Protein

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Genbank accession
AHY25232.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,60
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,79
Protein sequence
MADLLKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADFDVLSDGVNVDFFIEENTIQQYDPTRGYKEDFAVIYDNRMWISNSEIIKPSGPFASILWRAVRTDPKWIEVTQPVYSLKSGDYVTINSNQRSSDLSLPSDPQDGDYIVVKDIGNNAGYNRQRIIATAQSIIRWGSARSEVLLSKPLSYNIMVFSNRQWQFYETAQEDRGTVITSSSGVFRAQAGDNILRRYTNAEPVRLTLPKYANQGDIIRSVDIDGLGPTYHLIISTFDTTSSIGTVGTHEIEFRTSSDGFLVYDELNKLWVVWDADIKTRLRIIKDDVVLRPNESIMVFGENNAISQTINITLPTSVAIGDTVKIALNYIRKMQTVIIKASPGDEIATDINLLQFPKRSEYPPDAEWVYVTELSFNGDISYTPVVEFSYIENDGKSCWVVAQNVPTIEQVDPKDNNTRKRLGVISLASQAEANVDFENSPLRQQAITPETLANRTATETRRGIARIANTGQVNQDTTFNFQDDIIITPKKLNERTATETRRGVAEISTQAETNAGIDDTTIITPKKLEARRATENMAGIAPLVSTVNTTMAPSRGNPGTNSYDYNEATKIVTPKAMFQAKATNTSQGGVYLALQSEVIAGVTQSGFPNAVVTPETLHAKTSTDSRIGLIEIATQAETDAGTDYTRAVTPKTLNDRKSSEVLTGIARIATQVEFDAGSLDTVISTPLKVKTHFNNSSRTSVVSDSGLVETGTLWDHYTLNIQEASITQRGTLKLSTQAQVDSGTDDTTAITPLKLQRKKSTESTEGIIQLSTQAEVIAGTVSNKAFSPLHYKYIVQQEKSWEATPSRRGYVKLTENALTWAGDNVNGSVANQETFEKTGYAVSPYEMNKALSHYLPIGAKAVDSDKLDGLDSLQFIRRDINQTVDGSLTLTKSTQFQAAITSTSTAVFSGSVTGAGLVSTNGSLSINNGTNTWGITAANNGTTLVLGNSLTLNSNGNASVTGNISSNASIEAKNSYILNGKTIASTITRTPNTLILGDNTQNTVIKTLDASNLVVSDVADYKVLTEKNAKDIVGTNFVKKEGDTMGGKLTVNAPVLPKISETLAMAPLTSANIGFWGAEIVSASIYNTLPGYAVPVMEMSGGQQTGFVDHYEYVKAPGLMTCSGTSIDYIYRTWSPRPQIAQDNHNANTQYISIWDAARGVWGSWGRVYTNSAPPTASEIGAVTNSGSAFDNLTIRDWLQIGNVRIEPDESTQTVKFTWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1242 AA
molecular weight: 135249,41160 Da
isoelectric point:5,14128
aromaticity:0,07407
hydropathy:-0,30161

