Protein

View in Explore
Genbank accession
XKC19576.1 [GenBank]
Protein name
putative membrane protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSDYAYPYDPAGTNPACLVKGEQHKLEDYPNKWGCIIPLFAPFYRKDLTLRHVEEDRPLYEGIDYYLGHYYEAASVENKMPIFGSVMIIDQTLSGTIEFVKYRTLGGRYNMLKRIIDVHLNQVDLRDPRNLDWEDVMRYEMAIPSVDAPENIDEAIANDLPTGALDRVRKALERLNEAQKQGYDNVIEALVSLTDKIHAHDVDNHESKRGRHRITAEQLGALHRDATAVDSVKAYGYVLADLVTLINLLGENAEDTDNLFRLIGDSLEGRVRFDGSNVVIRNENGAAVISLVNGDLNIVSNSNIILDGDAANSNDNISSSLRAGDNLLSVHSDAGNDNTAVYNGFFLIHVGNIADFMPPPDYVDTIIHTGETETVYLTGRGIKGSPLTGYATFPEVATDTNGVYRLSHSIYSSDKSRAASGRALYRLNQLVSGKLDNTFTINGHRLNKDITITASDLGLGKVNNTAPGDKPASNAFKSEAAKKANASHTHDPSDFKNIPLANHDTYGLTKITPTRSGRTDIAATPSMLNDPYQEQLVAENNLSGKMPSLPFDIMQYGGFGYLPLPVLGSYGAAGTGSGVAVGCIEADGRLVLLRNGADHATRGVYYWYGEFKTDGSFSKTVTTTTEYRPSFIEDGDRVSHVHRGSDSVFPLSTINGKYYLVLTRSTMDMTKHVGTEIVNLNGCPLGNGCSIFLYKNEVHFHYHYFGNGGSYSRHWKAKISDIEAGRPITLERVGLNGDDWNGKSQSDIDTFFFTNIGQSTTLDGGKPIIHRRDNGHWTGSNNVRHSTQNSMFYIKDNKLRVQVYGRTYYSRSDGSTGYPLSHSFVLDLDTMQMVSDNADCFPIELYNNRWAMPAGKSAPAEAWVGANPNNNAPVLISKDRMFAFRFYGTTYIPRVYEFGSADGLEIFDYIEAGKSRPTTIAAADLEGAYGSVVGAGTKFMGFLPGNKLISDQTDGRDTICTYDMNGSYVEDGTGWGPTPDRRLLPSGENARMLRVPMNWETNRNEGFVLSSSYKSSMSKIVNETATTEVTWTDNLINDLRTRFRALHTATDGRSLWDDRVMLQVFGDWEAGANTLDCFIQYTYVHWANPEKTSRRVFTALHKCTIGMSGNTVTSVNIGDLITNANWNNSVTSWGSYESFGMNTCGVTDDGHKVFCLNHSLYVNYVGHSGGHIFQFVLDKDDGSVLHFRNRNAHTHVMYASYWHPDLGLVDTVNEYSAQVVSAKSLGRTVAEIQGNSYRSSQIIHATQVASGWVVYFTEEARFYVSGEEVTLPVQNFDLSKLSGFPSYQNKTFYIYVSVSYDSNGNGVGSYRFSLTKTEDTDTEMYIGYAITNDTQIVELKVSRATRLGTLYELEDHEYDQRAHNDITDLDKHSFSLGNVENMGMIHTLTLPTFKEVFDTWDRISHFKDSAQQPHNPGELNSWTYTEATDTLKCTINSATFVGFVSPAPVGDYVFDTLVGSPDGDNDGLVIILAFVEDAQGIEHTICAVRARSTEAHMVINGRFDIWYDYHLPSRKLIRTGGGTSSVGGWSGNYSRITAVRSGDKFTVSATNFVKSTNLEDHGKSAIELVHEFDLQEFTELQQFRSGGRFGYGCMSQPNSTFINILRPDENVGNYYASADTIRILSERQAESVKFATGVIAPGNKIPIPAGFTEADCHAVVAFNTSGSSVKLAYARAWLSGLTVNITTKLKGSAAVTNPAGSTARYYLIARKKPEV
Physico‐chemical
properties
protein length:1715 AA
