Protein

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Genbank accession
QXV78795.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGQRPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDSGNIIDLSITAGGNISGNITQTGDYTQTGKFNLIGPQIIASGGYIEFNYRTTGSGAWSGQHTAKAPIFVDLSSATSTSEYNPIIKQRFKDGTFSLGTLVSEGSLKIHYIDETGQSKYWTFARSGNFQVDSGNLLVSGGYLVAQSNIETRTGSLIGPSVVTKNISFDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGETNGINYLRKFRAKSGGTIYHELASAQTGKSDELSWWTGNTAVNKQMGLRNDGSLVLRRSLAIGTITTDENINNYGSTGAMGECYIVIGDAATGVSYKRSGVYDLVANGLSIASITPDSFRSTRKALFGRSEDQGGTWIMPGTNAAFLSVQTQADENSAGDGQTHIGYNSGGKMNHYFRGKGKTNINTQEGMEVNPGILKLVTGSNNVMFYADGGITSVKQLSIYNGIYLAANNSTAGLTFAPTTTIDGTKQILWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNASGDRNRETVFEVADGQGYYFYSQRVAPSGSETTGPVVTQFAGAVNARGSIITDGSFKVNGLSTLVGNVTMSNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSESNLYIIPTPKDAGESGGISNLRPLIIELNTGTVKMSHDVHLGDSGSGTGLLQVSNSLKTIKMICPVTINERNAALTLDSPSSSSANYLQGSKAGTRSWYVGLGGAGSDLSLYSQSYGHGLVISDNFVSISKPLKVGNAQLGTDGNITSGSGNFANLNTTLNRKVNSGFITYGATAGWYKFATVTMPQSTSTVFFKIAGGSGFNSGLFTQCNIAEIVLRTSNERPADLNAVLYTRTIAAAFKNIAVNNVSGDTYDIYVYAGTYCNQLTCEWSCTENATVSVIGINSSTQSPVDALPDTAVDGQVANVLNNLVDRGKVKRYEADSEIAINNQTGIRIRSNSDKTGSVATMLRNDGSSFYILFTDKNATDGEATVNGDWNSKRPFAINLTTGEVLMNNGIAVRSAALFYNSINVKDNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDASRGNRIEIADETNYIAYFEKAPGGANRFVVNNATVAGVNQMNSFGININNALGGNSIAFGDSDTGIKQNGDGLLDIYANSVQVFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLNGVIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1260 AA
molecular weight: 134450,10840 Da
isoelectric point:7,51652
aromaticity:0,08571
hydropathy:-0,25444

