Protein

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Genbank accession
AIX31036.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,99
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANQNFRVKKGIEVGLGATFLYADDSGVGINSASPRSNLDVRGRSQTEELLVDNYAEVQGPSTFVGLGTFGGDLYVGNDLYVKGNLSFTSFESETGNVTGVLTTRDFNVTGLSTFAGDATFQSDVNISGASSITGNLVVSGASTLTGIVTTGDDLYVGGSLYVFNDIFYDEITGRNLSISGIATLRQLEIQQDLEVAGLSTFVGLVSFRDAVGTNLTVYNLSANTGNFVEINVDGGGGGGGGTGIDSTSVNTEFLNVTGVATFNNGIATNFSAEFIDAGVTTTTDLHFTNGYGVNLNMSGITTVGILTVYENIYDSRNQVGYGDSLLVTQGGKLVWTRPDIAGIATSFQPGSTFYVSENGSNTNDGRSPEKAWSSIAYAVSQIGDTSHDILEVTAGEYTETFPITVPKGLTISGAGQRATIVRPSQATETNDGFLLNDRSTIHNITVTGFYKPQGSINYAFKFSVGAAITSRSPYVDKVTVINKGTQTSASDPYGYGSADSYPTTAPGGAGVLVDGSVVATNSLEAAILLNEVTLFTAGNQGIKITNGGRVEWLNGFIYFASEALVGLSDKTTGLAGAGKARLTLENASGGLVGGNTVQYYDSDGTTVLASGTIDNVSGSYVTLTNAGVGTFTTPRNRTAKKVDFVNGAQLSTAQARFGTSSLDVTGAGTDNITVDSTSDFGFGTGDFTVEFWIYRTGNINGKVICDFRDTAATDQAITIQGDGGNETDVYIGTTSVVTGTVPTTLNAWNHIAVCRVGSTITQYIDGAVSGSGTAATDLGVARQLTFGDRYDNSNNGPTAYLDELRVTKGAAKYTGAFTSPSVALTGDKDTSILLHFDGINGATSTTDDIIVLQDIRITGGNTADKVTLADYSQFGADLRSIACAIEYGNQGMIGDGDGVTLRAISINFNHVGALGDITNDPNLAIQSNEVIELNGGQVSYVSIDQKGDFRVGEAFYVNQETGEVSFTDTVTDLTALSSLTITDGTNSSIITPTSGRFGNVLISGQSVESVTGDLNIKTGGSGEINIFGNTNVIGILTAQIIEINAIQKGDTAIALDDTGTDGTIRFITDGQEAQRITNQQRVGINTTTPVTQLEVKGGTQLENLNVTGIATLNGVGIATIGGDPDFRNLNITGLSTFAGVGTFLSDLYVGGNLSVLGDIKFDEVDARNANITGIATVGFASITDARVGSALTNLGHTQLNTLNVSGVSTLSLLEVSGNSVFTGISTFNNNVTINGDLTINGSQNVDSFGTGDLIVSGIASINQAKIATGIVTTLTATRTESAELKVTGLSTFVGVATFANDVFVAGNLNVLGDIAYDEVTGRNLNITGISTLGTVKISNGIVTATSGVVTYYGDGSNLTGIDITDSDVRLRNLSVTGVSTFTGDVSFGANASLVGDLTSGRNANLSGIATVNDIYIDNLLYDSNNNVGAAGSILVTAGGKLQWLPPDQAGIATVFQPGNTFFVSKNGDDSSDGLSMEKSFATISYALSQISSGTNNVLLITAGDYEEVFPLSVPDGLTVKGVGQRAVLVRPTSATETNDGFQLGNASTVEDLTIGQMFKPQGASNNNYAFTYRSGATISSRGPYVSRVTVLNKGSVTSTSDPFGYGSADAYPTTAPGGAGVLADGSVLNSASLEASFLLNEVTTFTAGNIGIDMVNGARVEWLNGFSYFASEGVKGRADQSTGLYGAGKTRLRVENASGGLVNGNTIELYDIDGTTSLASGTIDGTSGAYTTLTTGGTGTFDIAGSRKAKAASFVDTASLSTTQAKFGNASLDVTGQSTDCINVDPSSDFGFGTGDFTAEFWLYRTSATAGATILDMRDAADTDSALSIRENTSDVIEVLVGNSVVLTSSTSAIGNAAWYHIAVARLGSTMELFINGAQEASASNSSDLGLSQSLTFGADYANANGTIAFLDELRIEKGAAKYTNPFTPSTVPLEGDRGTAILLHFDGSNGATEAPDDIQIFXDIRISGGNTADRLSLADYSQFGAELRSSGCARISVSVVVTQLIDYHLLTTVSLVLSCVPLVVLLSMVTKVSSETVLVLL
Physico‐chemical
properties
protein length:2043 AA
