Protein
View in Explore- Genbank accession
- WBF04344.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fibers protein
- RBP type
-
TSPTSPTSPTF
- Protein sequence
-
MISQFNQPRGSTSVEVNKQSIARNFGVKEDEVVYFSSGIDLSGFKVIYDESTQRAYSLPSGIVSGTTAISLNEQAILTHSAGSVDLGELAVSREEYVTLPGSFNFGHTINVKNELLVHDDKKYRWDGALPKVVPAGSTPASTGGVGNGAWVSVGDAAFRQEANKKFKYSVKLSDYSTLQDAVTDAVDGLLIDINYNFTDGESVDFGGKILTINCKAKFIGDGALIFNNMGPGSVINQPFMESKTTPWVIFPWDADGKWITDAALVAATLKQSKIEGYQPGVNDWVKFPGLEALLPQNVKDQHIAATLDIRSASRVEIRNAGGLMAAYLFRSCHHCKVIDSDSIIGGKDGIITFENLSGDWGLGNYVIGGRVHYGSGSGVQFLRNNGGESHNGGVIGVTSWRAGESGFKTYQGSVGGGTARNYNLQFRDSVALSPVWDGFDLGSDPGMAPEPDRPGDLPVSEYPFHQLPNNHLVDNILVMNSLGVGLGMDGSGGYVSNVTVQDCAGAGMLAHTYNRVFSNITVIDCNYLNFDSDQIIIIGDCIVNGIRAAGIKPQPSNGLVISAPNSTISGLVGNVPPDKILVGNLLDPVLGQSRVIGFNSDTAELALRINKLSATLDSGALRSHLNGYAGSGSAWTELTALSGSTPNAVSLKVNRGDYKTTEIPISGTVLPDEGVLDINTMSLYLDAGALWALIRLPDGSKTRMKLSV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 708 AA molecular weight: 75289,71250 Da isoelectric point: 5,14929 aromaticity: 0,08051 hydropathy: -0,08418
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Salmonella phage PST-D24 [NCBI] |
3003695 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WBF04344.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP978318.1
[NCBI]
CDS location
range 125789 -> 127915
strand -
strand -
CDS
ATGATTTCTCAATTCAATCAACCACGCGGCTCCACTTCCGTAGAAGTTAACAAACAATCTATCGCTCGAAATTTCGGTGTCAAAGAAGACGAAGTCGTTTATTTCTCTTCTGGTATTGATCTCAGTGGATTTAAAGTAATTTATGATGAGTCTACCCAACGGGCTTATTCTCTTCCTTCGGGTATTGTTTCAGGAACGACTGCGATAAGCCTGAACGAACAAGCCATCCTCACTCATTCCGCTGGCTCTGTTGACCTTGGGGAATTAGCAGTAAGTCGCGAAGAATATGTGACTTTACCTGGTTCTTTTAATTTCGGCCATACCATTAATGTGAAAAATGAACTTCTTGTTCACGATGATAAAAAATATCGATGGGATGGTGCATTACCTAAAGTTGTTCCTGCTGGTTCAACGCCTGCATCAACTGGTGGCGTTGGCAATGGTGCTTGGGTTAGTGTTGGTGATGCTGCATTTAGGCAGGAAGCTAATAAGAAATTCAAATATTCAGTAAAGTTATCTGATTATTCTACATTACAGGATGCAGTTACTGATGCCGTTGATGGATTGCTTATTGATATCAATTACAACTTCACAGATGGTGAGTCTGTAGATTTTGGTGGTAAGATTTTAACCATTAACTGTAAGGCTAAGTTTATTGGAGATGGGGCTTTAATCTTTAATAATATGGGGCCAGGCTCGGTAATTAATCAACCATTCATGGAGAGCAAGACTACTCCATGGGTCATTTTCCCGTGGGATGCTGATGGTAAATGGATTACAGATGCTGCCCTTGTTGCTGCAACGCTGAAGCAATCAAAGATTGAAGGCTATCAACCTGGGGTAAATGACTGGGTTAAATTCCCTGGATTAGAAGCATTACTCCCACAGAACGTTAAAGACCAACATATTGCAGCCACTCTAGATATTCGCAGTGCCAGCCGAGTAGAAATAAGAAATGCTGGTGGTCTTATGGCTGCTTACCTTTTCCGTAGTTGTCATCACTGCAAGGTAATTGATTCAGATAGCATCATTGGTGGTAAAGATGGAATCATTACCTTTGAGAACCTTAGTGGTGATTGGGGATTAGGTAATTATGTTATTGGTGGACGTGTTCATTATGGTTCTGGTAGTGGTGTTCAGTTCCTGAGAAATAATGGTGGTGAATCCCACAATGGTGGAGTTATTGGTGTTACATCATGGCGAGCGGGTGAGTCTGGTTTCAAGACTTATCAGGGTTCCGTTGGTGGTGGTACTGCACGTAACTATAATCTACAGTTCAGGGATTCTGTTGCATTGTCTCCTGTTTGGGATGGTTTTGACTTGGGTTCTGACCCAGGTATGGCACCAGAACCGGATAGACCTGGGGATTTACCTGTATCTGAATACCCATTCCACCAACTGCCTAATAACCATTTGGTTGATAATATTCTTGTTATGAACTCACTTGGTGTTGGTTTAGGTATGGATGGTAGTGGTGGGTATGTTTCTAACGTTACCGTACAGGATTGTGCTGGTGCAGGTATGCTTGCACATACTTACAACCGTGTATTTTCTAACATTACAGTTATTGATTGTAACTACCTTAATTTTGATTCTGACCAAATTATCATTATAGGTGATTGTATTGTTAATGGGATTAGGGCTGCTGGGATTAAACCACAACCATCAAATGGTCTGGTTATCAGTGCACCAAACTCCACAATAAGTGGGTTGGTCGGTAATGTTCCTCCAGATAAAATTCTTGTTGGTAACTTACTTGACCCAGTATTAGGTCAGTCTAGAGTCATCGGGTTCAATAGTGATACTGCTGAGTTGGCTCTACGTATTAACAAGCTGTCAGCTACTCTGGATAGTGGTGCTTTACGTTCCCATCTGAACGGTTATGCTGGTTCTGGTTCAGCATGGACTGAGTTAACTGCACTCTCTGGTTCAACCCCTAATGCTGTATCTCTCAAGGTTAACCGAGGAGATTATAAGACAACTGAGATACCTATTTCTGGTACAGTATTACCGGATGAAGGTGTGTTGGATATTAATACAATGTCCTTGTACTTAGATGCGGGTGCACTGTGGGCTTTGATACGACTCCCTGATGGAAGTAAAACACGTATGAAGTTATCTGTGTAA
Tertiary structure
PDB ID
3fbb12786618ce923d9688ec0300a81638de0c9909921c008fd075be52958034
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50