Protein

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Genbank accession
AIZ02898.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYSVLSDGVNVDFFIEENTVQQYDATRGYKKNFAVINDNRIWVAQRDIDAPAGAFTPQYWLATRTDPKWETVASPTRQLNSGEFIAVDSAASFTTFTLPTNPVDGDTIVIKDIGGNVGYNEIKVQSSNVPGGGNQKIVRFGNQYSEVLITKPFSYNMLIFSNRLWQFWEAGNEERGIRVEPSTGRFHAQAGDFIMRRYTTGAPITFILPKYANQGDIVKSVDIDGLGPTFHLMVETFDSSSSLGKAGQHQMEFRTTGDGFFVYNAAEKLWYVWDGDFKTRLRVIRDNVKLLPNESVIVFGEDNSTPATINIDLPTDVLQGDIVKIALNYLRKSQTVNIRAAAGDKIASDIKLLQFPKRSEYPPDSTWVLVDSLTFNGNISYTPVIELSYAEDKLSGTSYWVVAQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALANQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVAKENQRGIARIATTAQVNQNSDFAFVDDVIISPKKLNERTATETRRGLAELATQQETDAGVDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYVPTTGATPATSRELNGTNVYNKNTTNLVISPKALDQYKATYTQQGAVILAVESEVIAGTSQSGWPNAVVTPEMLHRKTALDSRIGLIEIATQTETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKASETLTGIAEIATQSEFDTGTDDTRISTPLKVKTRFNNTARTSVNALSGLVETGTLWDHYNLNILEANETQRGTARLATQGEVNTGTDDKTIVTPLKLMSKKATENAEGIVRIATNAEATAGTSKVLAISPSALKYIAQTETTWEASETLRGFVRLSSGTATSAATTTTGAGFTYENGVYTPDPSKLVNYVKSGYAVSPYELNRVLQNFLPINAMAVNAEKLDSLDSTQFIRRDIAQTVEGVLTLTKQTNLSAPVVSTSTAVFTDVTAGTSTFGTVNVVNGTNKWKITAPSTGTTMTIGDTTNVLTLNTASGNVAVLNNLSAGNDVQAKNNYVLNGRTIATTTGEASGATLALGDNSQNLVLKTLDAGNIIANGGGAFKVLTEKNAVEIVDRNFVNQAGDTMSGMLRVNAPVRVFGTKPSLIAQAPTAETVGFWSVDINDEPTYSQFPGYWTMILKRQINIDTVQTKPAGMSDEVWNSSGWLTENGKNGKLPGGQELGPDGQPITPQPPVVPIHYRKPDGTLGDPVSTPEAPIRGTWFDYSVRDKQIKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKSAWTTFAMVYTADNPPSAEDVGALPADNTTMGNLTILDWLRIGNVRIIPDPTTKSVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1337 AA
molecular weight: 145177,68290 Da
isoelectric point:5,23376
aromaticity:0,07779
hydropathy:-0,31526

Domains

Domains [InterPro]
IPR048391
1112–1172
IPR048391 IPR048391
AIZ02898.1
1 1337
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_VR26
[NCBI] 		1567029 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIZ02898.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KP007362 [NCBI]
CDS location
range 151325 -> 155338
strand +
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCAGCATTCAGAGCAACATCCGGTCTCGATGCTGCTGGTGAGAAAGTCATTAATGTCGCGAAAGCTGATTACTCAGTTTTGTCAGACGGCGTTAACGTAGATTTCTTTATAGAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATGCAACGCGTGGATACAAAAAGAACTTCGCAGTTATTAATGATAACCGTATTTGGGTTGCTCAACGTGATATTGATGCTCCTGCTGGAGCATTTACCCCTCAGTATTGGTTAGCAACTCGTACTGACCCTAAATGGGAAACTGTTGCATCTCCGACTCGTCAGCTTAATTCGGGTGAATTTATCGCAGTTGACTCTGCTGCAAGCTTTACCACATTTACATTGCCTACAAACCCGGTCGATGGCGATACCATCGTTATTAAAGATATCGGCGGCAATGTTGGTTACAACGAAATTAAAGTGCAGTCAAGCAACGTACCAGGCGGCGGTAACCAAAAGATTGTTCGTTTTGGTAATCAGTATTCAGAAGTTTTAATTACCAAACCGTTCTCTTATAATATGCTTATCTTCTCGAATCGCTTATGGCAATTCTGGGAAGCTGGCAACGAAGAACGTGGCATCAGAGTAGAACCATCAACTGGTCGTTTCCATGCGCAAGCCGGCGACTTTATTATGCGTCGTTATACAACCGGTGCACCGATTACTTTCATTCTTCCTAAGTATGCGAACCAGGGCGATATTGTCAAATCTGTTGATATCGATGGCCTGGGGCCAACATTCCACCTGATGGTTGAAACCTTTGACTCCAGTTCCAGTCTTGGTAAAGCTGGACAGCATCAAATGGAATTCCGCACCACGGGCGATGGCTTCTTTGTTTATAATGCCGCCGAAAAACTCTGGTATGTTTGGGACGGTGATTTTAAAACTCGTCTTCGCGTTATTCGCGATAACGTTAAACTTTTACCGAACGAAAGTGTCATTGTATTTGGTGAAGATAACTCAACTCCAGCGACGATTAATATCGATTTGCCAACGGATGTTTTGCAAGGTGACATTGTTAAAATTGCACTGAACTATCTCCGCAAATCACAGACTGTTAATATAAGAGCTGCTGCTGGTGATAAGATTGCATCTGACATTAAATTGTTGCAATTTCCTAAACGCTCCGAGTATCCACCAGATTCAACTTGGGTATTGGTTGATTCATTGACCTTTAATGGTAACATCAGTTATACTCCAGTTATTGAATTGTCTTATGCCGAAGATAAATTGTCTGGAACAAGTTATTGGGTTGTTGCTCAAAACGTTCCGACTGTTGAGCGAGTTGACTCATTAAATGATTCCACGCGTGCTCGTCTTGGTGTTATTGCTCTGGCAAACCAGACTCAGGCAAACGTTGACCATGAAAATAACCCAGAAAAAGAACTCGCAATTACTCCTCAGACTTTGGCTAACCGTGTTGCTAAAGAGAACCAACGAGGCATTGCCAGAATCGCAACGACTGCCCAAGTAAATCAGAACAGTGATTTTGCATTTGTTGATGATGTAATTATTTCTCCGAAAAAACTCAATGAACGTACGGCAACAGAAACGAGACGTGGGCTCGCAGAACTCGCCACACAGCAAGAAACTGATGCAGGTGTAGATGATACCACAATTATCACTCCAAAGAAACTGCAAGCGCGTCAGGGCTCAGAATCGCTGTCCGGTATCGTGACTTACGTCCCGACCACTGGTGCAACTCCAGCTACTTCGCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAATACCACTAATCTGGTAATTTCTCCGAAAGCTCTTGACCAATACAAAGCTACTTACACTCAGCAAGGCGCAGTTATTCTGGCCGTTGAAAGTGAAGTAATTGCAGGTACATCGCAATCTGGCTGGCCAAACGCTGTTGTTACTCCGGAGATGTTGCATCGTAAAACAGCTCTTGATTCCCGTATCGGTTTAATCGAAATTGCTACTCAGACAGAAACAAATGCAGGAACCGATTATACCAGAGCCGTGACTCCTAAAACGTTAAATGACCGTAAAGCATCAGAAACGTTAACCGGCATAGCCGAGATTGCTACGCAATCAGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCAACTCCATTAAAAGTTAAAACTAGATTTAATAATACTGCTCGTACTTCTGTTAATGCATTAAGTGGTTTAGTAGAAACAGGGACGCTCTGGGACCATTATAACCTGAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACGGCAAGATTAGCAACTCAGGGTGAAGTTAATACCGGTACTGACGATAAAACAATCGTTACTCCGCTTAAATTGATGTCGAAAAAAGCCACTGAAAATGCCGAAGGTATTGTTCGCATTGCGACAAACGCAGAAGCGACTGCCGGTACATCGAAAGTTCTGGCCATCAGTCCGTCTGCGCTGAAATATATTGCACAAACGGAAACAACCTGGGAAGCATCTGAAACACTGCGTGGATTTGTTCGTTTATCTTCTGGCACAGCTACTTCGGCCGCAACTACAACGACTGGTGCAGGATTTACATATGAGAATGGTGTATATACCCCGGACCCAAGTAAACTGGTTAACTACGTAAAATCTGGCTATGCAGTTTCGCCTTACGAATTAAACCGCGTATTGCAAAACTTCTTACCGATAAATGCGATGGCTGTTAATGCCGAAAAACTTGATAGCCTCGATTCAACCCAGTTTATTCGTCGTGATATTGCTCAGACTGTTGAAGGTGTGTTAACTCTCACCAAACAGACAAATTTATCCGCTCCGGTTGTATCGACGAGCACTGCAGTGTTTACTGATGTAACGGCTGGCACTTCGACGTTCGGAACTGTGAATGTTGTTAATGGAACCAACAAGTGGAAAATCACTGCTCCTTCCACCGGAACGACAATGACTATTGGCGATACGACTAACGTATTGACATTAAACACTGCCTCGGGCAATGTTGCTGTATTGAACAACCTTAGTGCCGGAAACGATGTTCAAGCCAAAAATAATTACGTTCTAAACGGTCGTACTATTGCAACCACGACGGGTGAAGCTTCTGGTGCAACTCTGGCCCTGGGTGATAACTCGCAGAATTTAGTGCTCAAAACTCTTGATGCTGGTAATATCATAGCAAATGGTGGCGGTGCATTTAAAGTCCTGACCGAGAAAAACGCTGTTGAGATTGTTGATAGAAACTTTGTTAACCAAGCGGGCGATACAATGTCTGGTATGCTCCGTGTGAATGCTCCGGTCCGTGTATTCGGTACGAAACCAAGTCTTATCGCACAAGCCCCAACTGCGGAAACTGTTGGCTTCTGGTCTGTTGATATTAATGATGAACCGACTTACAGTCAGTTCCCCGGTTATTGGACAATGATTTTAAAACGTCAAATAAACATTGATACCGTTCAAACTAAACCGGCCGGTATGTCCGATGAAGTTTGGAATAGTTCTGGTTGGTTAACAGAAAACGGCAAGAATGGTAAATTACCCGGTGGACAAGAATTGGGTCCCGATGGACAACCGATTACACCACAGCCTCCGGTTGTACCAATTCATTATCGTAAACCAGATGGAACTTTAGGTGACCCAGTTAGTACACCAGAGGCTCCTATACGTGGTACATGGTTTGACTATTCAGTTCGTGACAAACAAATTAAATATCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACGCTGGATTCATGCTATCAAGATTGGGTTTGCTATCCTACTGGATTAAACGGTGGTACTATTCGTTATACTCGCACATGGCAGAAAAATAAATCAGCCTGGACGACTTTCGCAATGGTTTACACCGCGGATAACCCTCCGTCTGCAGAGGATGTTGGTGCATTACCGGCGGACAACACAACAATGGGGAACTTGACCATTCTTGATTGGTTACGTATCGGTAACGTGCGTATCATCCCAGACCCGACCACTAAATCCGTTAAGTTTGAATGGGTTGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
e14b4b81e9763ae6ba7f41ea4ea8a29969532165a6336c009fccbbf796a0b56a
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5459
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
VR bacteriophages - a small but diverse group of low-temperature viruses Kaliniene,L., Meskys,R., Simoliunas,E., Zajanckauskaite,A. and Truncaite,L. 2015-03-10 — GenBank