Protein

View in Explore
Genbank accession
WJJ54630.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,62
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MAIDTNINRIKFLRTTRAGAAPDPSLLDEGELAFNLVDRTIFSKNGPNIVELGFGKGGTVNGPVNATGQISTNDFLYSKYGFSVNSETADGRGISLYGNGYTASNGLPSYGLAMAATSKYGTFGAVSGSHATYLTTNSGTDRGWIFNYNGTTNVASISGTGIATFARVDAPLNGNANTATKLQSARNVNGVLFDGTSDINTPAITDVVSFDNRTVKPSDVRNKAMGVYFTSKAGLNGAADTNYGDFLSLSTYQDGTGGKVNGLYFNKLSREILHYQTDLNSNSWGTPKTIAYTDSSITGNAASATRLQTARTINGTAFDGTANINVNATYSEFIPDGADLNDYKTPGLYYCPTDAGAATQLNLPFSNAYSLFVERHAGIKQTITQYATNKTFIRKFYNGYWDNWRQLAFLDPSDQKFTENITLEKASSAAINVKSTTGNYSELILSNGNKTASVSLTPDGSFILWDSTRQSSFATFTPDGVQSILNSKLLINTPASLNVTGGETFAVTGGESSPIRFKINRGGAITTNAPETEASIAHATSYSWYNTEWQIGNIRGGSTNSLGFGITKFNDTLVWRHDGNTMTNYGNISNTGSISTQGDISSNGNLSAAGSISGDSLITRTGRIGAPTSTYHYLDIGRDGTDITTVGQYGGAFRVVDTSIGKNTFSVDPNTAIFAGRIVTKPGAFYQNITDLGNATAAITVPDVVAPQNTTGYAPFIHGSVQTNGFGYRTNVSIGAWRGSNTWSSSGAYIAIGGNDNYTTEAFRFMTGGYIGTSGGILNILGTLNAPTLTSTTGSFTTVNTTNINAQDSIVMSAAPGGSGRSGMYTGNGDGASFSTCNMDLGSHWGLGFKDNLGNRNIFFDTRAGNASFKGSIRIGASFADETQLLPVSNQLQILTSGGQARNISTGGVLASDAYDDASKVPVNGIYSKGDIKTSTWVYASKFTGPTGSGDGMFDGNANTATRLQTPRTIGGVAFDGTSNINLPGVNIQGNQNTTGNAASATRLQTARTFQITGGITTNAVSFDGQQNVTLTASNVDGSKVSGVVPEAVKAQTLAVTPQKNAKLVASWKGTILQSMTPTLTIVDANTLRVRLADDNPSNRLPVLRFNVKIGTVYHLAFSDTMLPINGTVTFVQTGLTWVEVDLNSPNHGLSGSGNGVNVMAITYSAYGCYFEGSISQIIGTTGPKDSQWAYVLKLNSPTTDATYNLSGSSQDAIWVADKDIWYLNPAQPVITAGAMISPDRLNFFAADTDSAKRMRSNMVTAQIWDIV
Physico‐chemical
properties
protein length:1268 AA
molecular weight: 133853,28940 Da
isoelectric point:6,26033
aromaticity:0,09385
hydropathy:-0,22823