molecular weight: 211389,54990 Da
isoelectric point:4,29580
aromaticity:0,07591
hydropathy:0,03648

Domains

Domains [InterPro]
IPR011050
347–639
IPR011050 PF13385 G3DSA:2.60.120.200
IPR013320
632–811
IPR013320 IPR013320
G3DSA:2.60.120.200
634–811
G3DSA:2.60.120.200 PF13385
AIX31036.1
1 2043
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI] 		1493511 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX31036.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019098 [NCBI]
CDS location
range 201858 -> 207989
strand +
CDS
GTGGCGAATCAGAATTTTCGTGTCAAAAAAGGTATAGAAGTTGGCTTAGGTGCCACTTTTCTATACGCAGACGACAGTGGAGTTGGCATTAATAGTGCTAGCCCACGATCAAACCTAGACGTTCGAGGTAGATCCCAAACAGAGGAACTACTGGTAGACAACTATGCAGAGGTGCAAGGACCCTCTACATTCGTTGGACTAGGTACCTTTGGGGGTGATCTATATGTTGGGAATGATCTATATGTAAAGGGCAACCTATCATTCACCAGTTTTGAATCTGAGACTGGTAATGTAACAGGTGTTCTTACCACAAGAGACTTTAATGTAACCGGATTATCTACGTTTGCGGGAGACGCCACCTTCCAAAGTGACGTAAATATCTCTGGTGCTTCTTCAATTACTGGAAACTTAGTAGTTTCTGGTGCCTCTACGCTCACAGGTATCGTCACAACTGGCGATGACCTCTATGTGGGTGGTAGTTTATATGTATTCAATGATATCTTCTATGATGAGATTACTGGTAGAAACCTCAGTATCTCTGGTATTGCCACACTCAGACAGTTAGAAATCCAACAGGACCTAGAAGTTGCAGGTCTCTCCACATTTGTTGGTTTAGTATCGTTCAGAGATGCAGTAGGTACAAACCTAACAGTTTATAATCTTTCCGCCAATACTGGTAACTTCGTAGAGATTAACGTCGATGGTGGAGGAGGCGGCGGTGGCGGTACTGGTATCGATAGTACCTCCGTCAATACCGAGTTCTTAAACGTCACTGGTGTTGCAACATTTAACAATGGTATTGCCACCAACTTCAGTGCAGAGTTTATTGACGCTGGTGTAACCACAACTACCGACCTCCACTTCACTAATGGTTACGGTGTCAATCTCAATATGAGTGGCATCACAACTGTTGGTATTCTAACAGTCTATGAGAATATCTATGACTCTAGAAACCAAGTTGGTTATGGTGACTCACTACTAGTCACACAGGGTGGGAAACTAGTATGGACTAGACCTGATATTGCAGGTATTGCCACTTCATTCCAACCAGGTTCTACCTTCTATGTAAGTGAGAATGGTAGTAATACCAATGATGGTAGAAGTCCAGAGAAAGCATGGAGTTCTATTGCATATGCCGTATCACAGATTGGAGATACTTCTCACGATATTCTAGAGGTTACTGCTGGTGAATACACAGAAACCTTCCCTATCACAGTCCCTAAAGGTTTAACCATTTCTGGTGCTGGACAAAGGGCAACCATTGTCAGACCGTCACAGGCAACCGAAACCAATGATGGTTTCCTACTAAACGATAGATCCACTATCCATAACATCACAGTTACTGGATTCTACAAACCACAAGGTTCTATCAACTACGCCTTCAAGTTTAGTGTTGGAGCAGCAATCACCAGTAGAAGTCCTTATGTTGATAAGGTCACGGTCATCAACAAAGGTACTCAGACAAGTGCCAGTGACCCATATGGTTATGGTTCAGCTGACTCCTACCCAACCACAGCACCTGGTGGTGCTGGTGTTTTAGTTGATGGTAGTGTAGTTGCAACCAACTCACTAGAAGCAGCAATTCTCCTCAATGAGGTTACACTATTCACTGCTGGCAACCAAGGTATTAAGATTACCAATGGTGGTAGAGTAGAGTGGTTGAATGGTTTCATCTACTTCGCTTCTGAAGCACTTGTAGGTCTTAGTGATAAGACTACTGGTTTAGCGGGTGCTGGTAAGGCAAGACTAACCCTAGAGAACGCCTCTGGTGGATTGGTTGGTGGTAATACCGTTCAATACTATGATAGTGATGGAACCACAGTTCTTGCTTCTGGTACCATTGATAATGTATCTGGTAGTTATGTAACACTAACCAACGCTGGTGTTGGTACATTCACAACTCCTAGAAATAGAACAGCCAAGAAGGTTGACTTTGTTAATGGAGCACAACTATCCACAGCACAGGCAAGGTTCGGTACATCCTCACTAGATGTAACTGGTGCCGGAACTGATAACATCACAGTTGATTCCACTTCAGACTTTGGGTTTGGAACTGGAGACTTCACCGTTGAATTCTGGATATACAGAACTGGTAATATTAATGGTAAGGTAATCTGTGACTTCAGAGATACCGCCGCTACAGATCAAGCAATTACTATCCAAGGTGATGGTGGTAATGAGACTGATGTTTATATTGGTACTACATCCGTTGTCACTGGTACAGTTCCTACCACACTGAATGCTTGGAACCATATCGCTGTTTGTAGAGTTGGTTCTACCATCACTCAGTATATTGATGGTGCTGTTTCTGGTAGTGGAACTGCTGCTACTGATCTAGGTGTTGCTAGACAACTAACCTTTGGTGATAGGTACGACAATAGTAACAACGGTCCTACAGCATACCTAGATGAACTTCGTGTCACTAAGGGAGCAGCAAAATACACAGGAGCATTCACTTCACCTTCAGTAGCACTCACAGGTGATAAGGATACTTCTATCCTACTACACTTTGATGGTATCAATGGAGCAACCTCCACTACAGATGATATCATTGTCCTCCAGGATATCCGTATCACTGGTGGTAACACAGCAGATAAAGTTACCCTAGCAGACTACAGTCAGTTTGGTGCTGACCTCAGGTCTATCGCTTGTGCCATTGAATATGGTAACCAGGGTATGATTGGTGATGGTGATGGAGTAACTCTCCGTGCTATCTCTATCAACTTCAACCATGTAGGTGCTCTTGGTGATATCACTAACGATCCTAACCTAGCGATTCAATCGAACGAGGTTATCGAACTCAATGGTGGTCAAGTATCCTATGTAAGTATTGACCAGAAGGGTGACTTCAGAGTTGGTGAAGCATTCTATGTGAATCAGGAGACTGGTGAAGTATCCTTTACAGATACTGTAACAGACCTAACTGCTTTATCCTCACTCACTATTACTGATGGTACTAATAGTAGTATCATTACTCCTACTTCTGGTAGGTTTGGTAATGTTCTTATCAGTGGTCAGAGTGTAGAGAGTGTAACCGGAGACCTTAACATTAAGACTGGTGGTTCCGGTGAGATCAATATCTTTGGTAACACCAATGTTATTGGTATTCTAACCGCTCAGATCATTGAGATTAATGCTATTCAGAAGGGCGATACAGCAATCGCTCTAGATGATACTGGAACTGATGGGACTATCCGTTTCATCACAGACGGACAAGAAGCACAACGCATTACAAACCAACAGAGAGTTGGTATTAACACCACCACCCCAGTTACTCAGTTAGAAGTTAAGGGTGGAACACAACTAGAGAACTTAAATGTAACTGGTATTGCCACACTTAATGGTGTTGGTATTGCTACTATCGGTGGTGATCCTGACTTCAGGAACTTAAATATCACTGGACTATCAACGTTCGCTGGTGTTGGTACTTTCCTCAGTGACTTGTATGTTGGTGGTAACCTCAGTGTCCTAGGTGATATCAAGTTTGATGAAGTTGATGCGAGAAACGCCAACATCACTGGTATTGCCACAGTTGGTTTCGCCTCTATCACAGATGCCAGAGTTGGAAGTGCCCTCACTAACTTGGGTCACACTCAACTCAATACTCTGAATGTAAGTGGAGTATCTACACTATCACTACTAGAAGTCAGTGGTAACTCAGTATTTACTGGTATCTCTACCTTCAATAACAATGTAACTATCAATGGTGACCTCACCATTAATGGTTCTCAGAATGTAGATAGTTTTGGAACTGGTGATTTAATAGTTAGTGGTATTGCTAGTATCAACCAGGCGAAGATCGCCACTGGTATTGTTACCACACTAACTGCCACTAGAACAGAGTCAGCAGAACTAAAAGTAACTGGTCTCTCCACCTTTGTTGGTGTTGCTACCTTTGCTAACGATGTATTCGTGGCAGGTAACCTCAATGTTCTAGGAGATATTGCATATGATGAAGTTACTGGTAGAAACCTAAACATCACTGGTATTTCCACACTCGGAACAGTTAAGATTTCAAATGGCATTGTAACCGCCACTAGTGGCGTTGTTACATATTACGGTGATGGTAGCAATCTAACCGGCATTGACATCACAGATAGTGATGTAAGACTCAGAAACCTTTCGGTTACTGGTGTCTCTACATTCACAGGTGATGTATCTTTTGGAGCAAACGCTTCTCTAGTAGGCGACCTAACTTCTGGTCGTAACGCAAACCTTTCAGGTATTGCGACAGTAAATGATATCTATATTGATAACTTACTTTATGATTCCAACAATAATGTTGGAGCAGCTGGTTCAATTCTTGTAACCGCAGGTGGAAAGTTACAGTGGCTACCGCCCGATCAAGCGGGTATTGCTACAGTATTCCAACCAGGAAATACATTCTTTGTTTCTAAGAATGGTGATGATAGTAGTGATGGTCTCTCCATGGAGAAATCATTTGCTACCATTTCCTACGCTCTGTCTCAGATTTCATCAGGGACAAACAACGTTCTCTTAATCACCGCTGGTGATTATGAAGAAGTATTCCCACTATCAGTTCCCGATGGACTGACTGTTAAGGGTGTTGGACAACGTGCGGTTCTAGTTAGACCCACTTCAGCTACAGAAACCAACGATGGTTTCCAACTTGGTAACGCATCCACAGTTGAAGATTTGACCATTGGTCAGATGTTTAAACCTCAAGGTGCTTCCAATAATAACTACGCTTTCACATATAGAAGTGGTGCTACCATTTCATCTCGTGGACCTTATGTTTCTAGAGTTACGGTTCTAAACAAAGGTAGCGTAACTTCTACCTCTGACCCATTTGGATATGGTTCAGCTGATGCTTATCCAACGACTGCCCCTGGTGGTGCTGGTGTATTGGCTGATGGTAGTGTTCTTAACTCCGCCTCACTAGAAGCCTCATTCCTACTTAACGAAGTCACCACCTTCACTGCCGGTAACATCGGTATTGATATGGTCAACGGTGCTCGTGTTGAGTGGTTGAATGGTTTCTCCTACTTCGCATCCGAGGGTGTTAAAGGTAGAGCTGACCAGTCAACTGGTTTGTATGGTGCAGGTAAGACGAGACTAAGAGTTGAGAACGCCTCTGGTGGTCTAGTCAATGGTAATACCATTGAACTCTATGATATTGATGGCACGACTAGCCTTGCTAGTGGTACTATTGACGGCACCAGTGGTGCATACACGACCCTGACTACTGGTGGTACTGGTACCTTCGATATTGCAGGAAGTCGTAAGGCGAAAGCTGCCTCATTCGTTGATACAGCCTCTCTATCTACAACACAAGCCAAATTCGGGAATGCTTCACTAGATGTAACTGGTCAGTCTACTGATTGTATCAATGTTGATCCAAGCAGTGACTTCGGTTTCGGTACTGGTGACTTTACAGCTGAATTCTGGTTGTATAGAACATCAGCTACTGCTGGTGCTACTATTCTCGATATGAGAGATGCAGCTGATACTGATTCAGCTCTATCTATTAGAGAGAACACTAGTGATGTTATTGAAGTTCTTGTCGGCAACTCTGTTGTTCTAACTTCATCCACAAGTGCTATTGGTAATGCCGCTTGGTATCACATTGCTGTTGCCCGTTTGGGTAGCACAATGGAACTATTCATTAATGGTGCCCAGGAAGCTTCAGCATCCAATTCATCTGACTTAGGTCTAAGCCAGTCACTCACCTTTGGTGCTGACTATGCTAACGCCAATGGTACTATTGCGTTCTTAGATGAACTCCGTATCGAGAAGGGTGCTGCTAAGTACACGAATCCGTTTACTCCTTCCACTGTACCCCTTGAGGGTGACCGTGGTACAGCTATCCTACTCCACTTTGATGGATCAAATGGAGCAACTGAAGCTCCTGATGATATTCAGATATTCYAGGATATCCGTATCAGTGGTGGTAACACAGCTGATAGACTATCACTTGCTGACTACAGTCAGTTTGGTGCTGAGTTGCGTTCCTCTGGTTGTGCTAGGATATCCGTATCAGTGGTGGTAACACAGCTGATAGACTATCACTTGCTGACTACAGTCAGTTTGGTGCTGAGTTGCGTTCCTCTGGTTGTGCTGTTGAGTATGGTAACAAAGGTGTCGTCGGAGACGGTGCTGGTGTTGCTCTAA

Tertiary structure

PDB ID
d81beedcad7e2bfe24d3455a40414d477180952a1fbe1239d6a8270669231340
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6805
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank