Protein

View in Explore
Genbank accession
AOV59414.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,77
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,97
Protein sequence
MADRFPLIVNAISKKIEEIVAGDNLELTGNGLIISGDTGAGKYLTSDGTTVFWGDPGNVYLTQSQTLTNKTLESSIISGSNNTITNIPNSALINSGITINGSTIALGGTVTTPDNNTTYTIAAVDGASAARKIIRLTSGGNAGSGIDDDITLIAGTNVTLDRSNDDITINSSYVDTDTITTLQSEVGGSAQSGAITIAASGSSTVSQNAGTKTITISSSYIDTITRLRATAGQVFSASDFTFLDGGATTVTQSVDGNGDPTITYSSVDTITRIKGGGAGSFVTGDTTFTGGTNVTVSQAGNIITVDSVDTNTVTRLSSGSNAVVSGDFNFTSSGATSLTQTTVGGVTTINISSANDDTGASLQASGGLILQGTNFRLKNYNTFSGNTLMKWDSGNDQLTDSIITDNGSTVTITGDLVVEGTQTILNVSTLQVEDNDIELRKGNNLTGTNGGITLNRTTDSSGNITSYVALQWNESVGYWRSWDGSVEKRFVTEGETQILTNKTLTSPTLTAPVLGSATATSINGLVISSTASATLDIASSKTLDVDRDLSLTSDNNSASINVNFRQGGNVAYTSDTLASFSSTTSTQIRGLITDTTGTGRLVFQDSPTFLTSLNTTSTGFTLFNSSVTNITAFGAAGIITMGQSGGTMTVNQSLVVNEDLTVGTGISDTITFNGTVNSENADILIRGTATDPMSVGRGGGAVNTNTRVGVSALQSNTSGSQNTALGYQALFTNNSGAANTAVGNRALRANGVGSNNIGIGRDVLLVNLEGSKNVAMGNNALESNTSGDSNVCIGHYAGFDVLGSGNVLIGPAYNENSGDVTFRPPSVSGDNQLVIGSGGQAWVRGDSNFDVTFNNDVTVDQDVIVKGNLTVNGIQTIVKSNIVQITDKNIELASIVSTQFVASATDGTADITSINPTAGLIPGMEVTTSTAGFTVPSNTIIVSISGNTATLSNNISGNGQITLTAIGPSDSAAEDGGIIVKGSTDKSILWKGSDAGVTYNSWVSSEHFDLASGKYLSLDAIRIADPNTSTIGPNNGTTTGLIDVTGGSNGYNLGSAVVGAAATSFNFTGTGEITLPNGDTAQRNSSPLNGMLRYNGQTNVFEGYSNGAWGSIGGNVAISSPAPSNSVEGDLWYDSDDGRLFVYYNDGVTTQWVDASPNGVPTDLIIEGTTELRGTATTRAILPDADDTYDLGSATKRWANIYSADLQLSNEGGANDVDGTWGQYTIQEGEHDLFLINRRSGKKYKFNLTEVN
Physico‐chemical
properties
protein length:1252 AA
molecular weight: 128860,08180 Da
isoelectric point:4,22458
aromaticity:0,05751
hydropathy:-0,13211

