Protein

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Genbank accession
UPW39410.1 [GenBank]
Protein name
receptor-recognition protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,82
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATIKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTIFTKDDLGNIINLGFAKGGDINGNVTHVGNYTQTGTFNLIGSQNVASGGYIEFAYKGTGVGSWAGQHTAKAPIFMDISASTATSEYNPLIKQRYKDGTFSLGTLVNEGSMKMHYIDETGTSKYWTFRRDGGFTVDSGSLVVATGNISASGNINSATGIVSAPQVNTKTIVLDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGEENGINYLRKFRAKSGGTIYHELVSSQTGKSEEISWWTGDTAINKRMGLRNDGSLVLRRSLAIGTITADENINNYGSTGAMGECYIVLGDPSTGFKSIASGKIDFVAQGTSTATLTNGVFLSTKRLTVGRSDDSGATWVMPGNNASVLTIQTTPDGNANGDGQTHLGYNSNGKFYHYFRGTGRMAVSMSEGLIVEPGILNIKTGNNELNLRADGTIYSTQRISIRSGMYFAGDDNTSALTFKAPTGVDGTKQILWEAGSRAGQNKSYVTVKAWGNSFNATGDKARETVFEVSDGQGYYFYSQRMAPSGSETTGPVVSQFNGQVNANGSINTAGSLKVDGLSTLNGAVTMSNGLSLTGGSSISGQVKIGGTNDALRIWNAEYGAIFRRSEAALHIIPTPKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHTVTLGDDGAGGNMVTVDNDTKLVVLTTNSRISPNFRMQLGQSTYIDAECTDIVKPAGAGSFVSQNNENVRAPFYMNINRTDTSTYVPILKQRYVQGDSCYSLGTLISTGDFRIHYHEGGDNDSTGPQKADLAWQFRRDGSFRSPNKIEINTVIIGTDGNITGGTGNFANLNTTINSLKTDIISSYPIGAPIPWPTDTPPVGYAIMEGQTFDKAAYPKLGAVYTSGTIPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHTHSASSNSVDLGTKTSSSFDYGTKTSSSFDYGTKSAASAGAHTHSLSGSTNSTGAHAHTDGLRMSSSGWSQYGTVTIPASVSTVKGTNQQGAGYCAKTDSQGNHSHSLSGTAASAGAHTHNVAVGAHTHTVGIGAHTHTVALGSHSHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1084 AA
molecular weight: 114285,13500 Da
isoelectric point:8,42913
aromaticity:0,07749
hydropathy:-0,34004

