Protein
View in Explore- Genbank accession
- UQS94320.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber distal subunit
- RBP type
-
TSPTSPTFTF
- Protein sequence
-
MALDPNINRIKHLRSSTAGAVPAASLLDEGEIAVNLVDRTIFSKNGANVVELGFGKGGTVTGPINVTGGNAVTAAQFNGALNGNAATASRLLTGRKINDVVFDGTRDITIEDSTKLYKENVLTASGDSRVIRDVATIRAMGTVNGALIIHLPKAARNASTMMKIIVQGFDYSSGLSSQGPWSVNLTGYNYSGPTWHSYQAVSTGSKAPFEHVRYGQAADHNVIILGGTSGDASIPTSSWTYYNISIEKIYLTAGNTTLYNNPEDPIYLTIEDSLTPYTLQVTLPLEGVNKAESLRTKRTFTFTGDATGSLAFDGTANVSTALTINSATTGQAGLVKLNNTLTSTSVTEALTAAQGKALQDTKVNRSGDTISGRLVVTQGITTPSISNDVTVPISFLGPSVNNSNAGGIRVRNLEVNNQYGVATRAFGIFSKDGLVAGDTTAYASLAAIGTGNNIPFKVNDTNVGTTYGFVPFIGGNVQSSSGYRTVTSIGVYRPGPNWADSGMYIATGSSDGASTEAFLFKGGRTISNTNGPVYLDGIADFSRNIDASSGMLASDGTSGWRKLGRATLGRSGRTMSLKLIGGTGFNAYNPQQAGTTIITLKSGNSNPATITMTVNIEQKNNLLSNGGWLPNAGPSACFVKVGTSNDYDIYVHTSGYLYASLVVTTGYQTSWVQDFQSAAVGAKPDGAVDAYVYNTLDSLDPEVFGAITFKNSVATPAKNTEYTKLSMIPPTHTGGTWLHRLNDTDSIAEYIIKYGPTPVLRMDSSGVVYTSTLRNSGATHLGNQTELGTIGTASQVYIDFHSGASNIDYDARIMSSGGTTAIGNGALSYIAASHAFNGRVDGGLISASTGLGISNTSNTVLAGLSLYGGAQSGKPNYGITFAGTGNAGTGKHGDLDNASWAVYLTCATTGVEKRGWIFQRSDNNANVASISTAGVLSTNGSIQTLSDNTMINVGNNNDLALVKKAGGAGFVGVGSNTGFAVKRSNATTVDPSNTFTDLLWVTTAGVVQSAGGFTGTFSGTFNGTISGTLTGSLNGNASTATTLQTARAIGITGSGASGSVSFDGSGNVNIPLSVATQATATNNTTIATTAFVQNVNVAETGASAYAVRLKTPRSFQITGGITTNAVSFDGQQNVTLTASNVDGSKVTGKVPAAAQADNATNAVLSQRTTSVDVNGQPGVRLAAMWSGTVYHNHSKSARYYSPTQIQIELGETAVVTDRINNMKVGNQLHVVFAGSTGWSNGMVTGTIDRLTTNVTSGSIDAIVSIPHSISPGNATSCRILAVTYSSIGCSFIGSVSSYAKASISTGDWSWLLQTSSSVVNPFISTATSGDIVDRNASLFPLGFIKDGNPTSMAATMLSSNICNFVVGDNNNDSPSHSGFVSVQIWDRA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1388 AA molecular weight: 143722,75330 Da isoelectric point: 6,99650 aromaticity: 0,07421 hydropathy: -0,07075
Domains
Domains [InterPro]
IPR054500
339–364
339–364
1
1388
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Acinetobacter phage AB-Navy71 [NCBI] |
2920929 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UQS94320.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OL770260
[NCBI]
CDS location
range 155666 -> 159832
strand +
strand +
CDS
