Protein

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Genbank accession
QPX48298.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MALLKTNTGIGTTNPTSALHVIGDVLVTGVVTSTTFNGNINSGVGTIVNLTNTRLTSGVGTITTLNSNTATILDIDNLRMLSGIATITQINATTIVSTNNDFDHLNANFGNIDVGIVTDISGTRLNYTGVGTITTLNSTNSTLTNLNNERLTSGIATVTDLINTRLTSGIATITDLNVTNSTFNNLNVINLNAVTGVVTDISGSRLNYTGVGTITTLNSTHTNLTNINSTGISTLADIRAERVTVTGIVTANSFRPTSGYIQAADGTNSFYIYNTTGNVAFQGTIGVNQINNAGGYQVLTFNNIDTRLTGNLDIAGVTTSSVFNGNIYSLGVSTFRNGPVLIGTGTSTGTAFQPLQVTGGAYVSDNLGLGLISPTSKLDVVGDGRFTGVVTATTFNGDINAGVSTLGVATAINLTSQQLIVSGLSTFVGVTTFQNDVYVSGDLYVTNDLKLDEITARNVNVTGVATIFNLVGTAATITTFNNTTSTITDLSNTRLTSGIATITDLNVTNSTFNNLNTTNLNAVTGVVTTLSGTNVTYTNSDFINLNANNAFVDVGIVTDISGTRLNYTGVGTITTLDTDTATINNLSSDYINVGVATATILNSGIGTITDLNNTRLVSGIATITTLNATNVVSTNSNFTNLNANNAYINVGVVTDISGTRLNYTGVGTIATLDTTNATIDDISNTNITVSGIATIQNLSVLGDFDVYDTTATFHNNVFISGNLSIGGTSSIITAQDLNILDKEITLGVTTNAFNQDVSNDITANHGGISIASTQGYPLVDLALAGFSSLPATYKQLMWVAANSYGVGTTDAWMFNYAVGIGSTQVPNDVRLAVGEVQITDHQINAITGDFDRLISGIATFTGADISNLHSNNLFAQSGIITDLSGTRLNYTGFGTIANLYSTDAYIDDIASNVGFATAFTAERLNVSGVGTIATLDSTTSTITNLNVTNSTFTNVNVNNLYAVSGIVTTLTSTHSTLENINSAGISTLNIVRTNTINSSGVVTAPTFVGDLLGVANYAHVSGYSTFSGYSNTSGFSTFSGYANAAGVSTFADYANNAGIATYAWTAGVSTYSGVAGYSTFSGYSDTTGFSTFSGYSNTSGFSTFSGYSNTSGFSTFSNYSDTSGFSTFSGYANNAGIATYAWTAGVSTYSGVAGVSTSVVGGNVDVSQLNVTGITTLGFATVSSLYVTGFTTIGQVQINPSGIITSASPGIATVVYYGDGSNLIGVNAFNVINQPLTSNTVYPTFATNAGVASVGISSTQVAYIPSSNRLGIGTTNPNYTLEIVGNTKVSGLTSVTNLEIYGTVGAGNTLGNDGQYLKSTGIGVTWSSFPTLRTTGITTAIYGQTSFSFAYNVGFLDVYVNGVKLAGSEYTAVNGSTVTLLSPTFSGDVVEFVSYNTLSTGSGGGGGGSISLDNLTDVEITNPQVGELLGFNGTYWVNDYTFTTTTATVSQVPIHTISSNDYRSIEYIIQVTNGTNYHLTKLLVLHDGTTAYNTEYGTLSTGPILATFDTDISGGAIRLLATPYSSSTITYKIKFTAIKS
Physico‐chemical
properties
protein length:1540 AA
molecular weight: 159429,72940 Da
isoelectric point:4,27596
aromaticity:0,08377
hydropathy:0,17532

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-SRM01
[NCBI] 		2781608 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QPX48298.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW015081 [NCBI]
CDS location
range 216169 -> 220791
strand +
CDS
