Protein

View in Explore
Genbank accession
QVW54298.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,79
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDSGNIIDLSISAGGNISGNITQTGDYTQTGKFNLIGPQIVASGGYIEFNYRTTGSGAWAGQHAAKAPIFVDLSSALSTSEYNPIIKQRFKDGTFSLGTLVSEGSLKIHYINESGDSKYWTFRRDGGFVVDTGGLAVSGGSITTSGNIAAIGNITSPQINTKNIILDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGEENGINYLRKVRAKSGGTIYHEIASAQTGKNDEISWWTGNSLTTKLMGLRNDGAMVLRRSLAIGTITTDENTNNYGSPTPMGERYIALGDAATGLKYIKQGVYDLVGNWNSVASITPDSFRSTRKALFGRSEDQGGTWTMPGTNAALLSVQTQADTNNAGDGQTHIGYNSGGKFSHYFRGKGQTNINTQEGMEINPGILKLVTGSNNVQFYANGTVSSIQRIKFDNGLVLTGARPDGIQLDAPTSADGTKTILWAGGTRAGQNKSYVSIKAWGNSFNASGDRARETVFEVADGQGYYFYAQRVAPATGSTVGPIQFRVAGALLTSGGITSSGSIVTESSLVANNGLSVNGQAKFGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEASLHIIPTPKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGRGGNMITVDNDNKLVVVTSHSRISPNYRMQLGQAAYIDAECTDAVRPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRTDTSTYVPILKQRYVQGNGCYSLGTLINNGNFRVHYHGGGDNGSSGPQTADFGWEFIKNGDFISPRDLIAGKVRFDRTGNITGGSGNFSNLDTTLNRKVTTGWINYSSVSGWYKLATVTMPQGVATVQFKITGGSGFNVGIFKQATINEIVLRSGNNTPKGINGVLWQRETDAIKDIAYINTSGDEYDVYISCGTYLNRLTIEYSTSENASVVVHGLYGPTQSPVAELPVDIVKGRVFKLLNNSSGVFDAGSSNISTNATFVANTTIGYRHKSNGDESGSAAALFYNDGTTFHILLTDKNTDTDKTKASGSYNSLRPFSINIASGKVTISNSMSVSGISEFYNDIALKNNGYIHFNKSGANPRNMSIFHAGDATRGNRIEIADESNYLVYFQRSPGGSNQCSFNSAVLSGITQTNSFGINTTNGWGGNSIAIGDSDTGFRQVGDGLLEAWANNVKVVRFTSSEVYSEKNVNAPNVYIRSDVRLKSNFKPIKNALERVEQLDGLIYDKAEYIGGEPVQTEAGIIAQTLQDVLPEAVHETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1298 AA
molecular weight: 138943,72200 Da
isoelectric point:8,18608
aromaticity:0,08629
hydropathy:-0,32288