ATGGCATTAGATCCAAATATTAACAGAATTAAACATCTAAGATCGAGCACTGCCGGTGCAGTGCCTGCAGCGTCTTTATTGGATGAAGGCGAAATAGCGGTAAACTTAGTTGATCGTACAATATTTTCAAAGAATGGTGCAAATGTAGTAGAACTTGGCTTTGGTAAAGGCGGTACTGTAACAGGCCCTATCAATGTTACAGGCGGTAATGCAGTCACAGCTGCGCAATTCAACGGCGCCTTAAATGGTAATGCTGCAACTGCATCAAGACTTCTTACAGGAAGAAAAATTAATGATGTAGTTTTTGATGGTACACGAGATATTACCATTGAAGATTCAACTAAACTTTATAAAGAAAATGTATTAACCGCATCAGGCGATTCTCGTGTTATCCGTGATGTTGCTACTATTAGAGCGATGGGTACAGTAAATGGTGCACTTATTATCCATTTACCTAAGGCTGCTCGTAATGCATCAACAATGATGAAAATTATTGTTCAAGGTTTTGACTATTCTTCTGGCCTCTCTTCTCAAGGACCATGGAGTGTGAACCTTACAGGATATAATTATTCTGGGCCAACTTGGCACTCGTATCAAGCTGTGTCTACCGGATCAAAGGCGCCATTTGAACATGTGAGATATGGGCAAGCGGCAGACCACAACGTAATAATTTTAGGTGGCACAAGCGGAGATGCTAGCATCCCTACATCATCTTGGACATATTACAATATATCAATTGAAAAAATTTATTTAACTGCAGGTAACACTACCCTTTATAACAATCCTGAAGATCCGATTTATCTCACCATTGAAGATTCATTGACTCCATATACCCTTCAAGTAACGCTACCGCTTGAAGGTGTTAATAAAGCAGAATCATTACGTACTAAACGTACATTCACTTTTACGGGCGACGCCACAGGTTCTTTAGCATTTGATGGCACGGCAAATGTTTCTACTGCATTAACAATTAATTCTGCAACTACAGGCCAAGCTGGTTTAGTTAAATTAAACAATACATTAACTTCTACATCTGTCACAGAAGCGTTAACTGCTGCTCAAGGCAAAGCCCTTCAAGACACTAAAGTCAATAGAAGTGGAGATACCATTTCAGGACGTTTAGTCGTTACTCAAGGTATTACTACTCCTAGCATTAGCAATGATGTCACTGTACCGATTAGCTTTTTAGGGCCTTCAGTAAATAATTCAAACGCAGGTGGAATACGAGTAAGAAATTTAGAAGTAAATAATCAATACGGCGTAGCGACACGTGCATTCGGGATTTTTTCTAAAGACGGCTTAGTTGCCGGAGACACTACTGCATATGCTTCTTTAGCAGCTATAGGCACCGGCAACAATATCCCATTTAAAGTAAATGACACTAATGTTGGGACAACATATGGATTTGTACCTTTCATTGGAGGTAATGTACAATCGTCTTCAGGATACAGAACAGTTACATCTATCGGTGTATATCGCCCAGGTCCAAATTGGGCTGATTCTGGAATGTACATAGCTACAGGATCTTCAGATGGTGCATCGACTGAAGCGTTTTTATTTAAAGGCGGTCGAACAATTTCTAATACAAATGGTCCAGTTTATCTTGATGGTATTGCCGACTTTTCAAGAAATATTGATGCGTCTTCTGGCATGCTTGCAAGTGATGGTACTAGTGGCTGGAGAAAGCTTGGGCGTGCAACGTTAGGTCGGTCTGGGCGCACAATGTCATTAAAACTCATTGGTGGCACTGGGTTTAATGCATATAACCCACAACAGGCTGGGACAACTATTATTACACTTAAGTCAGGTAATAGCAACCCGGCTACTATCACCATGACAGTTAATATAGAACAGAAAAATAACTTGTTGTCTAATGGCGGATGGTTACCTAATGCCGGACCTAGTGCATGTTTTGTCAAAGTTGGCACATCTAATGATTACGACATATATGTACATACTTCTGGGTACTTATACGCTTCATTGGTTGTTACTACAGGTTACCAAACCTCATGGGTACAGGATTTTCAATCTGCCGCAGTAGGAGCTAAACCGGATGGTGCAGTCGACGCATATGTGTACAACACATTAGATTCACTCGACCCTGAAGTGTTTGGCGCAATTACGTTTAAAAATTCTGTAGCGACACCTGCAAAAAATACAGAATACACAAAACTAAGCATGATACCTCCTACTCACACTGGTGGCACATGGCTTCATCGGTTGAATGACACGGATTCTATTGCAGAATACATCATCAAATATGGACCGACTCCGGTTCTACGTATGGATTCAAGTGGTGTAGTTTATACATCTACTTTACGAAATAGTGGTGCTACACATTTAGGTAATCAAACAGAATTAGGTACAATTGGTACTGCATCTCAAGTGTATATTGATTTCCATTCAGGCGCTAGTAATATAGATTATGATGCAAGAATTATGTCTTCTGGCGGAACTACTGCTATAGGAAATGGAGCATTGTCATATATTGCAGCTTCTCATGCATTTAATGGAAGGGTTGATGGTGGCCTAATTTCTGCTAGTACTGGTCTTGGCATTTCTAATACTTCTAATACAGTTTTAGCGGGTTTAAGTTTATATGGTGGCGCTCAATCTGGTAAACCAAATTACGGCATTACTTTCGCTGGTACCGGTAATGCAGGAACTGGTAAACATGGCGATCTAGACAATGCGTCATGGGCAGTATATTTAACTTGTGCCACTACTGGTGTTGAAAAACGTGGATGGATTTTCCAACGAAGTGACAACAACGCAAACGTTGCATCTATTTCTACTGCTGGTGTATTGTCTACTAATGGGAGTATCCAAACATTAAGCGACAATACAATGATCAACGTTGGTAACAACAACGATCTTGCATTAGTTAAAAAGGCTGGTGGGGCTGGATTTGTCGGAGTCGGTTCTAACACAGGATTCGCAGTTAAACGCTCTAACGCGACAACTGTAGATCCTTCTAATACATTTACAGATTTGCTCTGGGTTACAACTGCTGGCGTAGTGCAGTCTGCGGGTGGATTCACCGGTACGTTCAGTGGTACATTCAACGGTACTATTAGCGGAACACTTACTGGTTCGCTCAATGGTAATGCATCTACTGCAACTACACTACAAACTGCTCGAGCAATTGGTATCACTGGTTCTGGTGCATCAGGTTCTGTGAGTTTTGATGGATCAGGTAATGTTAATATTCCTTTAAGCGTTGCTACACAGGCTACTGCAACCAACAACACAACAATTGCCACTACAGCATTTGTTCAAAATGTTAATGTTGCTGAAACTGGTGCATCTGCCTATGCAGTACGGTTGAAAACACCACGATCTTTCCAAATTACTGGTGGCATCACAACAAATGCAGTATCATTTGACGGACAACAAAACGTTACATTGACCGCATCTAATGTCGATGGTTCAAAAGTTACAGGCAAAGTTCCTGCAGCTGCACAAGCAGATAATGCAACAAATGCCGTGTTATCACAACGTACTACAAGTGTAGACGTTAATGGGCAACCTGGTGTAAGACTTGCAGCAATGTGGTCGGGTACAGTATACCATAATCATTCAAAAAGTGCCAGATATTATTCTCCTACGCAAATCCAAATTGAATTAGGCGAAACCGCGGTTGTGACAGATCGTATAAACAATATGAAAGTCGGCAATCAGCTACATGTTGTTTTTGCAGGTAGTACTGGCTGGTCTAATGGCATGGTAACAGGTACTATTGATAGACTTACAACTAATGTTACATCTGGCTCAATAGATGCAATTGTTAGTATACCACATTCAATTTCTCCAGGAAATGCTACAAGTTGTAGAATATTGGCGGTAACATATTCTTCTATAGGATGTTCATTTATTGGGTCTGTGTCGTCATATGCAAAAGCAAGTATTTCTACAGGCGACTGGTCATGGCTACTACAGACTTCTTCTAGTGTAGTCAATCCTTTTATTAGTACTGCTACTTCAGGTGATATTGTTGATAGAAATGCATCATTGTTTCCTTTAGGATTCATAAAGGACGGCAATCCGACCTCTATGGCTGCAACAATGTTATCTTCGAATATTTGCAATTTTGTTGTCGGAGACAACAACAATGACAGCCCTTCACATTCTGGATTTGTAAGTGTGCAAATTTGGGATCGTGCATAA
Tertiary structure
PDB ID
44018bf81b1bd7432a5f71cf1b335734898f3f642dda8b764007135cb9f77afa
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Complete genome sequence of Acinetobacter baumannii phage AB-Navy71 | Le,T., Hernandez-Morales,A., Liu,M., Gill,J., Bishop-Lilly,K., Henry,M., Quinoas,J., Hamilton,T. and Biswas,B. | 2022-04-21 | — | GenBank |