Protein
View in Explore- Genbank accession
- QBX18415.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fibers protein
- RBP type
-
TSPTFTF
- Protein sequence
-
MIIVIHDSELKPVLILDNKKQGTLNFFDDQWTRHLMTGSSVFEFSVYKKNLLGDTPLSHKYDVLNDQAFVSFINKKGKVELFNVMRIEETENKITCYCENLNLELLNEYCPAFKADKAMSLEEYFVEFDMINFGALTIGVNEVKDKKLTLEWTATETKLARLLSIVTNFDAEVEFETKLNDNYTFKMLQVNIYKEYEEGVSSGVGQDKTDRVLRYHKNIDGVTKKVDKTQIYNAVKPFGKKKVTGTRVVSNPVTKKVTKLVTNRKTYVGGDLRLQDKILKKDFVQSIIDYAVLYNILPSGLIVQLFTESLWGTSYVARVDNNWGGLTWTGQTTRPSGVTVSRGSARPANEGGYYMHFASVADYLKDYAYLLAKQGIYNVVGKKTFATFTQGLFTIGGAKYNYAAVGYDRYKISMDSLRNQINKSNNNILNTIDSIWSTPVTTTGTTVAKRATQTINVLNQIQGMKGHRVGSGQCYALSAWYAMKLNGPGLDGGVTGFRGRIGAGVAASQIGTDYAWGSYQWLLDKNPTASNLKAGGIYNVRAFAPAPIQTGVYGHTGIIKSVTDTQVTVYEQNYAGRMYVIENVYNKTAFVNTLQTVCYPREIKEGMSVTGATTQQISGGTQISYDEVVQEAQTETYEEEQIVTIDKSIYKEWKDSKGQVEFYLKDGMFYAPLSKNRYPSVLSGNETKDNWIRKDLEVDTDSPAMLETVGLRDIKAHAYPIITYEVDGWFDGDIGDIVTIQDDGYKPPLILSARVVDQVVCDTNKKASKTTFSNYVEKASQISDDLISEMLRMYDDATPYNIRLAVSNGTAFKNGIGESLLTPTLEKNGKEYDAIFAYRNGDSHLDMGPQFLVKATDFSHVLNVTVEAYINDELVASAQVSFTDTEDGTDGVGVNSVSITYGLSKSAGTQPTTWTTDLPVAGQGDYLWTRKITDYTDSTKEDTIELTYSFQGKDGVAGASLKVSKIEYQAGTSGTVAPTGAWSTTIPSVPEGQYLWSKTTLSDNSIVYGIAKQGAVGPKGDKGDTYYPHTAWANSEDGKVDFSTTESKGRRYKGDYSDTNVAGSTDPTKYKWVDMTANAKTGNNNLLINTKSLSGNYFIANNSSETYLGGTIATAKAVSGSYQDAFRQAMKIAPEGNEFIVSFYAKSSVDNVTINNHFYSPNRTIKGVSSTGALFNNSNGGDGLIAFKLTTQWKRYWIKWTIRDASTEAENTPMWLILGRNFDSVNSVYIALPALYAGNLNTEWSKAPEDVDAKIDSKADEDFTIEQLNLIAENQRLLKAENDAKASLEELNTWVNTIKEQLEAQKNGQRISEEALIEASTRVTQIQAKLGEIALVTEAITQYMSYSENGLIIGMKDGTSSVRVTTDRISFYSGGTETAFISQGFLQIESGVFTLRLQIGHYLFEEDGNGMLMIGRVI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1418 AA molecular weight: 157084,50660 Da isoelectric point: 5,39689 aromaticity: 0,10367 hydropathy: -0,35628
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Streptococcus phage Javan425 [NCBI] |
2548161 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX18415.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK448756.1
[NCBI]
CDS location
range 27820 -> 32076
strand +
strand +
CDS