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
501–631
IPR048390 IPR030392 Coil
IPR030392
1200–1297
IPR030392
QVW54298.1
1 1298
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia virus KFS-EC3
[NCBI] 		2836074 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QVW54298.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ065353 [NCBI]
CDS location
range 69743 -> 73639
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGATGATTCAGGAAATATCATTGATTTAAGCATTTCTGCTGGCGGTAATATCAGTGGAAATATCACTCAAACCGGTGATTATACACAGACTGGAAAATTTAATTTAATTGGTCCGCAAATTGTAGCAAGCGGTGGATATATTGAGTTTAATTATCGTACTACTGGAAGTGGGGCTTGGGCTGGTCAACATGCTGCAAAAGCCCCAATTTTTGTAGATTTGAGCTCAGCTCTTTCCACATCTGAATATAATCCTATAATTAAGCAGCGCTTTAAAGATGGAACTTTTTCATTAGGTACTTTAGTTTCTGAAGGTTCGTTGAAGATTCATTATATTAATGAATCTGGCGATTCGAAATATTGGACGTTTCGACGTGACGGTGGATTTGTTGTTGATACAGGAGGTTTAGCAGTATCAGGAGGTAGTATAACTACATCTGGAAATATTGCAGCTATTGGAAATATTACTTCACCTCAAATTAATACTAAAAATATTATTTTAGATACAAAAGCATTCGGACAATATGATTCGCAATCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACAGGCGAAGAAAATGGTATAAACTATCTTCGTAAAGTTCGAGCTAAATCAGGTGGAACTATTTACCATGAAATCGCTTCAGCTCAAACCGGTAAGAATGATGAAATTTCTTGGTGGACCGGAAACTCGCTTACTACTAAATTAATGGGTCTTCGTAATGATGGCGCAATGGTATTACGTCGTTCGCTTGCTATTGGCACAATTACCACTGATGAAAATACTAACAATTATGGCTCTCCTACTCCAATGGGAGAAAGATATATTGCTTTGGGTGATGCTGCAACCGGTTTAAAATATATTAAGCAAGGCGTTTATGATTTAGTAGGTAATTGGAATTCCGTTGCATCTATTACCCCGGATAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGCATTATTTGGACGCTCAGAAGACCAAGGCGGAACCTGGACAATGCCTGGAACCAACGCCGCGCTTTTATCGGTTCAAACCCAAGCTGATACAAACAATGCAGGTGATGGTCAAACCCACATTGGATATAATTCTGGCGGTAAATTTTCCCATTATTTCCGCGGTAAAGGCCAAACCAACATTAATACACAGGAAGGTATGGAAATTAACCCTGGTATTTTGAAATTGGTAACTGGCTCTAATAACGTACAGTTTTATGCTAATGGAACAGTATCTTCAATACAAAGAATTAAATTTGATAACGGATTAGTTCTTACTGGTGCTAGACCTGACGGTATTCAACTTGACGCTCCTACATCAGCAGATGGCACTAAAACTATACTGTGGGCTGGTGGTACTCGCGCAGGTCAGAACAAAAGTTATGTATCTATTAAAGCGTGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGTGCTCGTGAAACAGTTTTTGAAGTGGCTGACGGGCAGGGATATTATTTTTATGCACAGCGTGTAGCTCCAGCAACAGGTTCGACTGTCGGACCAATTCAATTTAGAGTTGCCGGAGCATTATTAACTTCTGGCGGTATTACATCATCTGGTTCTATTGTTACTGAATCCAGTTTAGTTGCAAATAATGGATTATCTGTAAATGGACAAGCTAAATTTGGTGGAACAGCAGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATATGGTGCTATTTTCCGTCGTTCAGAAGCATCATTACATATTATCCCGACTCCTAAAGATGCCGGTGAAAGTGGTGGAATAAGTAATCTCCGCCCACTAAGTATCAGCCTTAATAATGGTATGGTACAAATGCGTCATTCTGTCACGTTAGGCGATGACGGCAGAGGCGGCAATATGATTACTGTAGACAACGATAATAAACTTGTTGTTGTTACTAGTCATAGTCGTATTTCTCCTAATTACCGTATGCAGTTAGGTCAGGCTGCGTACATTGATGCAGAATGTACTGATGCTGTTCGCCCTGCTGGTGCAGGTTCGTTCGCTTCACAAAATAATGAAAACGTTCGTGCTCCGTTCTACATGAATATAGATAGAACCGATACAAGCACTTATGTTCCTATTTTGAAGCAACGTTATGTCCAAGGTAATGGTTGCTATTCATTAGGAACTTTAATTAATAATGGTAACTTCAGGGTTCATTATCATGGTGGCGGAGATAACGGTTCTTCAGGACCACAAACAGCAGATTTTGGATGGGAATTTATTAAAAACGGTGATTTTATTTCACCTCGCGATTTAATAGCAGGCAAAGTCAGATTTGATAGAACTGGTAATATTACCGGTGGTTCTGGTAATTTTTCTAACTTAGATACGACTTTAAACCGTAAAGTAACTACCGGCTGGATTAACTATTCTTCTGTAAGCGGTTGGTATAAATTGGCAACAGTAACTATGCCTCAAGGTGTAGCTACAGTCCAATTTAAAATAACAGGCGGTTCCGGTTTTAACGTTGGTATTTTCAAACAAGCAACAATTAATGAAATTGTATTACGTTCTGGTAATAATACGCCTAAAGGAATTAACGGTGTTTTATGGCAACGTGAAACAGATGCTATTAAAGATATTGCGTATATTAATACCTCAGGAGATGAGTATGATGTTTATATTAGTTGCGGCACTTATTTAAATAGACTTACCATAGAATATAGCACTTCAGAAAATGCTTCTGTGGTAGTTCATGGATTATATGGGCCTACGCAATCACCAGTAGCAGAGCTTCCTGTAGATATTGTTAAAGGTCGTGTTTTTAAACTTCTTAATAATAGCTCAGGCGTTTTTGACGCGGGTAGTTCTAATATTTCTACAAATGCAACTTTTGTGGCAAATACTACTATAGGATATCGTCACAAATCTAACGGTGACGAAAGCGGCTCTGCAGCTGCTCTGTTTTATAATGATGGTACTACGTTCCACATATTATTAACAGATAAAAATACCGATACTGATAAAACTAAAGCCTCGGGTTCTTATAATAGCTTGAGACCTTTTTCTATCAATATCGCTTCAGGTAAAGTAACTATTTCAAACTCGATGAGTGTTTCTGGGATATCAGAGTTCTATAACGATATTGCCCTCAAAAACAACGGTTATATTCACTTTAATAAGTCTGGCGCTAATCCAAGAAACATGAGTATATTCCATGCTGGAGATGCCACACGTGGCAACCGTATTGAAATTGCCGATGAATCAAATTATTTGGTTTATTTCCAGCGTTCACCGGGCGGTAGTAACCAATGTTCATTTAACTCTGCTGTTCTTTCGGGTATAACACAGACTAACTCTTTTGGTATTAATACAACAAATGGTTGGGGTGGTAACTCCATTGCAATTGGTGATAGTGATACTGGTTTTAGACAAGTAGGCGATGGGCTTTTAGAAGCGTGGGCGAACAACGTTAAAGTTGTTAGATTCACCTCAAGTGAAGTTTATTCCGAGAAAAACGTCAATGCTCCTAACGTTTATATTCGTTCTGATGTTCGCTTGAAATCTAATTTTAAACCTATTAAAAATGCGCTCGAAAGGGTTGAGCAACTTGATGGTTTAATCTATGACAAAGCTGAATATATAGGCGGTGAACCTGTTCAAACCGAAGCGGGTATTATAGCTCAAACGTTGCAAGACGTTTTACCAGAAGCTGTCCATGAAACAGAAGACAGCAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Tertiary structure

PDB ID
49ffe6a342f451e626060ceccbdc306bd2a762aca42622c84266f3d5e7bc5ac7
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7236
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterization of a New and Efficient Polyvalent Phage Infecting E. coli O157:H7, Salmonella spp., and Shigella sonnei Kim,S.-H., Adeyemi,D.E. and Park,M.-K. 2021 — GenBank