Protein
View in Explore- Genbank accession
- XRX12425.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein proximal subunit
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MNQNSVPYYHLELNTFDSNTSIMSPGIHREIFYRSLSGYFIYNSSSSTWVLFDTDTVDRLRTVSTDTDLFPNETVTVVGKDNVTAQTIKLTLPDNVQPGDQITIALNYMRKAQTVNIVPKGTDMILTNKNLTQFPKRSSYPPDGNWVNTNILSYNGNSDYPPVIKFAYIDMGPIKQWLMVDCLPALERVDPSTDSTRGRLGVIALATQAQANLDKSVITAEAKEVAITPETLSNRTATEARQGIAKISTRAQNQLNTDDANYNDFDIVTPLKLNQKQATETMRGLAEIATQAETDSNTDDTRIITSKKLDGRRARTDLAGVAKLVAAGGVAPVKNGTNTRDTAGTGIYDHSDYVNIVTPKTLREFYSTEMALGTVYLANSAEVISGAASVAKYPLAVTPETLHTKTATDGRIGFTQVANQTEVNAGTDYFKYVTPKTLNDRKATEALTGIAKLATQTEFNAGTAGLISGPDKIKAYLSTPSRTAVVAASGLTQAGNLWTTTTFDIVAPTETQRGTTRLATQTEVNAGTDDNTVVTPKKLHAKKATTAAEGIIRIANTAETIAGTSGTTAVCPVNLKQVIQVETSWEASASLRGPVKISSGSITFVGNDTVGSTADVETYAKTGYAISPYELNKTLVNYMPLKAKAVDSDKLDGIDSTQFIRRDINQTVEGSLTFTSPTLFNDRVDVREMLEVGKTSGESLNTDNGKLRMVSGAVAPRAWAFAIHDGNVNGVGSSTLKFGYKYLTAQPGPIDIVAYEIHHSGAIKFNNTLNVVGATTINNTLNVSGIVSTDSVGFRIAGFDALTAVSGQTKVGTTTRGLDLIATDAAFIRALDSGTVYTVMTTKNRAGILDPLYVKKSGDTMTGRLNVSQPITATIPQSLATPNAVPNSNNFGTWTIDITDPAIYNTMRPYLVGVYAKNEETGATLPWYDKYDEFNGPGTLSQFGSSASNGSGTYQIWAPRPPADKANLPGHIAGTMWSRQWNPATNRWDGWGRMFTNNHPPLPQDIGAMSNNGSVFDSMRIRDWIQIGNLRIYANPETKTVRFDWIE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1047 AA molecular weight: 113159,46230 Da isoelectric point: 6,16745 aromaticity: 0,07545 hydropathy: -0,30535
Domains
Domains [InterPro]
IPR048391
886–995
886–995
1
1047
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XRX12425.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV067732
[NCBI]
CDS location
range 14949 -> 18092
strand -
strand -
CDS
ATGAATCAAAATTCAGTACCATATTATCATCTAGAATTGAACACATTTGATTCTAATACAAGCATAATGTCTCCAGGTATCCACAGAGAGATATTCTATCGTTCACTAAGTGGTTATTTTATTTACAATAGCTCGTCATCTACTTGGGTACTTTTTGACACAGATACAGTAGATCGACTACGAACTGTTAGTACTGATACTGATTTGTTCCCTAATGAAACTGTCACAGTAGTCGGCAAAGATAACGTAACTGCGCAAACAATTAAATTGACTTTGCCTGATAATGTGCAACCTGGTGACCAAATCACTATTGCATTGAATTATATGCGCAAGGCTCAAACAGTTAATATCGTCCCTAAAGGGACTGATATGATTTTGACTAATAAAAATCTTACACAGTTCCCTAAACGTTCGAGTTATCCACCTGATGGCAATTGGGTCAATACCAACATTTTGTCATATAATGGCAATAGCGATTATCCACCTGTGATTAAGTTTGCATACATTGATATGGGGCCTATTAAGCAGTGGTTAATGGTCGACTGTCTTCCTGCATTAGAACGTGTAGATCCTTCAACAGATTCAACACGTGGAAGATTAGGTGTCATTGCATTAGCTACCCAAGCTCAAGCGAATTTAGATAAATCTGTTATAACAGCGGAAGCCAAAGAAGTCGCTATTACGCCTGAAACTTTATCAAATAGAACTGCTACCGAGGCTCGCCAAGGTATAGCTAAAATTTCAACTAGGGCACAGAACCAACTTAATACCGACGACGCTAATTATAATGATTTTGATATAGTTACTCCTCTCAAGTTGAATCAAAAACAAGCCACCGAAACTATGCGTGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAAGCTGAAACAGATAGCAACACCGACGACACAAGAATTATTACATCTAAGAAATTGGATGGGCGTAGAGCAAGAACAGATCTTGCAGGCGTAGCAAAACTCGTTGCTGCTGGCGGTGTAGCACCAGTTAAAAATGGCACAAATACACGAGATACTGCTGGTACTGGCATCTATGACCATTCAGATTATGTGAACATTGTAACTCCAAAAACATTAAGAGAATTTTATTCTACAGAAATGGCTTTAGGTACAGTGTACTTAGCAAATTCTGCTGAAGTTATTTCTGGTGCTGCATCAGTAGCGAAGTACCCATTAGCTGTTACTCCAGAAACATTGCACACAAAAACTGCTACAGATGGTAGAATCGGTTTTACCCAGGTTGCGAATCAAACCGAAGTTAATGCCGGCACCGATTATTTTAAATATGTTACGCCAAAAACATTAAATGATCGTAAAGCTACAGAAGCTTTGACTGGTATTGCTAAACTTGCAACTCAAACTGAGTTTAATGCTGGCACTGCAGGACTAATCTCTGGCCCAGATAAAATTAAAGCATATTTGTCTACACCTTCACGTACTGCGGTAGTTGCCGCATCTGGTTTGACACAGGCCGGCAACCTTTGGACTACAACAACATTTGATATTGTTGCACCTACTGAAACACAACGTGGTACAACACGATTAGCTACTCAAACTGAAGTTAATGCCGGCACTGATGACAACACTGTTGTTACTCCTAAAAAGTTACATGCTAAAAAGGCTACAACTGCTGCAGAAGGTATTATTAGAATTGCTAATACTGCAGAGACTATAGCTGGAACTTCTGGCACTACCGCTGTATGTCCAGTAAACTTAAAGCAAGTAATACAAGTCGAGACGTCTTGGGAGGCTTCAGCTTCTTTGCGTGGTCCGGTAAAAATCTCTAGCGGTTCGATTACATTTGTAGGAAATGATACGGTTGGATCAACAGCAGATGTTGAGACTTATGCTAAGACAGGTTATGCGATTTCGCCATACGAGTTGAATAAAACTCTTGTAAATTATATGCCGCTGAAAGCTAAGGCTGTAGATTCTGACAAATTAGACGGAATTGACTCTACTCAGTTCATCCGTAGAGATATTAATCAGACTGTTGAAGGAAGTTTAACATTCACTAGCCCTACATTGTTTAATGATCGTGTTGACGTACGTGAAATGTTAGAAGTAGGCAAAACTTCAGGTGAATCACTTAACACAGACAATGGCAAGCTGCGTATGGTTTCTGGTGCTGTAGCTCCTCGAGCTTGGGCATTCGCTATACACGACGGTAACGTTAATGGTGTTGGATCATCTACACTTAAATTTGGCTATAAGTACCTTACTGCTCAACCAGGTCCTATCGACATTGTTGCATATGAAATTCATCATTCCGGCGCAATTAAATTCAACAATACTTTAAATGTAGTTGGTGCGACGACAATAAACAACACACTAAATGTTTCAGGTATCGTAAGTACAGACTCTGTCGGATTCCGAATTGCTGGATTTGATGCGTTGACGGCAGTCTCAGGACAAACTAAAGTAGGTACTACTACACGCGGTCTAGACTTGATTGCAACTGATGCTGCATTTATCCGAGCTTTGGATTCAGGCACAGTATATACTGTAATGACAACAAAAAATCGTGCAGGGATTTTAGATCCATTATATGTCAAGAAGTCTGGTGACACTATGACTGGTAGATTAAACGTCAGCCAGCCTATTACTGCTACAATTCCTCAGTCTTTGGCTACGCCTAATGCTGTACCTAATTCTAACAACTTTGGTACATGGACAATCGATATTACTGATCCTGCAATTTATAATACTATGCGCCCGTATCTTGTAGGTGTCTATGCCAAAAATGAAGAAACTGGTGCTACACTACCATGGTATGATAAGTATGATGAATTCAACGGACCTGGTACGTTGTCTCAATTTGGATCATCTGCGTCTAATGGCTCAGGTACATATCAAATTTGGGCGCCACGTCCGCCAGCAGATAAAGCAAATCTTCCTGGACATATTGCAGGAACTATGTGGTCCCGTCAATGGAATCCTGCAACAAATCGCTGGGATGGCTGGGGTAGAATGTTTACAAACAATCATCCGCCGTTACCACAAGATATTGGCGCTATGAGTAACAATGGTTCAGTCTTTGATTCTATGCGCATCAGAGATTGGATACAAATTGGCAATTTAAGAATCTATGCGAATCCAGAGACAAAAACTGTTCGCTTTGATTGGATAGAATAA
Tertiary structure
PDB ID
7d831835286bf713d35c3053f7803b0d77fb1e10137408959b3c4e6c69254d32
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50