Protein

View in Explore
Genbank accession
APU02601.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,74
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGQRPAASVLAEGELAINLKDKTIFTKDDSGSVIELGLKYGGTIDGSLTVNGNIIGNLTGNAATATKLKTARKINGISFDGSKDITLTPSDINVNSTTFIKNNGELPTDANLDTYGPIEEYLGVWSKSTSTNAQPANKFPEENAVGVLEVFVAGQFAGTQRYTVRSGNVYIRSLSAKWNGVDGPWGVWRNVQASTRPLSQTIDLDSLGELEHCGLWRNSSSAIASFDRHYPEEGSAAQGFLEIFEGGLYTRTQRYTTRMGMVYTRCLAAAWDASAPKWEEWKQVGHGTPATFYDGDLNDFKAPGLYNILGTDAVINCPTGEGLPAVIVGLLEVKQRASGGAIFQKFTTAGTGTTTRGRIFERAYTNSVWGAWNEVYTSYSLPITLGMGGVKSQLAELDWNTFDFVPGSMFSVPLNKIKNMPANMDWGTIDGNLILFSVGPSEHTSTGRTVQVWRGTVSQANYRYFVVRVAGNPGNRSFRVRRVVLEDGSHKWTAQQDFNGAVNFGGSTTFKSTTTFNTEVKFRSSNAFRMTASSNYDVIWRADSSRFYLLSTDENDKDGNFNANRPFSYELNTGDVTLGGTTRGSVLKLKRDSLTAFFGGDINMKGLLTFDAGRLGSRDYFKFNHWGDSNNARDNIIQLEDSQGAHFSTERTLATGAIKTRFFGETFTDGTLYLNQMNNSSEQFHINNWGNSEVGRSAVMEVGDSKGYHFYTERRTDNSLTFDVAGTFTVHGSSGITIKNSVGARHIWFKDDSDAEKAVIWATDEGILHIRNNHGGSFSHHFQGAMIKVGERVPYAGDQGLIRGEVSGGAYVNWRDRPAGLLLDCQQSVDSAHAIWKAVDWGRNYIAALDVHCPGDSNNTAAAVLHVQSADYQFNASGEFHATGNGNFNDVYIRSDRRLKENIEDYIGNATDLIGKLKVKTYDKVKSLSDREIIGHEIGIIAQDLQEILPEAINISKIGNLDKPDEVLTISNSAVNALLIKAIQEMSEEIKELKTPFFTKIARKIGKYFKF
Physico‐chemical
properties
protein length:1025 AA
molecular weight: 112696,35430 Da
isoelectric point:6,40930
aromaticity:0,10341
hydropathy:-0,38312

