Protein

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Genbank accession
AIX21997.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGSATQWSNSNPTLAQGELGIELDTGRIKIGDGVTAWNSLRYERPIESVSATANTLVQRDADGNFAAGTVTATLIGNASTSDRLSSTRQVSLTGDLTGSNTFDGGANLPINAELSRITTLPHYSSENTEATGTYTKVVVDSKGRITNASNPTTIQDYGLDTSIAGTGAQPYDLDLAAITNLTDGAAGFGLISRTSTGNITVRDIVTASTQRIVVNNGDGINGNPEIDLGLTTVVPDTSSFSQGLYNTESLTSVNSVGANGELLGTETVNTIKFTVDKYGRLQSATNVPIATATEGSKYANYDAGTAYSRYAIIQNASKVYQAIADIGAGVGAPTHSSGDTGSWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAAVGVDNTQLQNNRISFADGTTKEDFELDQELTATSGYRGFNYLNYIKVNDVSGNLLVGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDADITLDGALNQTLDKTGDGNLTFQLSQNTATDRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDLVEINASEGSGKVTVENARFQANYIATGNATMNLDPGDDRAVTGTVRVWGDLQVDGTTTTVNSTTLQVDDPIITLGGDTAPATDDNLDRGIEFRYYDTEARLGFYGWDTNYTDLGGHGGGYRFLHAATNTTEVFTGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTTNTTGDLVVAGGVGITQDVNIGGLLDVDSTFRANSTSRFDDTMVLRGASKSLQFQNGAGTVKSEIHTTTGNAEFGGILTVTGATDLNSTLNVASSVHFEATDEPTFALNSGTGIWEIQSNDYGSFRFDGGGYIAGDFMFDSDVVINGTILQKESATEVFNEQNFLRVRRKLESGSVQVLTPSYASHTTSNARIFGGAGIGTSLHIGGTSASEGLFIGKKESADTVKFSVLGASGNTDIEGTLNVEGEVTIQDSVIINAANEVFSIRNGSGVAKFDVDTDNGNTLIEGTLNVNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTVIEGTLNGKGDADFDSDLNVDGNTTLVGTLTVTNTTEFNNTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDASNELFSVRNGSAVAKFEVDTDNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGVSNVVTFTRNTQQTLTGSYAADGAFRLTGGAAIGKNLAVGGAARIYGGTELTGALDLNSSADISGALVTHDNVTITANNKTFAIQNGSAANKLTVDTDNGNTDIRGTLDIGGDVTAESNLTVTGNLTINGTTTTVNSTVTTLDDPIITVGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDSSAKIGFFGYDRSANQFAFVTDATNSSEVLSGTDGPLRAGSLNLTGAGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGPALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASAATATTVVARDSSGDFAANIITVASGEGAAAGIQGNSLTADTLKRSRIITLDGVVDGSVSFNGSADVTISTTYNDADITALAAMAGTGLVARTAANTYAQRSVTATASSGITVTNADGVSGNITINVASASTNAANNLVLRDASGDFAANEITADLIGGVTGNVTGNLTGNVTGNSSTVSTSSSGSATEVFVGTVFNQSGTNSITTNPGFKYDRATAKILGNLQGDVTGNLTGSASQVDTVTASSANAAYHLTMVDQHNTVANNETINTDQSLTYNPSTNRLKTKLELQTDAAPASATATGTVGEIRYDTNYIYICVATDTWKRAAISTWS
Physico‐chemical
properties
protein length:1730 AA
molecular weight: 178838,17720 Da
isoelectric point:4,26795
aromaticity:0,06012
hydropathy:-0,18775

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.10.10.30
1–44
G3DSA:2.10.10.30
SSF69349
4–245
SSF69349
IPR041352
5–43
IPR041352
AIX21997.1
1 1730
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014b
[NCBI] 		1493508 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX21997.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019060 [NCBI]
CDS location
range 88762 -> 93954