ATGATTATAGTAATTCATGATTCAGAGTTGAAACCAGTCTTAATACTTGATAATAAGAAACAAGGAACCTTGAACTTTTTTGATGATCAGTGGACAAGACATTTAATGACAGGGTCGTCCGTTTTTGAATTTTCTGTTTACAAAAAGAATTTACTAGGTGATACACCACTTTCTCACAAATATGACGTCTTGAATGACCAGGCATTTGTCTCTTTTATTAACAAAAAAGGCAAAGTTGAACTTTTTAACGTCATGCGGATTGAAGAAACTGAAAATAAAATCACTTGCTACTGTGAAAACCTAAACCTTGAATTACTAAATGAGTATTGTCCAGCATTCAAAGCTGATAAAGCGATGTCACTGGAAGAATATTTTGTTGAATTTGACATGATTAACTTCGGTGCATTAACTATTGGTGTTAACGAGGTTAAAGACAAGAAACTCACACTTGAGTGGACAGCAACTGAAACTAAACTTGCTAGACTTTTATCTATTGTTACCAATTTTGATGCAGAGGTTGAGTTCGAAACAAAGCTAAATGACAACTATACCTTTAAAATGCTTCAGGTTAACATTTACAAAGAATATGAAGAAGGCGTCTCAAGCGGAGTTGGTCAAGATAAGACTGATAGAGTGCTTAGATATCATAAAAACATCGATGGTGTTACAAAGAAAGTAGATAAGACTCAGATATATAATGCAGTCAAACCATTTGGTAAAAAGAAGGTAACTGGAACAAGAGTTGTTTCTAATCCAGTTACAAAAAAAGTAACTAAACTAGTTACTAACAGAAAAACATATGTTGGCGGTGATCTTCGACTTCAAGATAAAATTTTGAAGAAGGATTTTGTTCAATCAATTATTGATTATGCTGTTCTATATAATATTCTTCCATCAGGTCTAATTGTTCAGCTATTTACAGAGTCATTATGGGGAACAAGTTATGTAGCACGAGTGGACAATAACTGGGGCGGTTTAACATGGACTGGTCAAACTACTCGACCAAGTGGCGTCACAGTCTCAAGAGGTAGTGCAAGACCTGCAAATGAAGGTGGCTATTACATGCATTTCGCAAGTGTAGCTGATTACCTTAAAGACTATGCTTATCTTTTAGCAAAACAAGGCATTTACAATGTAGTTGGCAAAAAAACTTTTGCTACATTTACTCAAGGATTATTTACAATTGGCGGGGCAAAATATAATTATGCTGCTGTTGGTTATGATAGATATAAAATTTCGATGGACTCTTTGAGAAATCAAATCAATAAGAGTAATAACAATATCTTAAATACTATCGACAGTATCTGGTCAACACCAGTAACTACAACGGGAACGACAGTTGCTAAACGAGCGACTCAAACAATCAATGTACTTAACCAAATTCAAGGGATGAAGGGGCACAGAGTTGGTTCAGGGCAATGTTATGCGTTGTCGGCTTGGTATGCTATGAAACTAAATGGCCCTGGACTCGATGGTGGGGTCACTGGCTTTAGAGGTCGTATTGGCGCAGGTGTGGCGGCATCACAAATCGGTACTGACTATGCTTGGGGTTCCTATCAGTGGTTATTAGATAAAAACCCAACGGCAAGTAACTTAAAAGCCGGCGGTATTTATAACGTAAGAGCATTTGCTCCAGCACCTATCCAAACTGGTGTTTATGGTCATACTGGGATTATTAAAAGTGTTACAGATACTCAAGTTACTGTTTATGAGCAAAATTATGCAGGTAGAATGTATGTTATCGAAAATGTTTATAATAAGACAGCTTTTGTAAATACACTTCAAACAGTTTGTTATCCTCGTGAGATTAAAGAGGGTATGTCTGTAACAGGTGCAACGACTCAACAAATTTCAGGCGGTACTCAAATTTCATATGATGAAGTAGTACAGGAAGCTCAAACTGAAACTTACGAAGAAGAACAAATTGTAACTATCGACAAATCAATCTATAAAGAGTGGAAAGACTCAAAAGGCCAAGTTGAATTTTACCTGAAAGATGGAATGTTTTATGCGCCATTGTCAAAAAATAGGTATCCTTCAGTGTTATCCGGAAACGAGACAAAAGATAACTGGATTCGGAAAGATTTAGAAGTTGATACGGATAGTCCAGCTATGCTTGAAACTGTTGGACTACGTGACATCAAAGCGCATGCTTATCCAATAATCACTTATGAGGTTGATGGATGGTTCGACGGAGACATCGGAGATATTGTCACAATTCAAGATGATGGTTATAAGCCACCGCTAATTTTATCTGCAAGGGTAGTTGACCAAGTAGTTTGTGACACCAACAAAAAGGCTAGCAAGACAACGTTTAGTAATTATGTTGAAAAAGCTAGCCAAATTTCGGATGACTTAATTAGTGAAATGCTTCGTATGTATGATGATGCAACACCTTATAATATCAGACTGGCGGTATCAAATGGTACTGCTTTTAAAAACGGTATTGGTGAGTCATTACTAACACCAACTCTTGAAAAAAATGGAAAAGAGTATGACGCCATTTTTGCTTACAGAAACGGTGACAGCCACTTAGATATGGGTCCTCAATTTTTGGTAAAAGCAACCGACTTTAGCCATGTCCTAAATGTGACAGTCGAAGCCTATATAAACGATGAGTTAGTAGCATCAGCTCAAGTATCATTTACAGATACTGAAGACGGTACTGATGGTGTAGGCGTTAACTCTGTTTCAATCACTTACGGCTTATCAAAATCAGCTGGCACTCAACCGACAACTTGGACGACTGATTTACCAGTAGCTGGGCAAGGTGATTATCTATGGACTAGAAAAATAACGGACTACACTGACTCTACAAAAGAAGACACCATTGAATTAACTTACAGTTTCCAGGGCAAGGATGGCGTTGCTGGAGCATCGCTTAAAGTATCAAAAATAGAGTATCAAGCAGGAACGAGTGGCACAGTTGCACCAACAGGGGCATGGTCTACAACAATTCCAAGTGTCCCCGAAGGGCAATATCTATGGTCTAAGACAACACTGTCAGACAACAGTATTGTCTATGGTATAGCTAAACAAGGTGCTGTCGGCCCTAAGGGGGACAAAGGGGACACTTACTATCCGCATACTGCATGGGCTAACAGCGAGGATGGCAAAGTAGACTTTAGTACAACTGAGTCAAAAGGAAGACGGTATAAAGGTGACTACTCAGATACTAATGTAGCAGGTAGCACTGACCCTACCAAGTACAAATGGGTTGATATGACTGCTAATGCAAAGACTGGCAACAATAACTTATTGATTAACACAAAGTCATTATCAGGTAATTACTTTATTGCTAACAATTCATCTGAGACTTATTTAGGCGGTACTATTGCGACTGCAAAAGCAGTCAGCGGATCATATCAAGATGCTTTTAGGCAAGCGATGAAAATTGCCCCCGAAGGAAACGAGTTTATAGTTTCGTTTTATGCTAAGAGTTCGGTTGATAATGTAACAATTAACAATCATTTTTATTCACCGAACAGAACAATTAAAGGAGTTTCCAGTACAGGCGCATTATTTAACAATTCAAATGGCGGCGATGGTTTAATAGCGTTTAAGCTAACAACTCAATGGAAACGTTATTGGATAAAATGGACTATTCGTGATGCTAGTACAGAGGCCGAAAACACACCAATGTGGTTAATTTTAGGTCGCAACTTTGACTCAGTAAATAGCGTATATATCGCTTTACCTGCTTTGTACGCTGGGAACCTTAACACAGAGTGGTCTAAAGCTCCTGAAGATGTCGACGCTAAAATTGACTCAAAAGCAGATGAAGATTTTACCATTGAGCAATTAAACTTAATAGCGGAAAATCAGCGTTTATTAAAGGCGGAAAATGATGCAAAGGCAAGTTTAGAAGAGTTAAACACTTGGGTCAATACCATTAAAGAGCAACTTGAGGCACAAAAAAATGGGCAACGTATATCAGAGGAAGCCTTAATTGAAGCATCTACTCGTGTCACACAAATACAAGCTAAACTTGGGGAAATAGCACTTGTCACCGAAGCTATCACGCAGTATATGTCATACTCTGAAAATGGACTTATTATCGGAATGAAAGACGGTACGTCAAGCGTACGTGTGACAACTGACCGAATTAGTTTTTACTCAGGCGGAACAGAAACTGCTTTTATTAGTCAAGGATTTTTACAAATCGAATCTGGGGTATTTACATTACGTTTACAAATCGGACATTATTTGTTTGAGGAGGATGGTAATGGAATGCTCATGATTGGACGAGTAATATAG
Tertiary structure
PDB ID
726dabcdce7a1e7cf0e8252a7b4f334dacc1295f3c8be2043fbdca37e293b17f
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50