Domains

Domains [InterPro]
cd19958
334–408
cd19958 IPR005601
WJJ54630.1
1 1268
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter phage AB1I1M-1
[NCBI] 		3035939 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WJJ54630.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ627712 [NCBI]
CDS location
range 5957 -> 9763
strand +
CDS
ATGGCAATAGATACAAATATCAATAGAATTAAATTTCTTAGAACTACTAGAGCTGGTGCAGCTCCTGATCCATCACTATTAGATGAAGGTGAATTGGCGTTCAACTTAGTAGATAGGACTATTTTCTCTAAAAATGGACCTAATATAGTTGAGTTGGGATTCGGTAAAGGCGGAACAGTAAATGGGCCAGTAAATGCAACAGGGCAAATTAGTACCAATGACTTTTTATATTCAAAGTATGGATTTTCTGTAAATTCAGAAACCGCAGATGGACGCGGTATTTCATTATATGGTAATGGATATACCGCATCAAACGGTCTGCCGTCATACGGTCTTGCGATGGCTGCTACAAGTAAATATGGTACATTTGGTGCTGTGTCAGGTTCGCACGCAACTTACCTTACTACAAACTCAGGTACTGACCGTGGTTGGATTTTTAACTATAACGGAACTACCAATGTAGCTTCAATTTCGGGAACTGGCATTGCGACATTTGCTCGTGTAGATGCTCCGTTAAACGGTAATGCTAATACAGCAACTAAACTTCAATCAGCTAGAAACGTTAATGGCGTGTTGTTTGACGGCACATCAGATATTAATACACCAGCTATCACTGACGTCGTTTCATTTGATAATAGAACTGTTAAACCTTCTGATGTTAGAAATAAAGCCATGGGTGTTTATTTTACTTCAAAGGCAGGTTTAAATGGCGCGGCTGATACCAATTATGGTGATTTTTTATCTCTAAGCACTTATCAAGATGGCACTGGAGGAAAGGTAAACGGTTTATATTTCAATAAATTATCTCGAGAAATATTACATTACCAGACAGATTTAAATTCAAATTCGTGGGGAACTCCAAAAACGATTGCGTATACAGATAGTTCTATTACCGGCAATGCTGCATCAGCAACACGCTTACAGACAGCAAGAACTATCAATGGCACTGCATTTGATGGTACTGCGAATATCAATGTCAATGCTACATATTCGGAATTTATTCCTGATGGTGCGGATTTAAATGATTATAAAACTCCGGGGCTGTATTATTGTCCTACTGATGCTGGTGCAGCGACTCAATTAAATTTACCGTTTAGTAATGCGTATTCGTTGTTTGTTGAGAGACATGCTGGAATTAAACAGACCATTACCCAATATGCGACAAATAAGACTTTCATTCGTAAATTTTATAATGGCTATTGGGATAATTGGCGTCAATTAGCTTTCTTAGACCCAAGTGATCAGAAATTTACAGAAAATATCACTTTGGAAAAAGCTTCTAGTGCAGCAATCAACGTTAAGAGTACTACCGGTAACTATTCTGAACTTATTTTAAGCAATGGAAATAAAACCGCTTCTGTAAGTCTTACGCCAGACGGTAGTTTTATATTATGGGATTCAACTAGACAGTCGTCATTCGCGACATTTACACCAGATGGTGTACAATCGATATTAAATTCTAAGTTGTTGATTAATACTCCAGCATCGCTAAATGTTACAGGCGGAGAAACATTTGCTGTTACGGGTGGAGAAAGTTCTCCAATCAGATTTAAAATTAACCGCGGTGGAGCTATTACCACCAATGCTCCAGAAACCGAAGCATCTATCGCTCATGCCACTTCATACAGCTGGTATAACACCGAATGGCAAATTGGTAACATTCGTGGCGGTTCTACTAACTCTCTTGGGTTTGGTATTACTAAATTCAATGATACGTTAGTATGGCGCCATGATGGTAATACTATGACCAACTATGGTAACATTAGTAATACAGGTTCGATCAGTACGCAAGGAGATATTTCATCTAATGGTAACTTAAGTGCTGCAGGTTCAATCAGCGGAGATAGTTTAATCACTAGAACTGGTCGTATCGGTGCGCCAACATCTACGTATCACTATCTCGATATCGGTAGAGACGGTACAGATATTACTACAGTCGGTCAATATGGAGGTGCATTTAGAGTTGTTGATACATCTATCGGCAAAAATACATTCAGTGTTGACCCAAATACGGCTATTTTCGCTGGAAGAATTGTCACAAAGCCTGGTGCATTTTATCAAAATATAACAGACTTGGGTAATGCGACTGCAGCTATTACAGTTCCAGATGTAGTGGCTCCACAAAATACTACAGGATATGCTCCGTTCATTCATGGATCAGTTCAAACGAATGGCTTTGGTTATAGAACTAACGTATCTATTGGTGCTTGGAGAGGTTCTAATACTTGGTCATCTTCGGGTGCTTATATTGCTATTGGCGGTAATGATAACTATACGACAGAAGCTTTTAGATTCATGACTGGTGGTTATATTGGCACAAGTGGCGGTATTTTAAATATCTTAGGTACTTTAAATGCACCTACTTTAACATCTACAACTGGATCTTTCACTACCGTTAATACAACAAATATTAACGCCCAAGACAGTATTGTGATGAGTGCTGCGCCTGGTGGATCTGGACGAAGCGGTATGTATACCGGAAATGGTGACGGTGCGTCCTTCTCTACCTGTAATATGGATTTAGGTTCTCATTGGGGCTTAGGATTCAAAGATAATTTAGGAAACAGAAATATTTTCTTTGATACGCGTGCAGGTAATGCGTCGTTTAAAGGGTCTATTAGAATCGGTGCATCTTTTGCTGATGAGACTCAATTATTACCTGTGTCAAACCAACTTCAAATATTAACTTCAGGCGGTCAAGCTAGAAATATTTCGACTGGTGGTGTATTGGCTTCTGATGCTTACGACGATGCTAGTAAAGTTCCTGTAAACGGCATCTACTCAAAAGGTGATATTAAAACATCTACATGGGTATATGCATCTAAATTCACTGGTCCTACTGGATCAGGTGATGGTATGTTTGATGGTAATGCCAATACAGCAACTCGTTTGCAAACACCTAGAACAATCGGCGGAGTAGCTTTTGATGGTACAAGCAATATTAATTTACCAGGTGTTAATATTCAAGGTAACCAAAATACAACTGGTAATGCAGCGTCTGCAACTCGTTTGCAAACTGCAAGAACTTTCCAAATTACTGGTGGCATCACAACAAATGCAGTATCATTTGACGGACAACAAAACGTTACATTGACTGCATCTAACGTCGATGGTTCAAAAGTATCTGGCGTGGTTCCTGAGGCAGTTAAAGCGCAAACTCTTGCAGTGACACCGCAAAAAAATGCGAAATTGGTTGCATCATGGAAGGGTACCATATTACAATCTATGACGCCTACACTAACTATTGTTGATGCAAATACACTTCGTGTTAGATTAGCAGACGATAATCCGAGTAACAGATTGCCAGTATTGAGATTTAATGTGAAAATCGGCACAGTGTATCATCTCGCATTTAGTGATACTATGTTGCCGATCAATGGCACAGTAACTTTCGTCCAAACTGGGTTAACATGGGTTGAAGTTGATCTTAATTCACCTAACCACGGGCTATCAGGTTCAGGCAATGGTGTAAATGTTATGGCGATAACATATTCTGCATATGGTTGTTATTTTGAGGGCTCAATTAGCCAAATCATTGGCACAACAGGACCGAAAGACAGTCAATGGGCATATGTATTGAAACTCAATTCTCCGACAACTGATGCTACATATAATCTTAGCGGATCTTCGCAAGATGCAATATGGGTTGCAGATAAGGATATTTGGTATCTTAATCCTGCGCAGCCGGTGATAACTGCAGGCGCTATGATTTCTCCTGATAGATTGAATTTCTTCGCTGCTGATACAGATTCGGCAAAAAGAATGCGTTCTAATATGGTAACTGCACAAATTTGGGATATTGTATAA

Tertiary structure

PDB ID
eda82bf933ba83443264d32dbaefd6e25f62702f8d46e1863625ce12d973cb1e
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4683
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50