Domains

Domains [InterPro]
IPR048391
1090–1190
IPR048391
AHY25232.1
1 1242
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pectobacterium bacteriophage PM2
[NCBI] 		1429794 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Pectobacterium
[NCBI] 		122277 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AHY25232.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KF835987 [NCBI]
CDS location
range 153670 -> 157398
strand +
CDS
ATGGCCGACTTATTGAAACCTGCATTTCGTGCAACTTCTGGCCTGGATGCAGCAGGTGAAAAAGTTATCAATGTCGCTAAGGCAGATTTTGATGTATTAAGTGATGGTGTTAACGTTGATTTCTTCATTGAAGAAAATACCATTCAGCAATATGACCCTACAAGAGGGTATAAAGAAGATTTTGCTGTAATTTATGATAACAGAATGTGGATTTCTAACTCAGAAATTATTAAACCTTCAGGACCGTTTGCAAGTATATTATGGCGTGCTGTTAGAACAGACCCAAAATGGATCGAAGTTACCCAACCTGTTTATTCACTTAAATCTGGCGATTATGTTACTATTAATAGTAACCAACGTTCTAGCGATTTATCTTTACCTAGCGATCCACAAGATGGCGATTATATTGTTGTTAAAGATATCGGAAACAACGCTGGATATAATCGTCAAAGAATAATTGCAACAGCCCAAAGTATCATTCGTTGGGGCTCAGCTCGTTCTGAAGTTTTATTATCTAAGCCATTAAGCTATAATATTATGGTTTTCTCTAATCGTCAATGGCAATTCTATGAAACTGCTCAAGAAGATAGAGGAACAGTTATAACTTCAAGTAGTGGTGTATTCAGAGCTCAAGCAGGCGATAATATCTTAAGACGTTATACTAATGCAGAACCAGTAAGATTAACTTTGCCAAAATATGCTAATCAAGGTGATATCATTAGATCTGTTGATATTGATGGGCTTGGTCCAACATATCATTTAATTATTTCTACCTTTGATACTACTTCATCTATTGGAACTGTAGGAACTCACGAAATTGAATTTCGTACTTCTTCTGATGGATTTTTAGTTTACGATGAATTAAATAAGCTCTGGGTTGTCTGGGACGCTGATATTAAAACTCGTCTAAGAATAATTAAAGACGACGTTGTTTTGAGACCTAATGAAAGTATTATGGTCTTCGGTGAAAACAATGCTATTTCGCAAACAATTAATATCACTTTACCTACTAGCGTTGCTATCGGTGATACTGTTAAAATTGCACTGAACTACATCAGAAAAATGCAGACAGTTATTATTAAAGCATCTCCTGGCGATGAAATTGCTACAGACATTAATTTACTTCAGTTCCCTAAAAGGTCTGAGTATCCGCCGGATGCAGAATGGGTATACGTAACTGAATTATCTTTCAATGGTGACATTAGTTATACTCCTGTTGTGGAATTTAGTTATATAGAAAACGATGGTAAAAGTTGTTGGGTTGTGGCTCAAAACGTTCCTACAATAGAACAAGTAGACCCTAAAGATAATAATACTCGTAAGCGTTTAGGTGTTATTTCTTTGGCAAGCCAGGCTGAAGCCAATGTTGATTTTGAAAATTCTCCTTTGAGACAACAAGCTATTACGCCAGAAACACTTGCAAATAGAACTGCAACAGAAACAAGACGTGGTATCGCTCGTATTGCAAATACAGGACAAGTTAATCAAGATACGACATTTAATTTCCAAGATGATATCATTATTACTCCTAAAAAATTAAATGAAAGAACTGCAACAGAAACAAGACGTGGTGTAGCTGAAATCTCTACTCAGGCTGAAACTAATGCTGGCATAGATGATACAACTATTATTACTCCTAAAAAATTAGAAGCGAGAAGAGCTACCGAAAATATGGCAGGTATTGCGCCATTAGTTTCTACTGTTAATACGACCATGGCTCCATCCCGTGGCAATCCAGGAACTAATAGTTATGATTACAATGAAGCTACAAAAATTGTAACTCCGAAAGCTATGTTCCAAGCTAAAGCTACAAATACTTCTCAAGGTGGCGTTTATTTAGCATTGCAGTCTGAAGTTATTGCGGGTGTAACCCAATCAGGTTTTCCTAATGCGGTTGTTACGCCTGAAACATTACATGCAAAAACTTCCACTGATTCTAGAATTGGATTGATTGAAATTGCCACACAGGCAGAAACTGATGCTGGAACGGATTATACAAGAGCGGTTACACCTAAAACTCTTAATGACCGTAAATCTAGTGAAGTGCTAACAGGTATTGCTCGTATTGCAACACAAGTAGAATTTGATGCTGGCTCATTAGATACTGTTATTTCAACTCCGTTGAAAGTTAAAACACATTTTAATAATTCATCTAGAACTTCTGTTGTCAGCGATAGTGGTTTAGTAGAAACAGGGACCTTATGGGACCATTATACACTTAATATCCAGGAAGCAAGTATTACCCAACGCGGGACACTTAAGTTGAGTACCCAGGCCCAGGTTGATTCAGGCACCGATGACACGACTGCAATTACTCCATTAAAATTGCAGAGAAAGAAATCCACTGAAAGCACTGAAGGTATTATTCAGTTATCTACTCAGGCCGAAGTTATTGCTGGAACTGTTTCTAATAAAGCTTTTAGTCCGCTTCATTACAAATATATAGTCCAACAAGAAAAATCTTGGGAAGCGACTCCTTCTAGAAGAGGATATGTAAAATTAACTGAAAACGCTTTAACATGGGCTGGTGATAACGTTAATGGCTCTGTTGCTAATCAAGAAACATTTGAGAAGACAGGCTATGCGGTTTCTCCTTATGAAATGAATAAAGCATTAAGTCATTATTTACCTATTGGTGCAAAAGCAGTTGATTCTGATAAATTAGACGGACTAGATTCGCTTCAGTTTATTAGACGTGATATTAATCAGACTGTTGATGGCTCATTAACCTTGACCAAATCTACACAATTCCAGGCAGCAATAACGTCTACATCTACTGCAGTATTTTCTGGTAGTGTGACTGGTGCTGGTTTAGTGTCAACTAATGGCTCTTTAAGCATTAACAATGGAACTAATACTTGGGGTATTACAGCAGCCAATAATGGAACGACTTTAGTTTTAGGAAATTCACTTACATTAAATTCAAATGGAAATGCTTCTGTAACAGGAAATATTTCTTCTAATGCAAGTATCGAAGCTAAAAATAGTTATATCTTAAACGGTAAAACTATAGCATCAACTATTACCAGAACTCCTAATACTTTAATCTTAGGTGATAATACACAAAATACCGTTATTAAAACTCTTGATGCAAGTAATTTAGTCGTTAGCGATGTGGCAGATTATAAAGTATTGACTGAAAAGAATGCCAAAGATATTGTTGGTACTAATTTTGTCAAAAAAGAAGGCGACACAATGGGTGGTAAACTCACTGTTAACGCGCCGGTATTACCTAAAATATCTGAAACATTGGCAATGGCACCATTAACTTCTGCTAATATAGGATTCTGGGGTGCTGAAATAGTTTCTGCGTCTATTTACAATACATTACCTGGTTATGCTGTTCCTGTTATGGAAATGTCTGGTGGTCAACAGACTGGTTTTGTGGACCATTATGAATATGTTAAAGCTCCAGGATTAATGACTTGTTCAGGAACTTCTATTGATTATATTTACCGCACTTGGTCCCCAAGACCACAAATTGCACAAGATAATCATAATGCTAACACCCAATATATTTCTATTTGGGATGCTGCTAGAGGTGTTTGGGGTTCATGGGGAAGAGTTTATACCAATAGTGCTCCACCTACAGCAAGTGAAATTGGCGCTGTAACTAATTCTGGTTCTGCTTTTGATAACCTTACTATTAGAGATTGGTTGCAAATAGGTAATGTTAGAATTGAACCAGACGAATCCACTCAAACAGTTAAATTTACTTGGGTAGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
c7ec4bcff1a524c233dc09a5dd8ff51fcb3ff1bead2d7aa2e4ef23435ac6528b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2291
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50