Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_012021978.1 [GenBank]
- Protein name
- putative receptor binding tail protein
- RBP type
-
TSPTSP
- Protein sequence
-
MSFFAGKFSDGKTVLSLNAANGGDTGEHYSPNTNSIFHSDMPFVLVDGTYESGLGDAGNGFFVCQMPADIINIKSNDPGRVILTAIEINGTHRAFLNGTQSKVGQTIVATQADPFRSFASVSQTSGFAFGNSLASGTYNYNPSIGHEESISRNGTGGTTLHSTYHGIVRPGAEAPVGITVAKAFAQLGFPTNSSTVPIDGNNQYYWDPGWMSPLGSAHRGHDWFYVCSSNIRGYGGVRQGLPGNVNTMYHDGGNRFVCRGSTTNLANQSGDSTILQDWYNITPTKVIWYVLNLRYSNGNMGISGNPFTGSDILISPSNFTIKGVSLPNTGYKFINQNAFGNLGYRPDMEYVGNNAAYTGAFGDTTARCELVGSSNGSLWSPVDYGGAKSQISIYKFGAGKQWYVNSSNNTIGNEHGVVWGPSSVPLRLFSGNVGSSYMGDDITPYYPGTGDRYVALSTIGLGIPGGNATVILTTEVISGNLNCAGVPANTWNNGVFQVQGRRAYSYSNGDAIFHQILTLPVGYLVPFHTTSAFRYTPNNALSRNSFIYTVKNLGNGNVELGVVMHVSLGSAVFLPRLRVTVQRLT
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 585 AA molecular weight: 62518,74990 Da isoelectric point: 7,68750 aromaticity: 0,11453 hydropathy: -0,18376
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage JLBYU43 [NCBI] |
2894751 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_012021978.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_105512
[NCBI]
CDS location
range 107488 -> 109245
strand -
strand -
CDS
ATGAGTTTTTTCGCAGGAAAATTTAGTGATGGTAAAACTGTATTATCTCTAAACGCTGCTAATGGTGGTGATACTGGTGAGCACTATTCTCCAAATACTAATAGTATCTTCCACTCCGATATGCCTTTCGTCCTAGTTGATGGTACTTATGAGTCTGGATTAGGTGATGCCGGTAATGGGTTTTTTGTATGTCAAATGCCCGCTGACATAATAAATATTAAATCTAACGATCCTGGTAGAGTTATACTAACTGCTATTGAGATAAATGGTACTCACAGAGCTTTTCTTAATGGTACTCAGAGTAAAGTTGGTCAAACTATAGTTGCCACTCAAGCAGATCCTTTTAGATCTTTTGCTAGCGTTTCCCAAACTAGTGGATTTGCATTTGGTAATAGCCTGGCATCTGGAACATATAACTATAACCCATCTATAGGGCATGAAGAATCTATCTCTAGAAATGGTACTGGGGGAACTACCCTACATAGTACTTATCATGGTATAGTTAGGCCAGGTGCAGAAGCTCCAGTAGGTATTACTGTTGCAAAAGCTTTTGCACAGTTGGGTTTTCCTACTAATAGTAGTACAGTACCTATAGATGGTAATAACCAATATTACTGGGACCCGGGATGGATGTCTCCTTTAGGATCAGCACACAGAGGACACGATTGGTTCTATGTTTGTAGCTCTAACATACGTGGGTATGGCGGGGTAAGACAAGGTCTTCCTGGCAATGTAAATACTATGTACCACGATGGGGGTAACAGATTTGTTTGTAGGGGTTCTACAACTAATTTAGCTAATCAATCTGGTGATTCTACAATACTACAGGATTGGTATAACATAACTCCTACTAAGGTTATTTGGTATGTACTTAATCTGAGGTATTCTAATGGTAATATGGGTATCTCTGGTAATCCTTTTACTGGTTCAGATATTCTTATCTCACCCTCTAATTTTACTATAAAAGGGGTTAGTCTTCCTAATACTGGGTATAAGTTTATTAACCAGAATGCTTTTGGTAACTTAGGTTATAGGCCAGATATGGAATACGTCGGAAATAACGCAGCGTACACTGGAGCCTTTGGAGATACCACCGCAAGGTGCGAACTTGTAGGTTCTAGTAACGGGAGTTTATGGTCTCCTGTAGACTATGGAGGGGCTAAGTCTCAAATTAGTATTTACAAATTCGGAGCTGGTAAGCAATGGTACGTAAACTCAAGTAATAATACTATTGGTAACGAACATGGTGTTGTTTGGGGACCTTCTTCAGTTCCTCTGAGACTTTTTAGTGGAAATGTTGGTAGTTCTTACATGGGAGATGATATTACTCCTTACTACCCCGGAACTGGAGATAGATACGTGGCTCTATCTACTATTGGACTAGGAATTCCAGGAGGTAATGCTACTGTTATTCTTACTACTGAAGTTATATCTGGTAATCTTAACTGTGCAGGTGTTCCGGCTAATACATGGAATAACGGTGTATTTCAGGTGCAGGGAAGAAGGGCTTATAGCTATAGTAATGGAGATGCAATATTCCACCAGATTTTAACGCTACCTGTAGGTTACTTAGTACCATTTCATACTACATCTGCATTTAGATACACACCTAATAACGCACTAAGTAGGAATAGTTTCATATATACAGTTAAAAATCTAGGAAATGGGAATGTAGAGTTAGGGGTAGTTATGCACGTAAGTTTAGGTAGTGCGGTTTTCCTACCTAGATTAAGAGTAACAGTTCAACGCCTTACCTAA
Tertiary structure
PDB ID
980807b89574ae6a8ea0ac62095d192d1306fe9e97b1262fdefa381dfea7f34f
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50