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAGTTAAGACGTGGCTCGGCTACGCAGTGGAGCAATTCAAATCCTACGCTGGCGCAAGGCGAATTAGGAATTGAACTCGATACAGGCCGTATCAAAATCGGTGATGGTGTTACTGCATGGAACTCACTTAGGTATGAAAGACCTATTGAATCAGTTTCTGCTACGGCAAATACATTGGTTCAGCGTGACGCTGATGGCAATTTTGCTGCAGGTACAGTAACAGCAACTCTTATTGGTAATGCTTCAACATCAGATCGTCTTTCTTCTACTAGACAAGTTTCACTTACGGGCGACTTAACTGGTTCTAATACCTTTGATGGTGGTGCAAACCTTCCTATCAATGCAGAACTTTCACGTATTACTACGCTACCTCATTATTCTAGTGAAAATACTGAGGCAACAGGAACTTATACTAAAGTAGTAGTTGACTCTAAAGGTAGAATTACTAATGCTTCTAATCCAACTACTATTCAAGACTATGGTTTAGATACCAGCATTGCAGGAACAGGTGCTCAACCATATGATTTAGACCTTGCTGCAATCACCAATCTTACTGACGGTGCTGCTGGTTTCGGTCTTATTTCTAGAACATCTACTGGCAATATTACTGTTAGAGATATTGTAACCGCATCTACTCAACGTATTGTTGTTAATAATGGCGATGGTATTAATGGTAATCCAGAAATTGACTTAGGTCTTACTACGGTTGTTCCAGATACATCATCATTTTCTCAGGGTTTATATAATACAGAAAGTCTTACATCTGTAAATTCTGTTGGCGCAAATGGAGAACTTCTTGGTACTGAAACTGTAAACACAATTAAATTTACAGTAGATAAGTACGGTCGTCTTCAAAGTGCAACAAATGTGCCTATCGCTACTGCTACCGAGGGTAGTAAGTATGCTAACTATGATGCAGGCACTGCTTATTCTAGATATGCAATCATTCAGAATGCATCAAAAGTCTACCAAGCGATTGCAGACATCGGTGCTGGTGTTGGTGCTCCTACTCATTCCAGTGGTGATACTGGATCATGGCGTTACCTCGCGGCTGAGGCAACGGAACAGAAGGGACTGGCTAGTTTTGCACAGGAAGATTTCGACGTTGACAGCAACGGGCATGTCACAATCGCCGCAGTAGGTGTTGATAATACACAATTACAAAATAATAGAATTTCTTTTGCTGATGGAACTACAAAAGAAGATTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTGCAACCTCTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATATTAAAGTTAATGACGTTAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTACTTCTCTGACGCTGATATTACTCTTGACGGCGCTCTTAATCAGACACTGGATAAGACTGGGGATGGTAACCTTACCTTCCAGTTAAGTCAGAATACTGCTACAGATAGAAACTTTAACATTCTGACAACTAATGCTGGTTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCAGAAGATTTAGTTGAAATTAATGCCTCTGAGGGAAGTGGTAAAGTCACTGTAGAAAACGCAAGATTCCAAGCAAACTACATTGCCACAGGTAATGCGACGATGAATCTTGACCCTGGCGATGATCGTGCTGTAACTGGCACCGTTCGTGTCTGGGGTGACCTCCAAGTCGATGGCACTACCACTACTGTAAACAGCACAACCCTGCAGGTCGATGACCCCATCATTACTCTGGGTGGAGATACTGCACCTGCAACCGATGACAATTTAGATCGTGGTATTGAGTTTAGATACTACGACACTGAAGCACGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAATTACACCGATTTGGGTGGTCATGGTGGCGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTACTGAGGTGTTTACTGGAACCGATTCTGGTATCATTGCAGGTAACGTAAAACTTACAACTGGCACCAACTCAACTACTAATACAACTGGTGATTTGGTAGTTGCTGGTGGTGTTGGTATTACTCAGGATGTAAACATCGGCGGTTTGTTGGATGTTGATAGTACATTCAGAGCAAATAGCACATCTCGTTTCGATGATACGATGGTGCTCCGTGGTGCTTCTAAGTCACTACAATTCCAGAATGGTGCAGGCACCGTTAAGTCCGAGATTCATACTACTACAGGTAATGCTGAGTTTGGTGGTATCTTAACAGTTACTGGTGCTACTGACCTCAATAGCACATTGAATGTTGCTAGTTCTGTCCACTTTGAAGCAACTGATGAACCCACCTTTGCATTGAATTCTGGCACTGGTATTTGGGAAATCCAATCCAATGATTATGGTTCATTCCGATTTGATGGTGGTGGATATATTGCTGGCGACTTTATGTTCGACAGTGACGTTGTTATTAACGGTACTATTCTACAGAAAGAATCTGCTACAGAGGTCTTCAACGAGCAAAACTTCCTGAGAGTTCGTCGTAAGTTAGAATCTGGATCCGTCCAGGTTCTAACCCCTAGTTATGCTTCACATACTACCTCAAACGCTAGAATCTTTGGTGGTGCTGGTATTGGTACTAGTCTCCACATTGGTGGCACATCTGCCAGCGAAGGTCTGTTTATTGGTAAGAAGGAGAGTGCCGATACGGTCAAATTCTCTGTCCTAGGTGCATCTGGTAACACTGATATTGAAGGCACTCTCAATGTTGAGGGTGAAGTTACTATTCAAGATAGTGTAATTATCAATGCTGCCAACGAAGTATTCTCTATTAGAAATGGTTCTGGTGTTGCTAAGTTTGATGTTGATACTGATAACGGCAATACCTTAATTGAAGGGACGTTAAATGTTAATGGTACTGTCGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTCAGAAACGGCACAACGGATAAATTCTTCGTTGATAATGTAACTGGCAACACCGTAATTGAAGGCACTCTGAATGGTAAGGGGGACGCTGATTTTGATAGTGATCTCAATGTTGATGGTAATACAACTCTGGTTGGCACTCTAACAGTCACTAATACCACCGAGTTTAATAACACCGTTGATGTTGATGCTAACTTTGCTGTTAGAAGTGGTAGTACGGATAAGATGACCGTCGCCTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGTACATTGGTTGTTCAAGGTCAAACAACTATTAATGATTCTCTGATTGTTGATGCTTCTAATGAACTCTTCTCTGTAAGAAACGGTTCTGCAGTTGCGAAGTTTGAGGTTGATACTGATAACGGCAATACAAATATCATTGGCACACTAACTGTTGGTGATGCAACTCAAATTAATGACACCCTTGGCGTCTCTAATGTTGTAACCTTCACAAGAAATACACAGCAAACTCTGACTGGTTCTTATGCTGCTGATGGTGCATTCCGTCTGACTGGTGGTGCTGCTATTGGTAAGAATCTTGCTGTTGGTGGTGCTGCAAGAATCTATGGTGGCACTGAATTAACAGGTGCTCTAGACCTTAATAGTAGTGCAGACATTTCTGGTGCTCTGGTAACTCACGATAATGTAACTATCACTGCAAATAACAAAACATTTGCTATCCAAAATGGATCTGCTGCTAACAAACTTACAGTAGATACTGATAATGGTAACACTGATATTCGTGGCACCCTAGACATTGGTGGTGATGTAACTGCTGAGTCTAATCTTACTGTTACTGGAAACCTTACTATCAATGGAACGACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGATGGTAAGGATCGTGGTGTTGAATTCCGTTATTACGACAGCTCTGCGAAAATTGGTTTCTTCGGATACGACAGATCCGCCAACCAATTCGCATTCGTAACAGACGCGACTAATTCATCAGAAGTTCTTTCTGGAACTGATGGTCCTCTTCGTGCTGGTAGTCTTAATCTTACTGGTGCTGGTACATCACTTGATGTTGATGCCAATGCTAACATTGATGGCACTCTGACTGTAGATGGTCAAATCATCTCTCAAGTTTCTTCTGGTCCTGCACTGGTTATTCCTAACACGACTAAGATTAACAACCTCAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTGCAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGAAGGTGCTGCTGCGGGTATTCAAGGTAATTCTCTTACTGCAGATACACTTAAAAGGTCAAGGATAATCACTCTCGATGGTGTTGTTGACGGTAGTGTATCCTTTAACGGATCTGCTGATGTTACTATTAGCACTACTTACAATGATGCAGACATCACTGCACTCGCCGCTATGGCAGGCACTGGTCTAGTAGCAAGGACTGCTGCCAATACTTACGCCCAACGCTCTGTAACCGCCACAGCGTCCTCTGGTATCACTGTTACCAATGCTGATGGTGTATCGGGCAATATCACCATTAACGTCGCTTCTGCAAGCACTAACGCAGCAAATAACCTTGTCCTTCGTGATGCTTCTGGTGATTTTGCTGCCAATGAAATTACTGCTGATTTGATTGGTGGTGTAACGGGTAACGTAACTGGTAACTTGACTGGTAACGTTACTGGTAATTCATCTACAGTCAGCACCTCAAGTTCTGGTTCTGCTACTGAAGTCTTTGTTGGAACAGTATTCAATCAGTCTGGTACTAATAGCATTACTACCAATCCTGGATTTAAGTATGACAGAGCAACCGCTAAAATTCTTGGCAATCTCCAAGGTGATGTTACTGGTAATCTGACTGGTAGTGCATCTCAGGTTGATACCGTCACTGCATCCAGTGCCAATGCCGCTTATCATCTGACGATGGTTGATCAACATAATACTGTTGCAAATAACGAAACCATTAA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Tertiary structure

PDB ID
08a28ec5a4c49e15de301ff91f0fe48d65dd9d1ab432b2daf866ae2ae56f5f77
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5785
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank