Protein

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Genbank accession
QBQ78808.1 [GenBank]
Protein name
putative tail collar domain protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,81
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQTGDYLQNGAYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTTGNGAWANQHSNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVNEGSFKFHYIDETRTSKYWTFNRNGNFQVDSGSLLVSNGYLVTQSNIETKAGSLIGPKVITKNINVSTKSWDTNIDTAYDLVSLPTWQYTPTETDLDTNGINYLRKFRGHVSSAIFHEVADARSGKPQNISYWTGRNAEVYQWSYTTDGRMSVANSIGIGLADVGDQGRYPLVSFGKGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDLIANGVSTGTINSTGINSTKKLMVGYSRDSGTTWDYPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYSSNAKMYHYFRGTGRMSVSMGDGLLVEPGILDIKTGSNSLNLRADGTIASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLVFKAASGIDGTKQIMWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNATGDKARETVFEVSDGQGYYFYSQRVAPTGSETTGPVVTQFNGQVNARGSIITDGSFKVNGLSTLVGNVTMSNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEDKLYIIPTPKNVGESGGISNLRPFYIALSNGKVSMDHDVDIGGGRFKVEAAGTTAGQRITVNMASDAIRINAPTQESSNFIQGRKEDVPKWYLGIGDGGNVVRMHSYTYSHGIALNSDTVDIAKPLRIGSTQIGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDADLYPKLAAVYPSGALPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASSTDLGTKTTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGTTSSAGAHQHARSGPQVTAAWANDLFRDGVTTIGANSYAKINSGITGSTLATKVGKTSNDGAHTHSWSGTTSSTGNHAHTVGIGAHTHSVGIGAHSHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1038 AA
molecular weight: 110353,59790 Da
isoelectric point:8,66450
aromaticity:0,08574
hydropathy:-0,39557

