Protein

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Genbank accession
AOO02533.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRIKIGDGVTAWNTLRYERPVESNTNTPNTLVQRDADGNFSAAIVTASLIGNASTATRLDQTRQIQLSGDVTASGNFDGSQNLNLSSALTLVSTLPHYLQDNDPSITRVFTEVTVDQKGRVVNARTPAQMNLADYGLDGSATSDTSLAQPWNPNLEAISDETGTGFYVRTGAGSIAVRQILAESADIVVSNGTGVSGNPNLSLAIQAGLVAGNYNTESLTSVTQAGGSGEPFGTETVNAVKFSCDNHGRLSSATNVPIATATEGSKYSSYNAGTTYARYDIIANESKVYQAYQAISAGAGAPTHSSGDNGGWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAALGVDNTQLQNNRISFADGNTKEDFELDQELTGTTGYRGFNYLNYIKVNDTSGNLLVGANNTGDSGAGELDINVRSYFSDPDITLDGIVDQTLDKTGDGNLTFQLTQNSASARNLSILSTNAGSGTSTVTITAEDVVDIDTSDANGKVHIEDLRIQSNYLASTGQLNLDPGDDRTASGLVRIFGDLQIDGTTTTVNSTVTTVDDPVITLGGDTAPASDDNKDRGIEFRYYDTQARVGFYGWDTGYTDLGGHEGGYRFLHAATNTSEVFAGTDSGLIAGNVKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGAGIGQDVNIGGLLDVDGTFRVNSTSRFDDNIVLQGASKTLQLNNGSGTTKIEFQSTTGNGSLGGILDVTGNFNVNTNKFNVVAASGNTSIAGTLGVTNIATFSNDIDANANMTLAGDLHMESTNDITVAKNAGTGVWEIQSNDYGALRIDGGVYAAGDALIDGTLHVNGAIEVKDSATEAESRLNWLRVRYRGRFGDSYQATPSYASHNTTTIRAHGGAGIERTLHIGGTGSGEGLFVGKRYSGDTVKFSVLGASGNTDIQGTLDVAGNTEINGTLDVDADFAVRNGTTDKFFVDNLTGNTNIEGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKFTVASASGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIIDAANEVFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGVSDVVTFTRNTDQTLTGLYGADGAVRITGGVGVQRNLAVGGNMRVYGDFEITGSTTQTGNTGFSGLVSITNTSDATSFSDNSVALTTDGGLIVSKNAWVGGDFYVWDDANSRNAFYVDTSTGDATLHNTLTVGGNLIVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDSAPASNDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGYDRSANQFSFLVDATNNAEVHTGTDAPLRAGSLNLTGSGTALDVDNNANIDGTLTVDGQITSNVAQGVTPLIITSTTKVNNLNVDLLDSMTTASANTPTTVVNRDSFGNFAAGTITAALVGNASTATTLETARTITVDGVVDGNVSFNGSADVTITTVFNDSDITALAAQTGTGLVVRTGTGTYARRSVTATASSGVTITNGDAVAGNITINVASASSNSANNLVLRDGSGNFSAGTITAALIGSVTGNVTGNLTGNVTGNVTGDLTGNVTGNVTGNLDGIVGGNTPAAVTGTTITANTGFTGNLTGNVTGQVTGNVTGDLTGDVTGNLTGNVTGNVTGNVTGDLTGDVTGNVTGNVTGNVTGTVSSISNHTTSNLTEGTNLYYTDARADARIAAADTDNLSEGSTNLYFTNARADARIAAADTGDLSEGTNLYYTEARVQTQLDNAYEQLRAMLNNLATATTLTLALSGDPTPGDVTALNNGTLVGGSGYNTATGVATTSSGSGTGLTVDITASGGIITSVAINAGGAGYAVGETITISTGNADATINVSAVIEMAVGDTVTGGTSGTTAVITAVGTNQITVDNVDGFFKKTETVSAGDVSNLTISSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:1912 AA
molecular weight: 195846,86940 Da
isoelectric point:4,19980
aromaticity:0,05753
hydropathy:-0,16799

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
4–200
SSF69349
IPR041352
5–43
IPR041352
AOO02533.1
1 1912
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-RIM2
[NCBI] 		687800 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO02533.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349249 [NCBI]
CDS location
range 89989 -> 95727
