Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_009887343.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTSPTSPTF
- Protein sequence
-
MGYFQMTRNVEELFGGVVTAPHQIPFTYKSNVGGETFLSLPFYPVTGVVTINGGMQVPLDNFEIEGNTLNLGRALSKGDVVYCLFDKILSPEDTAKGIRIYKFQAVGGETEFTPDFTSYGVQSLYIGGEYKTPEIEYSYDSTTGKVSLQTALTAGVWVVAEMSVKQPNISPAFDRSIQEIARSANVKDSEVIVSTDTISLLDGKKVVYDIATQTSYGLPTIPDGSVISSVSAGKLNYNPGDVQVDLLPLEDSFINVINTLGRNDGAKYIGECHSVADLRNTEPTMDGQRIILKQHTAGTLLGGGVFRALIDGTGKTDNNGTVIKTVGGAAWLRVNADRVNPFMFGALGGSNDDTIPVQSCVDSGKATQLTDAHYVSNIQLKYNTSSIYGSGLHYSRLHQLPSATGNCITIKDTCSLIVLDAFGVYGTGAQQGTSFTAGTTGIYVETPSGLSADYPFHTTADPRRDLCISKVHIAGFDEYGLNIDSGNFSVTTDSLLVNHINQVGVRCATTDWTWTNIQVNTCGKQCLVLDGCGNGRIIGGKFIWANWQPYGTVGQFPGITINNSQNMVINGIEVQDCGGNGIEISDSYSISMNGLNTNRNGINANNTFYNIVFNKSDAVINGFVGLNYAANSGSGANSSAGNFQFLSNDCSVTINGVVETGYMGINFIGDNNIINPTNSDLSINGLVNYSKTGLQTMNETPTFDGVSTTPVYVSVPSSVGQVNGLRLSQANKDKLLYSRTAGPEGITMAAVVVPTISGAEVFNFMAIGSGFSDTSNSLHLQLVIDASGKQTIALLLGGDGTTQILSGDLPNDLKLQSGVPYHIAIGAKPGYFWWSILNIQTGKRIRRSFRGAYLAVPFNSIFGLTSPLTFFSDSNAGGDACSGVGAKVYVGMFSSENDYVASRYYNLINPVDPTKLISYRILDSSI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 926 AA molecular weight: 98838,65960 Da isoelectric point: 4,96048 aromaticity: 0,09179 hydropathy: -0,04536
Domains
Domains [InterPro]
G3DSA:3.30.2020.50
161–250
161–250
1
926
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Salmonella phage rabagast [NCBI] |
2713314 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009887343.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_049499.1
[NCBI]
CDS location
range 7935 -> 10715
strand +
strand +
CDS
ATGGGGTATTTTCAAATGACCAGAAATGTAGAAGAATTATTCGGCGGCGTAGTCACAGCTCCCCACCAGATTCCTTTCACGTATAAATCAAATGTCGGTGGAGAAACTTTCCTTTCCTTGCCGTTCTATCCTGTCACTGGCGTAGTCACAATCAACGGTGGTATGCAAGTTCCCTTAGACAACTTTGAAATCGAAGGAAATACGTTGAATCTCGGGCGCGCATTGTCCAAAGGCGATGTTGTGTATTGCTTATTCGATAAAATTCTTTCGCCAGAAGATACAGCCAAAGGTATCCGCATATACAAATTTCAGGCCGTAGGAGGTGAAACCGAGTTCACTCCTGATTTCACATCTTATGGAGTCCAATCTCTTTATATCGGTGGCGAGTACAAAACCCCCGAAATTGAATATTCCTATGACAGCACGACAGGAAAAGTATCTTTGCAAACTGCACTGACTGCAGGCGTTTGGGTAGTCGCTGAAATGTCTGTTAAACAACCGAATATCAGTCCGGCGTTTGACCGAAGTATTCAAGAAATCGCCCGTTCTGCTAATGTAAAAGACTCTGAAGTCATCGTTAGTACGGACACCATATCTTTGTTGGATGGGAAGAAAGTTGTTTATGATATAGCGACGCAAACCAGTTATGGTTTACCAACCATTCCTGATGGTTCTGTCATTTCTTCTGTATCTGCTGGGAAATTGAATTACAACCCAGGTGATGTGCAGGTTGATTTGTTGCCTTTAGAAGATTCATTTATTAATGTGATAAACACTCTGGGGCGCAATGATGGTGCCAAGTATATTGGAGAATGCCATTCTGTTGCTGATCTCAGGAATACTGAACCCACTATGGATGGACAACGCATTATTCTTAAGCAACACACTGCGGGTACTCTTCTTGGTGGAGGGGTATTCCGTGCGTTAATTGATGGTACAGGAAAGACTGATAATAACGGTACTGTGATCAAAACTGTTGGCGGCGCGGCATGGTTACGTGTTAATGCTGATAGAGTTAACCCATTCATGTTTGGTGCTTTGGGTGGTTCTAATGATGATACTATTCCAGTACAATCTTGTGTGGATAGTGGTAAGGCCACACAATTAACTGATGCACATTACGTTAGCAATATCCAGTTAAAATATAATACGTCGTCTATTTATGGGTCTGGATTACATTACTCAAGGTTGCATCAGTTGCCTTCTGCTACTGGGAATTGTATTACCATAAAAGATACATGCTCCCTTATTGTATTAGACGCCTTTGGGGTATATGGCACAGGTGCACAACAAGGCACGTCATTTACTGCGGGCACAACAGGTATCTATGTAGAAACTCCTTCAGGTCTCTCAGCCGATTATCCGTTCCACACTACCGCAGACCCAAGACGCGACTTGTGTATTTCTAAAGTCCATATAGCAGGTTTTGATGAATATGGGTTAAATATTGATAGTGGTAACTTTAGTGTTACTACAGATTCTCTTTTAGTCAACCACATCAATCAGGTGGGTGTCCGTTGTGCTACTACTGATTGGACTTGGACAAATATCCAGGTTAATACCTGCGGTAAACAATGTCTGGTTCTTGATGGTTGTGGTAATGGTCGTATTATTGGCGGTAAATTCATTTGGGCTAACTGGCAACCTTATGGTACAGTAGGACAGTTCCCAGGCATTACTATTAATAACAGCCAGAATATGGTTATTAATGGTATTGAGGTACAAGATTGTGGCGGGAATGGCATTGAGATTAGCGATTCATATTCAATTTCCATGAACGGATTGAACACCAATCGTAACGGCATCAATGCTAACAACACTTTCTACAACATCGTATTTAACAAAAGTGATGCAGTTATCAACGGATTCGTAGGACTCAATTATGCCGCGAATAGTGGTTCAGGTGCTAACTCTAGTGCAGGCAATTTTCAGTTCCTGTCTAATGATTGTAGTGTCACCATTAATGGTGTGGTTGAGACTGGTTATATGGGCATTAACTTTATTGGTGATAACAATATTATCAACCCCACCAATTCCGACCTGAGCATTAACGGATTGGTTAATTATTCCAAGACTGGTTTGCAAACCATGAACGAGACCCCTACATTTGATGGTGTTAGCACTACACCTGTTTATGTAAGTGTCCCATCTTCTGTAGGGCAAGTAAATGGTCTGAGACTATCACAAGCCAACAAAGATAAATTACTGTATTCAAGAACAGCAGGTCCAGAAGGTATTACCATGGCTGCTGTTGTAGTACCCACCATATCTGGAGCTGAAGTATTTAACTTCATGGCCATTGGTTCAGGGTTTAGTGATACATCCAACAGTCTTCATCTTCAATTAGTTATAGACGCTTCTGGAAAACAAACAATTGCTTTGCTATTGGGGGGCGATGGTACAACCCAAATTTTATCTGGGGATTTACCTAACGACCTTAAACTACAAAGTGGTGTACCATATCATATAGCTATTGGTGCTAAACCAGGATATTTCTGGTGGAGTATTCTTAATATTCAGACGGGTAAGAGAATCAGACGGTCATTCCGAGGCGCTTATTTAGCCGTACCATTTAATTCTATATTCGGATTAACTTCCCCATTAACGTTCTTCTCAGATAGCAATGCTGGTGGGGATGCTTGTTCTGGGGTGGGCGCTAAAGTGTATGTTGGTATGTTCTCTTCCGAGAACGATTATGTAGCCTCACGATACTACAATCTGATTAATCCGGTAGACCCTACTAAGTTAATTAGTTACCGTATATTGGATTCTTCTATTTAA
Tertiary structure
PDB ID
09bea8130db9566f273837910ddf303a555b75e845b27644e5e0bae6a20b6ba1
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50