molecular weight: 189634,89250 Da
isoelectric point:5,57593
aromaticity:0,10262
hydropathy:-0,37248

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage pVp-JHP1101
[NCBI] 		3374749 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XKC19576.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ451753 [NCBI]
CDS location
range 92380 -> 97527
strand -
CDS
ATGTCAGATTACGCTTATCCTTACGACCCTGCCGGAACAAATCCTGCATGTTTGGTCAAAGGGGAACAGCACAAGCTTGAGGACTACCCTAATAAATGGGGTTGTATCATTCCTCTGTTTGCGCCGTTCTATCGCAAAGATCTCACACTACGTCATGTAGAGGAAGATCGTCCCCTTTACGAAGGTATTGACTACTACCTCGGTCATTATTACGAAGCAGCGTCTGTAGAAAACAAGATGCCTATCTTCGGTAGTGTGATGATAATCGATCAAACGTTATCTGGCACTATTGAATTCGTAAAATACCGAACTCTCGGTGGTCGCTATAACATGCTTAAGCGAATCATCGATGTACATCTTAACCAAGTTGACTTACGTGACCCACGTAACTTAGACTGGGAAGATGTCATGCGCTACGAGATGGCTATCCCGTCCGTAGATGCGCCTGAGAACATCGATGAGGCGATTGCTAACGATTTACCAACTGGTGCCCTAGACCGCGTTAGAAAAGCATTAGAGCGCCTTAACGAAGCACAAAAGCAAGGTTACGATAATGTCATTGAAGCTTTAGTTTCACTGACTGATAAAATCCATGCTCACGATGTTGATAACCACGAATCAAAACGTGGCCGACATCGCATTACAGCAGAACAACTAGGTGCATTGCACCGTGATGCCACTGCGGTTGATTCCGTAAAAGCCTACGGTTATGTTCTTGCTGATTTGGTAACACTTATTAACCTACTAGGTGAGAATGCGGAAGATACGGATAACCTATTCCGTCTAATCGGCGATTCACTAGAAGGGCGTGTTCGTTTTGATGGCTCAAACGTAGTCATTCGAAATGAAAATGGTGCAGCAGTTATTAGTTTGGTTAACGGTGACCTAAACATCGTATCTAACAGTAACATCATCCTAGATGGTGATGCTGCTAACAGTAATGACAACATCTCATCGTCTCTACGTGCAGGTGATAACTTACTGTCTGTCCACTCTGATGCAGGAAATGACAACACAGCAGTTTATAACGGGTTCTTCTTAATCCACGTTGGTAACATTGCTGACTTCATGCCGCCGCCTGATTATGTAGATACGATCATCCATACTGGTGAGACTGAAACGGTTTACTTAACAGGTCGTGGTATTAAAGGCTCGCCATTAACAGGCTACGCAACGTTCCCTGAGGTAGCTACTGATACAAACGGTGTCTATCGTCTAAGCCACTCTATCTATTCGTCTGATAAGTCACGTGCGGCTTCTGGTCGTGCTCTGTATCGTCTTAATCAGTTAGTGAGTGGGAAATTAGACAATACCTTTACTATTAATGGTCATCGACTTAACAAAGACATTACAATCACGGCGAGTGATTTAGGTCTAGGTAAAGTCAACAATACGGCACCGGGCGATAAACCTGCTAGTAATGCGTTTAAGTCAGAGGCTGCGAAGAAAGCAAATGCATCGCACACTCATGATCCAAGTGACTTTAAGAACATCCCACTTGCAAACCATGATACCTACGGTCTGACTAAGATAACGCCAACACGTTCAGGTCGTACTGACATTGCGGCAACGCCGTCGATGTTAAACGACCCTTACCAAGAGCAGTTAGTTGCAGAAAACAACTTAAGTGGTAAGATGCCATCGCTACCATTTGACATTATGCAATATGGTGGGTTTGGTTATCTCCCATTACCTGTGTTGGGTTCATACGGTGCAGCAGGTACAGGTTCTGGTGTTGCAGTAGGTTGTATTGAAGCCGATGGTCGTCTCGTGCTATTACGTAACGGTGCTGACCATGCAACTCGTGGTGTGTATTATTGGTACGGTGAATTTAAGACGGACGGCTCGTTCTCTAAAACCGTAACAACGACGACTGAATACCGTCCAAGCTTTATTGAAGACGGTGATCGTGTAAGCCACGTCCATCGTGGTAGTGATTCAGTATTCCCATTGTCTACAATCAACGGTAAGTACTACTTAGTACTGACACGTAGTACCATGGATATGACTAAGCACGTTGGTACTGAAATTGTTAACTTAAATGGCTGTCCGTTAGGTAACGGTTGTTCTATCTTCTTGTATAAGAATGAAGTTCACTTCCACTACCACTATTTTGGTAATGGTGGTAGCTATAGCCGACACTGGAAAGCTAAGATTTCAGATATCGAAGCAGGTCGTCCAATCACGTTAGAACGTGTGGGTCTAAATGGTGATGACTGGAACGGTAAGTCACAAAGTGATATTGATACGTTCTTCTTTACTAACATCGGTCAATCAACAACTTTGGATGGTGGTAAGCCAATCATTCACCGTCGTGATAACGGTCACTGGACGGGGTCAAATAACGTTCGCCACTCAACGCAAAACTCAATGTTCTATATTAAGGATAATAAGTTACGCGTTCAGGTTTACGGTAGAACGTATTACTCGCGTTCTGATGGTTCGACAGGTTATCCGTTATCACATTCGTTTGTGTTGGATTTAGATACAATGCAGATGGTGTCGGATAATGCAGACTGTTTCCCAATTGAGTTGTATAACAACCGATGGGCGATGCCTGCGGGTAAGTCTGCTCCTGCTGAGGCGTGGGTTGGTGCCAACCCGAACAACAACGCTCCGGTGTTAATCAGTAAGGACAGGATGTTTGCATTCCGTTTCTACGGTACAACATACATTCCAAGAGTGTATGAGTTCGGTTCAGCTGACGGGTTAGAAATCTTCGATTATATCGAAGCAGGTAAGTCAAGACCGACAACTATTGCAGCTGCTGACTTAGAAGGTGCTTACGGTTCTGTGGTGGGTGCAGGTACTAAGTTCATGGGTTTCCTACCGGGGAACAAACTTATCAGTGATCAAACTGATGGTCGTGATACGATATGTACTTATGACATGAACGGTAGTTACGTAGAAGACGGTACAGGTTGGGGTCCAACTCCAGACCGCCGTTTGTTACCTAGTGGTGAGAATGCAAGAATGCTTCGAGTGCCAATGAACTGGGAAACAAACCGTAACGAAGGTTTTGTATTGTCATCGTCGTACAAATCAAGTATGTCAAAAATAGTCAATGAAACGGCAACGACTGAAGTGACTTGGACGGATAACTTGATTAACGACCTACGTACACGATTTAGAGCACTGCATACTGCAACAGATGGTCGCTCTCTTTGGGATGACCGTGTAATGTTACAAGTGTTCGGTGATTGGGAAGCGGGCGCTAATACACTTGACTGCTTTATCCAATACACCTACGTGCACTGGGCAAATCCTGAGAAGACTTCACGCCGTGTATTTACAGCACTGCATAAGTGTACGATCGGTATGTCGGGTAACACCGTAACGAGTGTGAATATTGGCGACTTAATTACTAATGCTAACTGGAACAACTCTGTGACCAGTTGGGGTTCGTATGAATCGTTCGGTATGAATACATGCGGCGTAACTGACGATGGGCATAAAGTGTTCTGTCTTAACCATTCGCTGTATGTAAACTACGTAGGTCACTCAGGCGGTCATATCTTCCAGTTTGTTCTGGATAAAGATGATGGTAGTGTTCTACACTTCCGTAATCGTAATGCTCACACGCACGTGATGTACGCATCGTACTGGCATCCGGACCTTGGTTTGGTGGATACGGTGAATGAATACTCGGCGCAGGTTGTTTCGGCTAAGAGTCTAGGTCGTACAGTTGCGGAGATTCAGGGTAACAGTTACCGTAGTTCTCAAATCATTCATGCTACGCAAGTAGCGTCTGGTTGGGTGGTTTACTTTACCGAGGAGGCAAGATTCTACGTTAGTGGGGAAGAGGTTACACTCCCTGTACAAAACTTTGACTTATCGAAGTTGTCAGGATTCCCAAGTTACCAAAACAAAACGTTCTATATCTACGTAAGTGTATCGTACGATTCGAACGGTAATGGTGTTGGTAGCTATCGTTTTAGTCTAACGAAGACTGAAGATACCGATACAGAGATGTACATCGGTTATGCGATTACTAACGATACCCAAATTGTAGAATTGAAAGTTTCGCGTGCTACACGTTTAGGTACGTTGTATGAGTTGGAAGACCACGAGTATGATCAGCGTGCGCATAATGACATCACTGACCTTGACAAACACTCATTTAGTTTGGGTAATGTTGAGAATATGGGGATGATTCATACGCTAACGCTACCTACCTTTAAAGAAGTATTCGATACTTGGGATCGTATCTCCCACTTTAAAGATAGTGCGCAACAGCCACACAATCCAGGTGAGTTAAACAGTTGGACGTATACTGAAGCAACTGATACGCTTAAGTGTACAATCAACTCTGCAACGTTCGTAGGTTTCGTAAGCCCGGCTCCGGTTGGCGATTACGTCTTCGATACGTTAGTAGGTTCACCTGATGGTGATAACGATGGCCTAGTAATCATCCTAGCGTTTGTTGAAGATGCTCAAGGTATTGAACACACCATCTGTGCAGTACGCGCACGTTCTACCGAAGCGCATATGGTAATTAATGGACGATTTGATATTTGGTATGATTACCACTTACCATCTCGTAAATTGATTCGTACTGGCGGTGGTACTTCAAGTGTTGGTGGTTGGTCAGGTAACTACTCACGTATTACTGCGGTTCGTTCTGGCGACAAGTTTACAGTTTCGGCTACAAACTTCGTCAAGAGTACAAACCTAGAAGACCATGGTAAGAGTGCAATTGAATTAGTCCATGAATTTGATTTGCAAGAGTTCACTGAACTACAGCAGTTCCGTTCAGGTGGCAGATTCGGTTATGGTTGTATGTCACAACCAAACTCAACGTTTATCAACATCCTTCGTCCTGACGAAAACGTTGGTAACTACTATGCGTCTGCGGATACCATCCGTATCCTCTCTGAGAGGCAAGCAGAGTCCGTTAAGTTCGCTACTGGTGTCATTGCTCCGGGTAACAAGATTCCTATCCCTGCGGGCTTTACAGAAGCCGATTGTCATGCAGTGGTAGCATTCAACACAAGTGGGTCTAGTGTTAAACTGGCTTATGCTAGAGCTTGGCTATCGGGACTTACTGTCAACATTACAACTAAGCTTAAAGGCAGCGCGGCTGTAACTAATCCTGCGGGCAGTACTGCTCGTTACTATCTAATCGCCCGTAAGAAACCAGAGGTGTAA

Tertiary structure

PDB ID
25dbc59ef16d2a154c10a0f6b130803b8b4752faab6f665c1ace337eba141646
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5480
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome of Vibrio phage pVp-JHP1101 Park,J.H., Kim,S.G. and Park,S.C. 2025-11 — GenBank