Domains

Domains [InterPro]
cd19958
117–203
cd19958 cd19958 cd19958 IPR030392
IPR030392
909–1011
IPR030392
APU02601.1
1 1025
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage YUEEL01
[NCBI] 		1932889 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
APU02601.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KY290975.3 [NCBI]
CDS location
range 147274 -> 150351
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGTCAACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATTAATTTAAAAGATAAAACAATTTTCACAAAAGATGACTCAGGCAGTGTTATAGAATTAGGTTTAAAATATGGAGGAACAATTGATGGTTCTTTAACTGTTAATGGAAATATAATTGGAAATTTAACAGGTAACGCTGCAACTGCAACGAAATTAAAAACAGCACGAAAAATTAATGGTATATCCTTTGATGGGTCAAAAGATATCACGCTAACTCCATCTGACATAAATGTCAATAGCACAACGTTTATAAAAAATAATGGCGAATTACCTACTGATGCTAATTTAGATACGTATGGGCCCATTGAAGAATATCTTGGTGTTTGGTCGAAATCTACTTCAACAAATGCGCAACCAGCAAATAAATTCCCAGAAGAAAATGCCGTAGGTGTACTAGAAGTATTTGTGGCCGGCCAATTTGCTGGCACTCAGCGTTATACTGTAAGATCTGGTAACGTCTATATTCGTTCCTTATCTGCTAAATGGAATGGCGTCGATGGTCCATGGGGTGTGTGGCGTAATGTTCAAGCGTCAACTCGTCCACTTTCACAAACGATTGACCTTGATAGCTTGGGAGAATTAGAACATTGTGGCTTATGGAGAAACAGTTCAAGCGCAATCGCATCATTTGATCGCCATTATCCAGAAGAAGGATCAGCCGCACAAGGATTTTTAGAAATATTTGAAGGTGGTTTATACACAAGAACGCAGCGTTATACTACCCGCATGGGTATGGTTTATACTCGTTGTCTCGCTGCTGCATGGGATGCTAGTGCACCTAAGTGGGAGGAATGGAAGCAGGTTGGTCATGGCACACCAGCGACTTTCTATGATGGAGATCTGAATGATTTTAAAGCTCCTGGGTTATATAACATTTTAGGCACTGATGCCGTTATTAACTGTCCTACCGGTGAAGGTTTACCAGCCGTTATTGTTGGTTTGCTAGAAGTTAAACAGCGTGCTTCTGGTGGTGCTATTTTCCAAAAATTTACTACTGCCGGAACAGGTACAACTACTCGCGGACGTATTTTTGAGCGTGCATATACTAATAGTGTTTGGGGTGCATGGAACGAAGTATACACATCTTATTCTCTGCCAATTACTTTGGGTATGGGTGGTGTTAAATCTCAATTAGCGGAGCTAGATTGGAACACATTTGATTTTGTTCCTGGCAGTATGTTTAGCGTTCCTTTGAACAAAATAAAGAACATGCCAGCAAATATGGATTGGGGTACGATTGACGGAAACTTGATTCTGTTTTCCGTCGGTCCTAGCGAACACACTAGCACAGGGCGTACTGTTCAGGTTTGGCGTGGTACTGTGTCACAAGCTAACTACCGTTATTTTGTCGTTCGTGTTGCTGGTAATCCGGGAAATAGAAGTTTCAGAGTTCGTCGTGTTGTTCTTGAAGATGGTAGCCACAAATGGACAGCTCAACAAGATTTTAATGGTGCTGTTAACTTTGGTGGTTCAACAACGTTTAAATCAACTACAACATTTAATACAGAAGTTAAATTCCGCTCATCTAATGCATTCCGTATGACCGCTAGTAGTAATTATGATGTTATTTGGCGTGCTGATAGTAGCAGGTTTTATCTACTTTCTACTGACGAGAATGATAAAGATGGAAACTTTAATGCAAATAGACCTTTCAGTTATGAATTGAACACTGGTGATGTTACTTTGGGTGGTACTACTCGTGGTAGCGTTTTAAAATTAAAACGTGATTCTCTCACCGCATTTTTTGGCGGTGATATTAACATGAAAGGCTTGCTGACTTTTGATGCCGGACGTTTAGGATCACGAGATTATTTTAAATTTAACCATTGGGGTGATAGTAATAATGCTCGTGATAACATCATCCAGTTAGAAGATAGTCAAGGCGCCCATTTTTCCACTGAACGTACTTTAGCGACAGGTGCAATTAAAACTCGTTTCTTTGGCGAAACATTTACTGATGGTACATTATACCTAAATCAGATGAATAATAGCTCTGAACAATTCCATATCAATAATTGGGGAAATTCAGAAGTTGGTCGCTCGGCAGTGATGGAAGTCGGTGATTCCAAAGGTTATCACTTCTATACAGAACGCAGGACAGATAACAGTTTGACGTTTGATGTTGCTGGCACTTTTACCGTGCATGGATCTAGCGGGATCACTATCAAAAACTCTGTTGGTGCTCGCCACATCTGGTTTAAAGATGATAGCGATGCAGAAAAGGCTGTTATCTGGGCTACAGATGAGGGTATTTTACATATTCGCAATAATCATGGGGGTTCATTTAGTCATCACTTCCAGGGCGCAATGATTAAAGTGGGAGAGCGTGTTCCTTATGCCGGAGATCAAGGGCTTATTCGCGGTGAAGTTTCTGGTGGTGCTTATGTGAATTGGAGAGATCGCCCTGCTGGTTTGTTGCTTGACTGTCAACAAAGCGTTGATAGTGCTCATGCTATTTGGAAAGCGGTTGATTGGGGGCGTAACTACATCGCTGCTCTGGACGTTCATTGTCCCGGTGATAGTAATAATACTGCGGCAGCGGTTCTCCATGTTCAGTCTGCTGATTATCAATTCAATGCAAGTGGAGAATTTCATGCCACTGGTAACGGAAACTTTAACGATGTTTATATTCGATCAGACCGTCGCCTCAAAGAAAACATCGAAGATTATATAGGAAATGCAACTGATTTAATCGGTAAACTGAAAGTTAAAACCTACGATAAAGTTAAATCATTATCCGACCGTGAAATTATCGGTCATGAGATCGGCATTATCGCGCAGGATTTACAAGAAATATTACCAGAAGCGATTAATATTTCGAAAATTGGCAATCTTGATAAACCAGACGAAGTTCTGACAATTTCTAACTCCGCTGTGAATGCTCTTTTAATTAAGGCCATTCAGGAAATGAGTGAAGAAATTAAAGAATTAAAAACGCCTTTCTTCACTAAAATTGCTCGCAAAATTGGTAAATACTTTAAATTCTAA

Tertiary structure

PDB ID
1ebc88be7eae03ad7c1e5ecf74277bb5cdf2c8bb87c009821fa27937820f1417
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6136
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The complete genome sequence of Enterobacteria phage YUEEL01 Raman,G., Sivasankaran,A., Park,S. and Ahn,Y.-H. 2021-07-26 — GenBank