Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_009881459.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTSPTFTF
- Protein sequence
-
MALDPNINRIKHLRSKTAGAVPSPTLLDEGELAINLVDRTIFSKNGANTVELGFGKGGTVAGPINVTGGNAVSAAQFNGALNGNAATASRLLTGRKINDVVFDGTKDITIEDSTKLYKTDVLTAAGNSRVIRDAATIRAEGTAKGAVVIHLPKKANSVSTMMKLCIQGFDYVSGRATQSNWSVDISGYNYTGAAWHSYQAISTGGPAPFDTVRWGQAGDHQVIILGEAGASPSSWSYYNISIEKIYLTANNTASYDDPNDPIYMAIEADISNYTINATMPLEGVAMAKRLEIGRTLTFTGDARGSLLFDGTANVSTALTINSATTGQAGLVKLNNTLTSTSVTEALTAAQGKALQDTKVNRSGDTISGRLVVTQGITTPSISNDVTVPISFLGPSVNNSNTGGIRVRNLEVNNQYGTSTRAFGIFSKEGIVAGDSAPYASLAAIGVGNNIPFKVNDTNVYTTYGFVPFLGGNVQSSSGYRTVTSIGVYRPGPDWADSGMYIATGSSDGASTEAFLFKGGRTIENTNGPIILKGNADSATKLQTPRTINGVAFDGTSNIRIQQLAEGIPAGADLNTYLTEGFYYCDTDAVAQTIKNGPFTGAAFCLLVERTAGVKQTFTIYSPGSSRTWIRNIYIYGGTTGAWREVAYTDAPTFTGAGRFIDNLTVNGITNTTGLNNSGDLRSSGSSYLGNQNELGTIGTAGPVYIDFHSGTSNIDYDARIMSSGGTTAIGNGALSYIAASHSFNGSIGAGIISASSISVSTGLGISNTSNTVLAGLSLYGGAQSGKPTYGITFTGTSNAGTGKHGDLTNATWAVYLTCAASSVEKRGWIFQRSDNNENVASISTAGVLSTSGSIQTLNDNTMINVGNDKDLALVKKRGSKAFIGVGADTPFSVSKSNANWVDPTHTFTELFTVSSAGVANAVGGFTGTFSGTFNGTISGTLTGSLNGNASTATTLQTARAIGITGSGASGSVQFDGTDNAIIPLTVATQATETNNTSIATTAFVQNVNVAETGASAYAVRLKTPRSFQITGGITTNAVAFDGQQNVVLTANAVDGSKVSGVVPEAIKAQTLAVTPQKNAKLVASWKGTILQSMTPTLTIVDANTLRVRLADDNPGNRLAVLRFNVKIGTVYHLAFSNTMLPINGTVTYVNTGLTWVEVDLNAPNHGLSGSGLGVNVMAITYSAYGCYFEGTISQIIGTTGPQDSQWAYVLKLNSPTTDATYNLSGSSQDAIWVADKNIWYLNPVQPVITAGAMISPDRLNFFAADTDSSARMRSNMVTAQIWDIV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1285 AA molecular weight: 133813,46570 Da isoelectric point: 6,14051 aromaticity: 0,07782 hydropathy: -0,04833
Domains
Domains [InterPro]
IPR054500
335–360
335–360
1
1285
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Acinetobacter phage KARL-1 [NCBI] |
2301662 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009881459.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_049441.1
[NCBI]
CDS location
range 23492 -> 27349
strand -
strand -
CDS
