Protein

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Genbank accession
WBY53096.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,61
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGTFNSGRWRALRTDANWITVSSGSYQLKSGEAISVNTAAGNDITFTLPSTPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQLVLIFSNRLWQMYVADYSREAVVVTPANTYQAQSNDFIVRRFTSAAPINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEDGTHSIEGRTSIDGFLMYDDNEKLWRLFDGDNKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGITQTIELQLPTNISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANADLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDIIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTTGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDARIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRIATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATQSETVAGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQSLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLNAPLVSSSTATFGGSLAANSTFTIRNTGTPTRIVFEKGPASGANPVQSMSIRVWGNQYGGGSDTTRSTVFEVGDETSHHFYSQRNKNGTIAFIINGTVMPININASGLMNVNGTATFGSSVTANGEFISKSANAFRAISGNYGFFIRNDATNTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140251,93830 Da
isoelectric point:5,48493
aromaticity:0,07525
hydropathy:-0,31528

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
979–1092
IPR048390 IPR048391
WBY53096.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage REP4
[NCBI] 		3022457 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WBY53096.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ174503 [NCBI]
CDS location
range 39798 -> 43667
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGACGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACCTAATTCAAGAAAACACAGTTCAGCAATATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCGGCAGGAACTTTTAACAGTGGACGCTGGAGAGCATTGCGTACTGATGCTAACTGGATCACAGTCTCATCTGGTTCATATCAATTAAAATCCGGTGAAGCTATTTCGGTTAACACTGCAGCTGGTAATGATATTACGTTTACTTTACCATCTACTCCAATTGACGGTGATACTATCGTTCTCCAAGACATTGGAGGAAAACCTGGGGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCAGTGCAAAGTATTGTAAACTTCAGAGGTGAACAAGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAGTCACAGTTAGTTTTAATTTTTAGTAATCGCCTGTGGCAAATGTATGTGGCTGATTATAGTAGAGAAGCTGTAGTTGTAACACCAGCGAATACTTATCAAGCGCAATCCAACGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTGCACCGATTAATATTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCACGGCGATATTATTAATTTCGTCGATTTGGATAAATTAAATCCACTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACTACATCAGTACAAGAAGATGGAACTCATTCTATTGAAGGCCGTACATCTATTGACGGTTTCTTGATGTATGATGATAATGAAAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGAGACAACAAAGCACGTTTACGTATCATAACGACTAATTCAAACATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAATGGAATAACTCAAACAATTGAACTCCAGCTTCCAACTAATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAGTTCCCAAAACGTTCAGAATATCCGCCTGAAGCTGAATGGGTAACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGACGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTTGATTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCTAATGCTGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTGAATCAGAACACTACATTCTCTTTTGCTGACGATATTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAGGAAACTAATGCAGGTACTGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGACAAGGTTCTGAGTCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACTACAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTCGTTTCGCCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACGCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAGAGTCAAGAAGGATGGGCAAATGCTGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGCAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACACAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTATAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTGGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCACAGGAAGGTGTTATTAAAGTTGCGACTCAGTCTGAAACTGTGGCTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCTACTACTGCAATAAGAGGCTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTTGGTTCTACACAGAGCTTAGAGCTATACGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCAAAAGCTGCTGACGCGAATTTATTAGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAATGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGCTCGTTGGCTGCTAACTCCACATTTACTATACGTAACACAGGAACTCCGACCCGCATCGTTTTCGAAAAAGGTCCTGCATCCGGTGCAAACCCGGTTCAGTCAATGAGCATCCGTGTATGGGGTAACCAGTATGGTGGCGGTTCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGCGATGAAACATCTCATCACTTTTATTCTCAGCGTAATAAAAACGGTACTATAGCGTTTATCATTAATGGTACTGTAATGCCAATAAACATTAATGCTTCCGGTTTGATGAATGTGAATGGCACTGCAACATTTGGTAGTTCAGTTACAGCCAATGGTGAATTCATCAGCAAGTCTGCAAATGCTTTTAGAGCAATAAGTGGTAATTATGGATTCTTTATTCGCAATGATGCTACTAACACCTATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAACAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGCACTAAAACATCTGACTTATATACCCGTGCACCGACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGTGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCACTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCAGAAGCACGTACAACCCGTTGGACACGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCGAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGTGGAAACCCTCCTCAACCGTCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACGGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
fc5a936b0a131145f3d2dc4b9593818ae4039a8bd11b219a52a0dfa789121c1a
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5737
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Swapped genetic code blocks viral infections and gene transfer Nyerges,A., Vinke,S., Flynn,R., Owen,S.V., Rand,E.A., Budnik,B., Keen,E., Narasimhan,K., Marchand,J.A., Baas-Thomas,M., Liu,M., Chen,K., Chiappino-Pepe,A., Hu,F., Baym,M. and Church,G.M. 2022 — GenBank