Protein

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Genbank accession
URY13102.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,58
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,92
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSGRWRALRTDANWTTVSSGPYQLKSGESISVNTAAGNDITFTLPSSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLITAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQIVLIFSNRLWQMYVADYSREAAVVTPASLYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTTIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGATQTIELQLPTDISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPGAEWVTVQELVFNGETNYVPVLELAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQDTTFSFADDIIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGKLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTTVRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADSNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVTANSVLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTVRVWGNQFSGELDTTRSTVFEVSDETSSHFYSQRNKAGNITFNINGTVTPINVNASGTLNANGVATFGNSVTATGEIISRSANAFRAINGNYGFIVRNDGSVTNFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 139997,47630 Da
isoelectric point:5,36847
aromaticity:0,07215
hydropathy:-0,32203

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
980–1092
IPR048390 IPR048391
URY13102.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage ESh24
[NCBI] 		2950770 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
URY13102.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
ON528734.1 [NCBI]
CDS location
range 136997 -> 140866
strand -
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCAGGAGCTTTTAATAGCGGACGCTGGAGAGCATTACGTACCGATGCAAACTGGACAACTGTTTCGTCAGGACCTTATCAATTAAAATCAGGCGAATCGATTTCAGTTAACACCGCAGCGGGTAATGACATTACATTTACTTTGCCATCTTCTCCAATTGATGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAGGTTTTAATTACAGCTCCGGTACAAAGCATTGTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAGTCACAGATAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGTAGAGAAGCGGCAGTTGTAACTCCAGCGAGTCTTTATCAAGCGCAATCCAACGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTGCACCAATTAATGTTAAACTTCCAAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTCGATTTAGATAAACTAAATCCGCTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACAACGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACAACTAATTCTAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTCATGGTGTTTGGTGCGAATAACGGAGCAACTCAAACAATTGAGCTTCAGCTTCCGACTGATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCTGGTGAAGATAAAATTGCTTCCTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGCTCAGAATATCCGCCTGGAGCTGAGTGGGTTACAGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTAGAGCTTGCATATATTGAAGATTCTGATGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTAGACTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCTAATGTCGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACGTTAGCTAATCGTACTGCTACTGAAACTCGCAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTTAACCAGGATACTACATTCTCTTTTGCTGATGATATTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAAGAAACAAACGCAGGAACAGATGATACAACCATCATTACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACTGCAGGTGCTACTCCAGCTTCTAGCCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTAGATCAATATAAAGCTACTCCAACGCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAGAGTCAAGAAGGATGGGCAAATGCTGTTGTAACGCCAGAAACGTTACACAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGATTAATTGAAATTGCTACACAATCTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACTAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACACTTCGTGTGGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCTGGAAAATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCACAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTACAGAGTGAACCTACCTGGGCAGCTACTACTACAGTAAGAGGCTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTTGTCGGTAATGATACAGTCGGTTCTACCCAAGATTTAGAACTGTATGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCATACGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTACCGTTAAAAGCAAAAGCTGCTGATAGTAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCGCAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTACAGCAAATAGTGTACTAACGATTTCTAATACTGGAACAGCAACTCGATTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACAAACCCAGCCCAAACGATGACTGTTAGAGTGTGGGGAAATCAATTTAGTGGGGAATTAGATACAACACGTTCTACCGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACATCTAGTCATTTTTATTCTCAGCGCAATAAAGCTGGAAATATAACATTTAATATCAACGGTACAGTAACACCGATAAATGTTAATGCTTCAGGAACATTGAATGCAAATGGCGTAGCAACATTTGGTAATTCAGTCACTGCAACTGGTGAAATTATTTCTCGAAGCGCAAATGCTTTCCGTGCTATTAACGGAAATTATGGTTTCATTGTTCGCAATGATGGATCAGTAACGAATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAGACTGGTGGATTCAATGGATTACGCCCATTAGCTATTAATAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATCGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCTGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAAGGTACTAAAACATCTGACTTATATACACGTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGATATTAACGATTCAGCTACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGTCTTCCATATTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACACTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTATCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCAGAAGCGCGTACCACTCGTTGGACCCGCACATGGCAGAAAACCAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCTCAACCGTCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
89623fec06f105e5ecd9ab98c516f7a32390790f97984a106b8c834eceee3c72
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5635
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Design of a bacteriophage cocktail active against Shigella species and testing of its therapeutic potential in Galleria mellonella Filippov,A.A., Su,W., Kevorkian,R.T., Sergueev,K.V., Srijan,A., He,Y., Lurchachaiwong,W., McGann,P.T., Ellison,D.W., Swierczewski,B.E. and Nikolich,M.P. — — GenBank