ATGGCACTACTTAAGACTAATACTGGTATAGGTACAACCAATCCAACGTCTGCCTTACACGTTATTGGAGATGTATTAGTTACTGGTGTAGTTACATCTACGACATTTAACGGAAATATTAACTCTGGGGTTGGCACTATTGTCAATCTAACCAACACACGGTTGACAAGTGGTGTTGGAACTATTACAACTCTGAACAGTAATACTGCAACAATTCTTGATATTGATAATTTGAGAATGTTGAGTGGTATTGCCACCATCACTCAAATCAACGCTACAACAATTGTATCTACTAATAATGATTTTGACCATTTAAATGCTAATTTTGGAAATATTGATGTTGGTATTGTCACAGATATTTCTGGAACAAGACTCAATTATACTGGTGTTGGTACAATTACCACACTCAATAGCACTAATTCTACATTAACCAATCTCAATAATGAGAGATTAACGAGTGGTATTGCAACTGTAACTGACCTTATTAATACCAGATTGACAAGTGGTATTGCCACAATTACTGATTTAAATGTAACTAACTCTACATTTAATAATCTTAATGTTATTAATTTAAATGCAGTAACTGGTGTCGTTACTGATATATCTGGTTCAAGACTGAATTATACTGGTGTTGGAACAATCACAACACTGAATAGCACTCACACTAATTTAACTAATATTAATTCTACTGGAATTAGCACTCTTGCTGATATTAGAGCAGAACGTGTTACTGTTACTGGAATTGTAACCGCAAACTCATTCCGCCCAACGAGTGGTTATATTCAAGCAGCAGATGGAACTAATTCATTTTACATCTACAACACCACTGGTAATGTAGCGTTCCAAGGAACTATTGGTGTTAATCAAATTAACAATGCTGGTGGATACCAGGTTCTTACTTTCAATAATATTGATACAAGACTTACTGGCAATTTAGATATTGCTGGAGTTACAACTTCTTCGGTATTTAATGGTAATATCTATTCTCTTGGTGTTTCTACTTTTAGAAATGGTCCAGTATTAATTGGAACTGGAACTTCTACAGGGACTGCATTCCAACCACTCCAAGTTACTGGTGGTGCTTATGTTTCGGATAATCTTGGATTGGGACTTATTTCCCCAACATCAAAACTGGATGTTGTTGGTGATGGTAGATTCACTGGCGTAGTTACTGCCACTACCTTTAATGGAGATATTAATGCAGGTGTCTCTACACTTGGTGTTGCAACAGCAATCAATCTAACTTCCCAACAACTGATTGTATCTGGACTATCTACATTTGTTGGAGTCACAACATTCCAAAATGATGTTTATGTTAGTGGAGACCTTTATGTTACTAATGATTTAAAATTAGATGAAATTACTGCTCGTAATGTCAATGTAACTGGTGTTGCTACAATCTTTAATCTTGTAGGCACTGCGGCAACAATTACAACTTTTAATAATACAACTTCTACGATTACTGATTTAAGCAACACCAGATTAACTTCTGGTATCGCTACAATTACAGATTTAAATGTAACAAACTCCACATTTAATAATCTCAATACAACTAATTTAAATGCAGTAACTGGAGTTGTTACTACACTTTCAGGTACAAATGTAACTTATACAAACTCAGACTTTATTAATCTAAATGCCAATAATGCGTTTGTTGATGTTGGTATTGTTACTGATATCTCAGGAACCAGATTAAATTATACTGGTGTTGGCACAATCACCACATTAGATACTGACACTGCAACAATTAATAATCTTTCAAGTGATTACATCAATGTTGGTGTTGCTACTGCTACGATTCTGAATAGTGGTATTGGTACGATTACTGATTTAAACAACACAAGACTTGTAAGTGGTATCGCTACAATTACTACACTCAATGCGACGAATGTAGTTTCAACTAATTCTAACTTTACCAATCTAAATGCAAATAATGCTTATATCAATGTTGGTGTTGTTACGGATATTTCAGGAACAAGATTAAATTATACTGGTGTTGGCACAATCGCAACATTAGACACTACAAATGCTACGATTGATGATATTTCTAATACCAATATAACTGTAAGTGGTATTGCAACAATTCAAAATCTTAGTGTTTTGGGTGACTTTGATGTTTATGATACGACAGCAACTTTCCATAATAATGTCTTTATTTCCGGAAACTTAAGTATTGGTGGTACATCATCAATAATTACTGCACAAGACTTAAATATCTTAGACAAAGAAATTACTCTCGGTGTTACAACAAACGCTTTTAATCAAGACGTTTCAAATGATATCACTGCAAATCACGGTGGTATTTCAATTGCTTCTACTCAAGGTTATCCATTAGTAGACCTTGCCCTTGCTGGATTTAGTTCTTTACCAGCAACTTATAAGCAGTTGATGTGGGTTGCTGCCAATTCTTATGGAGTTGGAACCACTGATGCTTGGATGTTTAACTATGCAGTCGGCATTGGTTCTACACAAGTCCCCAATGATGTAAGACTTGCTGTTGGTGAAGTTCAGATTACTGACCATCAGATTAATGCAATAACTGGAGATTTTGATAGATTAATCAGTGGAATTGCTACATTCACTGGTGCTGATATTAGTAATCTTCACTCCAATAATTTATTTGCACAATCTGGAATTATTACAGATTTAAGTGGCACCAGATTAAACTATACTGGATTTGGAACAATCGCCAATCTTTATAGTACTGATGCTTATATTGATGACATTGCTTCAAATGTTGGATTCGCAACTGCCTTTACTGCCGAAAGATTAAATGTATCTGGTGTTGGTACAATTGCCACACTTGATAGCACGACTTCTACGATTACGAATCTGAATGTAACTAACTCAACATTCACAAATGTAAATGTAAATAATCTTTATGCTGTTAGTGGTATTGTTACAACACTTACTAGCACTCATTCAACTCTAGAAAATATTAATTCTGCTGGAATCAGCACTCTTAATATTGTAAGAACGAATACTATTAATTCTAGTGGTGTTGTAACTGCTCCTACATTTGTTGGAGATTTATTAGGTGTAGCAAATTATGCTCACGTATCTGGTTATTCTACCTTTTCTGGATACTCAAACACTTCTGGATTCTCCACATTCTCAGGATACGCAAATGCTGCTGGAGTATCTACCTTCGCAGACTATGCTAACAATGCTGGTATAGCAACTTATGCTTGGACTGCAGGCGTCTCCACTTACTCTGGTGTTGCTGGATATTCAACGTTCTCTGGATATTCAGATACCACTGGTTTCTCAACGTTCTCTGGTTATTCTAACACATCAGGATTCTCAACTTTCTCTGGTTACTCGAACACATCTGGATTCTCAACATTCTCTAATTATTCGGATACTTCAGGGTTCTCAACCTTCTCTGGTTACGCTAACAATGCTGGCATAGCGACTTATGCCTGGACTGCTGGAGTTAGCACTTATTCTGGTGTTGCTGGAGTATCTACAAGTGTAGTTGGTGGAAATGTAGACGTATCTCAACTGAATGTAACTGGAATTACAACTCTTGGATTTGCAACAGTTTCTTCATTATATGTCACTGGATTTACTACGATTGGTCAAGTTCAAATCAATCCATCAGGAATTATCACTTCTGCAAGTCCAGGTATTGCAACAGTTGTTTATTATGGTGATGGTTCAAATCTGATTGGTGTTAATGCATTTAATGTTATTAATCAACCATTAACATCAAATACTGTTTATCCAACATTTGCAACAAATGCTGGTGTGGCATCTGTTGGCATTTCTTCCACACAAGTTGCTTATATCCCATCATCCAATCGTCTTGGTATTGGAACAACTAATCCAAATTATACTTTAGAAATTGTTGGTAATACTAAAGTTTCTGGTCTGACTTCTGTTACCAATCTTGAGATTTATGGAACTGTAGGTGCTGGAAATACTCTTGGAAATGATGGGCAATACTTAAAATCAACTGGTATTGGAGTCACTTGGTCTTCTTTCCCAACCTTAAGAACGACTGGAATTACCACTGCAATTTATGGTCAGACCTCATTTAGTTTTGCTTATAATGTTGGATTCCTTGATGTTTATGTAAATGGTGTTAAATTAGCGGGAAGTGAATATACTGCTGTTAATGGTTCAACTGTAACATTACTTTCGCCAACATTTAGTGGAGATGTTGTTGAATTTGTTTCTTATAACACATTGAGCACTGGGTCTGGTGGCGGAGGAGGAGGGTCAATATCACTTGATAATCTAACTGATGTTGAAATTACAAATCCTCAAGTTGGAGAATTACTTGGATTTAATGGAACATATTGGGTTAATGATTATACATTTACAACTACTACTGCAACAGTATCGCAAGTTCCTATTCATACAATTTCTTCAAATGATTATCGTTCCATTGAGTATATAATTCAAGTTACAAACGGAACTAACTATCATTTGACAAAATTATTAGTTCTTCACGATGGAACCACTGCATATAATACTGAATATGGGACACTTTCAACAGGACCAATATTGGCAACATTTGATACTGATATTAGTGGAGGAGCAATAAGACTTCTTGCAACTCCTTATAGTTCTTCAACAATAACTTACAAGATTAAGTTTACCGCAATTAAGTCCTGA

Tertiary structure

PDB ID
c3e08f48b2ea061e2a89e48dc0dc5c34aa0ecd662a075bee2646ccd3b2d56e8b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5159
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50