Protein

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Genbank accession
QBQ77268.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,84
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRVLFTKDDQGNIIDLGFAKGGSIDGNVIHTGNYNQTGDYTLNGTFTQTGNFNLTGIARVTRDIIAAGQITTEGGELITKSSGTAHVRFHDSADRERGIIYSPANDGLTTQVVNIRVKDYAAGDESTYAFSGSGLFTSPEVSAWKSMSTPQILTNRVITNNKSTSDYDIYSMADNVPLSESTTAINHLRVMRNAVGAGVFHEVKDNDGITWYTGDGLDTYLWSFTWSGGLKAGHSISVGTPGGNKGYSELGTASISLGDNDTGFKWHQDGYFHTVNNGTRTFIYGPAETQSLRKMVMGYSPDGVLMTTPPTENYALATVVTYHDNNAYGDGQTLLGYYQGGNYHHYFRGKGTTNINTAGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGRNNSSTLMFRGNTTGYSSVDNMDIKVWGNTFVDPSGGIRKNIMEISDATSWMSYIQRLTTGEVEMNVNGSFESSGVTAGDRGVHTTGEISSGAVNALRIWNADYGAIFRRSEGSLHIIPTAYGEGKDGDIGPLRPFSMALDTGKVTIPDLQSSYNTFAANGYIKFVGHGAGAGGYDIQYAQAAPIFQEIDDDAVSKYYPIVKQKFLNGKAVWSLGTEISSGTFVIHHLKEDGSQGHTSRFNQDGTVNFPDNVSVGGGEATIARNGNIWSDIWKTFTSAGDVTNIRDAIATRVAKEGDTMTGRLTLSAGNDALVLTAGTGASSHIRSDVGGTNNWFIGKGGGDNSISFYSYITQGGVNITNNGEIALSPQGQGTFNFNRDRLHINGTQWTAHQAGDWGNQWRQEAPVFVDFGNVGNDSYYPIIKGKSGITNEGYISGVDFGMRRIPNNWAQGIIRVGNQENGSDPQAIFEFHHNGNMYVPDMVKAGVRISAGGGDPAWTGACVVIGDNDTGLVHGGDGRINMVANGIHIANWGAGYQSHPGLWDSTGAFWTEVGRAIVSHGHLVQANDSYSTFVRDVYVRSDIRVKKDLVKFENASEKLSKINGYTYMQKRGLDEEGNQKWEPNAGLIAQEVQAILPELVEGDQDSEALLRLNYNGVIGLNTAAINEHTAEIAELKSEIEELKALVKSLLK
Physico‐chemical
properties
protein length:1103 AA
molecular weight: 118682,78510 Da
isoelectric point:5,46441
aromaticity:0,09248
hydropathy:-0,36419

