Protein

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Genbank accession
UGL60446.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMVGDLGIVKLLYGGKTVFDPTGSSEITIGDVLKTFKLNANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAITNTFSGTQNIQGDANLLRLRNQNANNAQYIEGVNLDGSARWWVGIGSNGSDEVKLYNNKYNSALTVASNVSVNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAGNNNFTGLNTFSNPVNINSDAAAIILKNKTANDNLFILARDSGNNNLWYIGKGDTDANVTLYDYKGGTAIKLDSSGVTFNKGVKIIGQVQPSDWANIDSRYIPAATLSTIARNNAQNTFKSGQTIVADGQALLLRSATDSPSLYVRGQNQSGTNKWYVGFNTSNVLGLSNEASGTTLTLDSAGINSNKNLNITGQVKPSDFSNLDARYFTQSASDSRYLRIRSTNFNNGNDDKWAKIATVVMPPTASTAVIEVFGGSGYNYGFPYQASKTEIVLRAGGNSPKGLNIVAWKNSENLIITDIGYVNTSGDTYDIYCRVGPFQNDTTSRVQSSSNASVQLFEAPQTFDDAPQGIVKGTIARYYTSMQKPTPSDIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRVAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTNTTGAHTHSVSGSTNTTGNHTHTVGGHYVGDSIGGKPRVQVYGTEQVSSVAGDHSHTVSGTADSNGNHAHTVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:840 AA
molecular weight: 89963,09000 Da
isoelectric point:8,17925
aromaticity:0,08333
hydropathy:-0,39524

Domains

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage vB_SenM-pSJ21
[NCBI] 		2894725 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UGL60446.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OK539833.1 [NCBI]
CDS location
range 84526 -> 87048
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGATACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTTGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGATTTCTTAGCATCTTTTAAGCTTGAAAGGTTTGTTCAGATTGCTGGGAGCACTATGGTGGGGGATTTAGGTATTGTCAAGTTACTTTACGGTGGCAAGACTGTATTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAAATTACTATTGGTGATGTTTTAAAGACTTTTAAACTTAACGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCAGCAACTGTTTATCATACTCTGAATAAGCCAAGTCCTAATGAGCTTGGTATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATACGCAAGACTTGCTATCACAAACACATTCTCTGGAACTCAAAATATTCAAGGTGATGCTAACTTACTTCGCCTTAGAAACCAAAATGCAAATAATGCACAATATATCGAAGGTGTAAACCTAGATGGTTCGGCTAGATGGTGGGTTGGTATTGGTAGTAATGGCTCTGACGAAGTAAAGCTGTACAATAACAAATACAACTCAGCCTTGACTGTTGCAAGTAATGTCTCTGTTAATAAGTCTTTAGCAATCACTGGTCAAGTCCAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGACAGTAGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGGCAATAATAATTTCACTGGTTTAAACACATTCAGCAACCCTGTTAACATTAACTCTGATGCTGCTGCTATTATTCTGAAAAATAAAACTGCTAATGATAATTTGTTCATCCTAGCAAGAGACAGTGGAAACAATAATTTGTGGTATATTGGTAAAGGTGATACAGACGCTAATGTCACATTATATGATTACAAGGGTGGTACTGCTATTAAATTAGACTCATCTGGTGTAACATTTAATAAGGGTGTAAAAATCATTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTGGGCTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACGATTGCAAGAAATAATGCACAAAATACTTTTAAATCTGGGCAGACAATTGTAGCAGATGGTCAAGCACTATTGTTAAGAAGTGCAACTGATAGCCCCTCTCTCTATGTTAGAGGCCAAAACCAATCTGGAACTAATAAATGGTATGTTGGATTTAATACTTCAAATGTTCTTGGATTATCAAATGAAGCCTCTGGCACGACATTGACATTGGATTCAGCAGGTATTAATTCTAATAAGAATTTAAATATCACTGGTCAAGTTAAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAAAGTGCTAGTGATAGTAGATACCTGAGAATCAGAAGTACTAACTTCAATAATGGAAACGATGACAAGTGGGCTAAAATTGCTACTGTTGTAATGCCGCCTACCGCATCTACTGCGGTGATTGAAGTGTTTGGTGGGTCAGGTTATAACTATGGTTTCCCTTACCAAGCTAGTAAAACGGAAATTGTTCTCAGAGCAGGGGGTAATAGCCCAAAAGGTTTAAATATTGTTGCTTGGAAAAACTCGGAGAATCTCATTATTACGGATATCGGTTATGTTAATACATCTGGTGATACTTATGACATTTACTGTAGAGTTGGTCCATTCCAAAATGACACAACATCAAGAGTTCAATCTTCTAGCAATGCAAGTGTGCAATTGTTTGAAGCCCCACAAACATTTGATGATGCTCCACAAGGTATTGTAAAGGGTACAATTGCAAGATACTACACAAGTATGCAAAAACCAACCCCTTCAGATATCGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGATTCAACAGACCTTAATAAAATCTACCCTGTTGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAACGTTAACCCTAATACCGCACTTCCTGGATTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTAGGTAGAACTATCAGGGTTGCAGCAGCTAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGAGGTTCAGATTCTGTTACGTTAGCAGTTGGAAACTTACCTTCACACACTCATAGTTTCTCTGCGACAACCTCTAGCTTTGACTACGGTACTAAAACCACTAACACTACTGGTGCTCACACCCACTCAGTGAGCGGTTCAACAAATACCACAGGTAATCACACACATACTGTTGGTGGTCATTATGTAGGTGACTCTATCGGTGGTAAACCACGTGTTCAGGTATATGGTACAGAACAGGTTTCCAGTGTAGCTGGTGACCACTCACACACTGTGTCTGGTACTGCTGACTCTAACGGAAACCATGCTCACACAGTTGGTATTGGTGCTCACAGTCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTAACTAACCAGTTCTATAAGCTGATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Tertiary structure

PDB ID
c4863bc189b7ce903ac336fe6c2567b38fcbe1b7a654f93ab11233359fa017f5
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6787
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Salmonella virus vB_SenM-pSJ21 Park,S.Y., Kwon,H.M. and Kim,J.H. 2012-09-15 — GenBank