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
509–645
IPR048390 IPR051934
SSF88874
833–990
SSF88874 SSF88874
IPR037053
839–892
IPR037053 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003
IPR011083
844–891
IPR011083
UPW39410.1
1 1084
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_ESCO47
[NCBI] 		2918870 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UPW39410.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OM386662 [NCBI]
CDS location
range 99420 -> 102674
strand -
CDS
ATGGCTACTATTAAGCAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTAGCTGGTGTTAATCCAACAGCTGCGCAATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATCGTACTATTTTTACAAAAGATGATTTAGGCAATATTATTAACCTTGGGTTCGCTAAAGGTGGGGATATTAATGGTAATGTAACTCATGTAGGTAACTATACTCAGACAGGTACATTTAATTTAATAGGCTCACAAAATGTTGCATCAGGTGGATATATCGAATTTGCTTATAAGGGCACCGGAGTTGGTTCTTGGGCCGGTCAACACACGGCAAAAGCCCCTATTTTCATGGATATTTCCGCATCAACCGCTACTTCAGAATATAACCCGTTAATTAAGCAACGTTATAAAGATGGTACTTTCTCATTAGGGACCTTAGTTAATGAAGGCTCAATGAAGATGCATTATATTGATGAAACAGGCACTTCGAAATATTGGACTTTCCGACGCGATGGTGGATTTACGGTTGATTCTGGTAGCTTGGTTGTTGCAACAGGTAATATTTCTGCGTCAGGCAATATTAACTCCGCTACTGGTATAGTTTCTGCTCCACAAGTTAATACGAAAACCATTGTTTTAGACACAAAAGCATTTGGACAATACGATTCGCAATCATTAGTTCAGTATGTTTATCCTGGCACAGGTGAAGAAAACGGTATTAACTATCTTCGTAAATTCCGCGCAAAATCCGGCGGCACGATTTATCATGAATTAGTTTCTTCACAAACTGGTAAAAGCGAAGAGATTTCTTGGTGGACAGGTGACACCGCGATTAATAAACGGATGGGTCTTCGTAATGATGGATCTTTAGTATTACGTCGTTCTCTCGCAATTGGCACAATTACCGCAGATGAAAACATTAATAACTATGGTTCAACTGGCGCTATGGGCGAATGTTATATAGTTCTAGGGGACCCATCTACTGGATTCAAATCTATCGCTTCAGGTAAAATTGATTTTGTTGCACAAGGTACTTCTACTGCGACTTTAACAAATGGGGTATTTTTAAGTACGAAACGTTTGACTGTCGGTCGCTCAGATGACTCTGGTGCCACCTGGGTAATGCCTGGAAATAACGCTTCTGTTTTAACAATTCAAACAACTCCTGATGGTAATGCTAACGGTGATGGACAAACTCATCTTGGGTATAATAGTAATGGTAAGTTTTATCATTATTTCCGTGGCACAGGACGTATGGCAGTATCTATGTCCGAGGGTCTTATTGTTGAACCTGGCATATTAAACATCAAAACCGGTAATAATGAATTAAATCTTAGGGCTGATGGTACCATCTATTCAACCCAACGTATTTCTATACGATCCGGCATGTATTTTGCAGGTGACGATAATACGTCGGCTTTAACATTTAAAGCTCCTACAGGGGTAGACGGCACAAAACAAATCTTGTGGGAAGCTGGTTCTAGAGCAGGACAGAATAAAAGTTATGTGACTGTTAAAGCTTGGGGTAATAGTTTTAATGCTACCGGTGACAAAGCGCGCGAAACAGTATTCGAAGTTTCTGATGGACAAGGATATTATTTTTATTCACAGCGTATGGCTCCAAGTGGCTCTGAAACTACTGGGCCTGTTGTATCCCAGTTCAATGGACAAGTTAATGCTAACGGCTCTATTAACACTGCAGGAAGTCTTAAAGTTGATGGTTTGAGCACTTTAAATGGTGCAGTTACCATGAGCAATGGACTTAGTTTAACAGGCGGTTCTTCTATTAGTGGTCAAGTTAAAATTGGTGGAACTAATGATGCATTAAGAATTTGGAATGCCGAATACGGTGCTATTTTCCGCCGCTCTGAAGCAGCATTGCATATTATTCCAACTCCCAAAGATGCTGGTGAAAGCGGTGGAATAAGTAATCTCCGCCCATTAAGTATTAGTCTTAATAATGGCATGGTACAAATGCGTCATACCGTTACATTAGGTGATGATGGTGCCGGCGGTAATATGGTCACCGTAGACAATGATACAAAACTCGTTGTGTTGACCACTAATTCGCGTATAAGTCCTAATTTCCGTATGCAATTAGGGCAGTCGACATATATTGATGCTGAATGTACTGATATTGTTAAACCAGCAGGGGCTGGTTCATTTGTCTCGCAAAATAATGAAAATGTTCGTGCCCCATTCTACATGAATATTAATCGTACAGATACAAGTACTTACGTTCCTATTTTGAAACAACGATATGTCCAGGGCGATAGTTGTTATTCTTTGGGTACATTAATTAGTACGGGTGATTTTAGAATTCACTATCATGAAGGCGGTGATAATGATTCAACAGGTCCACAAAAGGCGGATTTAGCATGGCAATTTAGACGTGATGGCTCGTTCCGTTCACCTAATAAAATTGAAATTAATACCGTTATAATTGGTACTGATGGTAATATCACAGGTGGTACTGGTAACTTTGCTAACCTAAATACGACGATAAATAGTCTTAAGACGGATATCATCTCTAGTTATCCGATTGGTGCTCCGATTCCATGGCCAACTGATACACCTCCTGTGGGTTATGCTATTATGGAAGGCCAGACTTTTGACAAAGCGGCGTATCCTAAATTAGGTGCAGTATATACTTCAGGAACTATTCCTGATATGCGTGGACAAACTATTAAAGGTAAACCGAGTGGTCGTGCAGTGTTGAGTACAGAAGCAGATGGTGTTAAATCTCATACCCATAGTGCTTCTTCTAACTCGGTTGATCTAGGTACAAAAACGTCGTCAAGTTTTGACTACGGTACTAAGACAAGTTCGAGTTTTGACTACGGTACCAAATCTGCTGCTTCAGCTGGTGCGCATACACATAGTCTGAGCGGTTCCACAAACTCAACCGGCGCCCATGCTCACACAGATGGTTTAAGGATGAGCAGTAGTGGTTGGAGCCAATACGGAACAGTAACCATTCCGGCAAGTGTATCCACGGTTAAAGGAACCAACCAGCAGGGAGCTGGTTATTGTGCGAAAACAGACAGTCAGGGCAACCACAGTCACTCTTTATCTGGTACTGCTGCTTCGGCTGGAGCACATACACATAACGTGGCCGTTGGTGCTCATACGCATACTGTAGGTATTGGTGCTCATACACACACCGTTGCATTAGGCTCACATAGTCACACAATAACAGTTAACGCAACAGGTAATACAGAGAACACTGTTAAAAACGTTGCGTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCTTAA

Tertiary structure

PDB ID
ba90531746fea990cfa281d1c49ae65213585837053f66e453e527260e12f60c
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2477
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Avian Pathogenic Escherichia coli bacteriophages Nicolas,M., Trotereau,A. and Schouler,C. 2015-06 — GenBank