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-CAM4
[NCBI] 		1883367 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOV59414.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686200 [NCBI]
CDS location
range 166843 -> 170601
strand +
CDS
ATGGCTGACCGCTTTCCGTTAATTGTTAATGCAATTTCAAAGAAGATTGAAGAAATTGTAGCAGGAGACAATTTAGAACTAACTGGTAATGGTCTTATTATCAGTGGTGATACTGGTGCTGGCAAGTATTTAACGAGTGATGGAACTACCGTTTTCTGGGGAGATCCTGGCAATGTTTACCTTACACAATCACAAACATTAACTAATAAAACTCTTGAATCTAGTATTATTTCTGGATCGAATAATACTATTACAAACATTCCTAATAGTGCTCTTATTAATTCTGGAATTACGATTAACGGATCTACTATTGCTCTTGGTGGAACTGTAACAACTCCTGATAATAACACTACTTATACTATTGCTGCTGTAGATGGAGCTTCTGCTGCGAGAAAAATTATTCGTTTGACATCAGGTGGCAATGCTGGTTCTGGAATTGACGATGATATTACTTTAATTGCTGGAACTAATGTAACTTTAGATAGATCTAATGATGATATTACAATCAACTCCTCATATGTAGATACTGATACTATCACTACATTACAATCTGAAGTTGGTGGTTCTGCTCAAAGTGGAGCAATCACAATTGCTGCCAGTGGATCTTCCACAGTATCTCAAAATGCTGGAACAAAAACTATAACGATTAGTTCTTCGTACATTGATACTATTACAAGACTCAGAGCAACTGCAGGTCAAGTATTTTCTGCATCTGACTTTACCTTTCTTGATGGTGGCGCAACCACAGTAACTCAGAGTGTAGATGGTAATGGTGATCCTACTATTACGTATAGTTCTGTTGATACGATTACTCGAATTAAAGGTGGTGGTGCCGGATCATTTGTAACTGGCGACACTACATTTACTGGTGGAACAAATGTAACAGTATCTCAAGCAGGTAATATAATTACCGTTGATTCTGTAGACACAAACACTGTAACTAGATTGTCTAGTGGTAGCAATGCAGTTGTTTCTGGAGATTTTAACTTCACATCTTCTGGAGCAACATCACTAACTCAAACAACAGTAGGTGGTGTCACTACTATCAATATTAGTTCTGCTAACGATGACACGGGTGCATCTCTACAAGCATCGGGTGGTTTGATACTTCAAGGCACTAACTTTAGACTAAAGAACTACAATACTTTCAGTGGTAACACTTTAATGAAGTGGGACTCTGGTAATGACCAGTTAACAGATAGTATTATTACTGATAATGGATCTACTGTTACGATTACCGGCGATTTAGTTGTTGAAGGAACACAAACTATTTTAAACGTTTCTACCTTACAGGTTGAAGATAATGATATTGAACTTAGAAAGGGTAATAACTTAACTGGAACGAATGGTGGTATTACTCTTAATAGGACCACTGATTCGTCTGGAAATATAACTTCATACGTTGCTTTACAATGGAACGAGTCTGTTGGATACTGGAGATCATGGGATGGTTCAGTAGAGAAAAGATTTGTTACTGAAGGTGAGACGCAAATTCTAACTAACAAAACTCTTACATCTCCTACTTTAACTGCTCCTGTTCTTGGATCCGCAACAGCAACGTCAATTAATGGTCTTGTAATTTCTTCTACTGCATCAGCAACTTTAGATATTGCATCATCAAAAACTTTAGATGTTGATAGGGACCTGTCATTAACTTCTGATAATAATAGTGCATCTATCAACGTAAACTTTAGACAAGGTGGAAACGTTGCTTATACATCAGATACTCTAGCATCATTTTCTTCTACAACATCAACTCAAATACGTGGTCTGATTACTGACACTACAGGTACAGGACGTTTAGTATTTCAAGATTCTCCAACATTCTTAACATCATTAAACACTACATCTACTGGTTTCACACTGTTTAATTCTAGTGTTACTAATATAACAGCATTTGGTGCTGCTGGCATTATTACTATGGGTCAATCTGGCGGCACGATGACCGTCAATCAAAGTTTAGTGGTTAATGAAGATCTAACAGTCGGCACTGGTATTTCAGATACTATTACGTTTAACGGCACTGTTAATTCTGAAAATGCTGACATTTTAATTAGAGGAACTGCCACTGATCCTATGAGTGTTGGTCGTGGTGGTGGAGCAGTTAACACAAACACGAGAGTTGGTGTTAGTGCTTTACAAAGTAATACTTCTGGATCTCAAAATACTGCACTGGGATATCAAGCATTATTCACAAACAATTCTGGCGCAGCGAACACGGCTGTCGGTAATAGAGCACTTCGTGCGAATGGTGTTGGTAGTAATAATATTGGTATCGGTAGGGATGTATTACTGGTAAACTTAGAGGGAAGTAAGAATGTTGCCATGGGCAACAACGCACTTGAAAGTAATACTAGTGGAGATTCTAACGTTTGTATTGGACACTATGCTGGTTTTGATGTACTTGGAAGTGGAAACGTTTTAATTGGACCAGCTTATAACGAGAACTCTGGTGATGTAACCTTCCGTCCTCCTAGTGTCTCTGGAGATAATCAATTAGTAATTGGATCTGGTGGACAAGCATGGGTTCGTGGCGATTCTAATTTTGATGTCACGTTTAATAATGATGTGACTGTTGATCAAGATGTTATAGTTAAAGGAAACTTAACTGTTAATGGAATACAAACTATAGTTAAATCAAACATAGTACAAATAACTGATAAAAATATTGAACTTGCTTCCATTGTAAGTACTCAGTTTGTCGCATCTGCCACTGATGGAACTGCTGATATCACGTCAATCAATCCCACTGCTGGTTTGATTCCTGGAATGGAAGTCACAACTAGTACTGCTGGATTTACAGTTCCATCTAACACAATTATCGTTAGTATTTCTGGGAATACTGCTACTCTCTCAAATAATATTTCTGGTAATGGACAGATTACATTAACTGCTATTGGTCCTTCTGATTCTGCTGCAGAAGATGGTGGTATTATTGTTAAAGGATCTACTGATAAATCTATTCTTTGGAAAGGATCTGATGCTGGAGTAACATATAATAGTTGGGTATCTTCGGAGCACTTTGATCTTGCTAGTGGAAAGTATTTGTCATTGGACGCAATCAGAATTGCTGATCCAAATACATCAACAATTGGACCTAACAATGGAACTACTACAGGTCTTATTGATGTTACTGGTGGTAGCAACGGATATAATTTAGGTAGTGCAGTTGTTGGTGCTGCTGCTACATCATTTAACTTTACAGGAACGGGGGAAATTACGCTCCCTAATGGTGATACTGCTCAACGTAATAGCAGTCCTTTGAATGGTATGCTTAGATACAATGGTCAAACTAATGTATTTGAAGGATATTCAAACGGTGCATGGGGATCAATTGGTGGTAATGTAGCAATTTCAAGTCCTGCTCCTTCTAATTCTGTGGAAGGAGATCTCTGGTATGATTCTGATGATGGTCGTTTGTTTGTATACTATAACGACGGAGTTACAACTCAGTGGGTAGATGCTTCACCAAACGGAGTTCCTACTGATCTAATTATTGAGGGAACTACAGAACTTAGAGGAACTGCTACTACAAGAGCAATACTTCCCGATGCTGATGATACTTACGATCTAGGTTCAGCAACTAAGCGTTGGGCAAACATCTACTCTGCTGACCTTCAACTATCTAACGAGGGTGGTGCTAATGATGTTGATGGAACTTGGGGTCAGTACACAATTCAAGAAGGTGAGCATGACCTCTTCCTAATCAACAGAAGATCTGGTAAGAAGTATAAGTTCAACCTTACGGAGGTCAACTGA

Tertiary structure

PDB ID
504f8dc82b978d7d82fb8e87659ad0be57759ef41cba2c3fb60da4008ff9e7e6
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2428
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50