Protein
View in Explore- Genbank accession
- QBX06173.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fibers protein
- RBP type
-
TSPTSPTF
- Protein sequence
-
MAELRSTTAIGGNIVWHGGNLRFDPQGETIRYQGHKIYTEHDTPLPGELGNGGTTSAFTKAESDGRFAPIVAGGYVKKTGDTMSGKLTNTANEIEINGASPRLLLRDNDNSKNWYIMNSTDSFSIRENDVVTTRFRIDATAADFSVDSIDINMKTALRGFDDWLRINDQNEFTSGVYYGSSLLRTDGTLQIGNNGSTLSVNGSAFTYEGNNVFTEAYHPNADKWTSARTLTTTLTGDVSGSASMTIDGSANATVTVTATVANDSHTHDGRYYTEAESDARFANVTGDTFTGNVAISKAGARLSFNETLYATENSGINWITGANQNLELIHEISDVDINTDGGNGQALIIRENGSTASVAGLEVQGEIFAKVNQRVFHDAYHPNADRWTSARTLTTTLTGDVSGSASMTIDGSANATVTVTATVANDSHTHDGRYYTEAESDARFANVTGDTFTGNVAISKAGARLSFNETLYATENSGINWITGANQNLELIHEISDVDINTDGGNGQALIIRENGSTASVAGLEVQGEIFAKVNQRVFHDAYHPNADRWTTARTITLGGDLTGSVSIDGTSNVTLNASVPSLSNYPTFAEVGIRADQPNYLATGRTMAGVDTTVDWDTLTQGGFYYKLSQGTNRPSGFTGYWYVQNMTYGSTSNTTQVAYPYGLAGNVGTMAMRTRYSEVWEDWVYMYHTDYHPYADKWTTARSLSLGGELSGSVSIDGSSNVTLDASVDFITNVLNINRVGESNPSIWFNNDTGETRGNIYWNRVDDSLQFRLNASDGTTAENIMSMYSDRTVFTDAVHTSALLNDANTEQGLLMYSGGTTRLGGGGAGAIYLCPQGVNYNASSNFAASLNTFGVMSLNSSSSTPLSVHRVEESSVPNVNIRFQGKSTNGNALGESWYAGSFTNGAGFGIGTNADLSTASNRLFEVGGAGAVVRREGTGATSLTIQGTDPFLLFDQTDIGKSGYIGMDGSGVDSLYVRTPDDSTRRSIYHEANKPTANDVVNNVISLNGLDSTKFYPVVFDANNTAGYTCEFTLSVGSGQGSSPYNNNTLTGVARGGGWSDHNAYYDLMLQKYSDSETNIHSIWEGSQGFVGLVIYVRGGQSINLRSNSRAQVYTSDYSFGGSVFPAGISNPLGAATNANMLAYFDRSGRYTSWSATNFKLNGGKYSIYTGTSNAELTLDTDANVNSIFRMTEDAGHHGAYIQYEGGANEFRLGTRQSDVDTIALRVYRGSASVHIGNELLSKAVDIALGGRIKFNGKHAIRAYDAQWLRINDESAFTSGIYCGNSLLRTDGQITSGSWSGSNKSARVASNFYDSTWAGNGTAAFSVNNPDTVGAHWAFASYYNGSNIRSGIQILSNSEGRMRFYTNRRSKYVEINGGSVVATGNVTAYSDARLKENVKVIDNALNKVGELSGYTYDKRTSLDSDEFTRETGVIAQEVQKVLPEAVMESDEDHILSVAYGNMNGLLIEAIKELNEKVDSLQNEVQELKRPWWKKLLRL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1500 AA molecular weight: 161723,88240 Da isoelectric point: 4,95405 aromaticity: 0,09533 hydropathy: -0,39193
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Vibrio phage Va3 [NCBI] |
2563734 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX06173.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK568540.2
[NCBI]
CDS location
range 163875 -> 168377
strand +
strand +
CDS