ATGGCATTAGATCCAAATATTAACAGAATTAAACATCTAAGATCTAAGACAGCAGGTGCAGTGCCAAGCCCTACTCTCTTGGACGAAGGCGAATTAGCCATTAACTTGGTTGATCGTACAATATTTTCAAAAAATGGCGCAAACACAGTTGAACTTGGGTTCGGTAAAGGCGGTACAGTAGCGGGGCCAATCAACGTAACAGGCGGTAATGCTGTATCAGCTGCACAATTCAATGGTGCATTAAATGGTAATGCTGCAACTGCATCAAGACTCCTTACTGGGAGAAAAATTAATGATGTAGTTTTTGATGGTACTAAAGATATTACTATCGAAGATTCTACTAAATTATACAAAACCGATGTGCTGACCGCTGCTGGTAATTCTCGTGTTATTCGTGATGCAGCAACAATTCGTGCAGAAGGTACTGCTAAAGGAGCAGTAGTAATTCATTTGCCGAAAAAGGCAAATTCAGTTAGCACAATGATGAAATTGTGCATTCAAGGATTTGATTATGTTTCTGGGCGAGCTACTCAAAGTAACTGGTCTGTAGATATTAGTGGATATAATTACACTGGTGCAGCTTGGCACTCATACCAAGCAATTTCAACAGGCGGCCCGGCGCCATTCGATACTGTTCGTTGGGGACAAGCTGGCGATCACCAAGTTATTATTTTAGGCGAAGCCGGTGCATCACCTTCTTCATGGTCATATTACAATATTAGTATTGAGAAAATTTATTTAACTGCTAATAATACAGCATCATATGATGACCCTAATGACCCGATTTATATGGCAATTGAAGCCGATATATCTAACTATACAATAAATGCCACTATGCCACTTGAAGGTGTAGCAATGGCTAAACGTTTAGAAATAGGCCGTACATTAACCTTCACCGGTGACGCGAGAGGTTCATTGTTATTTGATGGCACGGCAAACGTTTCTACTGCATTAACAATTAATTCTGCAACTACAGGCCAAGCAGGTTTAGTTAAATTAAACAATACATTAACTTCTACATCTGTCACAGAAGCGTTAACTGCTGCTCAAGGCAAAGCCCTTCAAGACACTAAAGTTAATAGAAGTGGAGATACCATTTCAGGACGTTTAGTCGTTACTCAAGGTATTACTACTCCTAGCATTAGCAATGATGTCACTGTACCAATTAGCTTTTTAGGGCCTTCAGTAAATAATTCAAACACAGGTGGAATACGGGTAAGAAATTTAGAAGTAAATAACCAATATGGCACATCGACACGTGCATTTGGGATTTTTTCTAAAGAAGGTATAGTCGCAGGCGATTCCGCACCGTATGCTTCTTTAGCAGCTATAGGCGTTGGCAACAATATCCCATTTAAAGTAAACGACACCAATGTTTATACAACATATGGCTTTGTGCCTTTCCTTGGAGGTAATGTACAATCGTCTTCAGGATACAGAACAGTTACATCTATCGGTGTATATCGCCCAGGCCCAGATTGGGCTGATTCTGGAATGTACATAGCTACAGGATCTTCAGATGGCGCATCAACTGAAGCGTTTTTATTTAAAGGCGGTCGAACTATTGAAAACACAAATGGGCCTATTATACTTAAAGGTAATGCAGATTCTGCTACTAAACTCCAAACACCTAGAACTATCAATGGTGTTGCTTTTGATGGAACTAGTAACATTCGAATACAGCAATTAGCTGAAGGTATTCCAGCTGGTGCGGATTTGAATACATACTTAACTGAAGGTTTTTACTACTGCGACACAGACGCAGTGGCTCAAACGATCAAAAATGGACCTTTTACTGGCGCTGCATTCTGCTTATTGGTAGAAAGAACTGCTGGCGTTAAACAAACATTTACGATCTATAGTCCTGGTTCTAGTAGAACATGGATCCGTAATATCTACATCTACGGCGGTACTACAGGAGCTTGGAGAGAAGTGGCATATACTGATGCACCAACTTTCACAGGAGCCGGAAGATTTATCGACAATTTAACCGTAAATGGAATTACAAACACAACGGGATTAAATAATTCTGGCGATTTGAGAAGTTCCGGATCTAGTTATTTAGGTAATCAAAATGAATTAGGTACAATTGGTACAGCTGGCCCAGTTTATATTGATTTTCATTCTGGCACTAGTAATATAGATTATGATGCAAGAATTATGTCTTCTGGCGGAACTACTGCTATAGGAAATGGAGCATTGTCATATATTGCAGCTTCTCATTCATTTAATGGCTCAATAGGCGCAGGAATTATTTCTGCTAGTAGTATTAGTGTATCTACTGGATTAGGTATTTCTAATACTTCTAATACAGTTTTAGCGGGTTTAAGTTTATATGGTGGCGCTCAATCTGGCAAACCAACTTACGGCATTACTTTCACTGGTACTAGTAATGCAGGAACTGGTAAACATGGTGATTTGACTAATGCTACGTGGGCAGTATATTTAACTTGTGCCGCTAGTAGTGTTGAAAAACGTGGATGGATTTTCCAACGAAGTGACAACAACGAAAACGTTGCATCTATTTCTACTGCTGGTGTATTGTCTACTAGTGGGAGCATCCAAACATTAAACGACAATACAATGATTAATGTCGGCAATGATAAAGATCTTGCGCTTGTCAAGAAAAGGGGTTCTAAAGCATTTATCGGCGTCGGGGCAGATACTCCATTTAGTGTATCTAAATCTAATGCAAATTGGGTTGATCCAACACATACATTTACAGAATTGTTTACAGTAAGTTCTGCAGGTGTCGCTAATGCAGTTGGAGGATTCACCGGTACGTTCAGTGGTACATTCAATGGTACTATTAGCGGAACACTTACTGGTTCGCTTAATGGTAATGCATCTACTGCAACTACGTTACAAACCGCTCGCGCAATTGGTATTACAGGTTCAGGTGCATCAGGTTCAGTGCAATTTGATGGTACAGACAACGCTATCATCCCATTAACTGTTGCGACACAAGCCACTGAAACTAACAACACGTCAATTGCCACTACAGCATTTGTTCAAAATGTTAATGTTGCTGAAACTGGTGCATCTGCCTATGCAGTACGTTTGAAAACACCACGATCTTTCCAAATTACTGGTGGCATCACTACTAATGCTGTTGCATTTGATGGGCAGCAAAATGTAGTATTGACTGCAAACGCAGTTGATGGTTCTAAAGTATCTGGCGTGGTTCCTGAGGCAATTAAAGCGCAAACTCTTGCAGTGACACCGCAAAAAAATGCGAAACTCGTTGCATCATGGAAGGGTACCATATTGCAATCTATGACGCCTACACTAACTATTGTTGATGCAAATACACTTCGTGTTAGATTAGCAGACGATAATCCGGGTAACAGATTGGCAGTATTGAGATTTAATGTGAAAATCGGCACAGTGTATCATCTCGCATTTAGTAATACTATGTTACCAATCAATGGCACAGTAACCTATGTCAATACCGGCTTAACATGGGTTGAAGTTGATCTTAATGCACCTAACCATGGGCTATCTGGCAGTGGGCTCGGAGTTAATGTTATGGCGATAACATATTCTGCGTATGGTTGTTATTTTGAGGGCACAATTAGCCAAATCATTGGCACAACAGGGCCACAAGACAGTCAATGGGCATATGTATTGAAACTCAATTCTCCGACAACTGATGCTACATATAATCTTAGCGGATCTTCGCAAGATGCAATATGGGTTGCAGATAAAAATATTTGGTATCTTAATCCTGTGCAGCCGGTGATAACTGCAGGCGCTATGATTTCTCCTGATAGATTGAATTTCTTCGCTGCCGATACAGATTCTTCAGCAAGAATGCGTTCTAATATGGTAACTGCACAAATCTGGGACATTGTATAA
Tertiary structure
PDB ID
97ffa95122bcddf29581014b7a60f359128b119f58a3dd5e8739209695a795af
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50