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:6.20.80.10
689–748
G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
IPR048388
691–765
IPR048388 SSF88874 SSF88874
IPR037053
786–839
IPR037053
IPR011083
791–838
IPR011083
QBQ78808.1
1 1038
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_KAW3E185
[NCBI] 		2508201 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBQ78808.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK373782 [NCBI]
CDS location
range 158110 -> 161226
strand +
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTGGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGACCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGCGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAACTGGTGATTATTTACAAAACGGCGCGTATAATCTCAATGGAAATCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATACATTGAATTTTTACCTAAAACCACTGGAAATGGCGCTTGGGCTAACCAACATTCGAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTAAGTTCAACTACTTCTGTTTCAGAATACCATCCACTGATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGCCGGTACATTAGTAAACGAAGGTAGTTTTAAATTCCATTATATTGATGAAACCCGGACTTCAAAATACTGGACTTTTAATCGAAACGGTAATTTTCAAGTTGATTCCGGAAGTTTATTAGTATCTAATGGATATTTAGTTACTCAAAGTAATATTGAAACTAAAGCTGGTTCTTTAATTGGTCCTAAAGTTATTACCAAAAATATCAATGTGAGCACTAAATCTTGGGACACTAATATTGATACTGCATATGATTTAGTTTCATTACCGACTTGGCAGTATACTCCAACCGAAACGGATTTGGATACTAATGGTATAAACTACCTTCGTAAATTCCGCGGACATGTTTCTTCTGCTATTTTCCATGAAGTTGCTGATGCTCGTTCAGGTAAACCACAGAATATTTCGTATTGGACGGGACGTAATGCCGAAGTTTATCAATGGTCTTATACCACAGATGGGCGTATGTCTGTTGCTAATTCGATAGGTATAGGTCTTGCTGATGTTGGTGACCAAGGACGTTATCCATTGGTTTCGTTTGGTAAAGGTATTGCAATTGGTGACAATGATACTGGTATTAAATGGGTTCGTGACGGCGTTATTGATTTGATTGCTAACGGGGTTTCGACCGGTACAATAAACAGTACTGGTATTAACAGCACTAAGAAATTGATGGTCGGTTATAGCCGCGATTCTGGTACTACTTGGGATTACCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACTGCGCGCACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGCGATGGACAGACTCATATCGGTTATAGCAGCAATGCCAAGATGTATCACTATTTCCGTGGTACAGGTCGTATGTCCGTTAGTATGGGCGATGGACTTCTTGTTGAGCCCGGCATTTTAGATATTAAAACCGGTTCAAATTCGCTAAATTTGCGTGCTGATGGTACCATCGCTTCTGTTCAAACGTTAAAACTTAATAACGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTCTAGTTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGATGGCACTAAGCAAATAATGTGGGAAGGCGGTACTCGTGCAGGTCAGAACAAAAGTTATGTGACCGTGAAAGCATGGGGTAACTCATTTAATGCTACTGGTGATAAAGCTCGAGAAACCGTATTTGAGGTTTCTGATGGCCAAGGTTATTATTTCTATTCTCAACGCGTAGCTCCGACCGGTTCTGAAACTACAGGCCCTGTTGTAACCCAGTTCAATGGACAAGTTAATGCTAGAGGAAGTATTATTACTGACGGAAGTTTTAAAGTTAATGGATTAAGCACTTTAGTCGGTAATGTTACTATGTCTAATGGTTTGTTTGTCCAAGGTGGTTCTTCTATTACTGGACAGGTAAAAATTGGTGGAACGGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGTGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGATAAGCTTTATATTATTCCAACTCCAAAGAATGTTGGTGAATCAGGTGGTATTTCTAATTTACGTCCGTTCTATATTGCATTAAGTAACGGTAAAGTTTCTATGGATCATGACGTAGATATAGGCGGCGGTAGATTTAAAGTAGAAGCGGCTGGAACTACGGCTGGTCAACGCATAACAGTAAATATGGCATCAGATGCTATTAGAATAAATGCCCCAACACAAGAATCTTCTAACTTCATCCAAGGACGTAAAGAAGATGTTCCGAAATGGTATTTAGGTATTGGCGATGGCGGCAACGTCGTTCGTATGCACAGTTACACCTACTCCCATGGTATTGCATTAAACTCTGATACGGTTGATATAGCTAAACCTCTTAGAATAGGTTCAACCCAGATTGGTACTGATGGTAATATTACCGGTGGTTCTGGTAATTTTGCTAACTTGAATACAACAATAAATAACCTTAAGACAGATATTGTCTCAAGTTATCCTATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTATGCCATAATGGAAGGTCAAACATTTGATGCTGACTTGTATCCTAAGTTAGCTGCAGTGTATCCTTCCGGCGCTCTGCCTGATATGCGTGGTCAAACTATCAAGGGTAAACCATCTGGGCGTGCTGTATTGAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCATCAAGCACAGATTTGGGTACTAAGACCACTTCTAGTTTTGATTACGGTAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGTAATACCACCGGCAACCATAACCATACGGTAAGTGGAACTACCAGTTCAGCCGGTGCTCACCAACACGCGCGTTCAGGTCCTCAGGTCACTGCTGCATGGGCAAACGATTTGTTTAGAGACGGGGTTACTACGATAGGTGCAAACTCATATGCTAAAATTAACTCAGGTATCACTGGTTCGACTTTAGCAACTAAGGTCGGTAAAACATCAAATGACGGTGCCCACACCCATAGTTGGTCAGGAACTACTAGCTCTACGGGTAACCATGCTCATACGGTAGGTATTGGTGCTCATACCCATTCGGTAGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTGCAATTGGTTCCCATGGACATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACAGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Tertiary structure

PDB ID
a8be405be4804f65c6c18a238b586c877d9422afe8df6fd3be9e71df1824ceff
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2493
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Still something new to discover - new insights into E. coli phage diversity and taxonomy Korf,I.H.E., Adriaennsens,E., Dreiseikelmann,B., Kropinski,A., Nimtz,M., Meier-Kolthoff,J.P., Rohde,M., van Raaij,M. and Wittmann,J. 2019-05-17 — GenBank