Protein

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Genbank accession
AIX40236.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MAQNTNLNVTPYYDDFDKDRNFYRVLFRPGFPIQARELSTMQSILQNQVESVGSHLFKDGAMVIPGQVGYDLNVQAILLQESFLGSDVETYRTQLTGTIIEGLTTGVKAKVLYSISASESERGYVTLYVKYIDSGDTTSESALNTFQINEQLIASKEITFGTTLIEIGTPFAQLLPVNATAVGSTAYISDGVYFIRGHFVNVPSSYLILNQYDTNPSYRIGLEILESIITPEDDESLNDNAAGTSNYSAPGAHRFKIGTQFVKRLITDEADKNFIELLRINNSNVESFVERTAYSELEKSMARRTYEESGDYVIDTFDVTPREHLNDGFNNGVYSANQTSSNGNLATDSKVALEVSPGTAYVRGYRTEFITPQYIDVDKPRDFDTRQNGIINFNLGNFLKVYDVYGWPEVSGDGVTDAYQILDLYDDYAANATSSVKAGANRIGRCRTVQLQKSSTALAATSPFGISPNITGGVYDLWVFDVQMFTVLNIANAVTPYTAGTRIVGKTSGAAGYIADTGNGSHYIYLEQVNGVFINSEILEVNGRTVGTLEAAWSYQLSDTRSCFGKDSGSNIIFGSNFILNDSRPVEASTVDIDDTTDDEITGFRTRFEKDLRPGDVVTPTISDFEGVNTHRILRVDPTAIATTAANKKSTVSAGNEIFDFAEQTAKIDGSLLNGTVTDGEYSELIRLRPFIFQKDYQNGELSFDLPEDTMKSLDDESFFVYRNFSSKTVTTGSITFTVPETESFAALSSDNYVLTVVSNGGSGTYSNGQNIDIDAEVDAANLTASFGANNQSFTVSGLGSVATVTLTALVSKNTVSKKLKTASKMQALKVFKTVEDLVEQPTGLTFSALYGTRVEDEDLSFGIQDVYRVHAVYESYDENDASAPYVVLTESVFFAGGTLIIGKTSGARGRVISFSNADLKLYYVGLNDIPFVQGETINGFNSANEDITGIIDDSDSSIFAGSKVVTNQFELEAGQKTNYYDVSRLRRLSTAVPPTRRLLVIFDYFAHASSGDYFSSQSYSGINFKEIPNYKLDGSIKFIRDQIDFRPGIKNLRNGSGTISAPYFVNCTTFDFVSRVFDNTGSTIFDIMQVNSSFRADYAWYLPRIDKLFLSHDGALRIAKGVSGYYLIPPADVQNSMLLATIEYKPYVFDPERDILITPEVLRRYTMKDIGDIEQRLTHVEYYTSLSMLESQADNTKTYDENGFDRLKNGYVVDDFTDHTTGDVLNVDYKCSLDFREGQLRPQHYTTNVGLRYNPTASTNVVRTNGNVVMLPFDDVAIVTQPYASRTENVNPFNVFTFIGRVDLTPASDDWIDIERLPARVENVEGDFSAVSRDLNVDQNGFAPIQWQSWQTTWKGETIRSRNRFTSRSGTYGVGRQLGRAGHGQRRQGLFYLHERRTIRVVNNQARQGIRTRVIPKIEQKSLGDTILSRTVIPWIRSRNIGFNVDRMKPRTRFYAFFDGDNVTNYITPKVVELIKNSTTDNRTNETPFVVGETVTGQTSGCQLKVVAPDDGYKTNPYGKGTETLPTSYSSQTVYLNHDITEISENISPNHFGNVQVGELLVGQTSGAIAVVKDRRILTDNVGNVQGTLFIPSPKNDANPRWATGTRSLRFTTSETNLKTPGTVDSSAQTTYSATGTLQTVRENILAVRNAEIVTDTVSEERVVQTTRTETRQVGWYDPLAQSFIIEEEGGMFLTGVDIFFNTKDANIPISMQIRTMENGYPTKTILPFSDVTITPDDIEISESAAVPSRFSFKAPVYIKSSVEYCFVLLSDSNEYQVWISRMGDVDVTGTRTISEQPYAGVLFKSQNASTWTADQYEDLKFTIYRANFTSTTGTVTLENAPQGKGNNGIHRLIENPIQTIKPKQILSLGPAVTQYTFSQGARLLQQTTAAQATIISTTTSSSVSDTLTINDASGSWLQGTANTYLVRSSESLATIVAGSSSGTLEVGDIVTGATSNSVGIVKTWDGSTNLVLHYITGAFTDTETLSEPGGWTATVTSSAESGDSYGAYLTAAPTFDSDQTEVLVYHQNHGMYNRSNNVSVEGVISEISPTTLTGALAAGATSISVLDANTFHTTVNGSVVSGSNPGYIRINSELIQYSAISSDGKTITVATSGRGSNSTTDTTHPSGSVVECYNLDGIPLIDINKTHTSVSCPWLDTYMLHITGVANSGIRGGGINVYASQNIQFETLTPSVSVMDLPETDITARVNTTSATSIGDGSTSVDQASFVNDGSYVPVTLNDLNLFNNPRMICSEVNELAKLSGQKSFTMKVDLSTEKDTLSPVVDLDRCSLITTSNRINQWPGGPDAYGQQSQIDTSQDVSTLPFGDRNDAVYITRLARLIRESRSLRIDLQMSRPPEADVRIYYRAFSSGTNDDFDSIGWTLIDTPLQYDASPNEEILWKDYYYEVSGLNFNAFQIKIVMRSSNQARVPLIADLRCIALAT
Physico‐chemical
properties
protein length:2442 AA
molecular weight: 268428,84540 Da
isoelectric point:4,79002
aromaticity:0,09623
hydropathy:-0,27842

Domains

Domains [InterPro]
IPR032096
12–67
IPR032096 IPR032096 IPR032096
AIX40236.1
1 2442
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014a
[NCBI] 		1493507 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX40236.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019138 [NCBI]
CDS location
range 76720 -> 84048
strand +
CDS
ATGGCACAAAATACCAATCTAAACGTTACACCTTATTACGACGACTTCGATAAGGATAGGAATTTTTATCGAGTTCTGTTCCGCCCTGGATTTCCAATTCAGGCGAGGGAACTTAGCACAATGCAGAGTATTCTGCAAAATCAAGTCGAATCGGTTGGTTCTCATCTATTTAAAGATGGTGCTATGGTCATCCCTGGACAAGTGGGATATGACTTAAATGTACAGGCAATTTTGCTGCAAGAATCTTTTCTTGGTAGTGATGTTGAGACATACAGAACTCAATTGACTGGTACTATCATTGAGGGTTTGACGACAGGTGTTAAGGCAAAAGTATTGTATAGCATCTCTGCCTCTGAATCTGAGAGGGGATATGTCACACTATATGTAAAGTATATTGATTCTGGGGATACAACTTCCGAATCTGCATTGAATACTTTCCAAATCAATGAACAGTTGATTGCAAGTAAGGAAATTACTTTTGGTACGACGCTGATTGAAATTGGCACTCCATTTGCTCAATTGTTGCCTGTTAATGCAACTGCAGTCGGATCGACAGCATACATTAGCGATGGTGTTTATTTCATTAGAGGTCATTTTGTTAATGTACCTTCTAGTTATTTGATTCTGAATCAATATGATACTAACCCTTCTTATAGAATTGGTTTAGAAATTTTAGAATCTATTATCACCCCCGAAGATGATGAATCTTTGAATGATAATGCTGCTGGAACATCAAATTATTCTGCACCTGGTGCCCATAGATTTAAAATTGGTACTCAGTTTGTAAAACGATTAATTACTGATGAGGCAGATAAAAACTTTATTGAACTTCTCAGGATCAATAACAGTAATGTAGAAAGTTTTGTTGAGAGAACAGCATATAGCGAACTTGAGAAGTCGATGGCTCGTAGGACTTATGAAGAGTCTGGCGATTATGTCATTGATACTTTTGATGTAACTCCTCGCGAGCATCTCAATGACGGATTTAATAATGGTGTGTATAGTGCGAACCAGACTTCTAGTAATGGAAACCTTGCTACAGATTCTAAGGTAGCATTAGAAGTTTCTCCTGGAACTGCATATGTTAGGGGTTATAGAACAGAGTTTATTACACCTCAATACATTGATGTTGATAAACCAAGGGATTTCGATACTCGTCAAAATGGAATTATCAACTTTAACCTTGGCAATTTCCTGAAAGTTTATGATGTTTATGGTTGGCCAGAAGTTTCTGGTGATGGAGTAACAGACGCATATCAGATTCTAGATCTTTATGATGATTATGCTGCGAATGCAACATCATCAGTAAAGGCAGGTGCTAATAGAATTGGTAGATGTAGAACTGTTCAGTTACAGAAGTCTTCTACTGCTCTTGCTGCAACGTCACCATTTGGAATTAGTCCTAATATAACTGGTGGTGTTTATGATCTATGGGTATTTGATGTTCAGATGTTCACCGTTCTGAACATTGCTAATGCTGTAACACCATATACAGCAGGAACTAGAATTGTAGGTAAAACATCTGGAGCAGCTGGTTACATTGCTGATACTGGAAATGGTAGTCACTACATTTATCTTGAGCAGGTCAATGGAGTATTCATTAATAGTGAAATTCTAGAAGTAAATGGAAGAACAGTTGGTACTCTTGAAGCAGCATGGTCTTATCAGTTAAGTGATACTAGATCGTGCTTTGGTAAGGATAGTGGAAGTAATATTATCTTTGGTTCTAATTTTATTCTGAATGACTCTCGACCTGTTGAGGCATCTACAGTTGATATTGATGATACAACAGATGATGAAATTACTGGTTTCAGAACTAGGTTTGAAAAAGATCTTCGTCCTGGAGACGTTGTTACTCCAACAATTTCTGATTTTGAGGGAGTAAATACTCATCGCATTTTAAGAGTTGATCCTACTGCTATTGCAACAACAGCAGCTAATAAGAAATCTACAGTTAGTGCTGGAAATGAAATCTTTGATTTTGCAGAGCAAACTGCAAAAATTGATGGCAGTCTGTTGAATGGTACAGTAACTGATGGAGAATATAGCGAACTAATTAGATTGCGTCCGTTCATCTTCCAAAAAGATTATCAGAATGGAGAACTTTCATTCGATCTTCCAGAAGATACTATGAAGTCTCTTGATGATGAATCATTCTTTGTATATAGAAACTTCTCTTCAAAAACAGTAACCACTGGTTCTATTACCTTTACTGTTCCTGAAACCGAATCTTTCGCAGCATTATCTTCTGATAATTATGTCTTAACTGTCGTTAGTAATGGTGGTTCTGGCACATATAGTAATGGTCAAAATATTGATATTGATGCTGAGGTAGATGCTGCAAATCTAACTGCTTCTTTTGGTGCTAATAATCAATCATTTACGGTTAGTGGATTAGGTTCAGTTGCAACAGTCACTCTGACCGCATTGGTTTCTAAGAACACTGTTTCTAAGAAACTGAAGACTGCTTCTAAGATGCAGGCATTAAAAGTATTCAAAACAGTAGAAGACTTAGTAGAACAACCTACAGGACTTACATTTAGTGCTCTATACGGAACCAGAGTTGAAGATGAAGATCTCTCGTTTGGTATTCAAGATGTATATAGAGTTCATGCAGTATATGAATCATATGATGAGAATGATGCGTCGGCACCATATGTAGTTTTAACTGAATCAGTCTTCTTTGCAGGTGGAACATTAATTATTGGTAAGACTTCTGGTGCTAGAGGTCGTGTAATTTCATTCTCTAATGCAGATTTGAAGTTGTACTATGTTGGACTAAATGACATTCCATTCGTTCAGGGTGAAACTATTAATGGTTTCAATTCTGCTAATGAAGATATTACTGGTATTATTGATGACTCGGATTCTTCAATTTTTGCTGGTAGTAAAGTAGTTACAAATCAATTTGAACTTGAAGCGGGACAGAAAACTAATTACTATGATGTTTCACGATTAAGAAGATTAAGTACTGCTGTACCTCCGACAAGAAGACTGCTGGTAATCTTTGATTATTTCGCACATGCATCTTCTGGTGATTACTTCTCATCACAATCTTATAGTGGAATTAATTTCAAAGAGATTCCTAACTATAAATTAGATGGTTCTATTAAGTTTATTAGAGATCAAATCGATTTCCGTCCTGGTATTAAGAACTTAAGAAATGGATCAGGCACAATCAGTGCTCCATACTTTGTAAATTGTACTACGTTTGATTTTGTATCCAGAGTATTTGATAATACTGGATCAACAATCTTCGATATCATGCAAGTCAATTCTTCATTCCGTGCAGACTATGCTTGGTATCTTCCTAGAATTGACAAACTATTCTTATCGCATGATGGAGCACTTAGAATTGCTAAGGGTGTTTCTGGTTACTACTTGATTCCACCAGCAGACGTTCAAAATTCAATGCTTTTAGCGACTATTGAATACAAACCATACGTCTTTGATCCTGAAAGAGATATTCTGATTACTCCAGAAGTTCTCAGACGTTATACAATGAAGGACATTGGTGATATTGAGCAGAGATTGACTCATGTTGAATACTATACATCATTGTCTATGCTTGAGTCTCAAGCAGATAATACTAAGACCTATGATGAAAATGGTTTCGACCGTCTGAAAAATGGTTATGTTGTTGATGACTTTACTGATCACACCACTGGCGATGTATTAAACGTCGATTATAAGTGTTCTTTAGACTTTAGAGAAGGTCAGTTGCGTCCTCAACACTATACTACTAATGTAGGACTTAGATATAATCCTACAGCATCTACTAATGTCGTTAGGACTAATGGTAATGTAGTAATGCTTCCCTTTGATGATGTTGCAATTGTTACACAACCATATGCATCTAGAACTGAGAACGTCAATCCATTCAACGTCTTTACCTTTATTGGTCGTGTTGATTTAACACCTGCATCTGATGACTGGATTGATATTGAGCGTCTTCCTGCTCGTGTTGAAAACGTTGAAGGTGATTTCTCTGCTGTTTCTAGAGATCTCAATGTTGATCAGAATGGTTTTGCTCCTATTCAATGGCAGTCTTGGCAGACAACTTGGAAGGGTGAGACAATTAGATCTAGAAATAGATTTACATCTAGATCTGGTACATATGGTGTTGGTCGTCAGTTAGGTCGTGCAGGTCACGGTCAGCGTCGTCAAGGTCTATTCTATCTTCACGAACGTCGCACTATTCGTGTTGTTAATAACCAAGCACGTCAGGGTATTCGTACTAGAGTTATTCCTAAGATTGAACAGAAGTCTTTGGGAGATACAATCCTGTCACGTACAGTAATTCCTTGGATTCGCTCTCGTAATATCGGTTTCAACGTTGATCGTATGAAACCCCGTACAAGATTCTATGCATTCTTTGACGGTGATAATGTCACTAACTACATCACACCAAAAGTTGTTGAACTTATCAAAAACTCCACCACTGATAATAGAACCAACGAAACTCCTTTTGTTGTAGGTGAAACTGTTACTGGACAAACCTCTGGTTGCCAACTTAAAGTTGTTGCACCTGATGATGGATATAAAACTAATCCATATGGTAAGGGTACAGAAACTCTTCCAACTTCATACTCATCCCAAACAGTATATCTAAATCATGATATCACTGAAATTTCTGAGAATATATCACCAAATCATTTTGGTAATGTTCAGGTTGGGGAACTTTTAGTTGGTCAAACGTCAGGTGCAATTGCGGTGGTAAAAGATCGTCGCATCCTCACTGATAACGTTGGTAATGTTCAGGGTACATTATTCATTCCTTCCCCTAAGAATGATGCCAACCCACGTTGGGCAACAGGTACTCGCTCTTTGCGTTTCACAACTTCGGAAACTAATCTGAAGACACCTGGTACTGTAGATTCTTCTGCACAAACAACGTATTCGGCAACAGGTACTCTTCAAACTGTTCGTGAAAATATTTTGGCAGTTAGAAATGCTGAAATTGTTACCGATACTGTTAGTGAAGAAAGAGTTGTCCAGAC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Tertiary structure

PDB ID
812a52cf7bc16053515a7163d367397c191c23d91e1db846812a1d4dadc8461e
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7612
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank