Protein

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Genbank accession
CAB4173649.1 [GenBank]
Protein name
Collagen triple helix repeat
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,92
Protein sequence
GTTGATGPQGISVTLKGTKATAVLLPSSGQQAGDAWIVEADGDLYFWNVSAGTWDNIGQIVGPQGPTGATGTAATIAVGTVLTGITGSSVVVTNSGTSGAATLNFTIPTGATGATGATGATGTAATLAVGTVTTGITGSSATISNSGTTSAAVLDFSIPIGATGATGATGTAATIAVGTITTISSGSSATVSNSGTASAVLLDFSIPQGATGPTGNTGATGATGSTGTTGTAATLAVGTVTTGAAGGAVSVSNSGTSSAATLNFTIPIGDTGATGATGATGNTGTAATLAIGTVTTGTAGSSAIVSNSGTTSAATLNFTIPRGNTGDTGATGATGTAATLAVGTVATGAAGSSTLVSNSGTASAATFNFTIPRGDTGIQGATGNTGATGAAGATGTAATITIGTVITGTVGSSATVTNTGSSSAAVLDFSIPTGATGPQGATGATGATGPQGATGLQGATGPQGPTGPAGLTGDTGAAGTAGAAGAVGPAGATGSQGIQGIQGATGATGATGPQGDTGLTGPAGATGSQGIQGIQGNTGATGLTGPAGAVGPQGDTGLTGATGLTGPAGSQGIQGIQGATGTTGTTGQGIATGGTTGQVLVKLSNTDYDTGWAAQSGGGGGGSSVTVAATAPASPSTGSVWFNTENATMYIWTGTAWVEPSGGVAGPAGPAGSVLKITSISICNSSYTVLDDTAVSNTGGYIKLTGTNFAAGCIVTVGTINATTTTYVSATEVRAQLPATVAGSYTVYLTNTDGGTCFRLNAVTFSAPPVWSTGTYSSPTAVSTQLLATGDSTLTYTLTSGSLPSGITLSSSGLLSGTTTLNSYSFTVTATDAQLQDVSQVISLTIANVPPSAVEYLVVAGGGGGGSAVFNVDNGGGGGAGGYSTSTGFAVASGTPITVTVGAGGATATQGYNSQLGSLTASIGGGRGGTNGSFAGGSGGSGGGGAGVTGYTGGGSATSGQGNIGGNGNGSSWPGGGGGAGAAGGTAGVSPQTTGSGGVGLASSISGTSTYYAGGGGGSGSGATFPNGGNGGGGTGNASGTAGASGTANTGGGGGGGSGSGGAGAGGPGGSGIVIIRYADSYSAAASTTGSPTITNPTGYRVYKWTSSGSITF
Physico‐chemical
properties
protein length:1113 AA
molecular weight: 101263,01050 Da
isoelectric point:4,06975
aromaticity:0,04492
hydropathy:0,15912

