADLTVDSGTLYVNSTNNRVLIGQTTESNPVKFNVYTASGDTEFATGSALSSQTTLYQSSVFNQVDTGESGIVLQHGASAAAQWGITTHRTGANVGELIIRTRTATATSATRLTISNGGSILPGADSDQDLGSDTVRWQNIYSDITHALNSVRIAKGVSNQEADIQFLGGGTGNGGGRGFRIGNNIGGGADVFEIYSSETNGADDWKSLATPDPLPPALAIQGTNNRVGINTNSFSGTDTTVTPNENRDYILNINGNMNIDGQLFQDNAEFVTSRWTKSTNDSGANIYRNSKVGIGDVASPAYQLHVKGGLNIEGSTYSSGQNQDVLWANGQAQWVDSYGIIKIQRTNINEDVTIPANVVSSSIGDIEIASGKTVTIASGGEWYIMD
Physico‐chemical
properties
protein length:3114 AA
molecular weight: 329981,58850 Da
isoelectric point:4,52122
aromaticity:0,08349
hydropathy:-0,15443

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014e
[NCBI] 		1493510 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010355702.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_062736.1 [NCBI]
CDS location
range 92101 -> 101445
strand +
CDS
ATGAGTTTTCATATTAATTCCGATAAAGAAAAAATTAGGGGCGTAAACCCTAAACTCATCGGTGATAATGAAGCTACAATTAGGGTAGGCACTGGGGCAAATGAACAGGAAATCATGCGCCTACAGAAAGATCCTGTTAGTGGTCTTCCCCGTGTAGGTATCAATAGAACAGGTCAAAGAGTCAATAATATTGATATCGATCAAGGAGGAACTGGATACAATCAGGTTCCTATAATTGAAATTGATCCACCACCAACTGGTGGAGTTCAAGCTCGAGCGTCTGCTTCTATTTTTAATGGTAGAGTTACATCTGTTTCGGTTAATGAACCTGGATCTGGTTATACATCTGTTCCTGGTGTTGCATTTATAGGAGGAAATGGTCAAGGTGCTTCAGCAACTGCCTTTCTTGATACTGTTGAGTTTGAACTTGATATCAATGGTGCTATCAGAACATCAACATCTATCATTTCTGATACTGCGCGAATTTTAAATCTGGATATTGAGAACTTTATTACTCCAGATTTGAACCTGAGGGCACCAAACCTCAAAACATATATGAATGGCACTGGTACGCCATGGGCTTCCAATGTTATTGTACAAAAAGGTCAGTATAGGTATGCGGTTAGTAATGTATATCAAGCATTAAACACAGGAACTACAGGAATTCTTACACCAGAACATAAAGATGGTGTTGTAACAAATGGAACTGTAGATTTTAAACATATTGGTTTTAGAGTAAGCAACCCAACCGATTTTGATTATTTAGAAACCGGAGAAGCAGGAGCATTCCCGCGTTCTATTACTCCATTGTTGGGTGATAGATCAGATAAGATTGCTACTACAGAATACGTCCTCAACCTAGCAACGAATGACGTTGGTGGTCGTATCTACGTTTCACAGCAGATTGGTTCTGACCTAAACGATGGTCGTTCTGCCGTAAACCCTGTCAGAACAATTAAGAAGGCAGCACAAGAGGCATGGAAAACTCCTGGTGTCAAAGAAACACTAATTGTTTCTGGTGGTAATTACGTAGAAGATAACCCAATCTCACTACCACCTGATTGTTCTGTTGTTGGTGATAACCTTCGTTTGGTAATTATCAGACCTGGTAATGTTGGTAAGCACATCTTCAAGTTTGGTGATAAAAATTATGTTACTGGTGTAACTTATAGAGATAAAGTTGACTCCAATGGAGATGCCACTGGAACGTGGGACTTTGCTATGGTCTTTGATGACAAGCAAAGAATTATTATCGATAATGAAGTTAATGGAGACTTTGGTGTTGAGTTCCCAGTTGGACATCAAGTTTTTGGACCAGATAGATTTCGTATCTCTTTCCAAAATAACACAGGATTAGCATTACTACAATCAGGAGTTCAACTTCTAGGTCTGAACACTGGTGCTAGAGCAGATAGTTCTGGTGTATCTTTTAACTCAACAACTGGATCGAATGCATTTGTTGCTGGCACAATTGATGTGACACTAACATCTGGTTCTTTTATTGAAGGAGACCAGTATAGTTATATTACATCAGCTGCGGTTGGTGGTGCATTATCACAAACAATTAGTGGCACTTCTGGAGAAAATACTTTAAGGTTTACTACAGATCCATCAACAGATCTTCCAGTAAGCGATGTTGTTTTCTTAGACGATACCGACAACTCATCATTCACTTCAGGTTTTTATCAAGTATCAGTTGTTAATAATGGTAATGCACCCACTTACTGGGATGTTACTTTTGTTCCTATTCTGGGTGCAATAGGATGGGACAGCACTTTATCCGATTCAACGATCACGGTTAGTTCTGCAACACCAACAACAAATACTATTGATAGCACAAACCTCAAGTCAATTAGAGCTGAAGGTGAAGTTGTTTCTTATGATGAAGATATTATATCAACTTTGCCAATCACTAGATTAGATTTCTCTCTACAAGGAGATCCTAGTATTGCTACTGGCGGTTTCCAATCTGATATTTACGGAGACGCAGAAGATATTGGTGGTGTTGTTGTTTATACGAGTGCTCTTGTAGGTAGAACTAACTTCCACGAATTTAAAGAAGGTCAAGAAATTGTTCTTGAAAACCTCCCAACTTCTGGACCAGACTTATCTTTCTTAAATGGAAAGCAAAGAATTTACAAAGTTTTGGAAGATGCTGATGGTCGCTGTAGACGATTTGTAATTCCCAAAAAAATTCCATCTTTAACAACTGCAAATTTCTCCCCAAGTGAATTTGCTGTAGTAAAATCCTATTCCAAGTCCGTCACACTTTCATTATTAAACTCACCAAACAAATTTGCTCTAGCAACTCCTACTGAAAGAAGATATCAGGATGCTTGTCAATTAATTAGAAATAACAGAGACTACATCGCAGAAGAAGTAGTTGGTATTATTAATGATCAATTTAAATCCGATTATTATTCTGTATATAACTTAGATGCGGTCAATAATACATTTGATATTTACTTAGGTCCATTAGATCATGCAAACACATATGTCAGTGGTGGTACTGTAGCATTTGGAGGAAATTCCTATGCTATCAGTGATTTTGTATACGACACTCTAGTAACTGGTGTAGCTACTATTACAACCACGGCAGCTGGCATCTCTGCGTTGTCTGAAGATGATACTGTTCAGTTAGCAGATATTTTAATCTCTTGCACTGCTGGTCAGAAAATTTACCCATCATATAGTTCACCAACAAATGTAAATAATGGGTCTAACGGAGATGAGCAATGTAAGCAAGACGTTATTCACTTCCTAAATGCTCTTGTAAGAGATCTTGAGTTTGGGTCCAACCACAATATTATCGAAGCTGCTTCTAAGTATATTGTAAATGGAAAGATTACTTATATTGAAGATGAAATTATTCAAAATGTGCGTGCAATTGAATATGCTAGAGAATTAGCAATTTATGCAATGTGTAATTGGAGGATTAAGAACAGAACAGTTTCGGATCCTTTATATACCACGAAGTATGCTACATCAGTAAGGTATACAGATCCCACTATTGTTAATACAACAGCAGGAACTCCTGCTTGTGATGATGTAAGATCTGCTATTGATACACTAGCATACCTTTGGGCTGATGTTATTACTAATGATGCATCTGGAACATATCTTGATGCTGCTTATCTAATTGCCAAGAATGCTGATCTAATTGCAGACCAAGCACTTATTGATACCGAGGTAGCATATCCAACTTTAGGTCTTTCAAATATTCGCCAAAGAAAATGTCTTAGAGACATTAGACTTGTAATTGAAGGTCTTGTAAGAGACTTAGTTCTTGGAGGAAACCATGGTATTGTTTCTGCTGCAGAATCGTATTTTAGTGGAACTGTTCTTTCTGGAATTCCAGAAGCGCAATTGGATGAAACCAGATATGCATTCCAGCAAGTAAAAGATCTTGCTATTGCGGCAATGCGTAATTGGTCTGATGGTGATGTTGTACCAACAACACCAACAGGATCTACATATGCTCCAACTACTGGAATACTTACAGTAACTTTCCCCAATCTTGCTATCATACCATCCCTTCAGGATAGGGTTGCTTTTGCTGAAGGAGCTATTACATATAGTTGTGCTGCTAACGGTGGTGGTAATGACGCAAGTCCCTATAGAACTGATCTAAATTTTGGACAAAGTTTCGCGCTTACAAATGTTTCATCTTCTGGAGGAAATACTACAATTACTGCTAATGTTGGAGTTGCTGGATCTAACGCAGATGTACACACGTTTGTAAGTGCTTTAACAGGCGGAACTAAAATTATCTATGCTCCATTTGCAACAACTTCACTTATTCCAAAATTTGAAGATTGGAGTATTCTAGAAGATAGTGCAAACCCATCATGTGCTGCTATTGCTTCTGCTATCACAACAGCATTAACAACCTTTGATAGTATTTTAGAATATGCTTCTGATCCTGTAAATGGTGCTGCTCCTGGATCTATTACACAAACCTTCGGAACTTTATATGAAACTAATAGTCTTCTGACTTATCCTACTAGTTTCATTAATGATTTTAGTAATAAAAGAATGGCAGTTCGTGGTGTATATGACGATTATCCAATTATTGAGGCATCTCCATATACCCAGAATGCATCGGTTATATCCTTTAGAGGTGGTGGCGGTGCAGAAATTGATGGTGATAAGGTCAAGCAACCTAACTGTCCTTTCCCTGGTCTAGAACCAGACGGTACAGCATCATTCCCCAATCAGGGTAAATCGATGGTTGCTGCGGCATTCACGATTGTCTCCTTTGGTGGCACAGGATATAAAGTTATCAATGATGGTTATACACAGTTAGTTTCTGTCTTCGTTATCTTCTGTCAAGATGGTGTTCTTTGTGAGACTGGTGGTTATGCATCTATCACCAACTCCGCAACTAACTTTGGTACATTTGCTCTAAGAGGAACAGGTTTCCGTAAAGATGCATATGAATTTGATGCTGGCGTAGTTAATGTTGTTTCTCAAACACCAACTGGTAGAACTATTCTTACTGTTGGTAATATTGGAAGAGAACCACTAGAACATTACATTGTTAAAATTGATGGTTATAGAAATGCAGATCCAGACAAAGAATTCTTTATTGAATCTGTAAGTGGAGTCACTGTTGGTCCTCCTTTTACAGCAATACTTACGATTGATGATGGTATTGGAAATGGTTTAACTCTAATTAGAGAGTCTGATGGTGCTACTGTTTCTGGTCTAACAGCACTACAGCAAGCATTAACACCATCTAATGCAGCAAATGCTGCAATTAAATTGCATAGACCATCTATTGTTAACTCTTCTTCCCATACTTGGGAATTTGCAGGTTCTGGAACTAACTACTTAGCTCTTCCTGAGAACGGTGGAACTAAAGTTGAGGCAAACGAGCAGGTATCTGAAAACTATGGTCGTGTATATGTTTCAGGTACTGACGAACTAGGCGACTTTAAAGTTGGAACATTTGCGAGAATTGAAAACAGAACTGGTAATATTACCTTCACGGGTACAGT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Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank