Protein
View in Explore- Genbank accession
- XAI67864.1 [GenBank]
- Protein name
- tail spike protein
- RBP type
-
TSPTSPTSPTF
- Protein sequence
-
MSTITQFPSGNTQYRIEFDYLARTFVVVTLVNSSNPTLNRVLEVGRDYRFLNPTMIEMLVDQSGFDIVRIHRQTGTDLVVDFRNGSVLTASDLTNSELQAIHIAEEGRDQTVDLAKEYADAAGSSAGNAKDSEDEARRIAESIREAGRLGYITRRSFEKGYNITTWSEVLLWEEDGDYYRWDGTLPKNVPAGSTPETSGGIGLGAWVSVGDAALRSQITNPEGAILYPELHRARWLDEKDVRGWGAKGDGVTDDTAALARALNDTPVGQKLNGNGKTYKVTSLPDISRFINTRFVYERIPGQPLYYVSEEFVQGELFKITDTPYYNAWPQDKAFVYENVIYAPYMGSDRHGVSRLHVSWVKSGDDGQTWSTPEWLTDLHPDYPTVNYHCMSMGVCRNRLFAMIETRTLAKNALTNCALWDRPMSRSLHLTGGITKAANQPYATIHVPDHGLFVGDFVNFSNSAVTGVSGDMTVATVIDKDNFTVLTPNQQTSDLNNAGKNWHMGTSFHKSPWRKTDLGLIPRVTEVHSFATIDNNGFVMGYHQGDVAPREVGLFYFPDAFNSPSNYVRRQIPSEYEPDAAEPCIKYYDGVLYLITRGTRGDRLGSSLHRSRDIGQTWESLRFPHNVHHTTLPFAKVGDDLIMFGSERAENEWEAGAPDDRYKASYPRTFYARLNVNNWNADDIEWVNITDQIYQGGIVNSGVGVGSVVVKDNYIYYMFGGEDHFNPWTYGDNSAKDPFKSNGHPSDLYCYKMKIGPDNRVSRDFRYGAVPNRAVPVFFDTNGIRTVPAPMEFTGDLGLGHVTIRASTSSNIRSEVLMEGEYGFIGKSIPTDNPAGQRLIFCGGEGTSSTTGAQITLYGVNNTDSKRIVYNGAEHLFQSADVKPYNDNVTALGGPSNRFTTAYLGSNPIVTSNGEKKTEPVVFDDAFLDAWGDVRYIMYQWLDAVQLKGNDARIHFGVIAQQIRDVFIAHGLMDENSTNCRYAVLCYDKYPRMTDTVFSHNEIIEHIDEEGNVTTTEEPVYTEVVIHEEGEEWGVRPDGIFFAEAAYQRRKLERIEARLSALEQK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1064 AA molecular weight: 119147,11760 Da isoelectric point: 5,18954 aromaticity: 0,10996 hydropathy: -0,45949
Domains
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XAI67864.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP079212.1
[NCBI]
CDS location
range 32408 -> 35602
strand +
strand +
CDS
ATGTCCACGATTACACAATTCCCTTCAGGAAACACTCAGTACAGGATTGAGTTCGACTACCTAGCCAGAACGTTTGTTGTTGTTACGCTGGTGAATAGCTCTAACCCTACCCTGAACCGTGTACTGGAAGTTGGTCGAGATTATCGATTCCTTAACCCAACGATGATTGAGATGTTGGTTGACCAATCAGGTTTCGACATAGTTCGTATTCACCGTCAGACTGGAACTGACTTAGTGGTAGACTTCAGGAATGGCTCAGTGTTGACAGCTAGCGACCTGACCAATTCAGAGCTTCAGGCTATCCATATTGCAGAAGAAGGTCGAGACCAAACGGTTGACTTAGCGAAGGAATATGCCGATGCTGCTGGTAGCTCTGCTGGCAACGCTAAGGATAGCGAGGACGAAGCACGACGAATCGCTGAGAGTATCAGGGAAGCTGGTAGACTTGGCTATATAACCCGTCGCTCCTTCGAGAAAGGCTACAACATTACAACATGGAGCGAGGTACTGCTATGGGAAGAGGATGGTGATTATTATCGCTGGGATGGTACGCTTCCAAAGAACGTTCCTGCTGGTTCAACTCCTGAAACTTCCGGTGGGATTGGATTAGGTGCGTGGGTTAGTGTCGGTGATGCTGCTTTAAGAAGTCAGATTACAAATCCTGAAGGGGCAATACTCTACCCTGAATTACATAGAGCACGCTGGCTTGATGAAAAAGATGTTCGTGGTTGGGGTGCTAAAGGGGATGGTGTCACTGATGATACAGCAGCGTTAGCGAGAGCATTAAACGACACACCGGTTGGACAAAAGCTTAATGGCAATGGGAAGACATATAAGGTCACATCCCTGCCTGACATTAGTCGCTTCATCAACACTCGTTTCGTTTATGAGCGCATTCCCGGACAACCTCTTTATTATGTCTCTGAAGAATTTGTTCAGGGTGAGCTGTTCAAAATAACGGACACCCCTTATTACAATGCGTGGCCTCAGGATAAAGCGTTCGTATATGAGAATGTGATATATGCACCTTACATGGGTAGCGATCGTCATGGTGTTAGTCGTCTGCATGTATCATGGGTTAAGTCTGGTGATGATGGTCAAACATGGTCTACTCCAGAGTGGTTAACTGATCTGCATCCAGATTACCCTACAGTGAACTATCATTGTATGAGTATGGGTGTATGTCGCAACCGTCTGTTTGCCATGATTGAAACACGTACTTTAGCCAAGAACGCATTAACCAATTGTGCATTGTGGGATCGCCCCATGTCTCGTAGCCTGCATCTTACTGGCGGTATCACTAAAGCTGCAAATCAGCCATATGCAACAATACATGTACCAGACCACGGACTATTCGTGGGTGATTTTGTTAACTTCTCTAACTCTGCGGTAACAGGTGTATCCGGCGATATGACCGTTGCAACCGTAATAGATAAGGACAACTTCACGGTCCTTACACCAAACCAGCAGACTTCAGATTTGAATAACGCTGGAAAGAATTGGCACATGGGTACTTCTTTCCATAAGTCTCCATGGCGTAAGACAGATCTTGGTCTAATCCCTCGTGTCACAGAGGTGCATAGCTTTGCTACTATTGATAATAATGGCTTTGTTATGGGCTATCATCAAGGTGATGTAGCTCCACGAGAAGTTGGGCTTTTCTACTTCCCTGATGCTTTCAATAGCCCATCTAATTATGTTCGTCGTCAGATACCATCTGAGTATGAACCAGATGCGGCAGAGCCGTGCATCAAGTACTATGACGGTGTATTATACCTTATCACTCGTGGCACTCGTGGGGATAGACTAGGTAGCTCTTTGCATCGTAGTAGAGACATAGGTCAGACTTGGGAGTCACTGAGATTTCCACATAATGTTCATCATACTACATTACCTTTTGCTAAAGTAGGGGATGACCTTATTATGTTTGGTTCAGAACGTGCAGAAAATGAATGGGAAGCAGGTGCACCAGATGATCGTTACAAGGCATCTTATCCTCGCACCTTCTATGCACGCTTGAATGTAAACAATTGGAATGCAGATGATATTGAATGGGTTAACATCACTGACCAGATTTATCAGGGCGGAATAGTTAACTCAGGTGTAGGCGTTGGTTCGGTAGTTGTGAAGGATAATTACATCTACTACATGTTTGGTGGAGAGGACCATTTTAACCCATGGACATATGGAGATAACTCAGCGAAGGATCCATTCAAATCAAATGGTCATCCCTCAGATTTGTATTGCTACAAAATGAAGATTGGCCCAGACAATCGTGTTTCTAGGGATTTCAGGTATGGTGCTGTACCTAACAGAGCTGTTCCAGTGTTTTTTGATACGAATGGGATTCGCACTGTTCCTGCGCCAATGGAATTTACAGGGGATTTGGGTTTAGGTCATGTGACCATTAGAGCCAGCACCAGTAGTAACATTCGCTCTGAAGTTTTAATGGAAGGTGAATATGGGTTTATCGGGAAATCTATACCGACTGATAACCCGGCAGGGCAGCGCCTCATATTTTGCGGGGGTGAAGGCACCAGTTCAACGACTGGCGCACAGATTACGCTTTATGGTGTAAATAACACCGACTCAAAGCGAATAGTTTACAATGGTGCTGAGCATCTATTCCAAAGTGCTGATGTTAAGCCTTATAACGATAACGTCACTGCGCTTGGCGGACCTAGCAACCGTTTCACCACTGCATACCTCGGAAGTAACCCTATTGTTACTTCTAACGGGGAGAAGAAAACAGAGCCAGTAGTTTTTGATGATGCTTTCCTTGATGCTTGGGGTGACGTTCGCTACATCATGTACCAGTGGTTAGATGCTGTTCAACTGAAAGGCAATGATGCTCGTATTCACTTCGGGGTTATTGCTCAGCAAATTCGTGATGTATTCATTGCACATGGTCTGATGGACGAAAACAGTACGAATTGTCGTTATGCTGTTCTGTGCTATGACAAGTATCCACGGATGACCGATACGGTATTTTCGCACAATGAAATCATTGAACACATTGACGAGGAGGGTAATGTCACCACTACGGAAGAACCTGTATACACCGAGGTGGTTATTCACGAAGAAGGTGAGGAGTGGGGTGTTCGGCCTGACGGAATTTTCTTTGCTGAAGCCGCTTATCAGAGAAGAAAACTGGAAAGAATCGAAGCCAGACTTTCTGCTCTTGAACAGAAGTAA
Tertiary structure
PDB ID
f446540ff9394caf24a4157f8634162c49320179f4e2560ec6116e70273e445c
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50