ATGGCAGAACTAAGATCAACTACCGCAATTGGTGGTAACATAGTTTGGCACGGAGGGAATCTTCGCTTTGACCCGCAAGGCGAGACAATTCGCTACCAAGGCCACAAAATTTATACAGAACATGATACACCACTACCAGGCGAATTAGGTAACGGTGGGACGACTTCTGCATTCACGAAAGCTGAATCTGATGGTCGTTTTGCTCCGATTGTTGCTGGCGGCTACGTGAAGAAAACCGGCGATACAATGTCAGGTAAATTGACAAACACGGCAAACGAAATTGAGATCAACGGGGCATCGCCACGTCTGTTGTTGCGCGACAACGACAACTCGAAAAACTGGTACATTATGAACTCGACTGATAGTTTCAGTATTCGAGAAAATGATGTAGTCACTACTCGCTTCAGAATTGATGCTACTGCTGCCGACTTTTCTGTTGATAGTATTGATATCAACATGAAAACAGCATTGCGTGGGTTTGATGATTGGTTGAGAATCAATGATCAGAATGAGTTTACGTCTGGGGTTTATTACGGAAGCTCTCTATTACGTACAGACGGAACGTTGCAAATCGGCAACAATGGTTCAACTCTGAGTGTAAACGGCTCTGCGTTCACGTATGAAGGTAATAACGTCTTCACTGAAGCATATCACCCAAATGCGGACAAATGGACATCTGCACGCACTCTTACAACGACTCTAACGGGCGATGTAAGCGGTTCTGCGTCTATGACTATTGATGGATCGGCTAATGCGACCGTGACTGTTACAGCGACTGTAGCGAACGATTCACACACACATGACGGTAGGTACTACACTGAAGCTGAATCTGATGCGAGATTTGCAAATGTTACAGGTGATACATTTACTGGAAACGTTGCGATCAGCAAAGCAGGTGCGCGTTTAAGCTTCAACGAGACTCTATATGCAACCGAAAACTCAGGTATTAACTGGATTACGGGTGCGAATCAGAATCTGGAATTGATTCATGAGATTAGTGATGTTGACATCAACACTGATGGTGGTAACGGTCAAGCATTGATCATTCGTGAGAATGGTTCAACTGCATCGGTCGCAGGACTTGAAGTACAAGGTGAGATCTTCGCGAAAGTAAACCAACGTGTATTCCACGATGCTTATCACCCAAATGCTGATAGGTGGACATCTGCACGCACTCTTACAACGACTCTAACGGGCGATGTAAGCGGTTCTGCGTCTATGACTATTGATGGATCGGCTAATGCGACCGTGACTGTTACAGCGACTGTAGCGAACGATTCACACACACATGACGGTAGGTACTACACTGAAGCTGAATCTGATGCGAGATTTGCAAATGTTACAGGTGATACATTTACTGGAAACGTTGCGATCAGCAAAGCAGGTGCGCGTTTAAGCTTCAACGAGACTCTATATGCAACCGAAAACTCAGGTATTAACTGGATTACGGGTGCGAATCAGAATCTGGAATTGATTCATGAGATTAGTGATGTTGACATCAACACTGATGGTGGTAACGGTCAAGCATTGATCATTCGTGAGAATGGTTCAACTGCATCGGTCGCAGGACTTGAAGTACAAGGTGAGATCTTCGCGAAAGTAAACCAACGTGTATTCCACGATGCTTATCACCCAAATGCTGATAGGTGGACTACTGCTCGTACAATCACACTAGGTGGTGATCTAACAGGTTCAGTATCTATCGATGGTACTTCAAACGTTACGTTGAATGCATCTGTTCCGTCACTATCAAACTACCCGACATTTGCTGAAGTTGGTATACGCGCAGATCAGCCGAATTACTTAGCAACTGGTCGAACGATGGCAGGTGTTGATACTACAGTTGATTGGGATACGCTAACACAAGGTGGTTTCTACTACAAGTTATCACAAGGTACAAATAGACCAAGCGGATTTACTGGCTACTGGTATGTTCAGAACATGACATATGGTTCAACTTCGAATACTACTCAAGTTGCATACCCTTACGGTCTAGCTGGAAATGTTGGTACAATGGCGATGCGTACTCGTTATAGTGAAGTATGGGAAGACTGGGTGTACATGTACCACACAGATTATCACCCATATGCAGACAAATGGACAACTGCACGTTCACTATCACTAGGTGGTGAGTTAAGCGGTTCAGTATCTATCGATGGTAGTTCAAACGTTACGCTAGATGCCTCAGTTGATTTCATCACGAACGTGTTGAATATCAATCGCGTTGGCGAATCAAACCCGTCGATTTGGTTTAACAACGACACGGGTGAAACTCGCGGTAACATCTACTGGAATCGAGTTGATGATTCATTGCAGTTTCGTTTGAATGCCTCTGATGGAACTACTGCTGAAAACATAATGTCAATGTACTCAGACCGTACAGTGTTTACAGATGCAGTTCATACAAGCGCGCTGTTGAATGATGCAAACACAGAACAAGGTTTGTTGATGTATAGCGGTGGTACGACTCGACTAGGTGGCGGCGGCGCGGGGGCAATTTACTTATGCCCGCAGGGTGTTAATTATAATGCATCAAGTAATTTCGCAGCATCGCTTAACACGTTCGGGGTGATGTCATTGAATTCATCATCTTCAACCCCACTTTCTGTACATCGAGTTGAGGAGTCTTCAGTACCTAACGTTAATATTCGATTCCAAGGAAAGAGTACTAACGGAAATGCACTAGGTGAATCGTGGTATGCAGGTTCGTTCACGAACGGTGCAGGGTTTGGTATTGGTACAAATGCAGACTTATCCACAGCATCAAATCGATTGTTCGAAGTTGGTGGTGCAGGTGCAGTTGTGCGTCGAGAAGGAACTGGTGCTACGAGTCTTACTATTCAAGGTACTGACCCGTTCTTGTTGTTTGATCAAACAGATATTGGTAAATCTGGTTATATCGGAATGGACGGTTCGGGTGTTGATTCACTTTATGTTCGTACCCCAGACGATTCGACAAGACGCAGCATTTACCATGAAGCGAATAAACCAACTGCGAATGATGTAGTCAATAACGTAATCAGTCTAAATGGTTTAGATTCGACTAAATTCTATCCAGTCGTATTTGATGCAAACAATACTGCTGGTTATACGTGTGAATTCACATTGTCTGTAGGTTCGGGTCAAGGCAGCTCACCATATAACAATAACACATTAACAGGGGTTGCTCGTGGCGGCGGTTGGTCAGACCACAATGCATATTATGACTTGATGTTACAGAAATACTCAGACAGTGAAACAAACATTCACTCGATCTGGGAAGGTTCACAGGGATTTGTTGGTCTTGTTATCTACGTTCGTGGTGGTCAGAGTATAAATCTGCGTAGTAACTCTCGCGCTCAAGTGTATACTTCAGACTACTCATTCGGTGGGTCGGTGTTCCCTGCGGGAATCTCAAACCCACTGGGTGCTGCAACTAATGCTAATATGCTCGCATACTTCGATAGATCAGGACGATACACATCGTGGTCGGCGACTAATTTCAAACTAAATGGTGGTAAGTATAGCATCTACACGGGTACGAGTAATGCTGAATTGACATTAGACACCGACGCTAACGTTAATTCGATCTTTCGTATGACTGAAGATGCTGGGCATCATGGCGCTTATATTCAATATGAAGGCGGGGCAAACGAGTTTCGTTTAGGTACTCGTCAGTCAGATGTTGACACTATTGCATTACGTGTATATCGCGGTTCTGCAAGTGTACATATCGGAAATGAGCTACTTTCCAAGGCTGTGGATATTGCGTTAGGTGGTCGTATTAAGTTCAATGGTAAACATGCGATTAGAGCTTATGATGCTCAGTGGCTGAGAATAAATGACGAAAGTGCATTTACTTCTGGAATTTATTGTGGTAATTCATTGCTACGCACAGACGGTCAAATCACTTCAGGTTCTTGGTCTGGTTCAAATAAATCAGCTAGAGTTGCATCTAACTTTTACGATTCGACGTGGGCAGGTAACGGAACTGCTGCATTTAGCGTAAACAACCCAGATACTGTGGGTGCTCACTGGGCATTTGCTTCTTATTACAACGGTAGTAATATTCGCTCGGGTATTCAGATTCTATCAAATTCTGAAGGTCGTATGCGTTTCTACACTAACCGTAGAAGTAAGTATGTTGAGATAAATGGTGGTAGTGTAGTTGCAACAGGTAACGTTACAGCTTACTCAGATGCACGTTTGAAAGAGAATGTCAAGGTTATTGACAATGCACTCAATAAAGTAGGTGAATTAAGCGGGTATACATATGATAAGCGCACATCATTAGACTCAGATGAGTTTACTCGTGAAACTGGTGTAATCGCGCAAGAAGTGCAAAAAGTGCTACCAGAAGCTGTGATGGAAAGTGACGAAGATCATATTCTATCAGTGGCGTACGGTAATATGAACGGTCTTTTGATTGAAGCTATTAAAGAGCTTAATGAGAAAGTCGATTCACTTCAGAACGAAGTACAAGAACTTAAACGCCCATGGTGGAAGAAGTTGCTTCGTTTATAA
Tertiary structure
PDB ID
87619e593d675c5bb19d9f6c0fb49ffc17689c0902dc161da1e37d5111fe5de2
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50