Protein
View in Explore- Genbank accession
- WOZ14994.1 [GenBank]
- Protein name
- tail spike protein
- RBP type
-
TSPTSPTSPTF
- Protein sequence
-
MTNPTLITTPFAENGDKNVIPESVGVEPQNATMQVGFPPITQQKISEGGIPPERNDFNGMFNLVTQHLVHLNKGLPYEFDQSFANAIGGYPLNARLMLDNGDIVRSTVANNTNNPNNDMTGWVKKESISTVNSIYDLPSTANDGDVIFVKGYYPLNASIQTHIGGGVRIYSSSRSSENDGFLCINGWVLQVIGNTVSFTQAGAKPNDNSFDSSDIINSVLATGLNVYDDPNHTYYVSKPILTKGQSIDGGFKITSSLDSVRTVTCSNEPVFKSKSNTYIYCGTTADYVDFMHIKSLGVDTILHYFQFKDGREWEKNYTQRDVLDSIKSSGLSVIVSTFEWVVKPDFPTWMNTALSYDNVVGFYTVDEPVGNNVSIAKQIEFAEAVREYTNLPICCAESQHNTYGNGVDNLAKVYDIIFFDSYYQHASVVSGLDPLEYTKLYYNAHLGIIRTQNPHAEVIPAIGAYISTSHTPSNADLEKLCSFNIDSSRTSDKVCSFIYDAFPESSDIKTCVKISTLLQNNVRDCNNTSRVNLTTDISFGTNSIGPYSSVDYGLSKIIDKWVYISPFPDVQTKMDGAYITTVVGSPTQTDTDFSFKTDSWDYKYSGICVKAGTSLVLTTLDFNVANIVSMYCRVYEGSTATGKVSLCETKNSGRELTVLQTHTFGDASQLSFPRIKGTGGKLAFLFEDVVFSENPTRPQITFRLFGSMSNW
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 711 AA molecular weight: 78451,73810 Da isoelectric point: 4,97594 aromaticity: 0,10970 hydropathy: -0,23671
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Acinetobacter phage vB_AbaM_AB3P2 [NCBI] |
3076809 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WOZ14994.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR526523.1
[NCBI]
CDS location
range 11297 -> 13432
strand +
strand +
CDS
ATGACAAATCCAACACTAATTACAACCCCGTTCGCTGAAAATGGCGACAAAAATGTAATCCCTGAATCTGTTGGGGTTGAGCCGCAAAATGCAACTATGCAAGTTGGATTCCCACCAATTACTCAACAAAAGATTTCTGAGGGCGGTATTCCGCCTGAGCGAAATGATTTTAATGGAATGTTCAACCTAGTTACGCAACATTTAGTACATCTTAACAAAGGCTTGCCTTATGAATTTGATCAATCCTTTGCCAATGCTATTGGTGGCTATCCATTAAATGCTCGTTTGATGCTTGATAATGGTGATATTGTTCGCTCTACCGTTGCGAATAATACAAATAATCCGAATAACGATATGACGGGGTGGGTTAAGAAAGAGAGTATAAGTACCGTTAACAGCATTTATGATTTACCATCTACTGCAAATGATGGAGATGTTATTTTTGTTAAGGGATATTATCCGCTTAATGCATCAATACAGACACATATTGGTGGTGGAGTTCGCATTTATTCAAGCTCTAGGAGTTCGGAAAATGATGGATTTTTATGTATAAACGGATGGGTTCTTCAAGTAATCGGTAATACTGTGTCTTTTACACAGGCTGGTGCAAAACCTAATGATAATAGCTTCGATAGTTCTGATATTATAAACTCAGTACTAGCTACAGGGCTTAATGTGTATGACGATCCAAATCACACTTATTATGTTAGTAAGCCGATTCTAACTAAGGGGCAAAGTATAGATGGTGGTTTTAAAATTACCAGTTCTTTAGATAGTGTAAGAACAGTTACATGCTCTAATGAACCTGTATTCAAGTCTAAATCAAATACTTATATTTATTGCGGAACGACAGCGGACTATGTGGATTTTATGCACATAAAATCATTAGGCGTTGATACTATATTGCATTATTTCCAGTTTAAAGACGGTCGGGAGTGGGAAAAGAATTATACTCAGAGAGATGTTTTAGATAGCATTAAATCATCTGGATTATCTGTTATTGTTAGTACATTTGAGTGGGTTGTTAAACCTGACTTTCCAACATGGATGAACACAGCTTTAAGTTATGATAATGTAGTCGGATTCTATACAGTCGACGAACCTGTCGGGAATAACGTTAGTATTGCTAAACAGATAGAGTTTGCGGAAGCTGTGCGTGAGTATACCAATTTGCCTATATGCTGCGCTGAGTCACAACACAATACCTATGGTAATGGTGTAGATAATTTAGCTAAAGTATATGATATTATATTTTTTGACTCCTATTATCAGCATGCTTCTGTTGTTAGTGGACTAGACCCATTGGAGTATACAAAACTTTATTACAATGCTCATTTAGGAATAATTAGAACTCAGAATCCACATGCTGAGGTAATTCCAGCCATAGGAGCTTATATTAGCACTAGCCACACACCATCTAATGCTGATCTTGAAAAATTATGCAGCTTTAATATAGATTCTAGTAGAACAAGTGATAAAGTATGTTCTTTTATTTATGATGCTTTTCCGGAATCATCAGATATTAAAACTTGCGTTAAGATTAGTACACTGTTACAAAATAATGTTAGAGATTGCAACAATACATCGCGAGTTAATTTGACAACAGATATTTCATTTGGGACAAATTCTATTGGTCCTTATAGTAGTGTAGACTACGGATTATCTAAAATAATTGACAAGTGGGTTTACATATCTCCTTTTCCAGATGTGCAAACAAAGATGGACGGTGCATATATCACAACGGTCGTCGGATCACCAACGCAAACTGATACTGATTTCTCATTTAAAACAGATAGTTGGGATTATAAATATAGCGGTATATGTGTAAAAGCTGGAACATCGTTAGTTTTAACAACGCTCGACTTCAACGTTGCAAATATTGTATCTATGTACTGTCGTGTATATGAGGGTAGCACTGCAACCGGAAAAGTGTCTTTGTGTGAAACAAAGAATAGCGGAAGAGAGTTAACAGTTCTACAAACACACACATTTGGAGATGCTTCACAATTATCTTTTCCAAGAATAAAGGGTACTGGTGGTAAATTAGCATTCTTATTTGAGGATGTAGTTTTTAGTGAAAACCCTACTCGACCACAAATAACATTCAGATTATTTGGATCTATGTCAAACTGGTAG
Tertiary structure
PDB ID
953dc8e06f8969455a7fdf4e1feb5ccc83685accd5f9708bc538fdc7de881903
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Isolation and genome-wide analysis of new Acinetobacter baumannii bacteriophage vB_AbaM_AB3P2 | Tan,Y. | 2023 | — | GenBank |