Protein

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Genbank accession
VVC17415.1 [GenBank]
Protein name
Phage tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEISIGDVLKTLKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVNNTFRGTQAILSDNEALIIKNITQGAPLYLRGQDADGTNRWYLGNDNRGTNNLVLKNVKSDVSIAILENLVTVNRTLQIAGQVQPSSFANLDARYFTQTAANQRFAQLTANNTFTGTNTFANFVAKKNAEAITLQNVDTAPSLYIRARKSDGNYKWYIGNDGDESILKIYNYLTKTQVSLGNTITMSKTVQIDGQVQPSDWTNIDSRYIPAGTLGNLPKLNVSNTFTNVQTIVSNNEGLVLRNLTQGKPLYIRGVDTENVSRWWLGVGGSNSNVVTLNNNYSGTKISLGGSSVMTNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYYTQAAANARYMLASITGSASEADGGDGVAWDAKTGLYKVTNTTGQSSSLVYHMFLGTSSTPSAQLKFSFKNGGMWYRTSRDAYGFEVNWSKVYTEAQKPTPSEIGAYTKAETDRKIATAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVDPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRVAAANGSDVATTGGSDSVTLSVGNLPSHTHRFSATTSSFDYGTKNTNSTGAHTHSVSGTAASAGQHAHRISQGDNANVPSGRVASSNSAQTHVGWTENDGAHTHSVSGTAASAGGHAHSVGIGAHSHTVSGKTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:784 AA
molecular weight: 84200,31890 Da
isoelectric point:9,14544
aromaticity:0,08036
hydropathy:-0,38240

Domains

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage VpaE1_ev035
[NCBI] 		2695839 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
VVC17415.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR699048.1 [NCBI]
CDS location
range 52386 -> 54740
strand +
CDS
ATGGCAGACTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGACACAATTCGTTCAGACGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTAGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTATTTGACCCAACAGGCTCTTCTGAGATTAGTATTGGGGATGTTTTAAAGACTCTTAAAATCAACGCAAACGGCCTTAAACTAACTATTGCAGACGCTTCAAGGTCGGCAACTGTTTATCATACTTTGAATAAGCCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGACGCAAGGTATGCAAGACTAGCCGTGAATAATACCTTTAGAGGTACTCAAGCTATCCTCTCTGACAATGAAGCGCTCATTATTAAAAATATCACTCAAGGTGCTCCACTCTATCTTCGTGGTCAAGATGCAGATGGTACTAACAGATGGTATCTAGGTAATGATAATAGGGGTACAAATAATCTTGTATTGAAGAATGTAAAATCTGACGTTTCAATTGCTATTTTAGAAAATTTGGTGACAGTCAACAGAACTCTTCAAATTGCTGGTCAAGTTCAGCCTTCAAGTTTTGCTAACTTAGATGCTAGATATTTTACCCAGACAGCAGCTAATCAAAGATTTGCACAGTTAACTGCGAATAACACTTTTACTGGCACTAACACTTTCGCTAATTTTGTTGCTAAGAAGAATGCTGAAGCCATCACTCTTCAGAATGTGGACACTGCTCCCTCTTTATATATCCGAGCAAGAAAGTCAGATGGGAATTATAAGTGGTACATTGGTAATGACGGTGATGAGAGTATTTTAAAAATCTATAATTATCTAACAAAAACACAAGTCTCACTAGGTAACACCATTACCATGAGCAAAACAGTTCAAATTGATGGTCAAGTACAACCTTCTGATTGGACTAATATTGACTCTAGATATATTCCAGCAGGAACTTTGGGCAACCTCCCTAAACTTAATGTGTCTAATACTTTCACAAATGTGCAAACTATTGTATCTAACAACGAAGGTTTGGTATTAAGAAACTTGACACAGGGGAAGCCACTATATATCCGTGGTGTTGATACTGAGAATGTTTCTAGATGGTGGTTAGGTGTAGGTGGTTCAAACTCTAATGTGGTAACACTTAACAACAACTATTCTGGCACTAAAATCTCACTTGGTGGCTCATCAGTAATGACTAATAAGAGCTTAGCTATTACTGGTCAAGTACAACCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTATACCCAAGCTGCCGCAAACGCAAGATATATGCTTGCAAGCATCACTGGTTCGGCTTCTGAAGCAGATGGTGGTGATGGTGTTGCATGGGATGCAAAAACAGGTCTTTATAAGGTTACTAACACCACTGGACAGTCTTCTTCACTTGTATATCACATGTTTTTAGGGACTAGTTCTACACCATCTGCACAATTAAAGTTTTCGTTTAAAAATGGTGGGATGTGGTATAGAACATCAAGAGATGCCTATGGCTTCGAAGTTAATTGGTCTAAAGTTTACACGGAAGCACAAAAACCAACCCCTTCAGAGATTGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCGGAAAATTGCAACAGCAATTAGTGACTCTACAGACCTTAACAAAATCTATCCAGTTGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTGACCCTAATACAGCACTTCCTGGGTTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAGTCGCAGCAGCAAACGGTTCGGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGACTCTGTAACGTTGTCTGTTGGTAACTTGCCATCACACACTCATCGTTTCTCTGCTACCACTTCATCTTTTGATTATGGTACGAAGAACACTAATAGTACTGGCGCTCACACCCACTCAGTTAGTGGTACTGCTGCATCTGCTGGGCAACACGCACACAGAATTTCACAGGGTGACAACGCTAACGTTCCATCAGGTAGAGTTGCATCTTCGAACTCTGCTCAGACCCATGTTGGTTGGACTGAAAATGATGGTGCTCACACCCACTCAGTTAGTGGTACTGCTGCATCTGCTGGTGGACATGCTCATTCTGTAGGTATTGGTGCTCACAGTCACACAGTTAGTGGTAAAACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Tertiary structure

PDB ID
68d5c0813e95b4e5b9b065aa60d7fdf80f1b0104a29d9a88948cfd6313013be6
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6873
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50