Protein

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Genbank accession
XDC03561.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MYSIKTDLDITGAGTVGKDLLVKGNAVFNNNLTVNGTVTFANATFTAIESSTANITSTLDVGGKATLSGGLGVEGNTTIGSAVVGSDTATINSNATFNGTVSVGSDFTQTAGTTTLQATKVKNLEVAETTAFKGNITADVGTTAAFDKITANTAEITNVSTTDISSTGTATFNDVTISGTLGGEFNLSDLNAVTLNVTGASNQQGAVTFGANVTGINSTATFKDIRIGSNSESQTFRLSFPYTAPGKRPTVILQNEIQSELMSPANLTVLTSASFGNASLSSYGITGNGLNKLDYLTVSGNNTQSPDTPLLEVQKGKTKVADFEVTGTATIPNIESTGTANFNNINVSGLLGGTFQLDDINAVSLNVTGVTSLVGGVTLGSNITGYNSTASFKAISLGQNSQDAAVKLGFGYTAPGQRPTVILPNEVQSEVVSPSTLNVLKTATFGNASLSTYGITGNGLNKLDYLTITGNETQAPGTPFLQVGGKAILNDVEFTGTVTGLTVDVSGQDLTPNSVVAAANIKGATLESTGNTTVGAKLTVTGDIAGTTATLSGALSAGSVSSGSITGTTSVSAPTISASTEVTAPTITASGTVSGQTINGTNISATTLTAPTISGNTNFTENVDITGSLTVGSLDLSTTDINAKSITTTAGATIGGDLVVQGSFDLSAADLNVKSLTTSGIVKSNDLVNANVLPVLNSTTITATTVNADDITVTGSANLGTIYSSSSVLVGSTLTVTGETTTASLVTPTISNASGVTISNNTNVTGDLTVTGAVIPGSIDLATTDVNAKSITTTAGATIGGNLTVNGTVDLTTADVTVKSLTSTGAIVSNESTISSVLPKLQSTDATIATLGSTTANITNLNVTGASTVADVTSSGKVKAVSVETPTISNVDGVSISNNTSITGDLTVSGTVTPGAIDLSTTDVSAKSITTTAGANIGGDLVVSGTVDLSGADVSVKSLTSTGIITVSSAEGINVLPKVQSTEVTVSALNATNAVVSGDVSAATASISGAITGGSATLSGVGTALNVTNNATVGGVLTVGSITSAAENVSITKNTAITGNLAVSGTLTAGVIDLSTTDVSVKTLTSLGDATVQGNLTVDGTINLSSANIVGVTLESTGSTTVGTDLILTTGNITGSPSISGNLGVTGTTTLTGATTVSNTLNTAGKLTVNAGGIQVVAGGIQVDSGTITASSANISGSSTLNSATVTTTLGVTGAASMNGGLTASTLDVTGDSTVQKLTVKGVFVPEGGLDLSGADLSVNSVTAATTLSVTGASTLTGGVSTSTVTASGKVTAQELSTGTLDVTTNGTVGGTLGVTGKATVGSLDSGAISATSGTFSTTLDVTGAATFGNNVNITGTLTPGALDLASTDVVANSLSVATTLHSDGNATIGGTLGVTGAVSAPSIALNGEGAALAVTNNATIGGTLGVTGATTLGSLTTSGAVKTGADVIIGTKIGDQPETVQIFPNTYIAGSLRVDGGINADIDVSGQTIEPYAVVAADTISAAGNITSGAELISKSATIGDVGSQNNNLTINGNVVNNGNFTVTGLLNATLNQANSDVAVKSLTATNSVAAGTSITAGTSITATGLLKGNTLEVTTTGSFGGAVTMSSGANITGTVGITSGNLTVGGDISATGTATLAATSVTTITTSGAATLASASVTGAATIGGTLTVTGLMTANGSVVLGDAAADTLTVNATSSFKENAVFDKDVTVTGQLTTTNADLTTTTVTTKKYDVIPNQVTSSVIAPTGTWTPDGTSNVYFITLDQDTTLAPITGLIGGGKASSVYIYVKQDATGNRNFTTDGTYAVVDGTLNKTANSVTIYQVIYDGVSPVTDMFIAQRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:1841 AA