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
509–645
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR048388
694–766
IPR048388 IPR030392 Coil
QXV78795.1
1 1260
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage FriedrichMiescher
[NCBI] 		2852011 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QXV78795.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ501066 [NCBI]
CDS location
range 61443 -> 65225
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGTCAACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGACGATTCAGGAAATATCATTGACTTAAGCATTACCGCTGGCGGTAATATCAGTGGTAATATCACTCAAACTGGTGATTATACACAGACTGGAAAATTTAATTTAATTGGCCCGCAGATTATAGCAAGTGGTGGATATATTGAGTTTAATTATCGTACTACTGGAAGTGGGGCTTGGTCCGGTCAACACACTGCAAAGGCTCCAATTTTTGTAGATTTAAGCTCAGCTACTTCCACATCTGAATATAATCCTATAATTAAACAGCGCTTTAAAGATGGAACTTTTTCATTAGGTACTTTAGTTTCTGAAGGTTCGTTGAAGATTCATTATATTGATGAAACTGGTCAATCTAAATATTGGACATTTGCGCGCTCAGGTAATTTTCAAGTTGATTCTGGTAATTTATTAGTATCTGGTGGGTATTTAGTCGCTCAGAGTAATATTGAAACAAGAACAGGTTCTTTGATTGGTCCATCTGTTGTAACTAAAAATATTTCATTTGATACGAAAGCGTTTGGACAATACGATTCGCAGTCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACTGGTGAAACAAACGGAATTAATTACCTTCGTAAATTCCGTGCAAAATCTGGTGGTACGATTTATCATGAATTAGCTTCTGCACAAACCGGAAAAAGTGATGAACTGTCTTGGTGGACCGGTAATACAGCCGTTAATAAACAAATGGGCCTTCGCAATGATGGGTCTTTAGTGTTGCGACGCTCACTCGCAATTGGTACAATTACAACAGATGAAAACATTAATAATTACGGCTCCACTGGAGCAATGGGTGAATGCTATATAGTCATTGGAGATGCCGCAACTGGTGTATCATATAAAAGATCTGGTGTATATGATTTAGTTGCTAATGGTCTTTCTATCGCGTCTATTACTCCTGACAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGCATTATTTGGACGTTCAGAAGACCAAGGCGGAACATGGATTATGCCTGGAACGAACGCTGCTTTTTTATCGGTTCAAACACAGGCTGATGAAAACTCTGCTGGAGATGGTCAAACCCACATTGGATATAACTCTGGCGGTAAAATGAACCACTATTTCCGTGGTAAAGGAAAAACTAATATTAATACTCAAGAAGGCATGGAAGTTAACCCAGGTATTTTGAAATTGGTAACTGGCTCTAATAATGTAATGTTTTATGCTGATGGCGGTATTACATCTGTTAAGCAGCTTTCAATATATAACGGCATATATTTAGCAGCTAATAATTCTACTGCTGGGCTAACATTCGCTCCAACTACTACAATTGATGGCACTAAGCAAATTTTGTGGGAAGGCGGTACTCGTGCTGGTCAGAATAAAAGCTATGTAACTGTTAAAGCGTGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGTAATCGTGAAACAGTTTTTGAAGTAGCTGACGGACAAGGTTATTATTTTTATTCCCAGCGTGTAGCCCCAAGCGGCTCAGAAACTACTGGTCCTGTTGTAACCCAGTTTGCTGGAGCTGTTAATGCTAGAGGAAGTATTATTACTGACGGAAGTTTTAAAGTTAATGGATTAAGCACTTTAGTCGGTAATGTTACCATGTCTAATGGTTTGTTTGTCCAAGGTGGTTCTTCTATTACTGGACAAGTTAAAATCGGCGGAACTGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCCGAATATGGTGCTATTTTCCGTCGCTCAGAAAGTAATCTTTATATTATCCCGACTCCTAAAGATGCTGGAGAATCTGGCGGTATAAGTAATCTTAGACCATTGATAATAGAACTGAACACCGGCACAGTTAAAATGTCGCATGATGTTCATTTAGGAGATTCTGGATCTGGTACAGGATTATTACAAGTAAGTAATAGTCTTAAAACTATTAAAATGATATGTCCAGTAACTATTAATGAACGTAATGCAGCGCTTACTCTAGATTCTCCTTCATCTTCTTCTGCTAATTATTTGCAGGGTTCTAAAGCTGGAACTAGATCGTGGTATGTTGGTCTTGGTGGCGCTGGAAGTGATTTATCGCTTTATAGTCAATCTTATGGACACGGTCTTGTTATAAGCGATAATTTCGTGTCAATCAGTAAACCTCTTAAAGTCGGAAATGCCCAACTAGGAACTGATGGTAATATTACTAGCGGTTCAGGAAACTTTGCTAACTTAAACACCACGCTAAATCGTAAAGTTAATTCTGGATTTATTACTTATGGAGCAACTGCTGGATGGTATAAGTTTGCAACAGTAACAATGCCACAATCCACTTCTACGGTCTTCTTTAAAATAGCCGGTGGTTCTGGATTTAATAGTGGATTATTCACACAATGCAATATTGCTGAAATTGTTTTACGTACTAGTAATGAAAGACCTGCTGACTTAAATGCTGTATTATACACAAGAACAATTGCAGCTGCATTTAAAAATATTGCAGTTAATAACGTCTCTGGAGATACATATGACATTTATGTTTATGCCGGAACATATTGCAATCAATTAACTTGTGAATGGTCATGTACCGAAAATGCTACTGTTAGCGTTATTGGTATTAACTCATCTACCCAATCACCTGTGGATGCTCTTCCAGATACAGCAGTTGATGGGCAAGTTGCTAATGTTCTTAATAACTTGGTTGATCGCGGCAAAGTTAAGCGTTATGAAGCCGATTCTGAAATAGCTATTAATAACCAAACTGGTATTCGTATTAGAAGCAACAGCGATAAAACTGGTTCTGTTGCTACAATGCTACGAAATGATGGCAGTAGTTTTTATATTCTGTTTACAGATAAAAATGCCACCGATGGCGAAGCAACTGTTAACGGTGATTGGAATAGTAAGCGTCCTTTCGCAATTAACTTAACAACAGGCGAAGTATTAATGAATAACGGCATAGCTGTTCGCAGTGCTGCTTTATTCTATAATAGCATAAATGTCAAAGATAATGGTTCTATTAACTTTGATAAGTCTGGTGCTAACCCAAGAAATATGAGAATATTTCATGCTGGCGATGCTTCTCGTGGTAACCGTATTGAAATTGCCGATGAAACTAACTATATTGCTTACTTTGAAAAAGCTCCAGGTGGAGCTAACCGCTTTGTAGTAAATAATGCTACTGTAGCTGGTGTTAACCAAATGAATTCATTTGGTATTAATATCAATAACGCACTTGGTGGAAATAGTATAGCATTTGGTGATAGCGATACTGGTATTAAGCAAAATGGCGATGGATTATTAGACATATATGCGAACAGCGTACAAGTATTCCGTTTCCAAAACGGTGATTTGTACTCATATAAAAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGCTTAAAATCTAATTTCAAACCTATCGAAAATGCACTTGATAAAGTTGAAAAACTCAATGGTGTCATTTATGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTAGCTCAAACGTTACAAGACGTTTTACCAGAAGCCGTCCGTGAAACAGAAGACAGCAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACGCTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Tertiary structure

PDB ID
3d8e5e74732016d7e97d254746d0ec4f8aae65a764d0310ac0b8662f4595f233
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2332
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Systematic exploration of Escherichia coli phage-host interactions with the BASEL phage collection Maffei,E., Shaidullina,A., Burkolter,M., Heyer,Y., Estermann,F., Druelle,V., Sauer,P., Willi,L., Michaelis,S., Hilbi,H., Thaler,D.S. and Harms,A. 2021 — GenBank