Protein
View in Explore- Genbank accession
- XNS38997.1 [GenBank]
- Protein name
- tail protein
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MRIQHNIDNVFQMIEGHRKCLDNNTGITNTSTQNKLVNPDGLIAAGWAGNKINNDWAMHESQAVLILGYIEAYRASKSDFYLDRAKDAWEAYNSHLLGAYAVESKMQRLSHYPLSTDGVPSHGGFKDVVVSFTNGRGKIPAGSPTWGEYLDKAFQAYNGVLGRNTVDSDVYGGTDDNPDWTTSGLSWWVEWYIAWDGNRYWANGSIADSGHTSVEFGTIQLQDKGVTGNHKVTYCVRLPQERGGSVIPAGSPVIVNPINVVADNQAPELDGEEMWCDACYQLYTLTGEEKYHTAFKQSYNKLLNFSDINAYDKLFRKTTLIKAPFTDGTCLVAGTVPVTSRDSDGYINFRMNARQPCEIIQKGTTYKIGRDAEIVMNFGGEGVLFQPHFILNDGNNNKKQYRIGVPFGGAEVTEIVAKVTDFVEVVGKDGNPYLLPKEENIAVSGGASVSMQYDTDIYNHSDNFTRCNIARGKVTFNFGREISLNSVTYRSDDEMVMVKFLDKDRWLWYADLYATNGQWITETLTLGDFKLDPTQPHHTEEEIKPFFANPKGLTSVDFSLSDRQIGNGLFDLYCVNTLPQFYVADRDAYLIWFSVWMASKTESTAKVGDCYVRNYKQGAYRHTPGVFPAGKVIDKENYLLEERPNWPYPGMQYPAVYCMGAENIDRHRLSNTIGFLYDAQVWYNNTFKTEGPVASRYVWQRGNEGLTGWWEMVDNSKLQSRSFVAACRTIYELKKHKEPVDERLFLFCQKWAWFLNRFQSSHSGNLPTDFNTSGGYSYQDRGDRMWVVGEWLAGCCWLGLCGYSETIPQIDIVVEACVKLLQKHHFINGDNVLNGCWAVYDPVGYHSGEILRGLGLYAQYRGLYL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 865 AA molecular weight: 97776,53390 Da isoelectric point: 5,57331 aromaticity: 0,12948 hydropathy: -0,41156
Domains
Domains [InterPro]
IPR008928
33–97
33–97
1
865
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XNS38997.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP925834
[NCBI]
CDS location
range 102801 -> 105398
strand -
strand -
CDS
ATGCGTATTCAACATAACATTGATAACGTATTTCAGATGATTGAGGGGCACAGGAAGTGCCTCGATAACAACACAGGTATTACCAACACCTCTACACAAAATAAGCTAGTAAACCCTGATGGTCTTATAGCTGCAGGGTGGGCAGGTAATAAGATAAATAATGATTGGGCAATGCATGAGTCCCAAGCTGTGTTGATTCTGGGATACATTGAAGCATACAGGGCATCGAAAAGCGATTTCTATCTGGATAGGGCAAAAGATGCTTGGGAAGCTTACAATAGCCATCTTCTGGGTGCATATGCAGTAGAAAGTAAAATGCAAAGATTGTCCCACTACCCCCTATCCACAGACGGGGTTCCATCACATGGTGGGTTTAAAGATGTAGTGGTGTCTTTTACCAACGGTAGAGGAAAAATCCCAGCTGGATCTCCGACATGGGGTGAATACCTTGACAAGGCATTCCAAGCGTATAACGGTGTGTTAGGAAGAAACACTGTAGACTCTGATGTTTACGGTGGCACAGATGATAACCCAGATTGGACAACATCCGGATTAAGTTGGTGGGTTGAGTGGTATATAGCATGGGATGGTAATCGCTATTGGGCTAACGGTAGCATAGCTGATAGTGGTCATACGTCTGTAGAGTTTGGCACAATCCAATTACAAGATAAGGGTGTTACAGGCAACCACAAAGTGACCTATTGTGTAAGATTACCTCAAGAGCGGGGTGGATCGGTGATCCCTGCCGGATCCCCTGTAATTGTGAATCCTATAAACGTGGTTGCAGACAATCAAGCCCCAGAGTTGGACGGGGAAGAAATGTGGTGTGACGCTTGTTATCAACTCTACACCTTGACAGGTGAGGAAAAGTATCACACCGCGTTTAAACAGTCTTACAACAAGTTGCTTAATTTCAGTGATATAAACGCTTACGACAAACTGTTTAGAAAGACCACGTTGATTAAGGCACCATTTACAGATGGTACTTGTCTTGTTGCAGGAACAGTTCCTGTCACGAGCAGAGACAGTGACGGGTATATCAATTTTAGAATGAACGCACGTCAGCCTTGCGAAATAATTCAAAAAGGTACCACCTACAAAATAGGCAGAGATGCTGAAATTGTCATGAATTTCGGAGGGGAGGGGGTTCTGTTCCAGCCACATTTCATCCTTAATGATGGCAACAATAACAAAAAACAGTACAGGATAGGGGTTCCTTTTGGAGGGGCAGAGGTAACAGAAATAGTTGCCAAGGTTACTGATTTCGTAGAGGTAGTTGGTAAAGACGGTAATCCGTACCTCTTACCTAAAGAGGAAAACATTGCCGTGAGCGGTGGTGCCAGTGTTAGTATGCAGTACGATACTGACATTTACAACCACTCTGACAACTTCACCCGTTGTAATATAGCAAGAGGCAAAGTAACTTTCAATTTTGGAAGAGAGATTTCTTTAAACTCAGTAACTTATCGATCAGATGATGAGATGGTAATGGTCAAATTTCTTGACAAAGATAGGTGGTTATGGTATGCTGATCTATATGCCACTAATGGACAATGGATAACAGAAACTCTTACTCTAGGAGATTTCAAACTAGATCCGACACAACCTCATCACACTGAAGAAGAGATTAAACCTTTCTTTGCTAATCCTAAGGGACTCACCTCTGTAGATTTCAGCCTAAGCGACAGACAGATAGGTAATGGCTTGTTTGATCTATATTGCGTCAACACACTGCCGCAATTCTATGTTGCAGATAGGGATGCTTATCTAATCTGGTTTAGCGTATGGATGGCAAGCAAGACAGAATCAACCGCTAAGGTTGGTGATTGCTATGTCAGAAACTACAAGCAAGGTGCATACAGGCACACACCAGGTGTGTTCCCTGCCGGAAAGGTGATAGATAAGGAAAACTATCTCTTAGAGGAAAGGCCAAATTGGCCCTACCCAGGTATGCAATACCCAGCAGTCTACTGCATGGGTGCAGAAAACATAGATCGCCATAGATTGTCAAATACAATAGGCTTTCTGTATGACGCTCAAGTCTGGTATAATAATACATTTAAGACAGAGGGTCCAGTTGCCTCACGTTATGTATGGCAAAGAGGTAATGAAGGGTTGACTGGTTGGTGGGAGATGGTAGATAACTCTAAACTCCAGTCAAGATCTTTTGTTGCTGCGTGCCGCACAATCTATGAGCTCAAGAAACATAAAGAACCTGTTGATGAAAGATTATTCCTGTTCTGCCAGAAATGGGCATGGTTTCTCAACAGATTCCAGTCATCTCATTCAGGAAATCTACCTACAGACTTTAACACCTCTGGGGGATATTCTTATCAAGATAGAGGCGACAGGATGTGGGTGGTAGGTGAATGGCTTGCAGGTTGCTGCTGGCTAGGTCTGTGCGGGTATTCAGAGACAATACCCCAAATAGATATTGTTGTAGAGGCCTGTGTGAAGCTACTGCAAAAGCACCACTTCATTAATGGGGATAATGTTTTAAACGGCTGCTGGGCAGTTTATGATCCGGTTGGCTATCACTCTGGCGAAATCCTTCGCGGTCTGGGCCTTTATGCTCAATACCGTGGATTGTACCTTTAA
Tertiary structure
PDB ID
4ef252cf2423ef5643c0226535a3f78de847350a0c10145c3d2b5dc3fc73bf5f
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50