molecular weight: 180375,94810 Da
isoelectric point:4,14859
aromaticity:0,02933
hydropathy:0,24264

Domains

Domains [InterPro]
IPR058970
1750–1829
IPR058970
XDC03561.1
1 1841
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_E9.1
[NCBI] 		3229727 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XDC03561.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP886230.1 [NCBI]
CDS location
range 147462 -> 152987
strand -
CDS
ATGTACTCAATAAAAACTGACTTAGATATTACTGGTGCTGGTACGGTTGGTAAGGATCTTTTAGTCAAAGGAAATGCTGTTTTCAACAATAACCTAACTGTAAATGGTACTGTAACTTTTGCAAATGCAACTTTTACTGCCATTGAATCATCAACTGCCAACATTACATCTACTTTAGATGTAGGTGGCAAAGCAACACTTTCTGGTGGTCTTGGTGTTGAGGGTAATACTACAATCGGTAGTGCAGTTGTCGGGTCTGATACAGCAACAATTAATTCAAACGCTACCTTTAACGGTACTGTATCAGTTGGTTCTGATTTTACACAAACTGCTGGTACAACCACTCTACAAGCAACTAAAGTTAAAAACTTAGAAGTTGCTGAAACAACAGCATTTAAAGGTAATATTACTGCTGATGTTGGGACTACTGCTGCATTTGATAAAATTACTGCTAATACCGCAGAAATTACTAATGTAAGTACAACAGATATTAGTAGTACTGGTACTGCTACATTTAACGATGTGACAATTAGTGGTACACTTGGTGGTGAGTTTAATCTATCTGACTTAAATGCAGTAACATTGAACGTTACTGGTGCATCTAACCAACAAGGTGCAGTAACTTTCGGTGCTAACGTAACTGGTATTAACAGTACTGCTACTTTTAAAGACATTCGTATTGGTTCTAACTCTGAATCACAAACCTTCAGATTAAGCTTCCCTTACACTGCTCCTGGTAAACGCCCAACTGTTATTCTACAAAACGAAATTCAGTCCGAGCTAATGTCACCTGCAAACTTGACAGTATTGACCTCTGCTTCTTTTGGTAATGCGTCATTATCTTCTTATGGTATTACTGGTAATGGTCTAAACAAATTAGATTATCTAACAGTTTCTGGTAACAATACACAATCACCAGACACACCACTATTAGAAGTTCAAAAAGGAAAAACTAAAGTTGCTGACTTTGAAGTAACCGGAACTGCAACTATTCCAAATATCGAAAGTACTGGTACTGCTAATTTTAATAACATTAATGTTTCTGGTCTTCTTGGTGGAACGTTCCAACTAGACGATATTAATGCAGTATCTTTGAACGTTACTGGTGTAACTTCATTAGTTGGTGGTGTTACTCTTGGTTCTAATATTACTGGTTATAACAGTACTGCATCCTTTAAAGCTATCAGCTTAGGTCAAAATAGTCAAGATGCGGCAGTGAAACTAGGTTTTGGATATACTGCACCAGGTCAACGCCCAACAGTTATTCTACCTAACGAAGTTCAATCAGAAGTCGTTTCTCCTTCTACATTGAACGTTCTTAAAACAGCAACTTTCGGTAACGCTTCTCTTTCCACTTATGGTATTACTGGTAACGGTCTAAACAAACTAGATTACCTAACTATTACTGGTAACGAAACACAAGCTCCAGGTACACCATTCCTACAAGTTGGTGGTAAAGCAATTCTTAATGATGTTGAATTTACTGGAACAGTAACTGGACTAACTGTTGATGTTAGTGGGCAGGATCTAACACCTAATTCTGTTGTCGCGGCAGCAAATATTAAAGGTGCAACACTTGAAAGTACTGGTAACACTACCGTGGGTGCTAAACTAACTGTTACTGGTGATATTGCTGGTACAACTGCAACTCTTTCTGGTGCATTATCCGCTGGTTCAGTAAGTTCTGGTTCTATTACTGGTACAACTTCTGTATCTGCACCAACAATTAGTGCATCTACTGAAGTAACGGCCCCTACTATCACTGCGAGTGGAACTGTAAGTGGGCAAACAATTAACGGTACTAATATTAGTGCAACAACTCTGACTGCACCAACTATTAGTGGTAATACTAACTTTACAGAAAATGTTGATATTACTGGTAGCTTAACTGTTGGTTCTCTAGACTTGAGCACTACCGATATTAATGCTAAATCAATCACTACTACTGCTGGTGCAACTATTGGTGGTGATTTAGTAGTTCAAGGCTCTTTTGATTTATCAGCAGCCGACCTTAATGTTAAATCATTAACTACTTCTGGTATTGTTAAAAGTAATGATCTTGTTAATGCTAACGTACTTCCAGTACTTAATAGTACTACCATAACGGCAACTACTGTTAATGCTGATGATATAACTGTTACCGGATCTGCTAATTTGGGTACAATTTACTCAAGCTCATCTGTTCTAGTTGGGTCAACTTTAACTGTAACTGGTGAAACTACAACTGCATCGTTGGTTACCCCAACCATTTCAAATGCAAGTGGTGTCACTATTTCCAATAATACAAATGTAACTGGTGACCTAACTGTTACTGGTGCAGTTATTCCAGGCTCTATCGATCTAGCAACAACTGATGTTAATGCTAAATCCATTACTACTACTGCTGGTGCAACTATTGGTGGTAACCTAACTGTTAATGGTACAGTAGATCTTACTACGGCTGATGTTACTGTCAAATCTTTAACTAGTACTGGTGCAATTGTTAGTAATGAATCCACAATTAGTAGTGTTCTACCTAAACTTCAAAGTACTGATGCAACTATTGCAACCCTTGGTTCAACAACTGCAAATATTACTAATTTGAATGTTACTGGTGCATCTACCGTAGCTGACGTAACTTCTTCAGGTAAAGTTAAAGCAGTTTCTGTAGAAACCCCAACAATTAGTAACGTTGATGGTGTATCTATTTCCAATAATACATCTATTACTGGTGACCTAACAGTTTCTGGTACAGTAACACCAGGTGCAATTGATTTGAGCACAACTGATGTAAGTGCAAAATCCATTACTACTACCGCTGGAGCAAATATTGGTGGAGATCTTGTTGTTTCTGGTACAGTTGATTTAAGTGGTGCTGATGTATCTGTTAAATCTCTAACAAGTACTGGTATTATTACAGTTAGTAGTGCAGAAGGTATCAACGTTCTACCTAAAGTTCAAAGTACTGAAGTTACAGTGTCTGCTCTAAATGCAACAAATGCAGTAGTTTCTGGTGATGTTTCAGCAGCAACAGCTTCAATCTCAGGTGCAATTACTGGTGGGTCAGCAACACTATCTGGTGTTGGAACTGCTCTAAATGTAACTAATAACGCAACTGTTGGTGGTGTACTTACTGTTGGTTCTATTACTTCAGCGGCAGAAAATGTATCCATTACTAAAAATACCGCGATTACTGGTAATTTAGCAGTATCTGGAACACTAACTGCGGGTGTTATTGATCTTAGCACAACTGATGTGTCTGTGAAGACATTAACTTCTCTAGGTGATGCAACCGTTCAAGGTAACTTAACTGTTGATGGTACTATTAACCTAAGTTCTGCAAACATCGTCGGTGTAACACTAGAAAGTACTGGCTCCACTACCGTAGGTACTGATTTGATACTAACTACTGGTAACATTACAGGTAGTCCATCTATTTCTGGTAACTTAGGTGTAACTGGCACTACAACTTTAACTGGTGCAACAACAGTTTCAAATACATTGAATACTGCTGGTAAACTAACAGTTAATGCTGGTGGAATTCAGGTTGTTGCTGGTGGTATACAAGTTGATTCTGGAACTATTACTGCTTCTAGTGCTAATATTTCTGGTAGCTCAACACTTAATAGTGCTACTGTAACCACTACACTAGGTGTTACTGGTGCAGCAAGTATGAATGGTGGTTTAACTGCTTCTACATTGGATGTAACAGGTGATAGTACAGTACAAAAACTAACTGTTAAGGGTGTATTTGTTCCTGAAGGTGGTTTGGACTTATCCGGTGCTGATCTTAGTGTGAATAGCGTAACTGCGGCAACCACATTAAGTGTTACTGGTGCTAGTACTCTAACTGGTGGTGTTTCCACTTCAACTGTTACTGCATCCGGTAAGGTAACCGCACAAGAACTAAGTACTGGTACATTGGATGTAACCACAAATGGAACTGTTGGTGGAACTTTAGGTGTAACTGGTAAAGCAACTGTTGGATCACTAGATTCAGGTGCAATCTCTGCAACATCTGGTACATTTAGTACTACACTAGATGTGACTGGTGCAGCGACCTTTGGTAATAATGTTAACATTACTGGTACATTAACCCCAGGTGCATTGGATTTAGCTAGTACTGATGTAGTTGCTAACAGTCTTTCTGTAGCTACAACTCTACATTCAGATGGCAACGCAACAATTGGTGGCACATTAGGCGTAACTGGTGCAGTATCTGCTCCATCAATCGCTCTTAATGGTGAAGGTGCTGCGTTAGCAGTTACTAATAACGCAACAATTGGTGGTACATTAGGTGTAACTGGTGCTACAACTTTAGGTTCTCTAACAACCTCTGGTGCAGTTAAAACTGGTGCTGATGTTATTATCGGTACTAAAATTGGCGATCAACCAGAGACAGTTCAGATTTTCCCTAATACTTACATTGCTGGCTCCTTGCGTGTAGATGGTGGTATCAACGCTGATATTGACGTTAGTGGTCAAACAATTGAACCTTATGCAGTTGTTGCGGCGGACACTATTAGTGCAGCGGGTAATATTACTTCTGGTGCAGAGTTGATTTCCAAATCAGCAACTATTGGTGATGTTGGTTCACAAAACAACAACTTAACAATCAATGGTAACGTAGTTAACAACGGTAACTTTACAGTAACTGGTCTACTTAACGCAACACTAAACCAAGCAAACTCTGACGTGGCTGTTAAATCATTAACTGCAACCAACAGTGTTGCTGCTGGTACTAGTATTACCGCAGGTACAAGTATTACTGCAACTGGTCTACTAAAAGGGAACACCCTTGAAGTAACTACTACTGGTTCATTTGGTGGTGCAGTAACAATGTCAAGTGGTGCTAACATTACTGGAACCGTTGGAATTACTTCTGGTAACCTAACTGTTGGTGGTGATATTTCTGCAACAGGTACTGCAACCCTAGCAGCAACTTCAGTAACTACCATTACTACTTCTGGTGCAGCAACACTTGCTAGTGCATCTGTTACTGGAGCAGCAACAATCGGTGG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Tertiary structure

PDB ID
dfe2ffdaeda48d8ada6dbc37e02023c54476cbf0f52c17c5ffd23d229edbb924
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5171
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50