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGACGTGGTGGTGCCCAGGAATGGGCAAACGCGAACCCAACTCTTGCACAAGGTGAACTCGGAATCGAACTCGATACGGGTCGTATTAAGATTGGTGATGGTGTTACTGCATGGAACACGCTGAGATATGAGCGTCCTGTTGAATCTAACACCAACACGCCAAACACTCTTGTTCAAAGAGATGCTGATGGTAACTTCTCTGCAGCAATTGTTACTGCTTCATTGATTGGTAATGCTTCTACTGCAACCCGTCTTGATCAAACTCGTCAGATTCAGTTATCTGGGGATGTTACTGCTTCTGGAAACTTTGACGGTTCTCAAAACCTGAACCTGTCTTCGGCATTGACGCTTGTTTCTACTCTGCCACACTATTTGCAAGACAACGATCCTAGTATTACTCGTGTCTTTACTGAAGTAACAGTTGACCAGAAAGGTAGAGTTGTAAATGCTAGAACTCCTGCTCAGATGAATCTGGCAGATTATGGTCTGGACGGTTCTGCAACTAGTGACACTTCTCTGGCACAACCTTGGAATCCAAACCTGGAAGCAATCTCAGATGAAACTGGTACAGGTTTCTATGTAAGAACTGGTGCTGGTTCGATTGCAGTCAGGCAGATTCTTGCTGAAAGTGCTGACATCGTTGTTTCTAATGGTACTGGTGTTTCTGGTAACCCCAACCTTTCTCTTGCTATTCAGGCAGGTCTTGTTGCTGGTAACTATAATACAGAGAGTCTTACATCTGTAACTCAAGCAGGTGGTAGTGGTGAACCTTTCGGTACAGAAACTGTAAACGCTGTTAAGTTCTCCTGCGACAATCATGGTCGCTTATCGAGTGCTACAAATGTACCTATTGCTACTGCTACTGAAGGTAGTAAGTATTCTAGCTATAATGCAGGCACTACTTATGCTCGCTATGATATTATCGCGAACGAATCAAAAGTTTACCAAGCATATCAGGCAATCAGTGCTGGTGCTGGTGCTCCTACTCATTCCAGTGGCGATAATGGAGGTTGGCGCTACCTCGCGGCTGAAGCAACAGAGCAGAAGGGACTGGCTTCATTTGCACAGGAAGATTTCGATGTTGACAGCAACGGGCACGTTACCATCGCTGCACTAGGTGTAGATAACACTCAACTACAGAATAATAGAATTTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTGGAACCACTGGATACAGAGGATTCAACTATCTTAACTATATCAAAGTTAATGATACGAGCGGCAATCTACTTGTTGGCGCTAATAATACAGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATATTAATGTACGCTCGTACTTCTCTGATCCTGACATTACTCTTGACGGCATTGTTGATCAGACACTGGATAAGACTGGGGATGGTAACCTTACCTTCCAGTTAACCCAAAACTCTGCATCTGCTAGAAACCTTAGTATCCTCTCTACAAATGCTGGGTCTGGCACAAGCACAGTTACAATCACTGCAGAAGATGTTGTTGACATTGATACATCTGATGCAAATGGTAAGGTTCATATTGAGGACTTGAGGATTCAGTCCAACTATTTGGCATCTACTGGTCAACTAAATCTTGACCCTGGTGATGATCGTACTGCATCTGGTCTGGTTCGTATCTTTGGCGATCTCCAGATTGACGGTACTACAACTACAGTCAACTCAACAGTAACAACAGTTGATGATCCTGTAATAACTTTGGGTGGCGATACTGCTCCTGCATCTGATGATAACAAAGATCGTGGTATTGAGTTCCGTTATTATGACACTCAAGCACGAGTCGGTTTCTATGGTTGGGATACTGGGTACACTGATCTGGGTGGTCATGAAGGCGGTTATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTTCCGAAGTCTTTGCTGGTACTGATTCTGGTCTTATTGCTGGTAATGTAAAACTTACAACTAACACTAACTCCACTTCAAATACAACGGGTGACCTCGTAGTTGCTGGTGGTGCTGGTATTGGTCAGGATGTAAACATTGGTGGTCTTCTGGATGTTGATGGCACATTCCGTGTTAATAGCACCTCTCGTTTTGATGACAACATTGTCCTTCAGGGTGCTTCTAAGACACTGCAACTAAACAATGGTAGCGGCACCACTAAAATTGAGTTCCAATCTACAACTGGTAATGGATCTCTTGGTGGCATCCTGGATGTAACTGGCAACTTCAATGTCAACACTAATAAGTTCAATGTTGTTGCTGCTTCTGGTAACACTTCTATTGCTGGCACCTTAGGTGTCACGAACATTGCGACATTCTCTAACGATATTGATGCTAACGCCAACATGACGTTGGCTGGTGACCTCCACATGGAGAGCACCAATGACATTACGGTTGCTAAGAATGCTGGCACTGGTGTTTGGGAGATTCAATCTAACGATTATGGTGCTCTTCGCATTGACGGTGGTGTGTATGCTGCTGGTGATGCACTGATTGATGGCACCCTACACGTTAACGGTGCTATTGAAGTTAAGGATAGTGCGACAGAGGCAGAATCGAGACTGAACTGGTTGCGTGTCAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGACTCTTATCAGGCAACTCCTTCCTATGCATCTCACAATACTACAACTATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACTCTGCACATTGGTGGCACAGGATCTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACTCTGGTGATACTGTTAAGTTCTCTGTTCTTGGTGCATCTGGTAACACTGATATCCAAGGCACACTCGACGTTGCTGGCAACACTGAAATCAATGGTACTTTAGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTTAGAAACGGTACAACTGATAAGTTCTTTGTTGATAACTTAACTGGCAATACTAACATCGAAGGCACTTTGGATGTCAACGGTGCAACTGAGATTACAAATACTCTGGATGTCAGCAACGCTGTTACATTCGATCAGACACTCCTGGTCCAAGGCAACTCTGAGTTTAACGGCACAGTTGATGTTGATGCTAACTTTGCAGTTAGAAGTGGTAGCACAGACAAATTTACTGTTGCTTCTGCATCTGGTAATGTTGCAACTGATGGTACTCTGGTTGTTCAGGGTCAGACAACTATCAACGATTCTCTGATTATTGATGCTGCTAACGAAGTCTTCTCGATTAGAAATGGTTCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGATAACGGAAATACAAATATCATTGGCACTCTTACTGTTGGTGATGCAACTCAGATCAACGATACCCTGGGCGTCTCTGATGTTGTTACCTTCACAAGAAATACTGATCAAACTCTGACAGGTCTCTACGGTGCTGATGGTGCAGTTCGTATTACTGGTGGTGTTGGTGTTCAAAGAAACCTCGCTGTTGGCGGCAACATGCGTGTCTATGGTGACTTTGAGATTACTGGTAGCACAACTCAGACTGGTAACACTGGTTTCAGTGGTCTTGTTTCGATTACCAATACTTCAGATGCTACATCATTCTCTGATAACTCTGTCGCTCTTACAACCGATGGCGGTTTAATAGTAAGCAAGAATGCATGGGTTGGTGGCGATTTCTATGTTTGGGATGATGCAAACTCTAGAAATGCATTCTATGTTGATACAAGCACTGGTGATGCAACTTTACATAATACACTTACTGTCGGTGGGAACCTGATTGTTAATGGAACAACAACTACTGTTAACTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTTTGGGTGGTGACTCAGCACCAGCGTCTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAGTGGGCTTCTTCGGATATGACAGATCCGCCAACCAGTTCTCATTCTTAGTCGATGCAACTAACAACGCCGAAGTTCATACTGGCACAGATGCTCCTCTTCGTGCTGGTTCTCTTAATCTTACTGGGTCTGGCACAGCACTTGATGTTGATAACAATGCCAACATTGATGGCACTCTGACTGTTGATGGTCAAATCACATCAAACGTTGCTCAAGGTGTAACACCTCTGATCATCACATCTACCACTAAGGTCAACAACCTGAACGTTGACCTCCTGGATAGCATGACGACTGCTTCGGCAAACACACCTACCACGGTTGTTAATCGCGATTCTTTTGGTAACTTTGCTGCAGGAACTATCACTGCTGCTCTGGTTGGTAACGCTTCTACAGCAACCACCCTGGAGACTGCAAGAACAATCACTGTTGATGGTGTTGTTGATGGTAATGTCTCCTTTAATGGATCTGCTGATGTAACTATCACAACGGTCTTCAACGACTCTGATATTACTGCTCTTGCTGCCCAGACTGGCACAGGTCTGGTAGTAAGGACTGGCACAGGCACTTATGCAAGACGCTCTGTGACCGCTACAGCGTCCTCTGGCGTCACTATTACTAACGGTGATGCAGTTGCTGGCAATATCACCATTAACGTCGCTTCTGCGTCCTCTAACTCGGCAAATAACCTGGTCCTGCGTGACGGTTCTGGTAACTTCTCTGCTGGTACAATCACTGCAGCACTGATTGGTAGTGTTACAGGTAACGTTACAGGTAATCTGACTGGTAATGTAACGGGTAATGTCACTGGTGATTTGACTGGAAATGTTACAGGTAACGTTACTGGTAATCTCGATGGCATCGTTGGTGGTAATACACCTGCTGCGGTCACGGGTACTACGATTACAGCGAACACTGGATTTACTGGTAATCTCACAGGTAACGTTACTGGCCAGGTCACTGGTAATGTCACTGGTGATTTGACTGGTGATGTAACTGGCAACCTGACTGGTAATGTCACGGGTAATGTAACTGGTAATGTTACTGGTGATTTGACTGGCGATGTTACAGGTAACGTCACTGGTAATGTAACTGGCAATGTAACTGGAACAGT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Tertiary structure

PDB ID
cbd3e3568e5f0b6d69c73552d2781db9775d6d9093097b6b6ec7eee3099cd9ea
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5251
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50