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:6.20.80.10
722–777
G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR030392
993–1052
IPR030392 Coil
QBQ77268.1
1 1103
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_WFK
[NCBI] 		2508198 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBQ77268.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK373775.1 [NCBI]
CDS location
range 152123 -> 155434
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGAGCACGTCCTGCCGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGACCGTGTACTTTTTACTAAAGATGACCAAGGAAATATTATTGATCTGGGTTTTGCTAAAGGTGGTAGTATTGACGGGAATGTTATTCATACTGGCAATTATAACCAAACTGGCGATTATACTTTAAATGGCACCTTCACTCAGACAGGTAATTTTAATTTAACCGGTATTGCTCGAGTAACACGTGATATTATTGCCGCTGGGCAGATTACGACTGAAGGCGGAGAACTTATTACAAAAAGTTCAGGTACAGCACATGTTCGTTTTCATGATTCGGCTGATCGTGAACGTGGCATTATTTATTCACCGGCTAATGATGGATTAACTACGCAAGTAGTTAATATCCGCGTTAAAGACTACGCCGCTGGTGATGAAAGCACCTATGCATTTTCGGGCAGTGGACTATTTACTTCACCTGAAGTATCAGCATGGAAATCTATGTCAACTCCTCAGATTTTGACAAATAGAGTTATTACTAATAATAAATCTACGAGCGATTATGACATTTATTCTATGGCAGACAACGTTCCATTGTCTGAAAGCACTACTGCTATTAATCATCTCCGTGTTATGCGCAATGCTGTAGGCGCTGGTGTATTCCATGAAGTTAAAGATAATGATGGAATAACTTGGTATACTGGAGATGGCTTAGACACTTATCTTTGGTCGTTTACCTGGTCCGGTGGATTGAAAGCAGGCCATTCTATTTCTGTTGGTACTCCTGGTGGCAATAAAGGATACTCTGAATTAGGGACTGCTTCAATTTCTCTTGGTGATAATGATACTGGATTTAAATGGCATCAGGATGGATATTTCCATACAGTAAACAACGGAACAAGAACTTTCATTTACGGTCCTGCGGAAACACAAAGCCTTAGAAAAATGGTTATGGGTTATTCTCCGGATGGTGTTCTTATGACAACGCCACCGACAGAAAACTATGCTTTGGCTACTGTTGTTACTTACCATGATAATAATGCATACGGCGATGGTCAAACACTTTTAGGATATTATCAAGGTGGTAATTACCACCACTATTTCCGTGGTAAAGGCACTACAAATATTAACACTGCAGGCGGATTGTTAGTTACTCCAGGCAATATTGACGTTATTGGTGGTTCTGTTAATATCGATGGTAGAAATAATTCTTCTACGCTGATGTTTAGAGGTAACACAACAGGATACAGCTCAGTTGATAATATGGATATTAAAGTTTGGGGTAATACGTTTGTTGATCCAAGCGGAGGTATCCGTAAAAACATTATGGAAATTTCTGATGCAACTAGCTGGATGAGCTATATTCAAAGACTTACTACTGGCGAAGTAGAAATGAACGTTAATGGTTCATTTGAATCATCTGGTGTTACTGCTGGAGATAGAGGAGTTCACACAACAGGTGAAATTTCATCTGGAGCAGTGAATGCTCTTCGTATTTGGAACGCAGATTATGGAGCCATTTTTAGACGTTCAGAAGGAAGTCTTCATATTATTCCAACTGCTTATGGCGAAGGCAAAGATGGCGATATTGGTCCACTTCGCCCGTTTAGTATGGCTTTAGATACCGGTAAAGTTACTATTCCAGATTTACAATCAAGTTACAATACGTTTGCTGCTAACGGTTATATTAAATTTGTTGGTCATGGAGCGGGTGCCGGCGGTTATGACATTCAATATGCTCAAGCGGCTCCTATTTTCCAGGAAATTGATGATGATGCTGTAAGCAAATATTATCCTATTGTTAAACAGAAGTTTTTAAATGGTAAAGCTGTTTGGTCTTTAGGTACTGAAATTAGTTCAGGTACATTCGTTATTCATCATCTGAAAGAAGATGGTTCACAAGGCCATACGTCTCGTTTTAATCAAGACGGTACTGTTAACTTCCCAGATAACGTTTCTGTCGGCGGCGGTGAAGCTACTATTGCTCGCAATGGTAATATCTGGTCTGATATCTGGAAAACGTTTACTTCAGCAGGCGACGTAACTAATATTCGCGATGCAATAGCTACTCGTGTTGCTAAAGAAGGTGATACGATGACCGGTAGGTTGACTTTATCTGCTGGAAATGATGCCCTTGTTTTAACTGCAGGCACGGGCGCTTCATCGCACATCCGTAGTGATGTAGGTGGTACAAATAATTGGTTTATAGGCAAAGGCGGCGGTGACAATAGTATAAGTTTTTACAGTTACATTACACAAGGCGGTGTAAACATAACAAATAACGGCGAAATAGCGCTTTCTCCTCAAGGACAAGGAACATTTAATTTTAATAGAGACCGCCTTCATATAAACGGTACACAATGGACCGCACACCAGGCTGGCGATTGGGGAAATCAATGGCGCCAGGAAGCTCCTGTATTTGTGGATTTTGGTAATGTCGGTAATGATAGTTATTATCCTATTATTAAAGGAAAATCTGGTATTACTAATGAAGGGTATATATCTGGTGTAGATTTTGGTATGCGACGCATTCCTAATAACTGGGCACAAGGTATTATTCGTGTAGGTAATCAGGAAAACGGTTCCGACCCACAAGCTATCTTCGAATTCCACCATAATGGAAACATGTACGTTCCTGACATGGTTAAAGCTGGAGTAAGAATATCAGCTGGTGGAGGTGACCCTGCATGGACAGGCGCATGTGTTGTTATTGGTGATAATGACACCGGATTAGTTCATGGTGGTGACGGCCGAATCAATATGGTTGCCAATGGTATACATATTGCAAACTGGGGAGCAGGCTATCAATCTCATCCTGGGCTTTGGGATTCAACCGGTGCTTTTTGGACAGAAGTTGGAAGAGCTATCGTTTCTCATGGGCATCTCGTTCAGGCAAATGATAGTTATTCAACGTTTGTCCGTGATGTTTATGTCCGTTCTGATATTCGTGTTAAAAAAGACCTTGTTAAATTTGAAAATGCTTCTGAGAAGCTTTCAAAAATTAATGGTTACACTTATATGCAGAAGCGAGGCCTAGATGAAGAAGGTAATCAAAAATGGGAACCTAATGCCGGTTTAATTGCCCAAGAAGTTCAAGCTATTTTACCTGAATTAGTTGAAGGCGATCAGGATAGTGAAGCTTTACTTCGTTTGAACTATAACGGTGTAATTGGTTTAAATACAGCTGCAATCAATGAGCATACTGCAGAAATTGCAGAACTTAAATCAGAAATTGAAGAACTTAAAGCATTAGTTAAATCATTGTTAAAATAA

Tertiary structure

PDB ID
27625576f6a9a8e547f18b9a96da6653bbe33fcc4e30c6609ac732d6fd8ae7c5
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5320
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Still something new to discover - new insights into E. coli phage diversity and taxonomy Korf,I.H.E., Adriaennsens,E., Dreiseikelmann,B., Kropinski,A., Nimtz,M., Meier-Kolthoff,J.P., Rohde,M., van Raaij,M. and Wittmann,J. 2019-05-17 — GenBank