Protein
View in Explore- Genbank accession
- CAO1701872.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber protein distal subunit
- RBP type
-
TSPTFTFTF
- Protein sequence
-
MLSKIQFKRTTVAGKRPTVQQLAVGELAINLTDRTIFTSTGTEVIDLGFAKGGNVDGNINVTGQVTATHFNGPLNGNAVSATRLQTARNIALTGDATGTVSFNGTANVNIPVVLSNTGVTARAYGSNMKIPTFTVDSKGRITHVVEQDLVNASTTQSGFVRLNNTLTSTSTTEALTAAQGKVLNDSKSNVGHTHTMADITDYSLRYIAAENLDDISGFGIYGQNANANSTAERNYPVPNEAGTLEVFPGTYNIRQRFTTFATNRTFERRRNNNGVGWTAWAETTSRWETIKEKPTLTLTGDISGSVSFNSAGNLSITTTNNRVNGLVTATSATGTANTATNNTNTFLNIVSSNSGRASSVGPSTQVQGTNGITVSSDTAGKLVISQDLANNLNDTSAAKSLTAAQGKVLNDTKLNLSGGNLTGTLFVHTTGIKAVNDTDTGFEWPKVGQLKIRANNRDRIVIDSTTGNTEIFSAAGHRVAMQNDGNLVNYNANGSVSWASNNTVKKSGDTIQWLRVEAPDEWVGFQAKSTHATSPKTYWNTYNSNGVSVVGRHDYQDTDNKHWQIEFFGTRNGDWTKDRREKLMGVYFDGIWAPAYGWLHEKFLTLDSAQTVRAETTFSNGVKFTGSPLPVSTPFGIEANRIQGYGNLFINADTDTSAGSTNEFVLLTSGYGKSQNLEQGFAIFGNRATWKSGKFTVEDNGDISVKNGGDYSAIKLTSTGDRQLRIESYPPANANMGALIWKNESKHTLHNKIEIPKHNGIMLTTASVINETNNTTTNMPASANAVKLAMDNANGRVSRTANETISGTKTFNGTINVPTVAATTNSTVAASTAFVKTTNLPFNKRR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 846 AA molecular weight: 90688,13270 Da isoelectric point: 9,28804 aromaticity: 0,07447 hydropathy: -0,42128
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAO1701872.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OZ335333
[NCBI]
CDS location
range 64965 -> 67505
strand -
strand -
CDS
ATGCTTTCAAAAATTCAATTTAAAAGAACAACGGTTGCAGGAAAAAGACCTACTGTACAACAACTCGCTGTGGGTGAATTGGCAATCAACTTAACAGATAGGACAATTTTTACTTCAACTGGCACCGAGGTCATTGACCTTGGCTTTGCTAAAGGCGGTAACGTAGATGGCAATATTAACGTTACCGGTCAAGTTACCGCAACTCATTTTAATGGTCCATTGAATGGTAATGCAGTTTCTGCTACTAGATTACAAACTGCCAGAAACATTGCTTTAACCGGTGATGCCACAGGCACGGTATCATTTAATGGTACTGCAAACGTTAATATTCCTGTTGTTTTGTCTAATACCGGCGTAACAGCTAGAGCATATGGCTCTAATATGAAAATTCCTACGTTTACTGTAGATTCTAAAGGGCGCATTACGCACGTTGTAGAGCAAGATCTAGTTAATGCTTCCACGACACAAAGCGGGTTTGTCCGATTGAATAATACACTAACGTCGACTTCAACAACAGAAGCTTTAACTGCTGCTCAGGGTAAGGTTCTTAATGATTCGAAGTCAAATGTTGGCCACACTCATACTATGGCCGATATTACTGATTATTCTTTAAGATACATCGCCGCAGAAAATCTTGATGACATATCAGGTTTTGGTATCTACGGACAGAATGCTAATGCAAACTCAACAGCTGAAAGAAACTACCCAGTTCCTAATGAAGCCGGCACCCTAGAAGTATTTCCTGGAACTTATAATATCCGTCAACGCTTTACAACATTTGCAACAAATAGAACATTTGAACGCAGAAGAAATAATAATGGTGTTGGTTGGACTGCCTGGGCAGAAACCACTTCTAGATGGGAAACAATTAAAGAAAAGCCTACTTTAACTCTTACTGGTGATATTAGCGGCTCAGTATCATTTAATTCGGCCGGTAATCTTTCTATCACCACAACTAATAATAGAGTTAATGGGCTGGTAACTGCCACCAGTGCTACAGGCACTGCAAATACAGCAACTAATAATACAAACACATTCCTTAATATTGTTAGTTCTAATAGTGGTAGAGCATCATCTGTAGGGCCATCTACTCAAGTCCAAGGTACAAATGGTATTACAGTATCATCAGACACTGCAGGTAAATTGGTTATTAGCCAGGACCTGGCTAATAACCTTAATGACACTTCTGCTGCTAAATCATTGACTGCTGCTCAAGGTAAAGTTCTTAATGACACAAAATTGAACCTTTCAGGTGGCAACTTAACCGGCACGTTATTTGTTCATACTACTGGTATTAAAGCCGTAAATGACACTGATACAGGCTTTGAATGGCCTAAAGTCGGGCAATTAAAAATTCGAGCTAATAATAGAGACCGAATTGTTATTGATAGCACCACTGGTAATACAGAGATTTTTTCAGCGGCTGGTCATAGGGTTGCGATGCAAAATGACGGTAACCTTGTCAACTATAACGCAAATGGCTCAGTTTCCTGGGCTTCTAATAATACTGTTAAGAAATCAGGCGATACAATTCAATGGCTTAGAGTCGAAGCGCCAGATGAATGGGTCGGGTTCCAAGCAAAATCAACCCATGCTACTTCACCAAAAACATATTGGAACACTTATAACAGTAATGGCGTATCTGTTGTAGGACGTCATGATTATCAGGATACGGATAATAAACACTGGCAGATAGAGTTTTTTGGGACAAGAAACGGTGATTGGACTAAAGATCGTCGTGAAAAACTAATGGGTGTTTATTTTGATGGTATCTGGGCTCCTGCTTATGGTTGGCTACATGAAAAATTCTTGACACTTGATAGTGCTCAAACTGTTAGAGCCGAAACAACTTTCTCCAACGGCGTTAAATTTACTGGTAGCCCATTACCAGTGTCTACACCATTCGGTATTGAAGCAAATCGTATTCAAGGTTATGGAAATCTATTCATTAACGCCGATACAGATACGTCAGCAGGTAGCACAAATGAATTTGTGCTACTGACGAGTGGTTATGGAAAATCGCAAAACCTTGAGCAAGGTTTTGCGATTTTCGGAAACCGAGCAACTTGGAAAAGTGGAAAATTCACCGTAGAAGATAATGGTGATATTTCAGTTAAAAACGGCGGTGATTATTCTGCAATTAAATTAACATCGACAGGTGATAGACAACTAAGAATCGAATCATATCCTCCAGCGAATGCAAACATGGGTGCGTTGATTTGGAAGAATGAGTCAAAACATACGTTGCACAACAAAATTGAAATCCCTAAGCATAATGGTATTATGTTGACTACGGCTTCTGTAATCAACGAAACAAATAATACCACTACAAATATGCCTGCATCGGCTAATGCAGTTAAATTAGCAATGGATAATGCCAATGGTCGAGTTTCTAGAACTGCAAATGAGACTATTTCTGGAACAAAGACATTTAACGGAACCATCAATGTTCCTACTGTTGCGGCCACAACTAATTCAACGGTGGCTGCATCAACGGCGTTTGTTAAAACTACCAATCTCCCTTTTAACAAACGCCGTTGA
Tertiary structure
PDB ID
7b409adc8a58acc36f1cb5c36dd1f2088874c8e5afdad05518a11fa0e4cb164d
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50