Domains

Domains [InterPro]
IPR050149
323–669
IPR050149 IPR014756 IPR049304
IPR008160
486–542
IPR008160
CAB4173649.1
1 1113
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured Caudovirales phage
[NCBI] 		2100421 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4173649.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796912 [NCBI]
CDS location
range 2 -> 3343
strand +
CDS
GGTACTACAGGTGCGACTGGACCACAAGGTATTTCTGTAACTCTTAAAGGTACTAAAGCTACTGCAGTTTTATTACCAAGTTCTGGGCAACAAGCAGGAGATGCTTGGATTGTTGAAGCAGATGGTGATTTGTATTTTTGGAATGTTTCTGCAGGTACATGGGATAATATAGGACAAATAGTAGGGCCACAAGGCCCAACAGGTGCTACAGGTACAGCAGCTACAATAGCTGTAGGAACTGTACTAACAGGTATTACTGGAAGTTCTGTAGTAGTAACTAACTCTGGTACTAGTGGGGCCGCCACTCTTAATTTTACAATCCCTACAGGTGCAACAGGTGCTACGGGTGCTACGGGTGCAACAGGTACTGCAGCTACATTAGCTGTAGGAACAGTTACAACAGGTATTACTGGAAGTTCCGCTACTATTAGTAATTCAGGAACTACTTCAGCAGCCGTTCTAGATTTTAGTATACCTATAGGTGCTACAGGTGCTACAGGTGCTACAGGTACTGCAGCTACAATAGCTGTAGGAACAATTACAACTATATCTTCCGGTAGTTCTGCTACTGTAAGTAATTCAGGTACTGCTTCAGCAGTACTTTTAGATTTTAGTATTCCTCAAGGGGCCACGGGTCCCACAGGTAATACAGGTGCAACAGGTGCTACAGGTTCTACAGGTACTACGGGTACTGCAGCTACATTAGCTGTAGGAACAGTTACAACAGGCGCAGCAGGTGGAGCTGTTTCAGTAAGTAATTCTGGTACTAGTTCTGCAGCAACACTTAATTTTACAATTCCTATAGGTGATACTGGTGCTACAGGTGCCACAGGTGCCACAGGTAATACAGGTACTGCAGCTACATTAGCCATAGGAACAGTTACAACAGGAACTGCAGGTAGTTCTGCTATTGTAAGTAATTCAGGTACTACCTCAGCAGCAACACTTAACTTCACAATTCCTAGAGGAAATACGGGGGATACTGGTGCTACAGGTGCTACAGGTACTGCAGCTACATTAGCCGTAGGAACAGTAGCAACAGGTGCAGCAGGTAGTTCCACTTTAGTAAGTAATTCAGGTACTGCCTCAGCAGCAACATTTAATTTTACAATTCCTAGAGGTGATACAGGTATACAGGGTGCTACAGGTAATACGGGTGCTACAGGTGCAGCAGGTGCTACAGGTACAGCAGCTACAATAACTATAGGTACAGTTATAACAGGGACAGTAGGAAGTTCTGCTACGGTTACTAATACTGGCTCTTCTTCAGCTGCAGTTTTAGATTTTAGTATACCTACAGGTGCTACAGGCCCACAAGGTGCTACAGGTGCTACAGGTGCTACAGGTCCACAAGGTGCTACAGGCCTACAGGGTGCTACAGGTCCACAAGGACCTACAGGACCAGCAGGTCTTACAGGTGATACAGGTGCTGCAGGTACTGCAGGTGCTGCAGGTGCAGTAGGTCCTGCAGGTGCTACAGGTTCTCAAGGTATTCAGGGTATTCAAGGTGCTACAGGTGCTACAGGTGCCACAGGTCCTCAAGGTGATACAGGTCTTACAGGGCCTGCAGGTGCTACAGGTTCTCAAGGTATTCAAGGTATTCAAGGTAATACAGGTGCTACAGGTCTCACAGGTCCTGCGGGTGCTGTGGGACCTCAAGGTGATACAGGTCTTACAGGAGCTACAGGACTTACAGGTCCTGCCGGTTCTCAAGGTATTCAGGGTATTCAAGGTGCTACAGGTACTACAGGTACTACAGGTCAGGGAATTGCTACAGGTGGTACAACTGGACAAGTATTAGTTAAATTATCTAATACTGACTATGATACTGGATGGGCGGCACAGTCTGGTGGTGGGGGAGGGGGATCTTCAGTTACAGTTGCAGCAACTGCACCTGCAAGTCCTTCTACAGGTAGTGTTTGGTTTAATACTGAAAATGCTACCATGTATATTTGGACAGGTACTGCATGGGTAGAGCCTTCTGGAGGGGTAGCCGGCCCTGCCGGCCCTGCGGGTTCTGTACTTAAAATTACTAGTATATCAATATGTAACTCTAGCTATACTGTTTTAGACGATACCGCAGTTAGTAATACTGGCGGATATATTAAATTAACTGGTACAAATTTTGCTGCGGGATGTATAGTTACAGTTGGTACTATTAATGCTACAACTACTACGTATGTAAGTGCTACGGAAGTAAGAGCTCAATTACCTGCTACAGTTGCTGGTTCTTATACGGTATATTTAACTAACACTGATGGGGGTACTTGTTTTAGACTTAATGCAGTCACCTTTAGTGCTCCGCCAGTATGGAGTACTGGAACTTATAGCTCCCCCACAGCGGTTAGTACCCAATTATTAGCTACTGGTGATAGTACATTAACATACACTCTTACTAGTGGTAGTCTACCTAGTGGGATTACATTAAGTAGTAGTGGACTTTTATCAGGAACTACTACATTAAATTCATATTCCTTTACTGTTACAGCTACTGATGCTCAGTTACAAGATGTAAGCCAAGTTATTAGTTTAACTATTGCTAATGTTCCGCCTTCTGCAGTTGAATACTTGGTTGTTGCTGGCGGCGGTGGTGGTGGCTCCGCTGTGTTTAATGTCGATAATGGGGGTGGAGGCGGTGCCGGTGGATATAGTACATCAACCGGATTTGCAGTTGCATCCGGCACTCCAATCACAGTAACGGTTGGGGCCGGGGGTGCAACAGCGACTCAAGGTTACAATTCTCAACTAGGATCTTTAACTGCTTCTATTGGTGGTGGGCGTGGCGGCACCAACGGTAGTTTTGCTGGTGGGTCCGGTGGCTCTGGTGGTGGTGGGGCCGGCGTTACTGGTTATACTGGCGGTGGTAGTGCAACTAGTGGTCAAGGTAATATAGGTGGTAATGGCAATGGAAGTAGTTGGCCTGGTGGTGGGGGTGGTGCTGGTGCTGCTGGAGGCACTGCTGGAGTATCCCCTCAAACAACAGGTTCCGGAGGTGTTGGTTTGGCATCTTCTATTTCTGGAACATCAACTTACTATGCGGGCGGTGGTGGTGGATCTGGTTCAGGCGCAACTTTCCCTAATGGTGGAAATGGGGGTGGCGGCACTGGAAATGCATCTGGTACTGCTGGAGCAAGTGGCACAGCTAATACTGGCGGTGGCGGTGGTGGTGGCAGTGGTAGTGGGGGTGCAGGTGCAGGTGGCCCTGGTGGTTCAGGTATTGTAATCATTCGCTATGCAGATTCATATTCTGCTGCAGCTTCAACTACAGGCTCTCCTACAATTACTAATCCCACGGGATATAGAGTTTACAAATGGACCAGTTCTGGTTCAATAACATTTTAA

Tertiary structure

PDB ID
914470ebee5b15cdbbcd2e4c2837cb564609175254dfdbe558a39ad7ab430a68
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2374
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50