Protein
View in Explore- Genbank accession
- ALM01895.1 [GenBank]
- Protein name
- hypothetical protein
- RBP type
-
TSPTSPTSPTFTF
- Protein sequence
-
MNILRSFTETVVTTPTDLFPISFEYDEKYDAVHVFLNDVAVEDLGYTVSQVNAVTLKVEPAIPEGTVRIERETDIDKMRYIFDAGALFIDQNVDADFRQIVHSQQEVRDGFIKLRNDVLPLVDGLEEALEAASEAGKAAEEAAQAAEEAANIALTNLRSTVSTIANLESLPTDDLYVGKCVYVVDLGCMYIYNGSSWDLSPVAHVTPDMFNGDIIEAANFAASHNLELHTGDTVYEVGVEFKVPKGLTWVANHTVIKQVAPAIDSSSASVLAPESNVTIKGYLILDMGAPTTGWGEKCHFRMDSFNNITPQVSNVQFDTLELRGGYFNCNGVVMAGGAKGLRGSCIKVGDSANIGRVFMAHWGNFTQHSYNRTTLKYTHVPNYSPTTHPNDCVIDSIYTGDLTCNTNDFSAIALISAGYNIHIGRIEGNVLDSTISGKGHYVATAGDLAFAYATPLERKRGMWGLTVDSIFGTTYSSAVCLISEALYRGADDLTNVVVPPTAADYDASIKLTIGDVDVTGRTAAVGNNYAVIARTGQFGKVKIESITTREFYSTFRIVDLCYNLEVGVMNCYDSKINPVTITGTTTLTRAPRGVHISTLNVWRYGVTSSSTTYRSVIQGDNFIDIVVDTLNVYEHGNAYCVVDIGGIITPPTTHIGEINVYDSTYPNTFLINNRSTMPIRLNSVYSTKPLVQVVSGGVVQTLLGKHIRYVSASVPTLSLNVGDEVLTNNGLLRCIAAGPASTTNLQLVEGGVDFAQDTIVLNPNTRHLLTSGRKLSYCKLALTSLRAAYSVSVDPTITFDVVMTADDTFSVYATNHNINTPYTLPSGRIYVQV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 833 AA molecular weight: 90417,84700 Da isoelectric point: 4,97474 aromaticity: 0,08643 hydropathy: 0,02353
Domains
Domains [InterPro]
Coil
122–149
122–149
1
833
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Acinetobacter phage vB_AbaP_PD-AB9 [NCBI] |
1701808 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Acinetobacter baumannii [NCBI] |
470 | Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales > Moraxellaceae > Acinetobacter |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ALM01895.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KT388103
[NCBI]
CDS location
range 4073 -> 6574
strand -
strand -
CDS
ATGAATATACTACGCTCATTTACAGAGACAGTGGTGACTACACCTACAGACCTTTTCCCTATCAGTTTTGAATATGATGAGAAATACGATGCTGTACATGTCTTTCTTAATGACGTAGCAGTAGAAGACTTGGGATACACAGTGTCTCAAGTTAATGCTGTTACTCTAAAAGTTGAACCTGCTATTCCAGAAGGTACAGTTCGTATTGAACGCGAAACAGATATTGATAAGATGCGGTACATCTTTGATGCTGGTGCGTTATTCATTGATCAGAATGTGGATGCAGATTTTCGACAGATCGTACACTCTCAGCAAGAGGTACGTGATGGTTTTATTAAATTACGTAATGACGTTCTACCACTTGTAGATGGTTTAGAGGAAGCTTTGGAGGCTGCTAGTGAAGCTGGGAAGGCTGCTGAGGAGGCTGCCCAAGCTGCTGAGGAGGCTGCTAATATAGCGTTGACGAACTTGCGCTCAACAGTATCTACTATAGCTAACTTAGAAAGTCTACCTACAGATGATTTATATGTGGGTAAATGTGTATACGTTGTAGATTTAGGATGTATGTATATCTACAACGGGAGCAGTTGGGATTTATCGCCAGTAGCACACGTAACTCCTGATATGTTTAATGGTGATATTATTGAAGCTGCTAACTTTGCAGCTAGTCACAATTTAGAATTGCATACAGGAGATACTGTTTATGAAGTAGGTGTTGAGTTTAAAGTACCTAAAGGTTTGACATGGGTAGCTAATCATACAGTGATTAAGCAAGTAGCCCCTGCTATTGATAGTAGTAGTGCGTCTGTATTAGCACCAGAAAGTAATGTTACTATCAAAGGTTATCTAATACTGGATATGGGCGCACCGACAACAGGTTGGGGTGAGAAATGCCATTTCCGCATGGATAGTTTTAATAACATAACCCCTCAAGTGAGTAATGTGCAGTTTGATACTTTAGAATTACGCGGTGGTTATTTTAACTGTAACGGTGTAGTAATGGCAGGTGGTGCAAAAGGTTTAAGAGGCTCATGTATTAAAGTAGGTGATAGTGCTAATATTGGACGTGTATTTATGGCTCATTGGGGTAACTTTACACAGCACTCCTATAACCGTACTACTTTAAAGTATACCCATGTACCTAACTACTCACCTACTACCCATCCTAATGACTGTGTGATCGATTCCATTTATACGGGCGATCTTACTTGTAATACTAACGATTTTAGTGCTATAGCATTAATATCCGCAGGTTACAATATACACATAGGGCGCATTGAAGGTAACGTTTTGGACAGCACTATTAGTGGTAAGGGGCACTACGTAGCTACGGCAGGTGATCTTGCATTTGCGTATGCTACTCCGTTAGAGCGTAAAAGAGGTATGTGGGGGCTTACTGTAGATTCCATATTTGGTACTACTTACTCTAGTGCCGTATGTTTAATTAGTGAGGCTTTATATAGAGGTGCAGATGACCTGACTAACGTGGTCGTACCACCTACAGCAGCAGACTATGATGCGTCTATTAAGCTAACTATAGGTGATGTAGATGTGACAGGGCGTACTGCTGCCGTAGGTAATAATTATGCCGTTATTGCGCGTACAGGGCAGTTTGGTAAAGTTAAGATTGAATCTATCACCACACGAGAGTTCTACTCTACGTTCCGTATTGTAGACTTGTGTTATAATCTTGAAGTAGGTGTTATGAATTGCTATGATTCTAAAATTAACCCTGTCACTATTACAGGTACTACTACTTTAACAAGAGCGCCTCGTGGTGTACACATATCAACTCTTAATGTGTGGCGTTACGGGGTTACTTCTAGTAGTACCACATACCGAAGTGTTATTCAAGGTGATAACTTCATTGATATTGTAGTAGATACACTTAACGTGTATGAGCACGGTAATGCTTACTGCGTAGTAGATATAGGCGGTATAATTACACCCCCTACTACACATATAGGGGAGATAAACGTATATGACTCAACATATCCAAATACTTTCCTAATCAACAACCGCAGCACCATGCCTATACGTTTAAATAGTGTATATTCTACTAAGCCCTTAGTTCAGGTGGTTAGTGGAGGTGTTGTGCAAACCTTGTTAGGTAAACACATACGTTATGTTAGTGCGAGTGTACCTACATTGAGTTTAAATGTGGGTGATGAGGTATTGACTAACAATGGGTTATTACGTTGTATCGCTGCTGGTCCTGCGTCAACGACTAACTTACAGTTAGTCGAAGGGGGTGTTGACTTTGCACAAGATACTATAGTTTTGAATCCAAATACAAGGCACTTGTTAACAAGTGGACGTAAACTAAGTTATTGTAAACTAGCTCTAACATCTTTAAGGGCTGCTTACAGTGTTAGTGTAGACCCTACAATAACGTTCGATGTAGTAATGACGGCAGATGACACTTTTAGTGTCTACGCCACTAATCACAACATAAATACACCATACACGTTACCTAGTGGTCGTATTTATGTGCAAGTATAA
Tertiary structure
PDB ID
4905980b9a9b7044e30142753375c6504c93ecf0cd29ebe0ccc3c0cb03f08fd0
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Isolation and characterization of an extensively-drug resistant Acinetobacter baumannii bacteriophage with broad host range | Liu,Y., Guo,X., Tang,J., Liu,F., Fan,H., Yan,Y., Xu,Y. and Shi,Y. | 2005-03 | — | GenBank |