Protein
View in Explore- Genbank accession
- AIW04091.1 [GenBank]
- Protein name
- L-shaped tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTFTFTFTF
- Protein sequence
-
MALKTKIIVQQILNIDDTTTTASKYPKYTVVLGNSISSITAGELTAAVEASAASAAAAKDSEIAAKESETNAKDSENLAAIYATSSETSATQSAASAAEAERQAGLSQKSAEASATSAEESKGFRNSAELAAQNAETSRRLAEQAKTAAQQAQTAAETAKTGAETAKAGAEAAATTAGEHAASAKQSELNAKESETNAAGSAVEAGDKAVDATIEANRAKAEADRAAQIVDSKLDKEDISGFIKVYKTKAEADADVANRVLGEKILVWNQTDSKYGWYKVAGTAEAPVLELVEIEQKLVSINNVHADDAGNVQITLPGGNPSLWLGEVTWFPYDKDSGVGYPGVLPADGREVLRVDYPDTWEAIEAGLIPSVSEAEWQAGATLYFSTGDGSTTFRLPDMMQGQAFRAPTKGEEDAGVVKDQIPYITVINGVSPNDTGEVTLGNVVTKNVWDGTSGEVLLRGAFGLGGSGIQLNEPDLVSFFKAMRAFGSGYYRNDTAIGGLPAYSAGFYSKTADTHSFICPQYSSGIVFIGTINDNQLDGENPAIHTNVLYGTANKPDLNNGTEGTLSVNKGGTGANTHEGVRSNFNIQGVFCVTSEESGDFNSISSPNGKLNLLIANSKVWGVQDTEGNIAPLLVERGGTGATNISQARKNPGIGESDIPVFKGVNLTLTNGVNSGLLYLTNKNTEGVQRTYSSIYNELQSELSKTTIRSSNDVTGKTAFLQFDENGKLYTSSVEATGNIKTGSLNLNYGHTFTINSGEQNALQISNYVAGIDTWCGYAKYNWYNDYAIAGLVRGGSTHVSDYRIEVYSPGVDAYSFQFFPQGKLRGASFNGRCTQGGWEMDLDENAHTIPFNARSIGNNNGGWVPIVSGGYATPSGYRIRAAFGAISPGASGWGRGVIKLMGDNSYFRGFEFHPSGNLTTWANSPDNAWGTAFEFTKSPSSDRDLKKDIIYTDGKEAYDRVMQWLPTLFKYKGQTTQRYGFIAQDLMKVDPQYVKLVPGAPVFEDVIGINEDGEEYIDRRIETGVEDDTLALDSNVMLVDLGAAVIYMNSQMEQQRKELEELKALVATLVNR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1074 AA molecular weight: 114585,16390 Da isoelectric point: 4,76290 aromaticity: 0,08380 hydropathy: -0,35894
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Salmonella phage Stitch [NCBI] |
2991861 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIW04091.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KM236244.1
[NCBI]
CDS location
range 85951 -> 89175
strand -
strand -
CDS
ATGGCACTTAAAACTAAAATTATTGTACAGCAGATTCTGAACATAGATGACACTACAACTACTGCTAGTAAGTATCCTAAATATACAGTAGTTTTAGGTAATTCTATTAGTTCTATTACTGCTGGTGAATTAACTGCTGCTGTAGAAGCCTCTGCTGCTTCTGCTGCGGCAGCAAAAGATTCCGAAATTGCAGCAAAAGAATCTGAAACAAATGCTAAGGACTCGGAGAACCTAGCTGCAATTTATGCTACTTCTTCTGAAACATCTGCAACTCAATCTGCGGCATCTGCCGCGGAAGCTGAGAGACAAGCTGGTCTGTCACAAAAGAGTGCTGAAGCATCCGCTACATCGGCGGAAGAATCTAAAGGATTCAGGAATTCTGCTGAATTAGCTGCTCAAAATGCGGAGACCAGTCGTAGACTTGCCGAACAAGCTAAAACTGCGGCTCAACAAGCTCAGACAGCTGCAGAAACTGCTAAGACTGGTGCTGAAACAGCAAAAGCAGGTGCAGAAGCTGCTGCTACAACTGCTGGAGAACATGCTGCTTCCGCTAAACAATCAGAATTAAATGCTAAAGAATCAGAAACTAATGCGGCTGGTTCTGCTGTAGAAGCAGGAGATAAGGCTGTAGATGCTACTATTGAGGCAAATCGTGCTAAGGCTGAAGCCGATCGCGCAGCCCAGATTGTAGATAGCAAGCTGGATAAAGAAGATATATCTGGTTTCATCAAAGTTTATAAGACAAAAGCAGAAGCTGATGCAGATGTTGCAAATCGTGTTCTGGGTGAAAAGATTCTAGTCTGGAACCAAACTGATTCAAAATATGGTTGGTATAAGGTTGCTGGTACTGCTGAGGCTCCTGTCCTAGAATTAGTAGAAATTGAACAGAAACTCGTATCAATCAATAACGTTCATGCAGATGATGCTGGTAACGTACAGATCACTCTTCCAGGAGGTAACCCTTCTTTATGGTTAGGTGAAGTTACTTGGTTCCCTTACGATAAAGATTCGGGTGTTGGATACCCTGGTGTTCTGCCAGCTGATGGTCGTGAAGTACTTCGTGTTGACTATCCTGATACTTGGGAAGCCATCGAAGCTGGTCTAATTCCTTCTGTTTCAGAAGCTGAATGGCAGGCCGGTGCAACTCTCTACTTCTCCACTGGTGATGGTTCCACAACCTTCCGTTTACCAGATATGATGCAAGGGCAGGCTTTTCGTGCACCTACTAAGGGAGAAGAAGATGCTGGAGTAGTTAAAGATCAGATTCCTTATATTACCGTAATCAATGGGGTTTCTCCTAATGATACTGGTGAGGTAACTCTCGGTAATGTTGTTACTAAGAATGTTTGGGACGGTACTTCTGGTGAAGTTCTTTTACGAGGTGCTTTCGGTTTAGGGGGTTCTGGTATCCAGTTAAATGAGCCTGATCTAGTTTCATTCTTTAAAGCTATGCGTGCTTTTGGTTCTGGTTACTACAGAAATGATACAGCTATTGGTGGCTTACCTGCATACTCTGCTGGTTTCTATTCTAAAACCGCAGATACCCATTCATTCATTTGCCCACAATATTCTAGTGGTATTGTATTTATCGGTACTATTAATGATAATCAGTTAGACGGGGAAAATCCTGCTATTCATACTAACGTGTTATACGGTACTGCTAATAAACCTGATCTTAATAATGGCACAGAAGGAACTCTATCAGTCAATAAAGGAGGTACGGGAGCTAACACGCATGAGGGGGTCCGTAGTAACTTTAATATTCAGGGAGTTTTTTGTGTTACAAGTGAAGAAAGCGGAGATTTTAATTCTATATCATCTCCAAATGGCAAATTAAACTTACTAATAGCAAATAGTAAAGTTTGGGGGGTACAAGATACCGAGGGTAATATTGCGCCCTTACTTGTAGAAAGAGGTGGTACTGGTGCAACAAATATAAGTCAGGCAAGGAAAAATCCTGGAATTGGTGAAAGTGATATTCCTGTATTCAAAGGTGTAAATCTTACCCTAACTAATGGAGTCAACTCTGGACTTCTATACCTAACAAATAAGAATACAGAAGGTGTGCAACGTACATATTCTAGTATTTATAATGAACTTCAATCTGAGCTAAGTAAGACGACAATACGTAGTAGTAATGATGTGACGGGTAAAACAGCTTTCCTACAATTTGATGAAAATGGTAAATTATACACATCTAGTGTTGAGGCTACTGGAAATATCAAAACAGGAAGTTTAAATTTAAACTATGGCCATACATTTACAATTAATTCTGGCGAGCAAAATGCACTACAGATTTCTAACTACGTTGCTGGAATAGACACCTGGTGTGGATATGCTAAGTATAACTGGTATAATGATTACGCTATTGCTGGGCTTGTTCGTGGCGGATCCACCCATGTATCTGATTATAGGATTGAGGTTTATAGTCCTGGTGTTGATGCATATAGTTTTCAATTCTTCCCACAAGGTAAGTTGAGAGGGGCATCTTTTAATGGAAGATGTACTCAAGGAGGGTGGGAGATGGATCTAGATGAAAACGCTCATACTATACCTTTTAACGCTAGGAGTATTGGTAATAATAACGGAGGCTGGGTCCCAATTGTATCCGGAGGTTACGCAACTCCATCAGGTTATAGGATTCGTGCGGCATTTGGTGCTATTTCTCCTGGTGCTAGTGGGTGGGGACGTGGCGTTATAAAACTCATGGGCGATAATAGTTACTTTAGAGGGTTTGAGTTTCATCCTAGTGGTAATTTAACCACATGGGCCAATTCTCCTGATAATGCTTGGGGTACCGCATTTGAGTTTACTAAGTCACCCTCATCAGACCGTGATCTGAAAAAAGATATTATCTATACTGATGGGAAGGAAGCATATGACCGCGTTATGCAATGGTTGCCCACTTTATTTAAGTATAAAGGACAGACAACACAACGCTATGGGTTTATAGCCCAAGACTTGATGAAAGTTGATCCCCAGTACGTTAAACTAGTTCCTGGTGCACCTGTATTTGAAGATGTAATAGGGATTAATGAGGATGGGGAAGAGTACATCGATCGTAGGATTGAAACGGGTGTTGAAGATGATACTCTAGCGCTAGATAGTAATGTTATGCTTGTTGATTTAGGGGCTGCTGTTATTTATATGAACAGTCAGATGGAACAACAACGAAAAGAGTTGGAAGAGTTAAAGGCTCTAGTAGCTACTCTAGTTAACAGATAA
Tertiary structure
PDB ID
8766cdecd0935d5746aad73234437b7a818225a18b83cc09d488a95f82db9313
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50